番茄GPATs基因家族鉴定与低温胁迫下的表达分析

1

作者 孟情缘 王忠宇 +2 位作者 王锦涛 余庆辉 李宁 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第9期2126-2137,共12页

【目的】鉴定番茄GPATs基因家族成员,分析基因表达模式,为番茄GPATs基因的各个成员功能研究提供依据。【方法】通过生物信息分析,在番茄中鉴定出15个SlGPAT成员,开展理化性质、基因结构、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析,并使用q... 【目的】鉴定番茄GPATs基因家族成员,分析基因表达模式,为番茄GPATs基因的各个成员功能研究提供依据。【方法】通过生物信息分析,在番茄中鉴定出15个SlGPAT成员,开展理化性质、基因结构、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析,并使用qPCR对SlGPAT基因在低温胁迫的表达模式进行分析。【结果】番茄SlGPAT基因不均匀分布在10条染色体上,且大多数为碱性蛋白,定位在质体中。系统进化关系揭示番茄GPATs基因可以分为3个聚类,相同保守结构域基因具有相似的基因结构;共线性分析发现SlGPAT基因家族存在基因复制现象,表明在进化过程中GPAT基因可能通过复制进行家族成员扩增;顺式作用元件分析发现SlGPATs基因中含有光反应、植物激素和非生物逆境胁迫相关顺式作用元件。qPCR分析发现SlGPAT基因家族在低温胁迫下半数基因表达上调,其中SlGPAT12在24 h时表达量达到最大值,是0 h的32倍。【结论】本研究为番茄GPAT基因功能的研究提供参考,也为番茄脂肪酸遗传改良提供重要候选基因。 展开更多

关键词 番茄 gpats基因家族 生物信息学 表达分析 低温胁迫

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甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPATs)的研究进展 被引量：6

2

作者 田增有 李开济 +1 位作者 门秀丽 吴静 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期103-107,共5页

甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferases,GPATs)催化甘油三酯和甘油磷脂合成的第一步反应。目前在哺乳动物已发现四种亚型GPAT1-4,其中GPAT1和GPAT2定位于线粒体外膜,而GPAT3和GPAT4定位于内质网。GPATs在调节细... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferases,GPATs)催化甘油三酯和甘油磷脂合成的第一步反应。目前在哺乳动物已发现四种亚型GPAT1-4,其中GPAT1和GPAT2定位于线粒体外膜,而GPAT3和GPAT4定位于内质网。GPATs在调节细胞甘油三酯和磷脂含量中起着重要的作用。基因过表达和敲除实验证实GPATs在肝脏脂肪变性、胰岛素抵抗和肥胖的发生发展过程中起着重要作用,并且部分亚型影响泌乳、精子发生等过程。本文将就GPATs各亚型的功能特点进行综述。 展开更多

关键词 甘油-3-磷酸酰基转移酶 gpats 甘油三酯合成

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植物GPATs基因研究进展 被引量：17

3

作者 刘聪 肖旦望 +4 位作者 施春霖 胡学芳 邬克彬 官春云 熊兴华 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1352-1359,共8页

甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油(Triacylglycerol,TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤。GPATs主要负责将脂肪酰基从酰基-酰基载体蛋白(acyl-ACP)或酰基辅酶A(acyl-CoA)上转... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油(Triacylglycerol,TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤。GPATs主要负责将脂肪酰基从酰基-酰基载体蛋白(acyl-ACP)或酰基辅酶A(acyl-CoA)上转移到甘油-3-磷酸的(Glycerol-3-phosphate,G3P)sn-1位置上。有些成员还具有sn-2酰基转移活性。目前已经在多种植物中克隆得到了GPAT基因。这些GPAT基因编码的酶主要分为三类,它们在细胞中分别定位于质体、线粒体和内质网上。这些酶参与三酰甘油、几丁质和软木脂等多种脂质的生物合成,在植物的生长发育中发挥着非常重要的作用。文章介绍了植物GPAT基因的染色体定位和基因结构以及GPAT酶的亚细胞定位、sn-2酰基转移特异性、GPAT酶的底物选择性及其生理功能的最新研究进展。 展开更多

