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拟南芥开花抑制因子TFL1与GRFs蛋白的相互作用 被引量:4
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作者 袁敏 邢继红 +3 位作者 王莉 葛伟娜 郭棣 张岚 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1772-1780,共9页
【目的】研究拟南芥开花抑制因子TFL1与2个GRFs家族成员GRF4和GRF7之间的互作关系,为进一步解析TFL1抑制植物开花的分子机制奠定基础。【方法】以拟南芥cDNA作为模板,利用基因特异性引物,克隆TFL1、GRF4和GRF7,分别连接入门载体pCR8,经... 【目的】研究拟南芥开花抑制因子TFL1与2个GRFs家族成员GRF4和GRF7之间的互作关系,为进一步解析TFL1抑制植物开花的分子机制奠定基础。【方法】以拟南芥cDNA作为模板,利用基因特异性引物,克隆TFL1、GRF4和GRF7,分别连接入门载体pCR8,经菌落PCR扩增和测序鉴定分别获得这3个基因的入门载体TFL1-pCR8、GRF4-pCR8和GRF7-pCR8。利用LR重组的方法将上述3个入门载体分别与目标载体pGADT7和pGBKT7重组获得酵母双杂交试验载体TFL1-BD、GRF4-AD和GRF7-AD。将TFL1-BD载体分别与GRF4-AD或GRF7-AD载体共同转化酵母感受态细胞,于双缺(-Leu/-Trp)培养基上30℃培养2—3d直至长出酵母克隆,选取合适大小的酵母菌落转移到双缺(-Leu/-Trp)和四缺(-Leu/-Trp/-His/-Ade)缺陷培养基上,通过观察酵母菌落的生长情况判断TFL1与GRFs之间的互作关系。利用LR重组的方法将上述3个入门载体分别与目标载体px-nYFP和px-cYFP重组获得TFL1-nYFP、TFL1-cYFP、GRFs-nYFP、GRFs-cYFP双分子荧光互补试验载体,并分别转化农杆菌感受态细胞。将转化TFL1-nYFP或TFL1-cYFP载体的农杆菌分别与转化GRFs-nYFP或GRFs-cYFP载体的农杆菌共注射烟草叶片,培养48h后在荧光共聚焦显微镜下观察烟草细胞中YFP荧光的表达情况。通过YFP荧光信号的有无来判断TFL1与GRFs之间的互作关系。【结果】成功克隆到拟南芥中的3个基因,分别是534bp的TFL1、888bp的GRF4和798bp的GRF7,并分别获得其入门载体(TFL1-pCR8、GRF4-pCR8和GRF7-pCR8)、酵母双杂交试验载体(TFL1-BD、GRF4-AD和GRF7-AD)和双分子荧光互补试验载体(TFL1-nYFP、TFL1-cYFP、GRFs-nYFP和GRFs-cYFP)。在酵母双杂交试验中,相较于阴性对照组,共同转化TFL1-BD与GRFs载体的酵母菌落在双缺(-Leu/-Trp)和四缺(-Leu/-Trp/-His/-Ade)培养基上都生长较好,结果表明TFL1与GRF4、GRF7在酵母中直接相互作用。在双分子荧光互补试验中,相较于阴性对照组,将转化TFL1-cYFP载体的农杆菌与转化GRFs-nYFP载体的农杆菌共注射烟草细胞之后均在烟草细胞核内产生较强的YFP荧光信号;与此同时,将转化TFL1-nYFP载体的农杆菌与转化GRFs-cYFP载体的农杆菌共注射烟草细胞之后同样在烟草细胞核内产生较强的YFP荧光信号。结果表明,TFL1与GRF4、GRF7在烟草中直接相互作用。【结论】拟南芥开花抑制因子TFL1与GRFs家族的2个成员GRF4和GRF7均直接相互作用。 展开更多
关键词 拟南芥 TFL1 grfs 酵母双杂交 双分子荧光互补
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二穗短柄草GRFs基因家族的鉴定及表达模式分析 被引量:7
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作者 马超 宋鹏 +5 位作者 尚申申 杨夏夏 杨金华 韩群威 李记民 冯雅岚 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1152-1162,共11页
GRFs基因家族在植物生长发育及逆境响应中起着重要的调控作用。为了探明二穗短柄草GRFs基因家族的基本特征及其进化关系,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对二穗短柄草GRFs基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明,二穗短柄草GRF... GRFs基因家族在植物生长发育及逆境响应中起着重要的调控作用。