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GRAMD1C和核受体亚家族3C组成员2作为溃疡性结肠炎生物学标志物的相关研究
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作者 郝小夏 师伟 陈利荣 《中国药物与临床》 2026年第5期314-322,共9页
目的 通过生物信息学分析方法寻找溃疡性结肠炎(UC)潜在的血液生物学标志物,为临床对UC的早期诊断和病情监测提供实验室支持,同时为探索UC发病机制提供新的思路和研究方向。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载GSE87473和GSE94648两... 目的 通过生物信息学分析方法寻找溃疡性结肠炎(UC)潜在的血液生物学标志物,为临床对UC的早期诊断和病情监测提供实验室支持,同时为探索UC发病机制提供新的思路和研究方向。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载GSE87473和GSE94648两个数据集,分别在这2个数据集的UC组和健康对照(HC)组间通过R语言进行差异表达分析,筛选出差异基因(DEGs),以结肠组织和血液中共有的下调DEGs作为核心基因。以核心基因表达量中位数把GSE87473的UC组样本分为高表达组和低表达组,进行免疫浸润细胞和免疫检查点(ICB)的分组比较。通过外部验证数据集GSE66407和GSE126124对核心基因进行验证并通过动物实验进一步证实。结果 GSE87473筛选出DEGs共974个,其中上调基因563个,下调基因411个;GSE94648筛选出DEGs共有215个,其中上调基因144个,下调基因71个。这2个数据集共有上调DEGs 22个;共有下调DEGs 2个分别是GRAMD1C和核受体亚家族3C组成员2(NR3C2)。以GRAMD1C表达量中位数(6.308)将UC组样本分为高表达组和低表达组,调节性T细胞和中性粒细胞在低表达组浸润比例高于高表达组,差异具有统计学意义(P<0.05)。ICB分析结果显示与高表达组相比,低表达组CD274和PDCD1LG2表达量上调(P<0.05)。以NR3C2表达量中位数(9.330)将UC组样本分为高表达组和低表达组,调节性T细胞和中性粒细胞在低表达组浸润比例高于高表达组,差异具有统计学意义(P<0.05)。ICB分析结果显示与高表达组相比,低表达组CD274和PDCD1LG2表达量上调(P<0.05)。外部验证数据集GSE66407和GSE126124进一步证实在UC组样本中GRAMD1C和NR3C2表达量比HC组低(P<0.05)。在UC组小鼠模型结肠组织中Gramd1c和Nr3c2表达量比HC组低(P<0.05),在UC组小鼠血液中Nr3c2表达量比HC组低(P<0.05),但是Gramd1c表达量和HC组差异无统计学意义(P>0.05)。结论 NR3C2在UC结肠组织和血液中均表达下调,推测NR3C2是UC潜在血液生物学标志物,对UC病情判断、疗效观察和预后评估有一定的临床价值。GRAMD1C在UC结肠组织中表达下调,将UC发病机制与自噬缺陷联系起来,下调GRAMD1C提高自噬,可能是机体的一种自我保护机制,以减轻肠道炎症反应。 展开更多
关键词 结肠炎 溃疡性 生物标志物 计算生物学 gramd1c NR3C2
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