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基于GEO数据库与机器学习回归分析的p53和pRb表达水平与宫颈癌相关性分析
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作者 陈群 苏峻瑶 从丽 《机器人外科学杂志(中英文)》 2026年第1期167-173,共7页
目的:通过GEO数据库与机器学习回归分析探究肿瘤抑制蛋白p53(p53)和视网膜母细胞瘤蛋白(pRb)表达水平与宫颈癌严重程度的相关性。方法:根据基因表达综合数据库(GEO)的宫颈癌全球流行病学数据,分析TP53和RB1基因与宫颈癌的相关性。同时,... 目的:通过GEO数据库与机器学习回归分析探究肿瘤抑制蛋白p53(p53)和视网膜母细胞瘤蛋白(pRb)表达水平与宫颈癌严重程度的相关性。方法:根据基因表达综合数据库(GEO)的宫颈癌全球流行病学数据,分析TP53和RB1基因与宫颈癌的相关性。同时,选取2022年1月—2024年12月于江苏省人民医院宿迁医院治疗的100例宫颈癌患者作为研究对象,收集癌细胞分化程度、癌症分期、患者年龄等临床资料,并从生化检验科室获取p53和pRb表达水平。结果:通过GEO数据库分析,宫颈癌发病年龄集中在35~62岁,前5年生存率呈显著下降趋势,5年生存率约为40%。TP53和RB1基因与宫颈癌相关,SCC-Ag、p53、pRb的表达水平在不同癌细胞分化程度中存在区别,差异有统计学意义(P<0.05),且癌细胞分化程度与SCC-Ag、p53、pRb表达水平分别呈正相关、负相关、负相关。p53和pRb均与SCC-Ag呈负相关。结论:p53和pRb表达水平与宫颈癌严重程度密切相关,对临床治疗预后具有参考价值。 展开更多
关键词 geo数据库 机器学习回归 P53 PRB 宫颈癌 严重程度
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基于GEO芯片数据筛选铁死亡参与肝细胞癌的核心基因及中药治疗预测
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作者 冯逢 林镛 +5 位作者 彭子明 班少群 苏会吉 毛德文 韦艾凌 龙富立 《西部中医药》 2026年第3期78-83,共6页
目的:基于生物信息学筛选铁死亡参与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的核心基因,并预测潜在干预中药。方法:利用基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库下载GSE39791芯片数据筛选HCC差异表达基因,对差异上调、下调基... 目的:基于生物信息学筛选铁死亡参与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的核心基因,并预测潜在干预中药。方法:利用基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库下载GSE39791芯片数据筛选HCC差异表达基因,对差异上调、下调基因分别进行富集分析;通过铁死亡数据库(ferroptosis database,FerrDb)检索铁死亡相关基因,绘制HCC差异基因与铁死亡相关基因的韦恩图,取交集基因。下载肝细胞癌GSE57957芯片数据验证交集基因的差异表达;借助Coremine数据库预测干预交集基因的潜在中药,筛选出可能通过调控铁死亡干预HCC的中药。结果:共获得301个差异表达基因,其中上调基因45个,下调基因256个;获得259个铁死亡相关基因;与铁死亡相关的HCC差异表达基因共10个,分别是AKR1C3、HSPB1、MT1G、HAMP、CXCL2、GABARAPL1、NNMT、GPT2、CBS、HBA1;预测得到乳香、合欢花、红参等46味中药。结论:基于生物信息学筛选可能参与铁死亡以干预HCC的中药,为临床用药及基础研究提供了新思路。 展开更多
关键词 肝细胞癌 geo数据库 铁死亡 生物信息学 中药
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利用载人登月任务搭载逆行GEO试验星的轨道方案设计
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作者 贺波勇 彭祺擘 《载人航天》 北大核心 2026年第1期27-32,共6页
考虑利用载人登月任务中火箭上面级地月转移加速冗余推进能力,提出搭载发射逆行GEO试验星的燃料最优转移轨道方案。介绍了利用载人登月月面着陆器和载人飞船地月转移加速火箭上面级冗余推进能力,搭载逆行GEO试验星的工程应用前景和方案... 考虑利用载人登月任务中火箭上面级地月转移加速冗余推进能力,提出搭载发射逆行GEO试验星的燃料最优转移轨道方案。介绍了利用载人登月月面着陆器和载人飞船地月转移加速火箭上面级冗余推进能力,搭载逆行GEO试验星的工程应用前景和方案,建立了会合坐标系中月面着陆器和载人飞船地月转移轨道拼接设计模型,对比分析了月面着陆器搭载和载人飞船搭载的燃耗及最优分离变轨方案。仿真结果表明:利用着陆器最优地月转移轨道搭载方案比利用载人飞船最优绕月自由返回搭载方案燃耗更少,变轨速度增量与逆行GEO减速制动速度增量总和约为1.773 km/s,最优变轨时机约在地月转移入轨后4.36 d。 展开更多