关键词 GPAT基因 底物选择性 sn-2特异性 GPAT功能

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基于网络药理学和实验验证探讨补阳还五汤对治疗非酒精性脂肪肝的作用机制

4

作者 杨金彪 周云越 +4 位作者 陈星彤 杨蕊红 王乔 薛爽 牛雯颖 《中国药理学通报》 北大核心 2026年第2期357-365,共9页

目的基于网络药理学筛选,并采用细胞实验验证补阳还五汤(Buyang Huanwu decoction,BYHWD)对非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)治疗的作用机制。方法通过网络药理学相关数据库获取BYHWD治疗NAFLD的活性成分、潜... 目的基于网络药理学筛选,并采用细胞实验验证补阳还五汤(Buyang Huanwu decoction,BYHWD)对非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)治疗的作用机制。方法通过网络药理学相关数据库获取BYHWD治疗NAFLD的活性成分、潜在靶点,构建“药物-成分-靶点”关系网络图,对交集基因进行GO和KEGG富集分析;体外培养L02细胞,采用油酸(oleic acid,OA)诱导L02细胞建立NAFLD模型。采用CCK-8分析不同浓度DMSO、OA和BYHWD对L02细胞活性的影响;用甘油三酯试剂盒检测细胞内TG含量;采用油红O染色观察细胞内脂质积累;用生化法试剂盒检测BYHWD对OA诱导的L02细胞脂质含量和氧化应激损伤的作用;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法和蛋白免疫印迹(Western blot)法检测AMPK和SREBP-1c、GPAT mRNA及蛋白水平变化。结果筛选出BYHWD活性成分111个,涉及靶点2264个,与NAFLD交集靶点531个,KEGG分析结果显示,BYHWD治疗NAFLD主要富集在lipid and atherosclerosis、AMPK、insulin resistance等信号通路。细胞结果表明,BYHWD能够明显降低TG、MDA的含量、抑制AST的活性并增强SOD的活性,促进AMPK基因和蛋白的表达,抑制SREBP-1c和GPAT基因和蛋白的表达。结论BYHWD可能通过调节AMPK和SREBP-1c、GPAT信号通路,减少脂质合成和堆积,改善氧化应激损伤,从而治疗NAFLD。 展开更多

关键词 非酒精性脂肪肝 AMPK SREBP-1C GPAT 补阳还五汤 网络药理学

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补阳还五汤及其有效部位改善非酒精性脂肪性肝病的作用及机制研究

5

作者 杨金彪 陈星彤 +5 位作者 周云越 杨蕊红 王乔 薛爽 张玉昆 牛雯颖 《中国药房》 北大核心 2026年第3期299-304,共6页

目的 研究补阳还五汤(BYHWD)及其有效部位改善非酒精性脂肪性肝病的作用及机制。方法 制备BYHWD及其醇沉、30%乙醇、50%乙醇、75%乙醇有效部位(即CC、30YC、50YC、75YC有效部位),以此灌胃大鼠并制备相应含药血清(同法制备空白血清和辛... 目的 研究补阳还五汤(BYHWD)及其有效部位改善非酒精性脂肪性肝病的作用及机制。方法 制备BYHWD及其醇沉、30%乙醇、50%乙醇、75%乙醇有效部位(即CC、30YC、50YC、75YC有效部位),以此灌胃大鼠并制备相应含药血清(同法制备空白血清和辛伐他汀含药血清)。将人L02肝细胞分为对照组、模型组、辛伐他汀含药血清组、BYHWD含药血清组、CC含药血清组、30YC含药血清组、50YC含药血清组、75YC含药血清组。除对照组外,其余各组均加入0.2 mol/L油酸诱导24 h,以建立脂质沉积模型,再加入相应20%含药血清/空白血清干预24 h。观察细胞中脂质沉积情况,并计算脂滴面积占比;检测细胞中甘油三酯(TG)及氧化应激[丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)]、肝功能[丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)]指标水平;检测细胞中AMP活化的蛋白质激酶(AMPK)/固醇调节元件结合蛋白1(SREBP-1)/甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)信号通路相关蛋白及mRNA表达水平。结果 与对照组比较,模型组细胞脂肪变性严重,细胞中脂滴面积占比以及TG、ALT、AST、MDA水平和SREBP-1、GPAT mRNA及其蛋白表达水平均显著升高(P<0.05),细胞中SOD水平、AMPK mRNA表达水平和AMPK蛋白磷酸化水平均显著降低(P<0.05)。与模型组比较,各含药血清组细胞脂肪变性均减轻,上述大部分定量指标水平均被显著逆转(P<0.05)。结论 BYHWD及其有效部位可通过调控AMPK/SREBP-1/GPAT信号通路,抑制氧化应激反应,减轻脂质沉积,从而发挥改善非酒精性脂肪性肝病的作用。 展开更多

