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水母雪兔子GPAT家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 胡国瑾 曾思恒 +3 位作者 杜明阳 多杰措 熊辉岩 段瑞君 《广西植物》 北大核心 2026年第1期123-136,共14页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)在植物生长发育和适应逆境胁迫过程中具有重要作用,为探究GPAT基因家族成员对高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)适应高山极端生境时发挥的作用,该研究采用HMM和BLASTp方法对SmGPAT基因家族成员进行全基... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)在植物生长发育和适应逆境胁迫过程中具有重要作用,为探究GPAT基因家族成员对高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)适应高山极端生境时发挥的作用,该研究采用HMM和BLASTp方法对SmGPAT基因家族成员进行全基因组鉴定,对家族成员的理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序和顺式作用元件进行分析,并基于转录组数据和qRT-PCR技术分析SmGPAT家族成员的组织表达模式。结果表明:(1)共鉴定出15个SmGPAT家族成员,随机分布在10条染色体上,分别编码357~566个氨基酸,蛋白质相对分子质量为40.16~63.86 kD,等电点为5.93~10.02,亲脂系数为79.56~104.60,亚细胞定位预测位于线粒体或内质网(除SmGPAT7以外)。(2)系统进化分析发现,SmGPAT家族分为3个亚族(Group 1-Group 3),各亚族的基因结构和保守基序相似。SmGPAT家族蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,各亚族蛋白质三级结构模型相似。(3)顺式作用元件预测分析结果显示,SmGPAT家族含有大量逆境胁迫响应、激素响应和光响应相关的元件。(4)不同组织转录组数据分析结果表明,SmGPAT家族成员在叶和花中的表达量较茎和根高,并且qRT-PCR结果与转录组结果基本一致。综上认为,水母雪兔子中鉴定出的15个SmGPAT家族成员在不同组织间的表达模式存在差异,其中在花和叶中表达量较高,推测其在水母雪兔子叶和花发育过程中发挥重要作用,该研究为进一步开展SmGPAT基因在适应高山极端环境过程中的功能研究提供理论基础。 展开更多
关键词 水母雪兔子 甘油-3-磷酸酰基转移酶 基因家族 生物信息学分析 组织特异性表达
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小麦GPAT家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 师毅君 王康君 +6 位作者 郭明明 张广旭 谭一罗 李晓峰 何茂盛 徐大勇 樊继伟 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期253-261,共9页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphateacyltransferase,GPAT)在植物生长发育和逆境反应中发挥重要作用,是催化甘油三酯合成的关键酶。对小麦的GPAT基因进行家族鉴定,并对其基因结构、理化性质、保守基序、顺式启动元件等进行分... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphateacyltransferase,GPAT)在植物生长发育和逆境反应中发挥重要作用,是催化甘油三酯合成的关键酶。对小麦的GPAT基因进行家族鉴定,并对其基因结构、理化性质、保守基序、顺式启动元件等进行分析。结果显示,共在小麦中鉴定出65个GPAT家族成员,其中在1、3号染色体上分布较多,其余染色体上分布较少。理化性质分析结果表明,GPAT成员的氨基酸长度为364 aa(TaGPAT3)~581(TaGPAT45)aa,分子量为40.17 ku(TaGPAT1)~64.11(TaGPAT45)ku,等电点为6.19(TaGPAT11)~9.60(TaGPAT26)。TaGPAT蛋白可以分为3个亚家族,其中GroupⅠ和GroupⅡ成员具有7~13个内含子,GroupⅢ成员具有0~4个内含子。通过进行表达模式分析发现,大多数TaGPAT基因在小麦组织和逆境胁迫下表达量较低,值得关注的是,TaGPAT5在不同植物组织中以及冷和干旱胁迫下表达量均较高。以上结果可为小麦基因功能的研究提供参考,也对拓宽小麦的遗传基础具有重要的理论和应用意义。 展开更多
关键词 小麦 gpat基因家族 生物信息 表达模式分析
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番茄GPATs基因家族鉴定与低温胁迫下的表达分析
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作者 孟情缘 王忠宇 +2 位作者 王锦涛 余庆辉 李宁 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第9期2126-2137,共12页