关键词 逆行geo 地月转移 搭载发射 载人登月 自由返回 轨道设计
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现代地理学Geo-STEP模式创建与应用
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作者 刘彦随 《地理科学》 北大核心 2026年第4期729-740,共12页
进入“人类世”以来,全球气候变化、高强度人类活动与信息智能化的多重作用和影响不断加大,全球人地系统及其地域格局正经历关系重塑和功能重构的巨大挑战,现代地理学研究面临理论创新与范式转型应对的迫切需求。本文围绕创建“地理科学... 进入“人类世”以来,全球气候变化、高强度人类活动与信息智能化的多重作用和影响不断加大,全球人地系统及其地域格局正经历关系重塑和功能重构的巨大挑战,现代地理学研究面临理论创新与范式转型应对的迫切需求。本文围绕创建“地理科学(Science)-技术(Technology)-工程(Engineering)-实践(Practice)”四维融通模式(简称Geo-STEP模式),系统阐释其理论内涵、四维交互机制及其创新应用。研究表明,Geo-STEP模式是一套系统化、综合性、贯通式的现代地理学方法论体系,它聚焦多维度关联、多体系耦合、多场景协同,构建起地理科学、技术、工程、实践多维融通的有机整体,其传导逻辑遵循“科学认知(S)-技术创新(T)-工程落地(E)-实践反馈(P)”的通用范式,推动现代地理学实现3个关键转型:一是从解释现象的理论研究向解决问题的工程实践转型;二是从单一学科的独立发展向综合交叉的协同创新转型;三是从理论研究向重大战略导向的理论与实践结合转型。本文重点剖析了Geo-STEP模式在国土空间规划、黄河流域生态保护和高质量发展、城乡融合与乡村振兴、地理教育与教学等重点领域的应用场景,初步验证其用于分析解决复杂人地系统问题的独特优势与综合能力,为“人类世”“人地圈”时空格局下地理科学体系与学科体系的优化重构提供理论参考和实践范式。 展开更多
关键词 geo-STEP模式 人地系统科学 地理工程 地理技术 地理学科体系
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基于GeoStudio的尾矿库边坡稳定性分析及支护方案探讨
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作者 杨其山 刘宏 《土工基础》 2026年第1期106-111,共6页
以都匀市匀东镇某重晶石选厂尾矿库边坡为研究对象,通过现场取样与室内试验得到各地层物理力学参数,采用Geo-Studio软件进行建模以及利用Seep/W渗流分析模块Van Genuchten模型进行尾矿库渗流场分析并构建出非饱和尾矿库的岩石力学模型,... 以都匀市匀东镇某重晶石选厂尾矿库边坡为研究对象,通过现场取样与室内试验得到各地层物理力学参数,采用Geo-Studio软件进行建模以及利用Seep/W渗流分析模块Van Genuchten模型进行尾矿库渗流场分析并构建出非饱和尾矿库的岩石力学模型,以及利用Morgenstern-Price方法进行计算,分析认为属于不稳定边坡且安全系数为1.151,且降雨随着天数的增加,安全系数变得越来越小。对不稳定边坡,结合现场实际情况,拟采用扶壁式挡土墙方案进行支护,并对支护后的边坡进行稳定性分析。根据建筑规范设计挡土墙,并对挡土墙进行抗倾覆验算和抗滑移验算,得到的安全系数满足建筑规范要求。 展开更多
关键词 尾矿库边坡 geo-Studio Morgenstern-Price 扶壁式挡土墙
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GEO“投毒”,怎么防
6
作者 崔晓萌 宋杰 《中国经济周刊》 2026年第6期74-75,共2页
“AI的脆弱性远超外界认知。”中国电子信息产业发展研究院政策法规研究所研究员李佳雪在接受本刊记者采访时说。近期针对AI的GEO(生成引擎优化)“投毒”一事引发广泛讨论。你刚刚向AI提问,得到了一个看似完美的答案,但它可能是假的。... “AI的脆弱性远超外界认知。”中国电子信息产业发展研究院政策法规研究所研究员李佳雪在接受本刊记者采访时说。近期针对AI的GEO(生成引擎优化)“投毒”一事引发广泛讨论。你刚刚向AI提问,得到了一个看似完美的答案,但它可能是假的。不是算法出错,不是幻觉,而是有人故意让它这么说。因为它被“投毒”了。多位长期观察AI行业的专家向本刊记者透露,通过GEO给AI“投毒”已悄然形成黑色产业链,而且存在源头真伪难核验、权属难界定等治理难点。 展开更多
关键词 AI 算法 幻觉 专家 治理难点 黑色产业链 geo
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从流量竞价到认知协商:生成式检索语境下信息真实性的技术治理研究——基于《决胜AI时代:GEO驱动企业营销新增长白皮书》的扎根理论分析
