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低温胁迫下花生差异表达基因的分离与分析
被引量：
12
1
作者
于树涛
于洪波
+7 位作者
苏君伟
赵立仁
史普想
赵艳
唐月异
王秀贞
吴琪
王传堂
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期569-576,共8页
筛选74个花生种质材料,最后以发芽率在80%以上的9650作为试验材料。对9650分别进行2℃和25℃(对照)处理,分别提取2、6和8h花生样品的总RNA。利用GeneFishing随机引物,克隆测序,获得34个独特的基因序列。经BLAST2GO注释,包括参与细胞合...
筛选74个花生种质材料,最后以发芽率在80%以上的9650作为试验材料。对9650分别进行2℃和25℃(对照)处理,分别提取2、6和8h花生样品的总RNA。利用GeneFishing随机引物,克隆测序,获得34个独特的基因序列。经BLAST2GO注释,包括参与细胞合成的组分、应激蛋白反应、代谢过程中的转运与运输、蛋白质的合成、以及耐低温相关的基因序列。进一步利用定量RT-PCR证实了4个基因的相对表达量,选择其中亲环蛋白基因相关序列,通过5'-RACE获得cDNA全长,为通过转基因技术对其进行功能分析奠定了基础。
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关键词
花生
低温
genefishing
差异表达
亲环蛋白
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职称材料
鲤鱼(Cyprinuscarpio,Cyprinidae)ants基因及其对鳞片发育的影响
被引量：
1
2
作者
程安达
蒋丽
+6 位作者
张保勇
王书
张研
刘永新
方平
李恒德
孙效文
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期120-128,共9页
ants(adenine nucleotide translocators),又称为ATP/ADP载体,利用Genefishing差异筛选技术对普通鲤鱼和德国镜鲤的皮肤转录产物进行筛选,得到了其中一个ant基因的部分片段,利用RT-PCR技术对皮肤中的ants基因进行钓取,得到6种不同的CDS...
ants(adenine nucleotide translocators),又称为ATP/ADP载体,利用Genefishing差异筛选技术对普通鲤鱼和德国镜鲤的皮肤转录产物进行筛选,得到了其中一个ant基因的部分片段,利用RT-PCR技术对皮肤中的ants基因进行钓取,得到6种不同的CDS序列。利用CLUSTALW对这6条翻译后的序列进行比对,发现这6条序列编码4种不同的氨基酸序列,表明ants基因至少有6种不同的转录产物(isoforms),但是在蛋白质水平上可能存在4种不同的翻译产物。利用NCBI上的blast对氨基酸序列进行同源性检索发现这4个蛋白产物与斑马鱼ant2最为相似,其相似度分别达到97%,97%,96%,98%。对处于不同分类地位的物种的ants基因与鲤鱼的4个ants表达产物进行进化树分析发现,这4个蛋白产物在93/100再现性水平上明显聚类为ant2,说明皮肤中表达的这些ants基因很可能是ant2。原位杂交结果显示,ant2在受精后4.5 h和6 h不表达,从受精后10 h开始在外包处强烈特异表达,在受精后12 h的胚胎中很弱表达,在受精后24 h的体节中特异强烈表达,在受精后48 h胚胎无表达,但是在着生鳞片的部位特异强烈表达,而在皮肤的其他部位则表达较弱或者不表达。以上的结果表明,ant2基因可能是通过不同的转录产物在精细调控鳞片的发育。
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关键词
ants
鳞被
ISOFORMS
genefishing
原位杂交
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职称材料
题名
低温胁迫下花生差异表达基因的分离与分析
被引量：
12
1
作者
于树涛
于洪波
苏君伟
赵立仁
史普想
赵艳
唐月异
王秀贞
吴琪
王传堂
机构
辽宁省风沙地改良利用研究所
山东省花生研究所
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期569-576,共8页
基金
国家花生产业技术体系建设(CARS-14)
辽宁省科技厅科技攻关项目(2011201021)
国家科技支撑计划课题(2012BAD36B00)
文摘
筛选74个花生种质材料,最后以发芽率在80%以上的9650作为试验材料。对9650分别进行2℃和25℃(对照)处理,分别提取2、6和8h花生样品的总RNA。利用GeneFishing随机引物,克隆测序,获得34个独特的基因序列。经BLAST2GO注释,包括参与细胞合成的组分、应激蛋白反应、代谢过程中的转运与运输、蛋白质的合成、以及耐低温相关的基因序列。进一步利用定量RT-PCR证实了4个基因的相对表达量,选择其中亲环蛋白基因相关序列,通过5'-RACE获得cDNA全长,为通过转基因技术对其进行功能分析奠定了基础。
关键词
花生
低温
genefishing
差异表达
亲环蛋白
Keywords
Peanut
Low-Temperature Stress
genefishing
Differential Expression Genes
Cyclophilin
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
鲤鱼(Cyprinuscarpio,Cyprinidae)ants基因及其对鳞片发育的影响
被引量：
1
2
作者
程安达
蒋丽
张保勇
王书
张研
刘永新
方平
李恒德
孙效文
机构
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心
上海海洋大学水产与生命学院
大连海洋大学生命科学与技术学院
中国水产科学研究院学科发展处
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期120-128,共9页
基金
中央公益级基本科研业务费项目(2011C015
2010C017)
+2 种基金
国家公益性行业(农业)科研专项项目(200903045)
863计划项目(2011AA100401)
"948"项目(2011-G12)
文摘
ants(adenine nucleotide translocators),又称为ATP/ADP载体,利用Genefishing差异筛选技术对普通鲤鱼和德国镜鲤的皮肤转录产物进行筛选,得到了其中一个ant基因的部分片段,利用RT-PCR技术对皮肤中的ants基因进行钓取,得到6种不同的CDS序列。利用CLUSTALW对这6条翻译后的序列进行比对,发现这6条序列编码4种不同的氨基酸序列,表明ants基因至少有6种不同的转录产物(isoforms),但是在蛋白质水平上可能存在4种不同的翻译产物。利用NCBI上的blast对氨基酸序列进行同源性检索发现这4个蛋白产物与斑马鱼ant2最为相似,其相似度分别达到97%,97%,96%,98%。对处于不同分类地位的物种的ants基因与鲤鱼的4个ants表达产物进行进化树分析发现,这4个蛋白产物在93/100再现性水平上明显聚类为ant2,说明皮肤中表达的这些ants基因很可能是ant2。原位杂交结果显示,ant2在受精后4.5 h和6 h不表达,从受精后10 h开始在外包处强烈特异表达,在受精后12 h的胚胎中很弱表达,在受精后24 h的体节中特异强烈表达,在受精后48 h胚胎无表达,但是在着生鳞片的部位特异强烈表达,而在皮肤的其他部位则表达较弱或者不表达。以上的结果表明,ant2基因可能是通过不同的转录产物在精细调控鳞片的发育。
关键词
ants
鳞被
ISOFORMS
genefishing
原位杂交
Keywords
ant
Scale
Isoforms
genefishing
in situ hybridization
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
低温胁迫下花生差异表达基因的分离与分析
于树涛
于洪波
苏君伟
赵立仁
史普想
赵艳
唐月异
王秀贞
吴琪
王传堂
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
鲤鱼(Cyprinuscarpio,Cyprinidae)ants基因及其对鳞片发育的影响
程安达
蒋丽
张保勇
王书
张研
刘永新
方平
李恒德
孙效文
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
在线阅读
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职称材料
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