关键词 补阳还五汤 非酒精性脂肪性肝病 脂质沉积 AMPK/SREBP-1/GPAT信号通路 氧化应激

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小麦GPAT家族全基因组鉴定及表达分析

6

作者 师毅君 王康君 +6 位作者 郭明明 张广旭 谭一罗 李晓峰 何茂盛 徐大勇 樊继伟 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期253-261,共9页

甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphateacyltransferase,GPAT)在植物生长发育和逆境反应中发挥重要作用,是催化甘油三酯合成的关键酶。对小麦的GPAT基因进行家族鉴定,并对其基因结构、理化性质、保守基序、顺式启动元件等进行分... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphateacyltransferase,GPAT)在植物生长发育和逆境反应中发挥重要作用,是催化甘油三酯合成的关键酶。对小麦的GPAT基因进行家族鉴定,并对其基因结构、理化性质、保守基序、顺式启动元件等进行分析。结果显示,共在小麦中鉴定出65个GPAT家族成员,其中在1、3号染色体上分布较多,其余染色体上分布较少。理化性质分析结果表明,GPAT成员的氨基酸长度为364 aa(TaGPAT3)~581(TaGPAT45)aa,分子量为40.17 ku(TaGPAT1)~64.11(TaGPAT45)ku,等电点为6.19(TaGPAT11)~9.60(TaGPAT26)。TaGPAT蛋白可以分为3个亚家族,其中GroupⅠ和GroupⅡ成员具有7~13个内含子,GroupⅢ成员具有0~4个内含子。通过进行表达模式分析发现,大多数TaGPAT基因在小麦组织和逆境胁迫下表达量较低,值得关注的是,TaGPAT5在不同植物组织中以及冷和干旱胁迫下表达量均较高。以上结果可为小麦基因功能的研究提供参考,也对拓宽小麦的遗传基础具有重要的理论和应用意义。 展开更多

关键词 小麦 GPAT基因家族 生物信息 表达模式分析

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芍药属牡丹组(Paeonia sect.Moutan)种间关系的分子证据:GPAT基因的PCR-RFLP和序列分析 被引量：35

7

作者 赵宣 周志钦 +2 位作者 林启冰 潘开玉 洪德元 《植物分类学报》 CSCD 北大核心 2004年第3期236-244,共9页

为了探讨芍药属牡丹组Paeoniasect.Moutan的种间关系 ,对采自 1 5个野生居群 ,代表牡丹组全部 8个野生种的 1 5份材料的GPAT基因片段 (外显子 5和 6之间 2kb的内含子 )进行了PCR_RFLP分析 ,并对代表牡丹组全部 8个野生种的 9份材料进行... 为了探讨芍药属牡丹组Paeoniasect.Moutan的种间关系 ,对采自 1 5个野生居群 ,代表牡丹组全部 8个野生种的 1 5份材料的GPAT基因片段 (外显子 5和 6之间 2kb的内含子 )进行了PCR_RFLP分析 ,并对代表牡丹组全部 8个野生种的 9份材料进行了测序。根据 1 2个限制性内切酶的PCR_RFLP数据 ,使用Network 3 .0计算机程序的RM (reduced_median)法建立了牡丹组种间亲缘关系网络树。同时根据 8个种 9份材料的GPAT基因片段序列 ,利用PAUP 4.0计算机程序建立了牡丹组GPAT基因的最大简约(MP)树和邻接 (NJ)树。结果获得了具有很高自展值支持、分辨良好的牡丹组种间关系 (GPAT基因 )树。最重要的是 ,该基因树所显示的牡丹组种间关系与根据形态学证据提出的牡丹组的种间关系基本吻合 ,并得到其他研究证据的支持。根据这一结果 ,对牡丹组的种间关系进行了详细的讨论。 展开更多