7
作者 余剑 《西部广播电视》 2026年第2期91-96,共6页
随着大语言模型将信息分发从“索引”转向“生成”,如何治理“机器幻觉”成为内容提供者的核心挑战。本文基于扎根理论,通过对《决胜AI时代:GEO驱动企业营销新增长白皮书》的编码分析发现,生成引擎优化(GEO)实质上是生产端与算法间的“... 随着大语言模型将信息分发从“索引”转向“生成”,如何治理“机器幻觉”成为内容提供者的核心挑战。本文基于扎根理论,通过对《决胜AI时代:GEO驱动企业营销新增长白皮书》的编码分析发现,生成引擎优化(GEO)实质上是生产端与算法间的“认知协商机制”。该机制并非简单的DSS原则应用,而是通过在概率性预测中植入“认知锚点”来提升确定性。提供完整的逻辑推演链条及数据实证能诱发算法内容的“结构化回流”,有效补救幻觉问题。然而,这一技术路径也潜藏风险:利用“社会化验证”抵消偏见的手法,极易被异化为“制造共识”的商业手段。这虽为平台治理提供了新工具,却也为数字内容的真实性带来了更大的不确定性。 展开更多
关键词 geo 认知协商 扎根理论
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基于GEO数据库探讨翼状胬肉线粒体代谢基因AKT1与ATP5F1及BAG3表达与作用
8
作者 王诗逸 王婧 +1 位作者 王华 陈玉萍 《国际眼科杂志》 2026年第3期398-404,共7页
目的:探讨丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、ATP合酶F1亚基(ATP5F1)及Bcl-2相关抗凋亡基因3(BAG3)三者在翼状胬肉发生发展中的表达差异及作用机制。方法:通过GEO数据库获取翼状胬肉相关基因表达数据,筛选差异表达基因;利用String数据库构建蛋... 目的:探讨丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、ATP合酶F1亚基(ATP5F1)及Bcl-2相关抗凋亡基因3(BAG3)三者在翼状胬肉发生发展中的表达差异及作用机制。方法:通过GEO数据库获取翼状胬肉相关基因表达数据,筛选差异表达基因;利用String数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,结合Cytoscape软件筛选核心靶点;采用GO和KEGG通路富集分析线粒体代谢相关通路特征。收集翼状胬肉手术患者的胬肉头部、体部组织标本,HE染色观察两组组织病理形态差异,免疫组化法检测AKT1、ATP5F1、BAG3的蛋白表达水平。结果:GEO数据库分析共筛选出差异表达基因1264个,其中上调585个、下调679个。GO富集分析显示,生物学过程、细胞组分及分子功能层面均存在线粒体相关通路的显著富集;KEGG富集分析以氧化磷酸化、化学致癌-活性氧簇通路差异最为显著。收集翼状胬肉手术患者28例28眼的胬肉头部、体部组织标本,其中男7例7眼,女21例21眼,平均年龄69.32±8.98岁。HE染色结果显示,胬肉头部较体部上皮细胞异型增生更明显、基质纤维排列更紊乱,且炎症细胞浸润更显著。免疫组化结果证实,AKT1、ATP5F1、BAG3在胬肉头部的蛋白表达水平显著低于体部(均P<0.05)。结论:线粒体代谢相关基因AKT1、ATP5F1、BAG3在翼状胬肉中存在明显表达差异,且与病变组织的病理进展密切相关,其可能通过调控线粒体能量代谢参与翼状胬肉的发生发展,为该病的机制研究及靶向治疗提供新的实验依据与思路。 展开更多
关键词 翼状胬肉 geo数据库 线粒体代谢 丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1) ATP合酶F1亚基(ATP5F1) Bcl-2相关抗凋亡基因3(BAG3)
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On-orbit refueling robust mission scheduling with uncertain duration for geosynchronous orbit spacecraft
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作者 Shuai YIN Chuanjiang LI +3 位作者 Edoardo FADDA Yanning GUO Guangtao RAN Paolo BRANDIMARTE 《Chinese Journal of Aeronautics》 2026年第1期410-424,共15页
