为研究糖原分支酶1(GBE1)基因多态性对坝上长尾鸡肉质风味及质量的影响,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增目标片段并结合直接测序法分析GBE1基因的单核苷酸多态性(SNP),再与肉质性状进行相关性分析。结果表明:选取60只坝上长尾鸡作为研究对...为研究糖原分支酶1(GBE1)基因多态性对坝上长尾鸡肉质风味及质量的影响,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增目标片段并结合直接测序法分析GBE1基因的单核苷酸多态性(SNP),再与肉质性状进行相关性分析。结果表明:选取60只坝上长尾鸡作为研究对象,GBE1基因存在4个SNP位点(g.96619229T>C、g.96619243T>G、g.96619350C>T和g.96619544C>T),各位点均存在3种基因型,优势基因型分别为TT、TT、CC和CT。卡方检验表明,4个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,多态信息含量(PIC)为0.262,0.262,0.332,0.373,显示出中等水平的多态性(0.25<PIC<0.50)。关联分析显示,在g.96619229T>C位点,携带TC基因型个体的腿肌肉中豆蔻酸含量显著超过TT基因型。同时,CC基因型的腿肌肉L^(*)平均值也明显高于其他2种基因型。g.96619243T>G位点,TG基因型的豆蔻酸含量高于TT型,而GG基因型腿肌L^(*)平均值显著高于TT和TG型。g.96619350C>T位点中,CT型豆蔻酸含量和腹脂率优于CC型,但腿肌L^(*)平均值低于TT型。g.96619544C>T位点的CT基因型脂肪酸含量多项指标显著高于CC型,且CT基因型个体在屠体质量、全净膛质量、腹脂质量和腿肌质量方面表现优于其他基因型,而TT基因型腿肌宰后24 h pH值显著高于CC基因型。连锁不平衡分析表明,前3个SNP位点间存在强连锁关系,识别出6种主要单倍型,优势单倍型为TTC(0.708)。综上,GBE1基因SNP位点与坝上长尾鸡肉质性状显著相关,且3个内含子位点间存在强连锁关系,其单倍型TTC为优质肉质的坝上长尾鸡育种研究提供了参考依据。展开更多
文摘为研究糖原分支酶1(GBE1)基因多态性对坝上长尾鸡肉质风味及质量的影响,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增目标片段并结合直接测序法分析GBE1基因的单核苷酸多态性(SNP),再与肉质性状进行相关性分析。结果表明:选取60只坝上长尾鸡作为研究对象,GBE1基因存在4个SNP位点(g.96619229T>C、g.96619243T>G、g.96619350C>T和g.96619544C>T),各位点均存在3种基因型,优势基因型分别为TT、TT、CC和CT。卡方检验表明,4个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,多态信息含量(PIC)为0.262,0.262,0.332,0.373,显示出中等水平的多态性(0.25<PIC<0.50)。关联分析显示,在g.96619229T>C位点,携带TC基因型个体的腿肌肉中豆蔻酸含量显著超过TT基因型。同时,CC基因型的腿肌肉L^(*)平均值也明显高于其他2种基因型。g.96619243T>G位点,TG基因型的豆蔻酸含量高于TT型,而GG基因型腿肌L^(*)平均值显著高于TT和TG型。g.96619350C>T位点中,CT型豆蔻酸含量和腹脂率优于CC型,但腿肌L^(*)平均值低于TT型。g.96619544C>T位点的CT基因型脂肪酸含量多项指标显著高于CC型,且CT基因型个体在屠体质量、全净膛质量、腹脂质量和腿肌质量方面表现优于其他基因型,而TT基因型腿肌宰后24 h pH值显著高于CC基因型。连锁不平衡分析表明,前3个SNP位点间存在强连锁关系,识别出6种主要单倍型,优势单倍型为TTC(0.708)。综上,GBE1基因SNP位点与坝上长尾鸡肉质性状显著相关,且3个内含子位点间存在强连锁关系,其单倍型TTC为优质肉质的坝上长尾鸡育种研究提供了参考依据。
