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Gene-gene,gene-environment,gene-nutrient interactions and single nucleotide polymorphisms of inflammatory cytokines 被引量:4
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作者 Amina Nadeem Sadaf Mumtaz +4 位作者 Abdul Khaliq Naveed Muhammad Aslam Arif Siddiqui Ghulam Mustafa Lodhi Tausif Ahmad 《World Journal of Diabetes》 SCIE CAS 2015年第4期642-647,共6页
Inflammation plays a significant role in the etiology of type 2 diabetes mellitus(T2DM).The rise in the pro-inflammatory cytokines is the essential step in glucotoxicity and lipotoxicity induced mitochondrial injury,o... Inflammation plays a significant role in the etiology of type 2 diabetes mellitus(T2DM).The rise in the pro-inflammatory cytokines is the essential step in glucotoxicity and lipotoxicity induced mitochondrial injury,oxidative stress and beta cell apoptosis in T2 DM.Among the recognized markers are interleukin(IL)-6,IL-1,IL-10,IL-18,tissue necrosis factor-alpha(TNF-α),C-reactive protein,resistin,adiponectin,tissue plasminogen activator,fibrinogen and heptoglobins.Diabetes mellitus has firm genetic and very strong environmental influence; exhibiting a polygenic mode of inheritance.Many single nucleotide polymorphisms(SNPs) in various genes including those of pro and antiinflammatory cytokines have been reported as a risk for T2 DM.Not all the SNPs have been confirmed by unifying results in different studies and wide variations have been reported in various ethnic groups.The inter-ethnic variations can be explained by the fact that gene expression may be regulated by gene-gene,gene-environment and gene-nutrient interactions.This review highlights the impact of these interactions on determining the role of single nucleotide polymorphism of IL-6,TNF-α,resistin and adiponectin in pathogenesis of T2 DM. 展开更多
关键词 Cytokines gene-environment INTERACTION Diabetes MELLITUS Single NUCLEOTIDE polymorphism Gene-gene INTERACTION
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Gene-environment interaction and male reproductive function 被引量:1
2
作者 Jonatan Axelsson Jens Peter Bonde +2 位作者 Yvonne L. Giwercman Lars Rylander Aleksander Giwercman 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期298-307,I0007,共11页