关键词 芍药属 牡丹组 野生居群 种间关系 GPAT基因 PCR-RFLP 序列分析

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冷胁迫下王百合GPAT基因保守区克隆及表达分析 被引量：10

8

作者 陈丽静 孙春玉 +3 位作者 钟鸣 阮燕晔 明军 雷家军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1726-1731,共6页

以王百合为试验材料,通过同源克隆和巢式PCR方法从4℃低温诱导的王百合试管苗中分离得到了王百合GPAT基因的保守区序列,采用DNAman软件和BLASTN对该序列进行分析并分别从蛋白和基因角度分析了GPAT基因在4℃冷诱导情况下的表达情况.结果... 以王百合为试验材料,通过同源克隆和巢式PCR方法从4℃低温诱导的王百合试管苗中分离得到了王百合GPAT基因的保守区序列,采用DNAman软件和BLASTN对该序列进行分析并分别从蛋白和基因角度分析了GPAT基因在4℃冷诱导情况下的表达情况.结果显示:(1)该保守区长744 bp,推测其编码247个氨基酸,氨基酸序列存在1个高度保守的区域(WIAPSGGRDRP),经过Blast比对分析发现,该保守区序列为LPLAT基因超级家族酶类的催化活性区,此家族多为催化酰基辅酶A(acylCoAs)或者酰基载体蛋白(acylACPs)中的酰基与受体蛋白结合的酰基转移酶类.(2)冷诱导促进GPAT基因的表达,随冷诱导时间延长,基因表达量不断增大,诱导4 h有大量表达,16 h表达量达到最高,16 h之后表达量随着冷诱导时间的延长逐渐下降,72 h时的表达量与0 h处理时基本一致.研究表明,GPAT在百合抵抗冷胁迫的过程中具有重要的作用. 展开更多

关键词 王百合 冷诱导 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT) 简并引物 保守区 同源性

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小桐子甘油-3-磷酸酰基转移酶(JcGPAT)cDNA的克隆与序列分析 被引量：13

9

作者 张楠 徐荣华 +1 位作者 刘小烛 刘爱忠 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期181-188,共8页

甘油-3-磷酸酰基转移酶是植物生物合成储存油脂过程中的关键酶,对油料作物种子含油量具有重要的限制作用。本研究以植物甘油-3-磷酸酰基转移酶同源基因的保守区域序列为基础,设计简并引物,结合RACE技术,从能源植物小桐子种子中克隆获得J... 甘油-3-磷酸酰基转移酶是植物生物合成储存油脂过程中的关键酶,对油料作物种子含油量具有重要的限制作用。本研究以植物甘油-3-磷酸酰基转移酶同源基因的保守区域序列为基础,设计简并引物,结合RACE技术,从能源植物小桐子种子中克隆获得JcGPAT基因的cDNA全长序列(GenBank登录号HQ395225)。JcGPAT cDNA核苷酸序列长度为1672bp,开放阅读框为1125bp,编码375个氨基酸。该基因具有明显的GPAT基因结构域,其编码的氨基酸序列与油桐、蓖麻等植物具有很高的同源性。RT-PCR表达分析表明,该基因在小桐子发育的种子、叶、根尖等多个组织表达。 展开更多

关键词 小桐子 GPAT 简并引物 基因克隆 表达分析

原文传递

冷诱导下毛百合甘油-3-磷酸酰基转移酶活性变化及其基因保守区的克隆 被引量：8

10

作者 陈丽静 葛菱 +5 位作者 李浩戈 郭志富 张丽 党晓璇 陶承光 李天来 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2011年第5期34-39,共6页

