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冠心病细胞焦亡基因的生物信息学筛选及临床验证
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作者 杨玉静 吴振敏 +5 位作者 李晖 赵越 钟笑凌 王子霞 张鑫强 邓倩昀 《中国实验诊断学》 2025年第8期954-962,共9页
目的 通过整合生物信息学分析与临床验证,筛选冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)细胞焦亡关键基因,并评估其作为生物标志物的诊断价值。方法 基于GEO数据库GSE113079数据集筛选差异表达基因,结合LASSO回归与随机森林算法确定关键基因。纳入... 目的 通过整合生物信息学分析与临床验证,筛选冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)细胞焦亡关键基因,并评估其作为生物标志物的诊断价值。方法 基于GEO数据库GSE113079数据集筛选差异表达基因,结合LASSO回归与随机森林算法确定关键基因。纳入2023年5月至2024年8月在广东省人民医院就诊的CHD患者630例及健康体检对照246例,采用实时定量PCR检测外周血样本目标基因表达水平,分析其与临床分型、血管病变支数及Gensini评分的相关性。结果 筛选出5个关键基因(PRKACA、CHMP6、GZMB、APIP、GZMA)。其中PRKACA、GZMB、GZMA在CHD患者中显著下调(均P<0.001),ROC曲线下面积(AUC)分别为0.862(95%CI,0.835~0.888)、0.943(95%CI,0.927~0.959)、0.777(95%CI,0.744~0.810)。亚组分析显示,GZMB与GZMA在急性冠脉综合征亚组中表达差异显著(P<0.05),随着Gensini评分的增加,GZMB、GZMA表达量呈下降趋势。结论 外周血PRKACA、GZMB、GZMA可作为CHD诊断的生物标志物,其表达水平与疾病严重程度相关,为早期诊断和个体化治疗提供了新思路。 展开更多
关键词 冠心病 细胞焦亡 生物标志物 PRKACA GZMB gzma
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有氧跑台运动对自然衰老模型小鼠血液单细胞类型与差异基因表达的影响
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作者 谭孟铨 王思诺 +8 位作者 李睿 王文举 江涛 谢希 陈凤 夏思佳 杨敏光 柳维林 吴铁成 《福建中医药》 2025年第10期16-24,共9页
目的探讨有氧跑台运动对自然衰老模型小鼠血液单细胞类型与差异基因表达的影响。方法将12只16月龄C57BL/6J雄性小鼠按照随机数字表法分为老年组和运动组各6只,取6只6月龄同品系小鼠作为成年组。运动组进行为期7周的有氢跑台运动:第1周... 目的探讨有氧跑台运动对自然衰老模型小鼠血液单细胞类型与差异基因表达的影响。方法将12只16月龄C57BL/6J雄性小鼠按照随机数字表法分为老年组和运动组各6只,取6只6月龄同品系小鼠作为成年组。运动组进行为期7周的有氢跑台运动:第1周进行适应性训练,初始运动速度为4 m/min,按每天2 m/min逐步递增至12 m/min,30 min/d,共5 d;第2周开始系统性训练,以5 m/min低强度进行热身5 min,随后以12 m/min速度完成50 min主训练,再以5 m/min低速运动5 min进行放松,每周7 d,持续6周。成年组、老年组放置于同规格静止水平跑台30 min/d,每周5 d,持续1周,第2周更改为1 h/d,每周7 d,持续6周。干预后采用巴恩斯迷宫系统定量评估3组小鼠运动功能(平均速度、运动距离);利用血液单细胞RNA测序分别检测3组血液单细胞类型和基因表达情况,比较老年组和成年组(2组合记为A组)与运动组和老年组(2组合记为B组)不同细胞类型的表达情况以及差异基因筛选情况,再分别从A组和B组的差异基因中筛选出组间差异倍数排名前5的标记(Marker)基因,分析其在不同细胞中的表达水平,最后将A组和B组的Marker基因取并集并进行KEGG通路富集分析。结果与成年组比较,老年组平均速度、运动距离均下降(P<0.05)。与老年组比较,运动组平均速度、运动距离均升高(P<0.05)。血液单细胞测序结果显示:在A组的血液中检测到45779个细胞,共9种细胞类型,分为24个细胞簇;在B组的血液中检测到45353个细胞,共7种细胞类型,分为21个细胞簇;与A组比较,B组中B细胞、造血干细胞增加,而自然杀伤细胞、刷细胞、T细胞、中性粒细胞减少;筛选出A组差异基因共49个,其中老年组较成年组表达上升的基因4个,表达下降的基因45个;筛选出B组表达差异基因共11个,其中运动组较老年组表达上升的基因7个,表达下降的基因4个;将A组表达差异基因和B组表达差异基因取交集,得到2个交集基因,分别是颗粒酶A基因(Gzma)和酪氨酸激酶结合蛋白基因(Tyrobp);将老年组较成年组表达下降的差异基因和运动组较老年组表达上升的差异基因取交集,得到Tyrobp基因;A组中排名前5的Marker基因分别是:S100钙结合蛋白A9(S100a9)、S100钙结合蛋白A8(S100a8)、趋化因子配体3(Ccl3)、趋化因子配体4(Ccl4)及Gzma。其中S100a9、S100a8基因在中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞、造血干细胞、粒细胞、T细胞、巨噬细胞、刷细胞、间充质干细胞中表达;Ccl3、Ccl4基因在自然杀伤细胞和刷细胞中表达;Gzma基因在自然杀伤细胞中表达。B组中排名前5的Marker基因分别是:溶菌酶2(Lyz2)、干扰素诱导跨膜蛋白1(Ifitm1)、Ccl3、Ccl4、Gzma,其中Lyz2基因在中性粒细胞、B细胞、造血干细胞、自然杀伤细胞、单核细胞、T细胞、刷细胞中表达;Ifitm1基因在B细胞和刷细胞中表达;Ccl3、Ccl4基因在自然杀伤细胞和刷细胞中表达;Gzma基因在自然杀伤细胞中表达;KEGG通路富集分析共获得到13条信号通路,包括沙门氏菌感染通路、趋化因子信号通路、NF-κB信号通路、B细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等。结论有氧跑台训练可能通过调控血液中Tyrobp、Gzma表达,并调节B细胞、造血干细胞、自然杀伤细胞、T细胞、中性粒细胞的增殖分化,改善衰老导致的运动功能减退。 展开更多
关键词 衰老 运动功能衰退 有氧运动 血液单细胞RNA测序 Tyrobp gzma
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