As genetic factors can hardly explain the changes taking place during short time spans, environmental and lifestyle-related factors have been suggested as the causes of time-related deterioration of male reproductive ... As genetic factors can hardly explain the changes taking place during short time spans, environmental and lifestyle-related factors have been suggested as the causes of time-related deterioration of male reproductive function. However, considering the strong heterogeneity of male fecundity between and within populations, genetic variants might be important determinants of the individual susceptibility to the adverse effects of environment or lifestyle. Although the possible mechanisms of such interplay in relation to the reproductive system are largely unknown, some recent studies have indicated that specific genotypes may confer a larger risk of male reproductive disorders following certain exposures. This paper presents a critical review of animal and human evidence on how genes may modify environmental effects on male reproductive function. Some examples have been found that support this mechanism, but the number of studies is still limited. This type of interaction studies may improve our understanding of normal physiology and help us to identify the risk factors to male reproductive malfunction. We also shortly discuss other aspects of gene-environment interaction specifically associated with the issue of reproduction, namely environmental and lifestyle factors as the cause of sperm DNA damage. It remains to be investigated to what extent such genetic changes, by natural conception or through the use of assisted reproductive techniques, are transmitted to the next generation, thereby causing increased morbidity in the offspring. 展开更多
关键词 endocrine disruption gene-environment interaction persistent organic pollutants semen quality testicular cancer
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Styrene and ethylbenzene exposure and type 2 diabetes mellitus:A longitudinal gene-environment interaction study
3
作者 Linling Yu Wei Liu +7 位作者 Yongfang Zhang Qiyou Tan Jiahao Song Lieyang Fan Xiaojie You Min Zhou Bin Wang Weihong Chen 《Eco-Environment & Health》 2024年第4期452-457,共6页
Styrene and ethylbenzene(S/EB)are identified as hazardous air contaminants that raise significant concerns.The association between S/EB exposure and the incidence of type 2 diabetes mellitus(T2DM),and the interaction ... Styrene and ethylbenzene(S/EB)are identified as hazardous air contaminants that raise significant concerns.The association between S/EB exposure and the incidence of type 2 diabetes mellitus(T2DM),and the interaction between genes and environment,remains poorly understood.Our study consisted of 2219 Chinese adults who