With the increasing number of geosynchronous orbit satellites with expiring lifetime,spacecraft refueling is crucial in enhancing the economic benefits of on-orbit services.The existing studies tend to be based on pre... With the increasing number of geosynchronous orbit satellites with expiring lifetime,spacecraft refueling is crucial in enhancing the economic benefits of on-orbit services.The existing studies tend to be based on predetermined refueling duration;however,the precise mission scheduling solution will be difficult to apply due to uncertain refueling duration caused by orbital transfer deviations and stochastic actuator faults during actual on-orbit service.Therefore,this paper proposes a robust mission scheduling strategy for geosynchronous orbit spacecraft on-orbit refueling missions with uncertain refueling duration.Firstly,a robust mission scheduling model is constructed by introducing the budget uncertainty set to describe the uncertain refueling duration.Secondly,a hybrid harris hawks optimization algorithm is designed to explore the optimal mission allocation and refueling sequences,which combines cubic chaotic mapping to initialize the population,and the crossover in the genetic algorithm is introduced to enhance global convergence.Finally,the typical simulation examples are constructed with real-mission scenarios in three aspects to analyze:performance comparisons with various algorithms;robustness analyses via comparisons of different on-orbit refueling durations;investigations into the impacts of different initial population strategies on algorithm performance,demonstrating the proposed mission scheduling framework's robustness and effectiveness by comparing it with the exact mission scheduling. 展开更多
关键词 geosynchronous orbit(geo) Hybrid Harris Hawks Optimization algorithm(HHHO) Mission scheduling On-orbit refueling Robust optimization
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全国首家主流媒体GEO未来传播联合体成立
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《城市党报研究》 2026年第3期21-21,共1页
2月3日上午,盐阜大众报业集团召开2026数智新生态战略共创会。会上,盐阜大众报携手20家主流媒体、技术公司、研究机构,正式成立“主流媒体在地服务语料库暨GEO未来传播联合体”。这是国内首个由主流媒体发起的GEO传播计划,旨在汇聚全国... 2月3日上午,盐阜大众报业集团召开2026数智新生态战略共创会。会上,盐阜大众报携手20家主流媒体、技术公司、研究机构,正式成立“主流媒体在地服务语料库暨GEO未来传播联合体”。这是国内首个由主流媒体发起的GEO传播计划,旨在汇聚全国媒体的智慧与在地资源。 展开更多
关键词 数智新生态 主流媒体 geo未来传播联合体
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基于Geo-Studio和蒙特卡罗法的黄土边坡降雨易损性评价研究
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作者 杨建伟 刘子瑄 +3 位作者 刘海 苟强 李晟 石科文 《建筑技术》 2026年第5期612-617,共6页