为了探明二穗短柄草GRFs基因家族的基本特征及其进化关系,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对二穗短柄草GRFs基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明,二穗短柄草GRFs基因家族包括12个家族成员,蛋白质序列长度在238~577个氨基酸之间;序列比对发现二穗短柄草GRFs家族基因包括2个保守的QLQ和WRC结构域及广泛的保守基序;染色体定位发现,12个家族成员在二穗短柄草的5条染色体上呈不均匀分布,bd03号染色体分布最多;系统发育关系比较分析表明,这些GRFs基因家族成员存在4对直系同源基因。RT-qPCR分析表明,全部GRFs基因家族成员在二穗短柄草幼嫩组织中表达量较高,而在根系和衰老组织中表达量较低,外源激素特别是GA3诱导了二穗短柄草大部分GRFs基因家族成员的上调表达,表明GRFs基因家族广泛地参与了二穗短柄草分生组织功能和器官形成的生命进程。本研究结果为二穗短柄草GRFs家族蛋白功能的研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 二穗短柄草 grfs基因家族 基因结构 进化分析 表达模式分析
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花生GRF基因家族的鉴定与分析 被引量:1
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作者 张鑫 张晓宇 +9 位作者 刘齐妹 陈振博 张瑞 张晓吉 薛云云 李娜 张蕙琪 田跃霞 王鹏冬 白冬梅 《生物工程学报》 北大核心 2025年第12期4850-4864,共15页
花生(Arachis hypogaea L.)是重要的油料作物,广泛种植于热带和亚热带地区。生长调节因子(growth-regulating factors,GRFs)是调控植物生长和逆境应答的重要转录因子。为了提高花生的产量和抗逆性,研究其GRFs在生长发育和逆境胁迫中的... 花生(Arachis hypogaea L.)是重要的油料作物,广泛种植于热带和亚热带地区。生长调节因子(growth-regulating factors,GRFs)是调控植物生长和逆境应答的重要转录因子。为了提高花生的产量和抗逆性,研究其GRFs在生长发育和逆境胁迫中的作用至关重要。本研究通过生物信息学方法分析了AhGRF基因家族的理化性质、进化关系、染色体定位以及序列差异,通过实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)技术揭示了AhGRF基因家族在干旱和低温胁迫下的表达模式,构建亚细胞定位表达载体分析AhGRF2b和AhGRF3b蛋白在细胞中的定位,最后利用酵母双杂交技术分析AhGRF3b的互作蛋白。结果显示,花生中共鉴定出24个AhGRF基因,不均匀地分布在16条染色体上,编码氨基酸长度为268-630 aa,相对分子量为29842.27-67980.83 Da,该基因家族蛋白多数呈酸性且预测定位于细胞核;系统发育分析发现AhGRF基因家族成员可以分为6个簇;多重序列比对结果表明大多数AhGRF含有保守的QLQ和WRC结构域;干旱胁迫和低温胁迫处理下,多个AhGRF基因表达量显著上调,尤其是AhGRF2b和AhGRF3b基因,表明多个基因可响应干旱和低温胁迫;烟草瞬时表达实验表明,AhGRF2b定位在细胞核和细胞质中,AhGRF3b定位在细胞核中。此外,酵母双杂分析发现,AhGRF3b与过氧化氢酶蛋白AhCAT3可能存在互作,推测花生AhGRF基因可通过调控活性氧的清除来参与花生抗逆。本研究的结果为花生抗逆育种提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 花生 GRF基因家族 生物信息学 逆境胁迫响应 蛋白互作
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三裂叶薯GRF转录因子家族全基因组鉴定和表达分析
4
作者 张海 陈昌健 +7 位作者 吴胜男 王忠伟 李闯 郭晓威 姚琪 王庆峰 袁宝祺 孙凯 《种子》 北大核心 2025年第9期48-55,共8页
生长调控因子(GRF)在植物的生长发育、信号转导和胁迫响应中起着重要的调控作用。利用生物信息学方法,对三裂叶薯的GRF成员进行全基因组鉴定,并对其系统发育关系、基因结构、启动子顺式作用元件、共线性关系以及表达特征进行了分析。结... 生长调控因子(GRF)在植物的生长发育、信号转导和胁迫响应中起着重要的调控作用。利用生物信息学方法,对三裂叶薯的GRF成员进行全基因组鉴定,并对其系统发育关系、基因结构、启动子顺式作用元件、共线性关系以及表达特征进行了分析。结果表明,三裂叶薯含有19个GRF家族成员,不均匀地分布在11条染色体上。根据其蛋白结构和系统发育特征,将19个ItbGRFs分为4组。物种间共线性分析发现,15个ItbGRFs与IbGRFs具有共线性。表达模式分析发现,多数ItbGRFs基因在叶中表达量较高且多数ItbGRFs基因对逆境胁迫均有响应。 展开更多
关键词 三裂叶薯 GRF 生物信息 进化分析