were part of the Wuhan-Zhuhai cohort.A follow-up assessment was conducted after six years.Exposure to S/EB was quantified by determining the concentrations of urinary biomarkers of exposure to S/EB(UBE-S/EB;urinary phenylglyoxylic acid level plus urinary mandelic acid level).Logistic regression models were constructed to investigate the relations of UBE-S/EB and genetic risk score(GRS)with T2DM prevalence and incidence.The interaction effects of UBE-S/EB and GRS on T2DM were investigated on multiplicative and additive scales.UBE-S/EB was dose-dependently and positively related to T2DM prevalence and incidence.Participants with high levels of UBE-S/EB[relative risk(RR)=1.930,95%confidence interval(CI):1.157-3.309]or GRS(1.943,1.110-3.462)demonstrated the highest risk of incident T2DM,in comparison to those with low levels of UBE-S/EB or GRS.Significant additive interaction between UBE-S/EB and GRS on T2DM incidence was discovered with relative excess risk due to interaction(95%CI)of 0.178(0.065-0.292).The RR(95%CI)of T2DM incidence was 2.602(1.238-6.140)for individuals with high UBE-S/EB and high GRS,compared to those with low UBE-S/EB and low GRS.This study presented the initial evidence that S/EB exposure was significantly related to increased risk of T2DM incidence,and the relationship was interactively aggravated by genetic predisposition. 展开更多
关键词 STYRENE ETHYLBENZENE Type 2diabetes mellitus Genetic risk score gene-environment interaction
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Fluctuating course of attention-deficit/hyperactivity disorder across development:Multifactorial influences
4
作者 Xi-Wen Zeng Lan-Fang Hu +2 位作者 Xiao-Lan Cao Bin-Rang Yang Zhao-Min Wu 《World Journal of Psychiatry》 2025年第8期149-160,共12页
Attention-deficit/hyperactivity disorder(ADHD)is increasingly conceptualized as a dynamic neurodevelopmental condition,marked by fluctuating symptom trajectories across development rather than the traditional static p... Attention-deficit/hyperactivity disorder(ADHD)is increasingly conceptualized as a dynamic neurodevelopmental condition,marked by fluctuating symptom trajectories across development rather than the traditional static patterns of persistence or remission.This review synthesizes empirical evidence on the varied trajectories of ADHD symptoms-including late-onset,partial remission,and recurrent fluctuation patterns-and underscores their clinical significance in longterm functioning.We adopt a multifactorial framework to explore how