借鉴工程结构地震易损性分析理念,将黄土边坡稳定状态划分为5个等级,并将边坡稳定状态与定量安全系数对应起来,建立基于Geo-Studio的边坡降雨稳定性极限状态方程,通过蒙特卡罗法随机抽样计算黄土边坡在各降雨条件下的稳定性能水平失效概... 借鉴工程结构地震易损性分析理念,将黄土边坡稳定状态划分为5个等级,并将边坡稳定状态与定量安全系数对应起来,建立基于Geo-Studio的边坡降雨稳定性极限状态方程,通过蒙特卡罗法随机抽样计算黄土边坡在各降雨条件下的稳定性能水平失效概率,得到黄土边坡的降雨稳定性能水平曲线,实现对黄土边坡在降雨条件下的易损性分析。算例结果表明:本研究提出的黄土边坡降雨易损性分析方法和稳定性能水平失效概率计算流程是可行的;边坡的降雨稳定性能水平曲线可以预测边坡在某降雨量下的稳定性能或安全系数,相比变形监测预警,能更早地预测边坡的失稳概率或危险状态,为防灾减灾赢得宝贵时间。 展开更多
关键词 黄土边坡 降雨易损性 稳定性能 蒙特卡罗法 安全系数 geo-Studio
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GEO卫星锂离子蓄电池在轨管理策略的演进 被引量:1
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作者 王利然 周蓉 +2 位作者 张文芳 刘鹏 姜垚先 《电源技术》 北大核心 2025年第2期300-306,共7页
由于锂离子蓄电池具有比能量高的突出优势,地球同步轨道(GEO)卫星的空间储能设备已由氢镍蓄电池替代为锂离子蓄电池。上一代卫星采用60~100 Ah锂电池组作为储能设备,实现了锂电池组首次在我国GEO轨道通信卫星上的应用。最新一代卫星采用... 由于锂离子蓄电池具有比能量高的突出优势,地球同步轨道(GEO)卫星的空间储能设备已由氢镍蓄电池替代为锂离子蓄电池。上一代卫星采用60~100 Ah锂电池组作为储能设备,实现了锂电池组首次在我国GEO轨道通信卫星上的应用。最新一代卫星采用150~250 Ah大容量、高比能量锂电池组首飞成功,象征着我国大容量、高比能量锂电池组的成熟应用。随着大容量、高比能量锂离子蓄电池的广泛应用,充电控制方式和均衡方式相应进步,针对锂电池组的在轨管理策略也有相应的变化,阐述了两代卫星锂电池组在轨管理策略。 展开更多
关键词 锂离子蓄电池 geo卫星 在轨管理策略 演进
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基于BDS-3 GEO卫星对磁暴期间的电离层扰动分析 被引量:2
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作者 赵金霞 袁野 《全球定位系统》 2025年第1期73-77,共5页
基于北斗三号卫星导航系统(BeiDou-3 Navigation Satellite System,BDS-3)地球静止轨道(geostationary earth orbit, GEO)卫星数据,采用非差非组合模型对电离层总电子含量(total electron content,TEC)进行估计,并详细分析了磁暴期间的... 基于北斗三号卫星导航系统(BeiDou-3 Navigation Satellite System,BDS-3)地球静止轨道(geostationary earth orbit, GEO)卫星数据,采用非差非组合模型对电离层总电子含量(total electron content,TEC)进行估计,并详细分析了磁暴期间的电离层时空变化.结果表明:GEO卫星的静地特性可实现对电离层特定位置展开连续不间断地精细化监测.研究通过相对电离层扰动指数量化了电离层响应特征,发现低纬度区域电离层扰动更为频繁且强度较大,主要是由于低纬度区域电离层热层中性成分异常变化和接近赤道异常现象区域共同导致的.该研究结果为利用GEO卫星进行电离层监测和更准确地揭示电离层时空变化的特征和规律提供一定的参考. 展开更多
关键词 北斗三号卫星导航系统(BDS-3) 地球静止轨道(geo)卫星 磁暴 电离层扰动 电离层总电子含量(TEC) 非差非组合
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具有多级适应性休假和修正的Min(N,D)-策略的Geo/G/1离散时间排队分析
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作者 魏瑛源 余玅妙 《数学物理学报(A辑)》 北大核心 2025年第5期1671-1697,共27页
考虑服务员具有多级适应性休假和系统采用修正的Min(N,D)-控制策略的离散时间Geo/G/1排队系统,运用更新过程理论、全概率分解技术和z-变换工具,从任意初始状态开始,研究队长的瞬时性态和平稳性态,得到了任意时刻n^(+)处队长瞬态分布的z... 考虑服务员具有多级适应性休假和系统采用修正的Min(N,D)-控制策略的离散时间Geo/G/1排队系统,运用更新过程理论、全概率分解技术和z-变换工具,从任意初始状态开始,研究队长的瞬时性态和平稳性态,得到了任意时刻n^(+)处队长瞬态分布的z-变换表达式,然后在队长瞬态分布的基础上,使用洛必达法则,通过直接运算得到了队长稳态分布的递推表达式,同时给出了稳态队长的随机分解结构和附加队长分布的显示表达式,并得到了不同时刻n^(-)、n、n^(+)处和外部观测点处队长稳态分布之间的重要关系.进一步,以便于作数值计算的队长稳态分布的递推表达式为基础,借助于数值算例,讨论了系统容量的优化设计.最后,建立了费用结构模型,应用更新报酬过程理论获得了系统长期运行下单位时间内所产生的期望费用函数,并通过数值实例,确定了使期望费用最小的最优控制策略. 展开更多