探讨了野生毛百合甘油-3-磷酸酰基转移酶活性在冷胁迫下的变化,用简并引物扩增了甘油-3-磷酸酰基转移酶基因保守区序列的结果表明,该保守区段长744 bp,推测编码247个氨基酸。在GPAT氨基酸序列中存在1个高度保守的区域(WIAPSGGRDRP),在N... 探讨了野生毛百合甘油-3-磷酸酰基转移酶活性在冷胁迫下的变化,用简并引物扩增了甘油-3-磷酸酰基转移酶基因保守区序列的结果表明,该保守区段长744 bp,推测编码247个氨基酸。在GPAT氨基酸序列中存在1个高度保守的区域(WIAPSGGRDRP),在NCBI上经过BLASTp比对分析,发现这段保守区序列为LPLAT基因超级家族酶类的催化活性区,此家族多为催化酰基辅酶A(acylCoAs)或者酰基载体蛋白(acylACPs)中的酰基与受体蛋白结合的酰基转移酶类。此序列Genbank登录号为HQ654523。 展开更多

关键词 毛百合 冷诱导 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT) 简并引物 保守区 同源性

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GPAT/AIRC基因对白耳鸡群体肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析 被引量：5

11

作者 张学余 束婧婷 +1 位作者 韩威 陈国宏 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期557-561,共5页

以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测。结果各发现了一个单核苷酸多态性位点。各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明:GPAT基因外显子2中AA型个体的肌... 以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测。结果各发现了一个单核苷酸多态性位点。各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明:GPAT基因外显子2中AA型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于AB型和BB型个体,AB型个体也稍高于BB型,但差异不显著;AIRC基因外显子8中CG型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于GG型和CC型个体,GG型个体的胸肌肌苷酸含量也显著地高于CC型。两个基因的单倍型对IMP含量也有显著的影响:单倍型为AACG的个体比单倍型为BBCC的个体高1.006 mg/g,单倍型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用该单倍型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。 展开更多

关键词 GPAT基因 AIRC基因 单核苷酸多态性 肌苷酸 单倍型 白耳鸡

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百合甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因密码子偏性分析及其表达受体选择 被引量：6

12

作者 冯慧颖 梁云 +5 位作者 徐雷锋 袁迎迎 袁素霞 刘春 明军 陈丽静 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期127-137,共11页

本研究运用CodonW和Emboss中的CHIPS、CUSP软件程序对铁炮百合(Lilium longiflorum)、亚洲百合杂种系品种(Lilium‘Excite’)、王百合(Lilium regale)和毛百合(Lilium pensylvanicum)这4种百合GPAT基因(GenBank登录号分别为:JX524738,JX... 本研究运用CodonW和Emboss中的CHIPS、CUSP软件程序对铁炮百合(Lilium longiflorum)、亚洲百合杂种系品种(Lilium‘Excite’)、王百合(Lilium regale)和毛百合(Lilium pensylvanicum)这4种百合GPAT基因(GenBank登录号分别为:JX524738,JX524739,JX524740和JX524741)密码子进行偏好性分析,分别与5种单子叶和6种双子叶植物的GPAT基因密码子偏好性进行比较与系统进化分析,又与4种常用模式生物基因组密码子的偏好性进行比较分析。结果表明,4种百合GPAT基因密码子偏性均较弱,基因表达水平较低,偏好于以A/T结尾的密码子;偏好密码子基本相同。在一定程度上表明,百合的GPAT基因在属间进化中比较保守。并且发现,GPAT密码子偏好性在单、双子叶植物上体现的差异并不显著,从一定程度上表明GPAT基因在进化上的保守性较高。百合GPAT基因密码子偏性与几种双子叶植物的更相近,某些双子叶植物也是该基因的适宜导入受体。在系统进化分析中,基于相对同义密码子使用度(RSCU)的聚类结果与基于CDS构成的聚类结果存在一定的差异,但均可在一定程度上反映物种间的进化关系。与4种模式生物密码子使用频率比较发现,4种百合与受体生物的差异情况比较一致,百合GPAT的密码子偏好性与受体生物酵母和大肠杆菌的基因组密码子偏好性均有较大的不同,表明需要对百合GPAT基因的部分密码子进行优化改造,才能使其在以上受体中高效的表达。百合GPAT与拟南芥基因组密码子使用频率差值较少,表明百合GPAT在拟南芥受体中的表达效率较高;而百合GPAT在烟草受体中的表达效率一般。对于转化植物的选择,拟南芥优于烟草。为准确预测百合GPAT基因的异源表达,为接下来选择其适宜的表达系统以及提高该基因在受体表达系统中的表达效率,进行有效的功能验证提供了有效的参考。 展开更多