genetic,environmental,and gene–environment interactions contribute to the emergence and evolution of ADHD symptoms over time.In addition,we consider how medication-related variables-particularly tolerance and adherence-may influence symptom fluctuation.Characterizing these developmental dynamics offers critical guidance for designing flexible,personalized interventions that align with individual trajectories and transitional vulnerabilities. 展开更多
关键词 Attention-deficit/hyperactivity disorder Symptom fluctuation Developmental trajectories Longitudinal studies gene-environment interaction
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牛甲状腺基因的功能及其与环境适应性的相关研究进展
5
作者 李昊 田雨阳 +7 位作者 张子铭 曹一凡 次仁罗布 尼玛仓决 旦增洛桑 雷初朝 巴桑珠扎 陈宁博 《中国农业科学》 北大核心 2025年第13期2682-2692,共11页
甲状腺是牛重要的内分泌器官,通过分泌甲状腺激素(thyroid hormone,TH)发挥生物学作用,具有促进营养代谢、生长发育、完善神经功能和调控生理机能等功能。甲状腺的多功能性对动物维持健康机体必不可缺,在动物的生长发育和环境适应过程... 甲状腺是牛重要的内分泌器官,通过分泌甲状腺激素(thyroid hormone,TH)发挥生物学作用,具有促进营养代谢、生长发育、完善神经功能和调控生理机能等功能。甲状腺的多功能性对动物维持健康机体必不可缺,在动物的生长发育和环境适应过程中影响深远。中国地方黄牛的遗传背景复杂,又经过各地长期杂交选育,形成了至少58个地方品种。为适应多样化的地理生态环境,中国黄牛基因组在扩散过程中产生不断的微进化,其中甲状腺相关基因可能在适应性方面发挥了重要作用。本文从动物生理学和基因组学角度,综述了近年来甲状腺调控功能与相关基因组遗传变异的研究进展。首先介绍甲状腺调控功能,甲状腺通过负反馈调节的方式动态调控体内的TH水平,进而调控动物的发育、代谢、节律和繁殖功能。甲状腺信号对于环境影响十分敏感,可对环境刺激做出相应的反应,主要体现在低温时增加产热、高温时减少内源性产热、调控免疫和神经细胞等抵抗疾病及其他不利因素。其次介绍目前甲状腺相关基因组遗传变异的研究进展,TH合成到发挥作用是一个复杂的过程,大量的基因参与了该过程的调控,部分基因的遗传变异对动物的健康与家畜的生产性能产生影响。近年来牛基因组相关研究发展迅速,对牛的起源、生产和抗逆性状相关基因的研究均有深入探讨。随着对牛基因组研究的深入,更多的牛甲状腺相关基因的新功能被挖掘出来。甲状腺相关基因对牛生长、代谢、环境适应等的关键性状均有影响,例如:DUOXA2参与了奶牛的细胞钙调节和西藏牛的高原适应性,其Leu20Pro变异对青藏高原黄牛具有潜在影响;TG是肉牛生产性状相关的关键调控基因之一,存在3个与公牛性成熟相关的SNPs,可显著降低公牛性成熟年龄。最后,本文展望了基因组重组测序技术和单细胞核转录组与染色质可及性测序技术在牛甲状腺相关基因遗传变异研究中的巨大潜力,从成本、作用以及应用实例等角度论证两种技术的可行性。基因组重测序可鉴定多种类型的变异位点,根据选择信号鉴定关键变异。单细胞核转录组与染色质可及性测序技术可直接研究在不同环境和发育阶段每个细胞内基因的表达差异,可用于验证关键调控基因的作用机理。探究牛甲状腺相关基因的功能及其与生长性能和环境适应性相关遗传变异,有利于进一步挖掘牛重要经济性状和抗逆性状新基因。本文介绍了甲状腺的调控机制和甲状腺相关基因对家畜生长、代谢、生物节律调控、繁殖功能以及环境适应的多方面影响,并对未来可用于甲状腺研究的新技术进行展望,以期为未来的甲状腺功能探究和牛生物育种提供参考。 展开更多
关键词 甲状腺 基因 生长性状 环境适应
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蔬菜抗坏血酸合成代谢及影响因素研究进展 被引量:2
6
作者 屈乃聃 曹玲玲 +3 位作者 王惠玉 郝敬虹 韩莹琰 刘超杰 《蔬菜》 2025年第5期17-26,共10页
抗坏血酸(AsA)又名维生素C,是蔬菜重要的营养品质指标,其含量受遗传因素和环境条件的共同调控。本文系统综述了蔬菜中AsA生物合成代谢的主要途径(L-半乳糖途径、D-半乳糖醛酸途径、L-古洛糖途径、肌醇途径和ASA-GSH循环途径)及其关键酶... 抗坏血酸(AsA)又名维生素C,是蔬菜重要的营养品质指标,其含量受遗传因素和环境条件的共同调控。本文系统综述了蔬菜中AsA生物合成代谢的主要途径(L-半乳糖途径、D-半乳糖醛酸途径、L-古洛糖途径、肌醇途径和ASA-GSH循环途径)及其关键酶基因(如GMP、GME、GGP、GalUR、GulLO、MIOX等)的研究进展;重点分析了光照(光质、光强、光周期)、温度、激素等环境因子对AsA合成的调控机制,并展望了未来研究方向,为高抗坏血酸含量蔬菜的分子育种和优质栽培提供了理论依据,且为蔬菜营养品质的遗传改良和产业应用提供参考。 展开更多
关键词 蔬菜 抗坏血酸 合成途径 循环代谢 基因调控 环境影响 遗传改良