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千穗谷GRF转录因子家族的全基因组鉴定及其对赤霉素的响应模式分析 被引量:1
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作者 杨晟 甘锦鑫 +4 位作者 周涛 刘宁芳 卢蕊 胡龙兴 徐倩 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期10-18,共9页
为明确千穗谷GRF基因在千穗谷生长发育过程中的作用,基于最新的千穗谷基因组信息,对AhGRF基因家族成员进行预测,并对其序列及其对外源赤霉素的响应模式进行分析。结果表明:千穗谷中共鉴定出AhGRF1~AhGRF9这9个基因,其不均匀地分布在8条... 为明确千穗谷GRF基因在千穗谷生长发育过程中的作用,基于最新的千穗谷基因组信息,对AhGRF基因家族成员进行预测,并对其序列及其对外源赤霉素的响应模式进行分析。结果表明:千穗谷中共鉴定出AhGRF1~AhGRF9这9个基因,其不均匀地分布在8条染色体上;AhGRFs分为5个亚家族,不同的AhGRF基因的表达模式不同,绝大多数AhGRF基因在花器官中高表达。AhGRF的启动子包含能响应水杨酸、脱落酸、茉莉酸甲酯、赤霉素、生长素等激素以及干旱、低温等胁迫的响应元件。AhGRF2、AhGRF5、AhGRF6、AhGRF8的启动子还含有与胚乳表达、分生组织、栅栏叶肉细胞分化相关的作用元件。赤霉素处理显著促进了千穗谷叶片和茎的生长,除AhGRF8在叶与茎中不表达外,叶中AhGRF7、AhGRF9的表达被抑制,AhGRF1~AhGRF6的表达量均在不同时间点上调;茎中的AhGRFs的表达模式与叶中的不同,所有基因的相对表达量均在赤霉素处理1 h时上调,且多个基因表达呈现节律性。 展开更多
关键词 千穗谷 生长调节因子(GRF) 基因家族 表达分析 赤霉素
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葡萄GRF/GIF家族基因对遗传转化再生效率的影响 被引量:1
6
作者 李敏 李思雨 +3 位作者 施紫涵 陈爽 徐炎 刘国甜 《园艺学报》 北大核心 2025年第1期51-65,共15页
为研究葡萄GRF/GIF家族基因对遗传转化再生效率的影响,对在葡萄基因组中鉴定到10个VvGRF和4个VvGIF基因进行了研究。VvGRF含有家族保守结构域WRC和QLQ,VvGIF含有保守结构域SNH和QG。VvGRF和VvGIF过表达烟草培养1个月后再生情况明显优于... 为研究葡萄GRF/GIF家族基因对遗传转化再生效率的影响,对在葡萄基因组中鉴定到10个VvGRF和4个VvGIF基因进行了研究。VvGRF含有家族保守结构域WRC和QLQ,VvGIF含有保守结构域SNH和QG。VvGRF和VvGIF过表达烟草培养1个月后再生情况明显优于空载对照。烟草中过表达VvGRF8-GIF2和VvGRF4-GIF2,再生效率高达73.58%和65.05%,是对照的2.4~2.7倍;过表达rVvGRF8-GIF2(miR396结合的靶位点突变后的VvGRF8-GIF2),再生效率提升效果最好,达到了83.43%,是对照的3.1倍;相对于VvGRF8-GIF2嵌合体的过表达转化,构建的VvGRF8、VvGIF2同源嵌合体VvGRF4-GIF2、VvGRF5-GIF2和VvGRF8-GIF3过表达后的促进再生效果相对较弱。综合试验结果,VvGRF8和VvGIF2有利于提升植物遗传转化的再生效率。 展开更多
关键词 葡萄 GRF GIF 遗传转化 再生
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半夏GRF基因家族的鉴定及表达分析
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作者 朱志炎 周厚英 +3 位作者 刘柳 张德清 田志宏 何勇 《植物科学学报》 北大核心 2025年第5期660-670,共11页
半夏(Pinellia ternata(Thunb.)Breit.)是一种重要的药用植物,受光照和温度的影响,其生长过程中容易出现“芽倒伏”现象。遮荫可缓解“芽倒伏”,并提升块茎总产量,但其作用机制尚不明确。生长调节因子GRF对植物的生长发育至关重要,能够... 半夏(Pinellia ternata(Thunb.)Breit.)是一种重要的药用植物,受光照和温度的影响,其生长过程中容易出现“芽倒伏”现象。遮荫可缓解“芽倒伏”,并提升块茎总产量,但其作用机制尚不明确。生长调节因子GRF对植物的生长发育至关重要,能够提高植物对逆境的抵抗力。本研究借助半夏染色体水平基因组草图,通过遮荫条件和高温胁迫下的全长转录组分析,利用生物信息学方法对GRF基因家族进行鉴定,共得到13个家族成员,划分为2个亚族。蛋白理化性质、亚细胞定位和三级结构建模结果表明,半夏GRF均为亲水性不稳定蛋白,定位于细胞核,部分GRF成员可能存在功能冗余。系统进化和共线性分析结果显示,半夏与水稻(Oryza sativa L.)的GRF基因存在密切的进化关系。半夏GRF具有典型的保守结构区域。启动子顺式作用元件及基因表达分析结果表明,GRF基因可能参与半夏对遮荫处理和高温胁迫的响应。研究结果为揭示遮荫提高半夏块茎产量并缓解“芽倒伏”的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 半夏 GRF基因家族 芽倒伏 块茎 基因表达 生物信息学
