目的以GEO(Gene Expression Omnibus)数据库为基础分析活化的蛋白激酶C受体1(receptor for activated C kinase1,RACK1)在糖尿病肾小管病中的表达及可能的机制。方法通过搜索Nephroseq数据库及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Gen...目的以GEO(Gene Expression Omnibus)数据库为基础分析活化的蛋白激酶C受体1(receptor for activated C kinase1,RACK1)在糖尿病肾小管病中的表达及可能的机制。方法通过搜索Nephroseq数据库及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes),明确RACK1在人的糖尿病肾小管病中表达情况及可能的通路。将培养的肾小管上皮细胞分为对照组、甘露醇组和高糖组,实时定量PCR测定其下游靶基因STAT1和STAT3的变化。FVB/N小鼠分为对照组和糖尿病肾病组,糖尿病肾病组小鼠给予腹腔注射链脲佐菌素构建糖尿病肾病的模型,实时定量PCR测定STAT1和STAT3 mRNA水平,免疫荧光染色明确p-STAT1和p-STAT3的表达情况。结果数据库数据分析发现RACK1在人糖尿病肾小管中表达明显升高。KEGG提示RACK1可能通过激活Jak-STAT信号通路发挥作用。与对照组比较,高糖组肾小管上皮细胞的RACK1、STAT1及STAT3的mRNA水平均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。糖尿病肾病动物模型中,肾小管的RACK1、STAT1及STAT3的mRNA水平均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);免疫荧光示p-STAT1阳性,主要位于肾小管上皮细胞中。结论 RACK1在糖尿病肾小管中高表达,可能是通过磷酸化STAT1激活Jak-STAT信号通路参与糖尿病肾小管病的发生发展。展开更多
目的:探讨钙调磷酸酶调节因子1(regulator of calcineurin 1,RCAN1)基因在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine和GEO数据库中有关RCAN1的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对RCAN1在乳腺癌中的作用进行荟萃分析。...目的:探讨钙调磷酸酶调节因子1(regulator of calcineurin 1,RCAN1)基因在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine和GEO数据库中有关RCAN1的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对RCAN1在乳腺癌中的作用进行荟萃分析。结果:Oncomine数据库中共收集了454项不同类型RCAN1的研究结果,关于在肿瘤与对照组织中RCAN1表达有统计学差异的结果有64项,其中RCAN1表达增高的有20项,表达降低的有44项。涉及到乳腺癌的研究数据集共有13项。乳腺癌中高表达的研究有0项、低表达的有13项。共有6项研究,9个乳腺癌分型数据集涉及RCAN1在乳腺癌组织和正常组织中的表达,包括2 508例样本。在数据库中综合比较9项研究成果,发现与正常组织相比,RCAN1在乳腺癌中的表达量低于正常组织(P<0.05)。不仅如此,通过挖掘GEO数据库,发现低表达RCAN1的患者总体死亡率较高,高表达RCAN1的患者预后较好(P<0.05)。结论:通过深入挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中肿瘤相关的基因信息,提示RCAN1的mRNA水平在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌预后相关,有望成为抗乳腺癌靶向治疗药物的重要靶点。展开更多
文摘目的以GEO(Gene Expression Omnibus)数据库为基础分析活化的蛋白激酶C受体1(receptor for activated C kinase1,RACK1)在糖尿病肾小管病中的表达及可能的机制。方法通过搜索Nephroseq数据库及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes),明确RACK1在人的糖尿病肾小管病中表达情况及可能的通路。将培养的肾小管上皮细胞分为对照组、甘露醇组和高糖组,实时定量PCR测定其下游靶基因STAT1和STAT3的变化。FVB/N小鼠分为对照组和糖尿病肾病组,糖尿病肾病组小鼠给予腹腔注射链脲佐菌素构建糖尿病肾病的模型,实时定量PCR测定STAT1和STAT3 mRNA水平,免疫荧光染色明确p-STAT1和p-STAT3的表达情况。结果数据库数据分析发现RACK1在人糖尿病肾小管中表达明显升高。KEGG提示RACK1可能通过激活Jak-STAT信号通路发挥作用。与对照组比较,高糖组肾小管上皮细胞的RACK1、STAT1及STAT3的mRNA水平均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。糖尿病肾病动物模型中,肾小管的RACK1、STAT1及STAT3的mRNA水平均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);免疫荧光示p-STAT1阳性,主要位于肾小管上皮细胞中。结论 RACK1在糖尿病肾小管中高表达,可能是通过磷酸化STAT1激活Jak-STAT信号通路参与糖尿病肾小管病的发生发展。
文摘目的:探讨钙调磷酸酶调节因子1(regulator of calcineurin 1,RCAN1)基因在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine和GEO数据库中有关RCAN1的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对RCAN1在乳腺癌中的作用进行荟萃分析。结果:Oncomine数据库中共收集了454项不同类型RCAN1的研究结果,关于在肿瘤与对照组织中RCAN1表达有统计学差异的结果有64项,其中RCAN1表达增高的有20项,表达降低的有44项。涉及到乳腺癌的研究数据集共有13项。乳腺癌中高表达的研究有0项、低表达的有13项。共有6项研究,9个乳腺癌分型数据集涉及RCAN1在乳腺癌组织和正常组织中的表达,包括2 508例样本。在数据库中综合比较9项研究成果,发现与正常组织相比,RCAN1在乳腺癌中的表达量低于正常组织(P<0.05)。不仅如此,通过挖掘GEO数据库,发现低表达RCAN1的患者总体死亡率较高,高表达RCAN1的患者预后较好(P<0.05)。结论:通过深入挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中肿瘤相关的基因信息,提示RCAN1的mRNA水平在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌预后相关,有望成为抗乳腺癌靶向治疗药物的重要靶点。