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Nar与Nap结构生物学的研究进展
7
作者 王静蕾 向兰欣 +1 位作者 王义东 薛冬梅 《微生物学通报》 北大核心 2025年第4期1371-1385,共15页
硝酸盐是全球氮循环的关键组成部分,同时也是植物有效氮的重要来源。研究硝酸盐的转化过程对于生态系统生产力的提高有重要意义,而自然环境中硝酸盐的转化主要是硝酸盐的异化还原。同时,硝态氮的大量输入导致了诸多环境生态问题,引起人... 硝酸盐是全球氮循环的关键组成部分,同时也是植物有效氮的重要来源。研究硝酸盐的转化过程对于生态系统生产力的提高有重要意义,而自然环境中硝酸盐的转化主要是硝酸盐的异化还原。同时,硝态氮的大量输入导致了诸多环境生态问题,引起人们广泛关注。反硝化反应是环境中硝态氮去除的主要过程。硝酸盐异化还原是反硝化过程硝态氮去除的第一步,可以为后续的还原反应提供反应底物。研究硝酸盐还原过程还可以加深对微生物脱氮的理解。硝酸盐异化还原由膜结合硝酸盐还原酶(Nar)和周质型硝酸盐还原酶(Nap)共同催化,但二者在结构、细胞定位、反应机理以及基因调控等方面存在差异,并且二者对于环境因子的响应也不尽相同,因此可能在催化硝酸盐还原过程中存在一定的差异性。本文系统论述了硝酸盐还原酶Nar与Nap在上述几方面的异同,以提升对系统中硝酸盐发展动态的认识。 展开更多
关键词 硝酸盐还原酶 结构 反应机理 基因调控 环境因子
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供水系统全流程微生物群落分布特征及时空变化
8
作者 费杰 毛慧 +4 位作者 王亚超 刘若宇 侯兴 李轶 张文龙 《中国给水排水》 北大核心 2025年第17期90-98,共9页
水质差异和微生物菌群的复杂性关联着供水系统的水质安全,深入研究供水系统中从水源到水龙头的微生物群落特征,对降低水传播疾病的风险、保障饮用水水质安全至关重要。为此,以多水源多水厂供水系统为例,采用16S rRNA测序技术和多元统计... 水质差异和微生物菌群的复杂性关联着供水系统的水质安全,深入研究供水系统中从水源到水龙头的微生物群落特征,对降低水传播疾病的风险、保障饮用水水质安全至关重要。为此,以多水源多水厂供水系统为例,采用16S rRNA测序技术和多元统计分析方法,系统分析了供水系统中微生物群落的时空分布、组装过程以及对环境变量的响应。结果表明,多水源水经不同水厂处理后,TOC去除率可达73.3%~85.7%,夏季效果逊于春季,且源头到龙头微生物多样性逐级降低。供水系统全流程中的微生物Shannon指数在夏季比春季高8.5%~19.8%,群落内竞争协同作用更复杂,但不同季节、不同处理阶段的微生物组装机制均由确定性过程主导。致病菌与耐氯菌在供水系统中的分布与存活状态受理化指标的影响,春季时TOC为关键因素,夏季时DO与余氯成为更为关键的调控因子。 展开更多
关键词 饮用水 多水源供水系统 微生物群落 基因测序 环境因子
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瓜类作物花性别分化研究进展 被引量:1
9
作者 韩圆圆 王紫雯 +4 位作者 朱梦园 刘正响 陈彦洁 李新峥 李庆飞 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第6期1-5,共5页
瓜类作物在我国广泛种植,不仅因其丰富的营养价值受到消费者喜爱,还因其经济价值在农业生产中占有重要地位,是我国重要的经济作物。瓜类作物属雌雄异花同株植物,雌花、雄花的分化,尤其是雌花的数量,直接影响瓜类作物的产量。近年来,瓜... 瓜类作物在我国广泛种植,不仅因其丰富的营养价值受到消费者喜爱,还因其经济价值在农业生产中占有重要地位,是我国重要的经济作物。瓜类作物属雌雄异花同株植物,雌花、雄花的分化,尤其是雌花的数量,直接影响瓜类作物的产量。近年来,瓜类作物花性别分化在分子和生理水平上的研究均取得了较大进展。主要综述了植物激素、基因和环境等因子影响瓜类作物花性别分化的研究进展,以期为后续瓜类作物花性别分化机制的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 瓜类 性别分化 激素 基因 环境因子
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城市垃圾房多环境介质中微生物群落与耐药基因的来源解析与传播特征研究
10
作者 姬亚杰 张翔 李丹 《环境科学学报》 北大核心 2025年第11期317-328,共12页
以城市生活垃圾房及周边环境为研究对象,通过高通量测序、实时荧光定量PCR及溯源分析,系统研究了垃圾房周边空气、土壤和垃圾渗滤液中微生物群落的季节变化特征,解析了空气中微生物的潜在来源、环境驱动因素以及不同环境介质中耐药基因... 以城市生活垃圾房及周边环境为研究对象,通过高通量测序、实时荧光定量PCR及溯源分析,系统研究了垃圾房周边空气、土壤和垃圾渗滤液中微生物群落的季节变化特征,解析了空气中微生物的潜在来源、环境驱动因素以及不同环境介质中耐药基因的传播规律.结果表明,空气微生物群落的丰富度和多样性在秋季最高,垃圾渗滤液微生物群落在夏季分布较为丰富且表现出明显的季节性差异,而土壤微生物群落季节性差异较小.垃圾房周边土壤、空气和垃圾渗滤液微生物群落在属水平下呈现不同的物种丰度分布,其中,克雷伯氏菌属(Klebsiella)、埃希氏菌属(Escherichia-Shigella)、布鲁氏菌属(Bryobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter)为条件致病菌属,可能引发多种疾病.通过Sourcetracker溯源分析发现,清洁空气是垃圾站周边空气中生物气溶胶的主要来源,而垃圾房周边土壤(2%~36.6%)和垃圾渗滤液(4.7%~15.1%)也具有较大的贡献,春秋季土壤源贡献显著,可能与季节性气候事件(强风、降雨)相关.温度和湿度对空气微生物群落结构影响最大(R^(2)为0.59和0.32),风速通过扬尘效应促进土壤源微生物的扩散,PM_(2.5)/PM_(10)浓度与部分微生物丰度呈正相关.空气中检测到15种耐药基因,夏季丰度最高,且与土壤、垃圾渗滤液共享14种耐药基因,可移动遗传元件(IS613和Tp614)的存在表明耐药基因存在跨介质水平转移的潜力.本研究揭示了垃圾房周边空气、土壤和垃圾微生物的组成和差异及耐药基因的分布,为城市环境卫生管理和公共健康防控提供了科学依据. 展开更多