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水稻生长调节因子GRF基因家族的鉴定及生物信息学分析
8
作者 刘之恩 何勇 +4 位作者 王志成 詹逍康 王廷宝 刘耀威 田志宏 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2025年第8期18-27,共10页
生长调节因子(growth regulating factor,GRF)作为一种植物特有的转录因子,在植物生长发育过程中发挥重要作用。为鉴定水稻GRF基因家族成员,通过生物信息学方法对其蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、亚细胞定位、基因结构、顺式作... 生长调节因子(growth regulating factor,GRF)作为一种植物特有的转录因子,在植物生长发育过程中发挥重要作用。为鉴定水稻GRF基因家族成员,通过生物信息学方法对其蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、亚细胞定位、基因结构、顺式作用元件、染色体定位、进化关系和共线性进行分析。结果表明,共鉴定出12个水稻GRF基因,其蛋白长度为211~456 aa,分子量为22.3~49.3 kD,等电点为4.78~9.85,亚细胞定位主要定位于细胞核;水稻GRF基因含有2~5个外显子,启动子顺式作用元件主要与激素调控、胁迫响应、光响应相关;12个GRF基因不均匀地分布在2、3、4、6、7、11、12号染色体上;水稻GRF基因与玉米亲缘关系较近,与番茄、拟南芥同源性较低;水稻GRF基因不存在串联重复事件,大片段重复是其主要扩张方式。以上研究结果为深入研究水稻GRF基因功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 水稻 生长调节因子 GRF基因家族 生物信息学
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茅苍术nov-miR396-GRF模块的鉴定与表达分析
9
作者 李谦 汤嘉豪 +4 位作者 郭家逸 刘越圳 沈银峰 余坤 邓娟 《植物生理学报》 北大核心 2025年第11期1577-1585,共9页
miRNA是药用植物中重要的内源小分子,通过调控其靶基因的表达来发挥作用。为挖掘茅苍术(Atractylodes lancea)small RNA数据库中新颖的miRNA,解析其功能,本文克隆茅苍术MIR396家族中新颖的miRNA(nov-miR396)的前体序列,分析其特征,发现n... miRNA是药用植物中重要的内源小分子,通过调控其靶基因的表达来发挥作用。为挖掘茅苍术(Atractylodes lancea)small RNA数据库中新颖的miRNA,解析其功能,本文克隆茅苍术MIR396家族中新颖的miRNA(nov-miR396)的前体序列,分析其特征,发现nov-miR396成熟体位于长度为94 nt的前体序列的5′端;利用生物信息学方法对nov-miR396的靶基因进行预测和分析,确定茅苍术AlGRF1转录因子为其靶基因;进一步构建双元表达载体pCNG-nov-miR396和pCNGFP-AlGRF1,注射烟草(Nicotiana benthamiana)叶片进行农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)介导的烟草瞬时表达实验,发现nov-miR396可以下调靶基因AlGRF1的表达;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测nov-miR396和AlGRF1在茅苍术不同组织中的表达水平,发现nov-miR396在根茎中表达量最低,但在花和须根中有较高的表达量,而靶基因AlGRF1在根茎中表达量最高,在须根中表达量最低,二者呈现负调控模式。因此,本研究成功克隆茅苍术novmiR396,揭示nov-miR396可以负调控靶基因AlGRF1的表达。研究结果可为miR396-GRF模块调控茅苍术生长发育研究提供基础。 展开更多
关键词 茅苍术 miR396 调控 生长调节因子(GRF)
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蒙古黄芪GRF转录因子家族全基因组鉴定及不同生长阶段表达分析
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作者 石志勇 卢庚龙 +5 位作者 刘红军 牛景萍 赵详 李玉芳 张全 梁建萍 《中草药》 北大核心 2025年第13期4779-4788,共10页