关键词 geo/G/1离散时间排队 修正的Min(N D)-策略 多级适应性休假 队长分布 系统容量优化设计 最优控制策略
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基于GEO数据库结合网络药理学和分子对接技术探究玉竹抗抑郁作用机制 被引量:1
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作者 姜振旭 王朝兴 +6 位作者 王宇亮 赵宏 沈宇 孙诗晴 马永哲 宋明明 张宇 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2025年第1期359-366,共8页
目的:基于生物信息学和网络药理学方法筛选玉竹治疗抑郁症的潜在药物靶点和信号通路,并通过PC12细胞实验初步证实其抗抑郁药效。方法:下载GSE98793表达矩阵和GPL570平台信息进行差异表达基因筛选;通过检索TCMSP数据库进行成分筛选,利用C... 目的:基于生物信息学和网络药理学方法筛选玉竹治疗抑郁症的潜在药物靶点和信号通路,并通过PC12细胞实验初步证实其抗抑郁药效。方法:下载GSE98793表达矩阵和GPL570平台信息进行差异表达基因筛选;通过检索TCMSP数据库进行成分筛选,利用Cytoscape3.7.1软件,构建玉竹“药物-成分-靶点”相互作用网络图和PPI网络图;利用DAVID数据库,进行GO和KEGG富集分析;使用SYBYL-X 2.0软件对主要活性成分及靶点进行分子对接验证;采用谷氨酸(Glu)诱导PC12细胞模型后,将玉竹醇提物按低、中、高剂量进行分组给药,考查其对PC12细胞损伤的保护作用。结果:筛选得到玉竹抗抑郁活性成分23个,活性靶点34个;“药物-成分-靶点”网络图显示棕榈酸、月桂酸、(+)-雪松醇等为玉竹抗抑郁的主要活性成分;PPI网络图显示PTGS2、PTGS1、SLC6A2、GABRA1、TNF等为关键靶点;通过GO富集分析得到GO条目共209个,其中包括生物过程(BP)149个,细胞组分(CC)23个,分子功能(MF)37个;主要涉及Chemical carcinogenesis-receptor activation、Small cell lung cancer和Adipocytokine signaling pathway等信号通路;分子对接结果显示,玉竹主要活性成分与抑郁症主要靶点对接结果具有良好稳定性;体外细胞实验结果表明,600μg/mL的玉竹醇提物对Glu诱导的PC12细胞损伤具有明显恢复作用。结论:玉竹可能通过炎症反应、氧化应激和前列腺素合成等途径发挥抗抑郁作用。 展开更多
关键词 玉竹 抑郁症 网络药理学 geo 数据库 作用机制
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GeO^(+)分子离子光谱性质的理论研究
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作者 刘晓华 闫爽 +1 位作者 贾家梁 张健 《高师理科学刊》 2025年第1期40-45,共6页
采用多参考组态相互作用(MRCI)的方法对GeO^(+)分子离子第一解离极限Ge^(+)(^(2)P_(u))+O(^(3)P_(g))对应的12个Λ-S态进行从头计算,获得全部的势能曲线(PECs).通过求解一维径向薛定谔方程获得束缚态的光谱常数,与实验以及理论结果进行... 采用多参考组态相互作用(MRCI)的方法对GeO^(+)分子离子第一解离极限Ge^(+)(^(2)P_(u))+O(^(3)P_(g))对应的12个Λ-S态进行从头计算,获得全部的势能曲线(PECs).通过求解一维径向薛定谔方程获得束缚态的光谱常数,与实验以及理论结果进行比较,吻合较好.同时,计算了Λ-S态对应的电偶极矩(DMs),分析了曲线随核间距变化的规律.通过自旋-轨道耦合矩阵元的数值对电子态密集交叉处的振动能级的扰动情况进行讨论.根据理论计算得到1^(2)Σ^(+)-X^(2)Π和2^(2)Π-X^(2)Π态间的跃迁偶极矩(TDMs)、弗兰克-康登因子(FCFs),同时拟合出了跃迁状态的自发辐射寿命. 展开更多
关键词 geo^(+)分子离子 势能曲线 光谱常数
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基于GEO芯片结合网络药理学及分子对接探究炙甘草汤治疗肺纤维化的作用机制 被引量:1
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作者 陈立炜 任天一 +4 位作者 邱玺瑞 李沁劼 凌云 武琦 徐泳 《药物评价研究》 北大核心 2025年第7期1828-1839,共12页