关键词 城市生活垃圾房 微生物群落 耐药基因 环境因素 传播扩散
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水产养殖环境中氮循环及其功能微生物研究进展与展望
11
作者 徐程鹏 沈烽 +8 位作者 徐慧敏 孟顺龙 宋超 范立民 裘丽萍 李丹丹 方龙香 刘祝萍 邴旭文 《中国农学通报》 2025年第27期157-164,共8页
微生物驱动的氮循环过程在促进水产养殖系统物质循环、净化养殖水环境、维持生态系统平衡等方面发挥着重要作用。相较自然生态系统,水产养殖系统中氮素的人为输入量较多,氮素的存在形式丰富,氮循环过程及其相关微生物受交错复杂且易波... 微生物驱动的氮循环过程在促进水产养殖系统物质循环、净化养殖水环境、维持生态系统平衡等方面发挥着重要作用。相较自然生态系统,水产养殖系统中氮素的人为输入量较多,氮素的存在形式丰富,氮循环过程及其相关微生物受交错复杂且易波动的环境因素影响与调控。文章阐述了水产养殖环境的生态特征,综述了水产养殖生态系统中固氮、氨化、硝化、反硝化、厌氧氨氧化、异化硝酸盐还原为铵等主要的氮循环过程及其相关微生物类群研究进展,总结了氮循环功能微生物环境影响特征,讨论了水产养殖环境中可能存在的与氮循环过程耦合的其他离子氧化还原反应,最终提出了对养殖环境中氮循环未来研究方向的展望,以期深入了解水产养殖系统中的氮循环过程及其功能微生物,为养殖环境中氮素的净化做出理论贡献。 展开更多
关键词 水产养殖 氮循环 功能基因丰度 环境影响
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低温、强光和JA对黑果枸杞花青素合成的影响
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作者 刘慧 赵思琪 +2 位作者 郭瑾 聂祝欣 王静 《北方园艺》 北大核心 2025年第21期95-103,共9页
以黑果枸杞无菌组培苗为试材,分析低温、强光和茉莉酸(Jasmonic acid, JA)处理后植株花青素含量及合成通路中调节基因及结构基因的相对表达量,探究了环境因子对黑果枸杞花青素合成的影响及其调控作用,以期为人工调控黑果枸杞花青素高效... 以黑果枸杞无菌组培苗为试材,分析低温、强光和茉莉酸(Jasmonic acid, JA)处理后植株花青素含量及合成通路中调节基因及结构基因的相对表达量,探究了环境因子对黑果枸杞花青素合成的影响及其调控作用,以期为人工调控黑果枸杞花青素高效合成提供参考依据。结果表明:低温、强光和JA处理均能显著增加黑果枸杞植株花青素含量,花青素合成通路中的调节基因LrAN2、LrbHLH112和LrAN11及结构基因LrPAL、LrC4H、Lr4CL、LrCHS、LrCHI、LrF3H、LrF3′5′H、LrDFR、LrANS和LrUFGT的表达量均上升,低温、强光及JA处理后,黑果枸杞植株中LrAN2和LrAN11、LrbHLH112和LrAN11、LrbHLH112和LrAN11分别发挥主要调节作用,促进结构基因LrC4H、LrF3H、LrDFR和LrANS;LrPAL、LrCHS、LrF3H、LrDFR和LrANS;Lr4CL、LrANS和LrUFGT的上调表达,提高花青素含量。 展开更多
关键词 黑果枸杞 花青素 环境因子 基因表达
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河南窑洞立面形态与平面布局基因的环境适应性表达
13
作者 杨颖娜 祁剑青 +1 位作者 何艳冰 闫海燕 《建筑与文化》 2025年第7期239-241,共3页
河南窑洞景观基因要素大致可以分解为立面形态、平面布局、建筑材料、局部装饰四个方面。立面形态基因是主体基因,圆拱分布最广,尖拱和抛物线拱常见于三门峡等地,洛阳窑洞以半圆拱居多,郑州窑洞以半圆拱和双心圆拱为多;门窗设置亦随着... 河南窑洞景观基因要素大致可以分解为立面形态、平面布局、建筑材料、局部装饰四个方面。立面形态基因是主体基因,圆拱分布最广,尖拱和抛物线拱常见于三门峡等地,洛阳窑洞以半圆拱居多,郑州窑洞以半圆拱和双心圆拱为多;门窗设置亦随着气候环境而不同;平面布局有“一”字形、“L”形、折线形、凹形、凸形、三合院、四合院、套院等表达。 展开更多
关键词 窑洞 景观基因 河南 环境适应性
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欧美基因治疗产品环境风险评估监管介绍及对我国的启示
14
作者 孙雯 谢金平 《中国新药与临床杂志》 北大核心 2025年第4期245-251,共7页