目的在全基因组水平鉴定蒙古黄芪生物调控因子(Growth-regulating factors,GRF)转录因子家族成员,开展系统的生物信息学分析,并探究该家族基因在黄芪不同生长期的表达模式,为研究GRF转录因子调控黄芪次生代谢的分子机制提供基础。方法... 目的在全基因组水平鉴定蒙古黄芪生物调控因子(Growth-regulating factors,GRF)转录因子家族成员,开展系统的生物信息学分析,并探究该家族基因在黄芪不同生长期的表达模式,为研究GRF转录因子调控黄芪次生代谢的分子机制提供基础。方法通过生物信息学方法鉴定黄芪GRF转录因子家族,对其编码蛋白的理化特性、保守结构域组成、潜在亚细胞定位、系统发育关系及启动子区顺式调控元件进行预测分析,利用转录组数据研究GRF基因在黄芪不同生长期的表达模式,并与黄芪根中黄酮皂苷含量数据进行基因表达与代谢物积累的相关性评估。结果蒙古黄芪基因组共鉴定获得9个GRF转录因子家族成员,分别定位在7条染色体,聚类为5个亚家族。AmGRF蛋白氨基酸残基数目在320~642 aa,均表现为亲水性特征,不存在跨膜结构域及信号肽序列,亚细胞定位均在细胞核。系统进化分析显示,AmGRF转录因子与大豆GRF亲缘关系较近。AmGRF基因启动子区存在大量与光信号响应、激素信号转导、生长发育及逆境胁迫应答相关的顺势作用元件。转录组数据表明,AmGRF基因各成员在不同生长期根部组织的表达模式存在较大差异,表明各家族成员可能在黄芪不同生长阶段中发挥特异的调控作用。基因表达与黄芪黄酮皂苷含量相关性分析显示,AmGRF3和AmGRF4与黄芪根中黄酮代谢调控相关,AmGRF5、AmGRF6和AmGRF8与黄芪根中皂苷代谢调控相关。结论在全基因组水平对蒙古黄芪GRF基因家族进行鉴定和生信分析,通过黄芪不同生长期根中皂苷黄酮含量测定和GRF基因表达数据,鉴定出与黄芪黄酮皂苷代谢相关的GRF转录因子,为深入解析该家族调控蒙古黄芪生长发育及次生代谢的生物学功能提供关键靶点。 展开更多
关键词 蒙古黄芪 GRF转录因子 生物信息学 系统发育 表达模式
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杜仲EuGIF1基因鉴定及其表达和蛋白互作分析
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作者 王若若 曲鹏坤 +4 位作者 张欣 王珞 朱英 田双一 赵德刚 《生物技术通报》 北大核心 2025年第12期267-279,共13页
【目的】基于杜仲(Eucommia ulmoides Oliv.)全基因组数据,系统鉴定GIF(GRF-interacting factor)基因家族成员,分析GIF基因家族成员基因表达模式及蛋白互作特性,为解析杜仲器官发育调控网络及优化杜仲的遗传转化体系提供理论依据。【方... 【目的】基于杜仲(Eucommia ulmoides Oliv.)全基因组数据,系统鉴定GIF(GRF-interacting factor)基因家族成员,分析GIF基因家族成员基因表达模式及蛋白互作特性,为解析杜仲器官发育调控网络及优化杜仲的遗传转化体系提供理论依据。【方法】利用HMMER和BLASTP方法鉴定杜仲GIF基因家族成员,结合生物信息学工具分析蛋白理化性质、三维结构及启动子顺式元件;通过RT-qPCR检测基因组织特异性及赤霉素GA3诱导表达模式;采用酵母双杂交(Y2H)和双分子荧光互补(BiFC)实验验证EuGIF1与EuGRF5的互作关系;此外,用EuGIF1基因的过表达载体对拟南芥gif1突变体进行遗传互补。【结果】在杜仲的基因组中共鉴定到了3个EuGIF基因,EuGIF1、EuGIF2和EuGIF3,其中,EuGIF1和EuGIF2位于杜仲基因组的7号染色体,EuGIF3位于杜仲基因组的17号染色体。EuGIF1、EuGIF2和EuGIF3编码的蛋白均含保守的SSXT/SNH结构域。启动子序列分析显示,EuGIF1基因的启动子区域含有2个赤霉素响应元件。EuGIF1在顶端分生组织中高表达且受赤霉素GA3快速诱导;蛋白的三维结构预测显示SSXT/SNH结构域可形成蛋白互作界面。共表达分析表明EuGIF1与EuGRF1/3/5表达模式相似,但Y2H和BiFC实验均未检测到EuGIF1与EuGRF5的直接互作。此外,EuGIF1基因在拟南芥中的过表达无法互补拟南芥gif1突变体中叶片窄小的表型。【结论】EuGIF1可能在赤霉素信号介导的杜仲器官发育中发挥重要作用,GIF1与GRF的互作可能具有物种特异性,且基因功能的保守性在不同物种之间存在一定的局限性。 展开更多
关键词 杜仲 GIF基因家族 赤霉素 蛋白三维结构 GRF蛋白 蛋白质相互作用
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水稻GRF基因家族生物学功能的研究进展
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作者 周启密 刘芸 何勇 《棉花科学》 2025年第2期113-115,共3页