关键词 百合 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因 密码子偏性 系统进化关系 转化受体选择

原文传递

GPAT基因表达载体的构建及对非洲菊的遗传转化 被引量：5

13

作者 尹梅 程在全 +2 位作者 夏小环 张伟媚 陈善娜 《西南农业学报》 CSCD 2007年第1期91-94,共4页

运用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT和QS115质粒中的诱导型启动子串联后,插入带有终止子PinⅡ的表达载体pCAMBIA1300质粒中。并用PCR和酶切等多种方法进行鉴定。构建后的载体经PCR和酶切鉴定... 运用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT和QS115质粒中的诱导型启动子串联后,插入带有终止子PinⅡ的表达载体pCAMBIA1300质粒中。并用PCR和酶切等多种方法进行鉴定。构建后的载体经PCR和酶切鉴定表明目的基因和启动子均已按预计方式插入载体的指定位置。用农杆菌介导的方法将它们转化到非洲菊中,获得了潮霉素的抗性植株,并通过PCR扩增验证,有抗性苗含有这个抗冷基因。 展开更多

关键词 甘油-3-磷酸转豌酶(GPAT)基因 诱导型启动子 构建 转化 非洲菊

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水稻中编码甘油-3-磷酸转酰酶部分cDNA的克隆及序列分析 被引量：4

14

作者 刘继梅 陈善娜 +2 位作者 鄢波 黄兴奇 杨明挚 《云南植物研究》 CSCD 1998年第3期339-342,共4页

参照国外报道的几种双子叶植物的甘油－３－磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列，设计并合成一对简并引物，提取抗冷性强的水稻品种“丽梗２号”的ＲＮＡ，采用ＲＴ－ＰＣＲ技术，扩增出了３１５ｂｐ的一段ｃＤＮＡ片段。扩增产物经纯化... 参照国外报道的几种双子叶植物的甘油－３－磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列，设计并合成一对简并引物，提取抗冷性强的水稻品种“丽梗２号”的ＲＮＡ，采用ＲＴ－ＰＣＲ技术，扩增出了３１５ｂｐ的一段ｃＤＮＡ片段。扩增产物经纯化后直接克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体系统中，经ＰＣＲ法鉴定，所得的重组质粒中含有３１５ｂｐ的片段。证明已克隆到水稻甘油－３－磷酸转酰酶部分ｃＤＮＡ。采用双链双脱氧法定序分析，表明所克隆的该段ｃＤＮＡ序列与国外所报道的双子叶植物的该段ｃＤＮＡ的核苷酸序列及氨基酸序列的同源性均达到７０％以上，提示了该基因在进化上具有一定的保守性。 展开更多