基因治疗产品在使用过程中可能发生意外泄露或脱落,从而将其所携带的遗传物质整合至其他非患者人群或动植物体内,对生态系统和人类健康造成不利影响。为降低基因治疗产品可能带来的环境风险,美国、欧盟均制定了相关法律法规并出台专门指... 基因治疗产品在使用过程中可能发生意外泄露或脱落,从而将其所携带的遗传物质整合至其他非患者人群或动植物体内,对生态系统和人类健康造成不利影响。为降低基因治疗产品可能带来的环境风险,美国、欧盟均制定了相关法律法规并出台专门指南,对基因治疗产品临床试验及上市注册过程中的环境风险评估的开展、审查及具体步骤作出规定。我国目前对基因治疗产品的环境风险问题尚未进行专门规定,建议我国可借鉴欧美的相关做法,建立基因治疗产品环境风险监管法律法规体系,明确环境风险评估具体步骤;统一基因治疗产品申请注册与环境风险评估的监管机构和审评程序;确立科学合理的基因治疗产品环境风险评估考量依据并根据产品环境风险大小采取不同的监管措施。 展开更多
关键词 基因治疗产品 环境风险评估 行业监管
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环境中四环素类抗性基因研究进展 被引量:1
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作者 任向征 宁康辉 +2 位作者 郑茹文 李照 温静静 《山东建筑大学学报》 2025年第2期118-126,共9页
四环素类抗生素因其廉价、高效和广谱性等特点在养殖、医疗行业得到大量使用,但同时也导致了四环素类抗性基因在水体、土壤和空气等环境介质中的广泛分布且不断传播转移,严重威胁生态安全和人类健康。文章总结了环境中四环素类抗性基因... 四环素类抗生素因其廉价、高效和广谱性等特点在养殖、医疗行业得到大量使用,但同时也导致了四环素类抗性基因在水体、土壤和空气等环境介质中的广泛分布且不断传播转移,严重威胁生态安全和人类健康。文章总结了环境中四环素类抗性基因的来源与传播途径,阐明其造成的生态健康风险,在四环素类抗性基因污染控制方面,探讨了现有的四环素类抗性基因的检测方法,对比分析了去除技术的机理、优缺点以及对四环素类抗性基因的去除效果,展望了未来该领域的研究方向,以期为探明四环素类抗性基因传播扩散规律、建立风险评价标准体系以及有效治理抗性基因污染提供新思路。 展开更多
关键词 四环素类抗性基因 环境污染 检测技术 去除技术
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板栗GRF和GIF基因家族的全基因组鉴定和表达分析
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作者 王香玉 田玉娟 +7 位作者 李云 王东升 王旋 郭春磊 刘静 张海娥 张京政 于立洋 《果树学报》 北大核心 2025年第7期1422-1441,共20页
【目的】生长调控因子(growth-regulating factors,GRFs)和生长调节因子互作因子(GRF-interacting factors,GIFs)在植物生长发育和应对环境胁迫方面发挥重要作用。作为中国重要的木本粮食树种,板栗(Castanea mollissima)在生长发育过程... 【目的】生长调控因子(growth-regulating factors,GRFs)和生长调节因子互作因子(GRF-interacting factors,GIFs)在植物生长发育和应对环境胁迫方面发挥重要作用。作为中国重要的木本粮食树种,板栗(Castanea mollissima)在生长发育过程中受到众多环境胁迫的影响。通过研究板栗GRF和GIF基因家族,为解析板栗GRF和GIF基因在板栗组织发育及响应环境胁迫中的潜在功能提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对板栗GRF和GIF基因家族进行系统表征。利用RNA-seq数据分析其在板栗不同组织不同发育阶段和不同环境胁迫中的表达谱。结合RT-qPCR试验验证了CmGRFs和CmGIFs在板栗种仁发育过程中的表达。【结果】在板栗基因组中鉴定到10个GRFs和3个GIFs成员,分布在7条染色体上。系统发育分析将CmGRFs分为4个分支,CmGIFs分为2个分支。同一分支的成员在基因结构和蛋白保守基序上高度相似。CmGRFs和CmGIFs启动子区域丰富的顺式作用元件暗示了其功能的多样性。共线性分析表明节段重复是CmGRF和CmGIF家族扩张的主要驱动力。基于RNA-seq数据,分析了CmGRFs和CmGIFs在5种板栗组织中的不同发育时期,以及在3种非生物胁迫(干旱、冷冻、热休克)和栗瘿蜂(Drycosmusk kuriphilus)侵染下的表达模式。结果表明,CmGRFs和CmGIFs可能参与板栗种仁和芽的发育,并与胚珠的育性有关。CmGRFs和CmGIFs的表达水平对温度胁迫和栗瘿蜂侵染有显著响应,另外,CmGRFs几乎不受干旱胁迫的影响。【结论】研究结果为进一步研究CmGRFs和CmGIFs的功能以及在板栗生长发育和应对环境胁迫中的潜在作用提供了参考。 展开更多
关键词 板栗 生长调控因子 生长调节因子互作因子 生长发育 环境胁迫 基因表达
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西安市非小细胞肺癌患者驱动基因突变与环境暴露因素的相关性分析 被引量:1
17
作者 胡阳 王倩荣 +4 位作者 王梦雪 程娜 吴梅娟 伍鲜娜 孙娟华 《公共卫生与预防医学》 2025年第1期114-117,共4页