生长调节因子GRF作为植物中特有的一类小型转录因子,已被证实参与调控植物的多个生长发育过程。在水稻中,GRF参与调控水稻根系生长、花发育和胁迫应答等重要过程,是调控水稻生长发育的功能基因。基于此,梳理了水稻GRF基因功能,包括GRF... 生长调节因子GRF作为植物中特有的一类小型转录因子,已被证实参与调控植物的多个生长发育过程。在水稻中,GRF参与调控水稻根系生长、花发育和胁迫应答等重要过程,是调控水稻生长发育的功能基因。基于此,梳理了水稻GRF基因功能,包括GRF基因控制水稻不同组织和器官的生长、GRF基因与水稻胁迫反应的相关性、转录因子GRF基因在水稻激素应答中的作用。 展开更多
关键词 水稻 GRF基因功能 OsGRF基因
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GRF转录因子对植物生长发育及胁迫响应调控的分子机制 被引量:18
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作者 马超 原佳乐 +2 位作者 张苏 贾琦石 冯雅岚 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2145-2153,共9页
生长调控因子(GRFs)是一类植物特有的转录因子家族。GRFs信号通路介导植物种子发育、根系生长、花的发育等很多重要的生命过程。尽管GRFs的上游基因已被发现,但是其下游靶基因的研究仍鲜见报道。本文对近年来有关GRFs的结构特征、生物... 生长调控因子(GRFs)是一类植物特有的转录因子家族。GRFs信号通路介导植物种子发育、根系生长、花的发育等很多重要的生命过程。尽管GRFs的上游基因已被发现,但是其下游靶基因的研究仍鲜见报道。本文对近年来有关GRFs的结构特征、生物学功能及调控机制等方面进行了综述,并结合当前研究现状展望了GRFs未来的研究方向,以期为该领域的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 生长调控因子(grfs) 生长发育 胁迫响应 生物学功能 调控机制
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生长激素释放因子(GRF)在动物肌肉组织的表达 被引量:27
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作者 张永亮 欧阳红生 +4 位作者 刘松财 连继勤 冯立文 赵建军 张玉静 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期239-242,共4页
向大鼠后肢小腿前部注射生长激素释放因子 ( GRF)的表达质粒 pc DNA3 -GRF4 0 μg,于注射后 2 d开始 ,每隔 5d杀 2只取样 ,提取 RNA和 DNA,用 PCR和 RT-PCR检测质粒及其表达。结果表明 ,在 3 0 d时仍为阳性结果。注射部位肌肉组织免疫... 向大鼠后肢小腿前部注射生长激素释放因子 ( GRF)的表达质粒 pc DNA3 -GRF4 0 μg,于注射后 2 d开始 ,每隔 5d杀 2只取样 ,提取 RNA和 DNA,用 PCR和 RT-PCR检测质粒及其表达。结果表明 ,在 3 0 d时仍为阳性结果。注射部位肌肉组织免疫组化检测结果表明 ,在部分大鼠 ( 1 4/ 2 4 )的肌肉组织中检测到了 GRF分子。给家兔注射 pc DNA3 -GRF质粒 1 0 0μg(第 组注射质粒 ,第 组注射含 1 0 %甘油的质粒 ) ,于注射后 1 d开始采血分离血清 ,用 RIA法测定血清生长激素 ( GH)的水平。结果表明 ,第 组在 5d时 ,GH水平上升2 7.1 %( P <0 .0 5)。本研究结果表明 ,外源 GRF在肌肉组织可获得表达 ,并能提高动物体内的 展开更多
关键词 GH 外源基因表达 GRF 肌肉组织
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茶树GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:27
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作者 王鹏杰 郑玉成 +3 位作者 林浥 周珍 杨江帆 叶乃兴 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期413-421,共9页