关键词 GPAT PCR 基因克隆 水稻 CDNA 克隆 序列分析

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柑橘类植物GPAT基因片段克隆和SNP分析 被引量：7

15

作者 吴波 刘勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期51-56,共6页

甘油-3-磷酸酰基转移酶基因是与植物抗冷性强弱密切相关的基因。根据已报道的各种植物GPAT基因的氨基酸序列上前后两个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从琯溪蜜柚、马家柚、莽山野橘等8种柑橘类植物中克隆得到315bp的GPAT基... 甘油-3-磷酸酰基转移酶基因是与植物抗冷性强弱密切相关的基因。根据已报道的各种植物GPAT基因的氨基酸序列上前后两个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从琯溪蜜柚、马家柚、莽山野橘等8种柑橘类植物中克隆得到315bp的GPAT基因片段。使用DNA Star5.0软件对8个片段序列进行同源性比较,8个片段的核苷酸同源性高达97.8%,与其它植物GPAT基因核苷酸序列的同源性都在72.5%以上;经过氨基酸序列推导,每个GPAT基因片段分别编码105个氨基酸,8个片段的氨基酸同源性为95.2%,与其它植物GPAT基因的氨基酸序列同源性在68.9%以上。试验克隆所得8种柑橘类植物GPAT基因片段序列存在明显的单核苷酸变异,在14个核苷酸位点存在SNPs(single nucleotide polymorphisms),导致6个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/22.5bp,核苷酸变异度为4.45%,氨基酸变异度为5.71%。采用NJ聚类法对克隆片段的核苷酸序列进行了遗传多样性分析。 展开更多

关键词 柑橘类植物 GPAT 基因克隆 SNP 序列分析

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岷江百合LiGPAT基因的克隆及生物信息学分析 被引量：4

16

作者 陈丽静 颜楠楠 +4 位作者 尹元元 张丽 钟鸣 马慧 李天来 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2984-2993,共10页

为探索百合的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,本试验选取了抗寒能力极强的岷江百合(Lilium regale)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF区序列,全长1 212 bp,编码403个氨基酸,分子量约为45.4 k D,Gen Bank登录号为JX... 为探索百合的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,本试验选取了抗寒能力极强的岷江百合(Lilium regale)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF区序列,全长1 212 bp,编码403个氨基酸,分子量约为45.4 k D,Gen Bank登录号为JX524740。通过同源序列比对发现,Li GPAT基因编码的氨基酸与单子叶植物油棕GPAT基因编码的氨基酸的一致性最高,达到67.17%。利用在线软件SMART进行分析,表明Li GPAT氨基酸在169~315序列存在一个Pls C结构域,这就说明Li GPAT蛋白属于酰基转移酶家族成员,且所有的活性位点都位于这个区域,具有酰基转移酶的活性。通过在线软件TMHMM Server 2.0预测分析揭示Li GPAT氨基酸序列不存在跨膜区域,可能是一个可溶性蛋白。利用在线软件Plant-m PLoc预测表明,Li GPAT蛋白质的亚细胞定位为叶绿体。 展开更多

关键词 岷江百合 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT) 聚合酶链式反应 生物信息学分析

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七种不同抗冷性植物甘油-3-磷酸转酰酶m RNA二级结构研究 被引量：4

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作者 柳维波 曹槐 +1 位作者 刘世熙 刘次全 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2002年第4期463-470,共8页

对南瓜、豌豆、黄瓜、拟南芥菜、红花、菠菜、黑子南瓜等 7种不同抗冷性植物甘油- 3-磷酸酰基转移酶的mRNA序列作了三核苷酸碱基模式分析 ,并用Zuker方法对其mRNA序列的翻译区进行了二级结构分析 ,统计出发夹、内环、膨胀环、三分支环... 对南瓜、豌豆、黄瓜、拟南芥菜、红花、菠菜、黑子南瓜等 7种不同抗冷性植物甘油- 3-磷酸酰基转移酶的mRNA序列作了三核苷酸碱基模式分析 ,并用Zuker方法对其mRNA序列的翻译区进行了二级结构分析 ,统计出发夹、内环、膨胀环、三分支环、四分支环等二级结构的基本结构单元数 ,通过对编码脯氨酸的密码子在mRNA二级结构中的分布位置的研究 ,发现这些密码子主要是分布在茎的末端、环的根部、膨胀环或分支环上 ,占到了序列中所有编码脯氨酸的密码子总数的 6 9%到 97%的比例 ,这与我们在研究其他物种的mRNA二级结构时的发现是一致的。 展开更多

关键词 抗冷性植物 甘油-3-磷酸转酰酶 MRNA 二级结构 GPAT酶 脯氨酸

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新干特早柚GPAT基因5’端克隆及序列分析 被引量：4

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作者 吴波 刘勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期915-918,共4页