目的运用GEO芯片、网络药理学及分子对接技术探究炙甘草汤治疗肺纤维化的作用靶点及其潜在机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM、ETCM数据库获取炙甘草汤的化学成分靶点并利用Uniprot校正靶点;通过GEO数... 目的运用GEO芯片、网络药理学及分子对接技术探究炙甘草汤治疗肺纤维化的作用靶点及其潜在机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM、ETCM数据库获取炙甘草汤的化学成分靶点并利用Uniprot校正靶点;通过GEO数据库筛选以及GeneCards、OMIM、TTD、disgenet数据库检索获取肺纤维化疾病靶点;完成药物成分靶点与疾病靶点的交集分析,借助Cytoscape软件结合STRING数据库,建立“药物-疾病-化合物-靶点”关联网络,进一步进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建与拓扑分析。将筛选出的共有靶点导入Metascape数据库,进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,以筛选关键信号通路。最后,通过分子对接方法验证网络药理学的预测结果,以确保其可靠性。结果共获得171种炙甘草汤活性成分,与肺纤维化相关的交集靶点有417个。经过PPI网络的筛选,确定了19个核心靶点,其中排名前5的是磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、蛋白激酶B(Akt1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白蛋白(ALB)和白细胞介素6(IL6)。GO富集分析结果显示,炙甘草汤主要调节细胞对外界刺激的反应、氧化应激以及基因转录等关键生物学过程。KEGG通路富集分析揭示了包括癌症信号通路、脂质代谢与动脉粥样硬化、TNF、IL-17、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、AGE-RAGE和低氧诱导因子-1(HIF-1)在内的多条信号通路。分子对接结果验证了炙甘草汤的前5种活性成分与5个关键蛋白的结合能均不高于-25 kJ·mol^(-1),表明结合稳定且有显著潜力。结论炙甘草汤中的多种活性成分可以通过多靶点、多信号通路针对肺纤维化发挥治疗作用,为后续实验和临床研究提供参考依据。 展开更多
关键词 肺纤维化 炙甘草汤 geo数据库 网络药理学 分子对接
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基于GEO数据集和网络药理学探讨枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的分子生物学机制 被引量:1
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作者 郑志锋 温小丽 +3 位作者 罗辉 白庆云 钟叶 王博龙 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2025年第2期58-67,共10页
本研究依托TCMSP数据库和SwissTarget Prediction平台预测枳实薤白桂枝汤活性成分靶基因;基于GEO数据集分析冠心病差异基因;筛选活性成分靶基因与冠心病差异基因的共有基因。借助Cytoscape软件、STRING数据库分别构建活性成分-靶基因网... 本研究依托TCMSP数据库和SwissTarget Prediction平台预测枳实薤白桂枝汤活性成分靶基因;基于GEO数据集分析冠心病差异基因;筛选活性成分靶基因与冠心病差异基因的共有基因。借助Cytoscape软件、STRING数据库分别构建活性成分-靶基因网络及PPI网络以挖掘核心成分及关键靶基因;再利用DAVID 6.8和Omicshare平台开展关键靶基因的GO富集和KEGG富集;最后使用AutoDock Vina软件将枳实薤白桂枝汤关键靶点与核心成分进行对接。发现31个枳实薤白桂枝汤活性成分通过APP、VEGFA、MAPK8、SRC、CREB1、JUN、BCL2L1、MMP9、TLR4、HSP90AA1十个关键靶基因,参与细胞凋亡过程的负调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节等主要生物过程;调控流体剪切应力和动脉粥样硬化、松弛素信号通路、雌激素信号通路、HIF-1信号通路以及多条免疫炎症信号通路;核心成分和厚朴酚能与APP、VEGFA、BCL2L1、JUN等关键靶点结合。由此可见,枳实薤白桂枝汤能多成分、多靶点协同治疗冠心病,其主要作用机制包括调控流体剪切应力和动脉粥样硬化、调节免疫炎症,抗缺氧等。 展开更多
关键词 枳实薤白桂枝汤 冠心病 网络药理学 geo数据集 分子机制
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基于GEO数据库探索鸡白痢沙门氏菌感染宿主基因特征