生长调控因子(growth regulating factor,GRF)是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育过程中起重要调控作用。该研究利用生物信息学的方法,从茶树基因组中鉴定获得11个CsGRF转录因子家族成员,且均具有完整的特征结构域QLQ和WRC。CsGR... 生长调控因子(growth regulating factor,GRF)是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育过程中起重要调控作用。该研究利用生物信息学的方法,从茶树基因组中鉴定获得11个CsGRF转录因子家族成员,且均具有完整的特征结构域QLQ和WRC。CsGRF家族成员含有3~6个外显子,基于系统进化关系将CsGRF家族分为6组,且与葡萄及猕猴桃GRF家族的亲缘关系更为接近。不同组织转录组数据分析结果表明,该家族在生长活跃的茶树嫩梢部位高表达。上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件。荧光定量检测发现,分别有10个和2个CsGRF成员在低温和干旱胁迫处理后呈现显著上调表达,其中CsGRF8和CsGRF11对2种非生物胁迫均有响应;并发现受ABA、MeJA和GA激素处理诱导分别有9个、3个和6个CsGRF基因的表达水平差异显著。研究表明,CsGRF基因家族在茶树生长发育过程及应激反应中起作用,推测CsGRF基因可能通过各种激素信号转导途径参与胁迫响应过程。 展开更多
关键词 茶树 GRF转录因子 系统进化 胁迫
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桃GRF基因家族的序列及其组织特异性表达分析 被引量:11
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作者 曹珂 薛灵姿 +5 位作者 王蛟 方伟超 朱更瑞 陈昌文 王新卫 王力荣 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期578-586,共9页
转录因子家族基因GRF(growth-regulating factor)是植物中特有的一类生长调控因子基因,在水稻和拟南芥中,GRF家族基因编码的蛋白质具有正向调控茎和叶生长发育的功能。为了探究在桃中GRF基因是否参与了狭叶桃"金蜜狭叶"的叶... 转录因子家族基因GRF(growth-regulating factor)是植物中特有的一类生长调控因子基因,在水稻和拟南芥中,GRF家族基因编码的蛋白质具有正向调控茎和叶生长发育的功能。为了探究在桃中GRF基因是否参与了狭叶桃"金蜜狭叶"的叶片发育,本试验首先分析桃基因组中鉴定出的GRF基因的序列信息;然后,以正常叶片的"上海水蜜"桃为对照,通过荧光定量PCR检测了这些GRF基因在"金蜜狭叶"桃的组织特异性表达情况;最后,利用126对简单序列重复标记对1个F2杂交群体进行连锁分析,定位狭叶性状,辅助筛选狭叶性状的候选基因。结果表明:桃基因组GRF基因包括10个成员,分布在除4和8外的其他染色体上,编码蛋白的氨基酸长度在191~612之间。蛋白序列分析表明,除ppa011917m的QLQ结构域中的Leu残基被Phe代替外,这10个GRF的N端均含保守的QLQ和WRC结构域。系统进化树将桃上的10个GRF基因分为3组。从10个GRF基因的表达结果可以看出,6个基因在茎尖的表达量高于幼叶,也高于其他成熟组织和器官;其中2个基因在狭叶桃中的表达显著高于正常叶对照。通过连锁分析将"金蜜狭叶"桃的狭叶性状定位在第6染色体的15.7~21.1 Mb之间,该区间仅含有1个GRF基因ppa003017m,是狭叶性状的候选基因。本研究将为"金蜜狭叶"桃狭叶性状基因的鉴定和高光效种质筛选奠定研究基础。 展开更多
关键词 反转录 GRF基因 狭叶 荧光定量
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基于Gibbs随机场与模糊C均值聚类的图像分割新算法 被引量:35
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作者 冯衍秋 陈武凡 +1 位作者 梁斌 林亚忠 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第4期645-647,共3页
模拟C均值聚类(FCM)是一种非常经典的非监督聚类技术,已被广泛用于图像的自动分割.由于传统的FCM算法进行图像分割仅利用了灰度信息,而没有考虑象素的空间位置信息,因而分割模型是不完整的,造成传统FCM算法只适用于分割噪声含量很低的图... 模拟C均值聚类(FCM)是一种非常经典的非监督聚类技术,已被广泛用于图像的自动分割.由于传统的FCM算法进行图像分割仅利用了灰度信息,而没有考虑象素的空间位置信息,因而分割模型是不完整的,造成传统FCM算法只适用于分割噪声含量很低的图像.为了克服传统FCM算法的局限性,本文利用Gibbs随机场所描述的邻域关系属性,引入先验空间约束信息,提出拒纳度的概念,建立包含灰度信息与空间信息的新聚类目标函数,继而提出基于Gibbs随机场与模糊C平均聚类的GFCM图像分割新算法.实验证明,利用本文所提GFCM算法可以有效地分割含噪声图像. 展开更多
关键词 图像分割 模糊C均值(FCM)聚类 Gibbs随机场(GRF) 多级逻辑模型(MLL)