采用5’-RACE技术从新干特早柚(Citrus grandiscv.Xingantezaoyou)叶片中克隆出一条长832 bp的GPAT基因5’端cDNA片段(GenBank登录号:DQ193970)。序列分析结果表明:该cDNA片段序列与其它科属植物的GPAT基因序列的同源性差异较大,除与同... 采用5’-RACE技术从新干特早柚(Citrus grandiscv.Xingantezaoyou)叶片中克隆出一条长832 bp的GPAT基因5’端cDNA片段(GenBank登录号:DQ193970)。序列分析结果表明:该cDNA片段序列与其它科属植物的GPAT基因序列的同源性差异较大,除与同类植物——温州蜜柑(Citrus unshiu)的同源性高达98.9%,与红花(Carthamus tinctorius)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、非洲油棕榈(Elaeis guineensis)、豌豆(Pisum sati-vum)、蚕豆(Vicia faba)的同源性分别为62.5%、54.6%、48.2%、47.4%、46.9%;其所编码的氨基酸序列与红花、拟南芥、非洲油棕榈、豌豆、辣椒的同源性分别为51.6%、60%、45.1%、48%、52.3%,与细菌(Bacillusamyloliquefaciens)的同源性仅为18.9%,说明GPAT基因的氨基酸序列具有种属特异性。 展开更多

关键词 新干特早柚 GPAT RACE 基因克隆 序列分析

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用保守氨基酸区段序列分离克隆几种云南高原作物GPAT基因cDNA片段 被引量：1

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作者 杨明挚 陈善娜 +4 位作者 刘继梅 谭德勇 鄢波 黄兴奇 陈莉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期39-40,共2页

用分子生物学技术分别成功地从南瓜及黑子南瓜、水稻、油菜中得到了ＧＰＡＴ基因ｃＤＮＡ片段中约３１５ｂｐ的片段，并用Ｔ４连接酶分别克隆到了ｐＧＥＭＴ载体系统上。这一片段在不同科的植物中其片段大小并无差别，但限制性酶切表明... 用分子生物学技术分别成功地从南瓜及黑子南瓜、水稻、油菜中得到了ＧＰＡＴ基因ｃＤＮＡ片段中约３１５ｂｐ的片段，并用Ｔ４连接酶分别克隆到了ｐＧＥＭＴ载体系统上。这一片段在不同科的植物中其片段大小并无差别，但限制性酶切表明其内部序列确实存在有差异。从南瓜中得到的ＧＰＡＴｃＤＮＡ部分片段经ＨｉｎｄⅢ酶切，得到了一个约１００多ｂｐ和一个约２００ｂｐ的片段，与前人所发表的南瓜ＧＰＡＴｃＤＮＡ序列（在该片段的１１１ｂｐ处有一个ｈｉｎｄⅢ的酶切位点）相符。 展开更多

关键词 南瓜 水稻 油菜 GPAT基因 CDNA片段

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肌苷酸合成酶系3个基因对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的遗传效应 被引量：1

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作者 张学余 束婧婷 +1 位作者 韩威 陈国宏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1440-1446,共7页

GPAT、AIRC和PURH基因作为肌苷酸合成过程中的酶系基因,它们对鸡肌肉肌苷酸含量均具有显著的效应。为了进一步验证这3个基因对肌苷酸含量的遗传效应,本研究以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP和测序相结合的方法,分析了这3个基因的单基因... GPAT、AIRC和PURH基因作为肌苷酸合成过程中的酶系基因,它们对鸡肌肉肌苷酸含量均具有显著的效应。为了进一步验证这3个基因对肌苷酸含量的遗传效应,本研究以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP和测序相结合的方法,分析了这3个基因的单基因以及合并基因型对鸡胸肌肌苷酸含量的影响。结果表明:GPAT、AIRC和PURH基因均对白耳鸡胸肌肌苷酸含量的差异产生影响,均与鸡肌肉IMP含量存在显著关联(P<0.05),这3个位点可作为影响鸡肌肉肌苷酸含量的分子标记;合并基因型的遗传效应要高于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用合并基因型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。 展开更多

关键词 GPAT基因 AIRC基因 PURH基因 肌苷酸含量 合并基因型 鸡

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