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作者 黄永熙 闫普普 +7 位作者 刘佳丽 刘满 刘恋 朱君 肖君豪 郭利伟 刘国平 杨小林 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第6期77-85,共9页
为了探究鸡白痢沙门氏菌感染后机体的生物功能变化及信号通路转导途径,明确其感染后的基因变化特征。研究通过GEO数据库下载鸡白痢沙门氏菌感染相关基因数据集,基于R语言进行生物信息学分析,筛选出数据芯片中的差异基因并对基因芯片共... 为了探究鸡白痢沙门氏菌感染后机体的生物功能变化及信号通路转导途径,明确其感染后的基因变化特征。研究通过GEO数据库下载鸡白痢沙门氏菌感染相关基因数据集,基于R语言进行生物信息学分析,筛选出数据芯片中的差异基因并对基因芯片共有基因进行GO和KEEG富集分析。利用String数据库进行蛋白互作分析,基于Cytoscape软件构建蛋白互作网络,并通过Cyto Hubba进行核心基因筛选,使核心基因在测序芯片中的表达趋势可视化。最后通过鸡白痢沙门氏菌攻毒雏鸡对临床数据预测结果进行试验验证。结果显示,两个基因芯片数据集分别提供4527个和806个差异基因,二者共有基因78个,GO与KEGG分析结果发现沙门氏菌感染后,分子功能的调控、离子通道激活等生物功能发生改变,负责产生IgA的肠道免疫网络等信号通路存在变化。筛选得到IL5、FN1和IL8等10个核心蛋白在临床数据中呈现同样的变化,动物试验验证得到上述核心靶点在不同肠道组织内呈现相同的表达趋势。研究结果表明,GEO数据库中转录组测序数据分析与临床沙门氏菌攻毒试验验证结果一致,可为鸡白痢沙门氏菌感染后生物标志物的确定提供理论依据和试验基础。 展开更多
关键词 鸡白痢沙门氏菌 geo数据库 生物信息学 感染
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基于GEO数据库的多发性硬化症进展相关潜在药物靶点系统分析及靶向中药成分预测
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作者 黄佳丽 岳利峰 +4 位作者 孙乐 马培 刘海波 许利嘉 肖培根 《中草药》 北大核心 2025年第20期7472-7484,共13页
目的 基于GEO数据库挖掘多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)疾病进展的潜在药物靶点,并通过反向筛选预测具有干预作用的中药活性成分,为MS的中医药治疗提供理论依据。方法 整合GSE224377和GSE149326数据集,筛选MS患者白质病灶区与正... 目的 基于GEO数据库挖掘多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)疾病进展的潜在药物靶点,并通过反向筛选预测具有干预作用的中药活性成分,为MS的中医药治疗提供理论依据。方法 整合GSE224377和GSE149326数据集,筛选MS患者白质病灶区与正常外观白质的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),结合加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)鉴定疾病进展相关核心模块。利用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析关键基因的生物学功能及通路。通过ETCM、TCMIP和NPASS数据库反向筛选靶向中药成分,结合Swiss Target Prediction评估成药性,使用Autodock vina进行分子对接验证核心靶点髓鞘碱性蛋白(myelin basic protein,MBP)和少突胶质细胞转录因子2(oligodendrocyte transcription factor 2,OLIG2)与中药成分的结合潜力。结果 共鉴定172个DEGs(59个上调、113个下调),加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)揭示11个与MS表型显著相关的基因模块,其中蓝色模块(107个枢纽基因)与疾病进展相关性最高(相关系数=0.74)。GO和KEGG分析显示,关键基因富集于髓鞘形成、轴突导向及血脑屏障破坏相关通路。根据8个疾病核心靶点匹配到45个中药成分,来源于62个中药。45个成分与MBP、OLIG2分子对接结果表明,凉薯素(与OLIG2结合能:-8.2 kcal/mol,与MBP结合能:7 kcal/mol)、白屈菜红碱(与MBP结合能:-7.5 kcal/mol)等成分与靶点的结合能力显著。结论 系统鉴定了MS进展的核心基因及通路,并预测了多种潜在中药活性成分,为MS的分子机制解析及中药干预策略开发提供新思路。 展开更多
关键词 多发性硬化症 geo数据库 中药成分 凉薯素 白屈菜红碱 髓鞘碱性蛋白 少突胶质细胞转录因子2
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