目的了解西安市非小细胞肺癌(non-smal cel lung cancer,NSCLC)患者驱动基因突变情况,分析其与环境暴露因素的关联性。方法纳入2019年1月至2023年12月空军军医大学第一附属医院收治的305例NSCLC患者,观察其驱动基因突变情况,分析其与环... 目的了解西安市非小细胞肺癌(non-smal cel lung cancer,NSCLC)患者驱动基因突变情况,分析其与环境暴露因素的关联性。方法纳入2019年1月至2023年12月空军军医大学第一附属医院收治的305例NSCLC患者,观察其驱动基因突变情况,分析其与环境暴露因素的关系。结果305例患者驱动基因突变率为46.89%,以EGFR基因突变占比最高,同时检出4例基因共突变;不同单驱动基因突变患者在性别上存在差异(P<0.05),EGFR以女性占比明显较高(P<0.05);单因素分析显示:驱动基因突变与非驱动基因突变患者在家族史、吸烟史、长期烹饪史、煎炸烟熏食物摄取间比较差异有统计学意义(P<0.05);logistic回归分析显示:长期烹饪史(OR=2.392)、煎炸烟熏食物摄取(OR=2.849)是影响EGFR基因突变环境暴露因素(P<0.05),有吸烟史(OR=1.377)是KRAS基因突变环境暴露因素(P<0.05)。结论西安市NSCLC患者以EGFR基因突变占比最高,且以女性为主,长期烹饪史、煎炸烟熏食物摄取与EGFR基因突变有关,有吸烟史与KRAS基因突变有一定的关联性。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 驱动基因突变 环境暴露 相关性
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基因驱动生物环境释放的多维风险与法律治理框架构建
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作者 吕建伟 邱成梁 《中国人口·资源与环境》 北大核心 2025年第3期116-125,共10页
近年来,基因驱动技术发展迅速,目前主要处于实验室研究及封闭田间试验阶段,尚未进行大规模的环境释放,但其应用前景已引起广泛关注。基因驱动技术在消除虫媒传播疾病、作物害虫和非本地物种入侵等方面展现出巨大潜力,然而其主动侵入性... 近年来,基因驱动技术发展迅速,目前主要处于实验室研究及封闭田间试验阶段,尚未进行大规模的环境释放,但其应用前景已引起广泛关注。基因驱动技术在消除虫媒传播疾病、作物害虫和非本地物种入侵等方面展现出巨大潜力,然而其主动侵入性、致死性及技术安全性等问题也可能引发生态环境、公共卫生和生物安全领域的潜在风险。具体而言,基因驱动生物可能通过跨空间或跨物种扩散影响非目标物种,进而破坏生态系统平衡;基因驱动系统可能会使目标种群个体产生抗性或携带另一种疾病,对公共卫生产生负面影响;此外,基因驱动生物的故意释放还可能引发生物安全危机。相较于转基因或基因编辑技术,基因驱动技术潜在风险发生的概率和负面影响更高,甚至可能引发全球性安全事件。目前,国际上对基因驱动生物的法律治理讨论尚不充分。《生物多样性公约》等国际条约虽提供了初步的监管框架,但存在缺少具体执行规则等问题。同时,欧盟、美国、英国等地区或国家也未给出明确的基因驱动生物监管回应,而沿用现有的转基因或基因编辑生物监管框架。然而,随着各国基因编辑生物监管政策的逐渐放松,以及现有生物技术监管框架普遍存在的监管主体职权不清晰、协调机制缺失和后端监管不足等问题,基因驱动生物面临弱监管甚至无监管的风险。特别是中国,现有的生物技术治理框架尚不成熟,难以对基因驱动生物治理进行有效回应。为此,引入敏捷治理理念,改造风险预防原则,推动形成动态的适应性基因驱动生物环境释放治理框架成为关键。具体包括:通过灵活立法策略,动态更新监管框架;重构多元主体监管格局,健全多部门间协调机制;推动多元主体参与治理,完善社区同意执行框架;深化国际交流合作,完善全球治理协作机制。 展开更多
关键词 基因驱动 生物安全 环境风险 预防原则 法律治理
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典型冶金微生物Acidiphilium的比较基因组研究
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作者 李星 娄伟 +4 位作者 黎亮志 尹华群 徐习中 夏令 孟德龙 《生物学杂志》 北大核心 2025年第1期48-54,共7页
酸性矿山废水(acid mine drainage,AMD)是一种寡营养、低pH以及富含重金属离子的极端酸性生境。该生境中含有大量的嗜酸、耐酸微生物,是系统中碳、氮和硫等物质循环的主要驱动者。Acidiphilium属菌株为兼性异养微生物,在AMD生境中丰度小... 酸性矿山废水(acid mine drainage,AMD)是一种寡营养、低pH以及富含重金属离子的极端酸性生境。该生境中含有大量的嗜酸、耐酸微生物,是系统中碳、氮和硫等物质循环的主要驱动者。Acidiphilium属菌株为兼性异养微生物,在AMD生境中丰度小于1%,但其与优势物种Acidibacillus经常表现出伴生关系,这说明Acidiphilium属在该系统中可能具有特殊的生态功能。为了探讨Acidiphilium属的生态功能和角色,从极端酸性环境中筛选到Aci-diphilium属的菌1株,经16S rDNA和ANI比对,命名为Acidiphilium cryptum Acc2。Acidiphilium cryptum Acc2基因组含有1066个蛋白编码基因,序列总长为4917178 bp,均高于该属其他菌的基因大小。Acidiphilium属泛基因组是开放的,共含有47242个蛋白编码基因,699个蛋白编码基因(1.48%)被鉴定为核心基因,可变基因共有33457个蛋白编码基因,占70.82%,2705个蛋白编码基因是特有基因,占5.73%。其重金属抗性基因的Ka/Ks值95.5%以上均低于1,具有较强的纯化选择。Acidiphilium属基因组中基因之间的流动和交换频率相对其他物种更高,对菌株的进化和环境适应能力具有较大的正向影响。阐明了Acidiphilium属基因组进化和基因水平转移的规律,揭示了其环境适应性进化机制。 展开更多
关键词 酸性矿山废水 Acidiphilium 环境适应机制 比较基因组学 基因水平转移
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