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CMV与SP双启动子增强外源基因在小鼠骨骼肌中的表达效率 被引量:9
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作者 章倩倩 刘松财 +2 位作者 戴建威 任晓慧 张永亮 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期554-559,共6页
构建分别含有CMV、肌肉特异启动子SP及双启动子CMV-SP的真核报告基因EGFP表达载体(pCMV-EGFP、pSP-EGFP及pCMV-SP-EGFP)和生长激素释放因子(GRF)表达载体(pCMV-GRF、pSP-GRF和pCMV-SP-GRF).将3种EGFP表达质粒分别注射至小鼠骨骼肌.注射... 构建分别含有CMV、肌肉特异启动子SP及双启动子CMV-SP的真核报告基因EGFP表达载体(pCMV-EGFP、pSP-EGFP及pCMV-SP-EGFP)和生长激素释放因子(GRF)表达载体(pCMV-GRF、pSP-GRF和pCMV-SP-GRF).将3种EGFP表达质粒分别注射至小鼠骨骼肌.注射后1周、2周、3周以及4周时,分别提取肌肉组织RNA,应用半定量RT-PCR检测报告基因(EGFP)的表达量,发现pCMV-SP-EGFP组EGFP表达量显著高于pCMV-EGFP组和pSP-EGFP组(P<0.01);经荧光检测得到了较强的荧光信号.将3种GRF表达质粒分别注射至小鼠骨骼肌,在注射后每隔10d记录小鼠累积增重,采血并用RIA法测定血清胰岛素样生长因子Ⅰ(IGF-Ⅰ)浓度,结果pCMV-SP-GRF组累积增重、IGF-I浓度分别高于生理盐水组、pCMV-GRF组和pSP-GRF组(P<0.05).结果表明:CMV与SP两种启动子组合,在小鼠骨骼肌内使外源基因表达效率提高.本研究为提高外源基因在肌肉组织的表达提供了新的途径. 展开更多
关键词 CMV启动子 SP启动子 双启动子 EGFP GRF IGF-Ⅰ
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植物中GRF转录因子的研究进展 被引量:12
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作者 袁岐 张春利 +1 位作者 赵婷婷 许向阳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期3145-3151,共7页
GRF转录因子是植物中特殊含有的转录因子。它主要调控植物细胞大小、参与叶绿体增殖、雌蕊发育、调控渗透胁迫等植物生长发育过程。GRF转录因子主要包含QLQ和WRC两个保守的结构域。而且GRF转录因子在多种植物中存在,包括拟南芥、油菜、... GRF转录因子是植物中特殊含有的转录因子。它主要调控植物细胞大小、参与叶绿体增殖、雌蕊发育、调控渗透胁迫等植物生长发育过程。GRF转录因子主要包含QLQ和WRC两个保守的结构域。而且GRF转录因子在多种植物中存在,包括拟南芥、油菜、马铃薯、水稻、番茄、玉米等。本综述主要是对GRF转录因子的结构与分布、进化分析以及它在植物生长过程中的作用加以阐述。其中,本综述探讨了GRF转录因子与植物营养生长的相关性,与植物生殖生长的相关性,以及与植物渗透胁迫的相关性。本综述总结了前人的成果与结论,详细的论述了国内外关于GRF转录因子的研究进展,为进一步研究GRF转录因子奠定基础。 展开更多
关键词 GRF 转录因子 结构特征 进化分析 功能作用
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植物生长调控因子研究进展 被引量:10
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作者 刘倩 王凤德 +2 位作者 张一卉 邱念伟 高建伟 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1775-1779,共5页
生长调控因子(growth-regulating factors,GRFs)是植物特有的一类转录因子。它可以通过N-末端QLQ结构域与GIF(GRF-interaction factor)蛋白中的SNH结构域互作,形成功能复合体,共同参与下游基因的表达调控。GRF蛋白在植物生长发育过程中... 生长调控因子(growth-regulating factors,GRFs)是植物特有的一类转录因子。它可以通过N-末端QLQ结构域与GIF(GRF-interaction factor)蛋白中的SNH结构域互作,形成功能复合体,共同参与下游基因的表达调控。GRF蛋白在植物生长发育过程中起到重要的调控作用。本文综述了近年有关GRF蛋白结构、基因特征、分子调控功能方面的研究进展,以期为GRF蛋白的进一步研究和利用提供一些有益的启发。 展开更多
关键词 生长调控因子(GRF) 功能 生长发育
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