【目的】鉴定番茄GPATs基因家族成员,分析基因表达模式,为番茄GPATs基因的各个成员功能研究提供依据。【方法】通过生物信息分析,在番茄中鉴定出15个SlGPAT成员,开展理化性质、基因结构、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析,并使用q... 【目的】鉴定番茄GPATs基因家族成员,分析基因表达模式,为番茄GPATs基因的各个成员功能研究提供依据。【方法】通过生物信息分析,在番茄中鉴定出15个SlGPAT成员,开展理化性质、基因结构、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析,并使用qPCR对SlGPAT基因在低温胁迫的表达模式进行分析。【结果】番茄SlGPAT基因不均匀分布在10条染色体上,且大多数为碱性蛋白,定位在质体中。系统进化关系揭示番茄GPATs基因可以分为3个聚类,相同保守结构域基因具有相似的基因结构;共线性分析发现SlGPAT基因家族存在基因复制现象,表明在进化过程中GPAT基因可能通过复制进行家族成员扩增;顺式作用元件分析发现SlGPATs基因中含有光反应、植物激素和非生物逆境胁迫相关顺式作用元件。qPCR分析发现SlGPAT基因家族在低温胁迫下半数基因表达上调,其中SlGPAT12在24 h时表达量达到最大值,是0 h的32倍。【结论】本研究为番茄GPAT基因功能的研究提供参考,也为番茄脂肪酸遗传改良提供重要候选基因。 展开更多
关键词 番茄 gpats基因家族 生物信息学 表达分析 低温胁迫
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植物GPATs基因研究进展 被引量:17
4
作者 刘聪 肖旦望 +4 位作者 施春霖 胡学芳 邬克彬 官春云 熊兴华 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1352-1359,共8页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油(Triacylglycerol,TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤。GPATs主要负责将脂肪酰基从酰基-酰基载体蛋白(acyl-ACP)或酰基辅酶A(acyl-CoA)上转... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油(Triacylglycerol,TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤。GPATs主要负责将脂肪酰基从酰基-酰基载体蛋白(acyl-ACP)或酰基辅酶A(acyl-CoA)上转移到甘油-3-磷酸的(Glycerol-3-phosphate,G3P)sn-1位置上。有些成员还具有sn-2酰基转移活性。目前已经在多种植物中克隆得到了GPAT基因。这些GPAT基因编码的酶主要分为三类,它们在细胞中分别定位于质体、线粒体和内质网上。这些酶参与三酰甘油、几丁质和软木脂等多种脂质的生物合成,在植物的生长发育中发挥着非常重要的作用。文章介绍了植物GPAT基因的染色体定位和基因结构以及GPAT酶的亚细胞定位、sn-2酰基转移特异性、GPAT酶的底物选择性及其生理功能的最新研究进展。 展开更多
关键词 gpat基因 底物选择性 sn-2特异性 gpat功能
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芍药属牡丹组(Paeonia sect.Moutan)种间关系的分子证据:GPAT基因的PCR-RFLP和序列分析 被引量:35
5
作者 赵宣 周志钦 +2 位作者 林启冰 潘开玉 洪德元 《植物分类学报》 CSCD 北大核心 2004年第3期236-244,共9页
为了探讨芍药属牡丹组Paeoniasect.Moutan的种间关系 ,对采自 1 5个野生居群 ,代表牡丹组全部 8个野生种的 1 5份材料的GPAT基因片段 (外显子 5和 6之间 2kb的内含子 )进行了PCR_RFLP分析 ,并对代表牡丹组全部 8个野生种的 9份材料进行... 为了探讨芍药属牡丹组Paeoniasect.Moutan的种间关系 ,对采自 1 5个野生居群 ,代表牡丹组全部 8个野生种的 1 5份材料的GPAT基因片段 (外显子 5和 6之间 2kb的内含子 )进行了PCR_RFLP分析 ,并对代表牡丹组全部 8个野生种的 9份材料进行了测序。根据 1 2个限制性内切酶的PCR_RFLP数据 ,使用Network 3 .0计算机程序的RM (reduced_median)法建立了牡丹组种间亲缘关系网络树。同时根据 8个种 9份材料的GPAT基因片段序列 ,利用PAUP 4.0计算机程序建立了牡丹组GPAT基因的最大简约(MP)树和邻接 (NJ)树。结果获得了具有很高自展值支持、分辨良好的牡丹组种间关系 (GPAT基因 )树。最重要的是 ,该基因树所显示的牡丹组种间关系与根据形态学证据提出的牡丹组的种间关系基本吻合 ,并得到其他研究证据的支持。根据这一结果 ,对牡丹组的种间关系进行了详细的讨论。 展开更多
关键词 芍药属 牡丹组 野生居群 种间关系 gpat基因 PCR-RFLP 序列分析
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小桐子甘油-3-磷酸酰基转移酶(JcGPAT)cDNA的克隆与序列分析 被引量:13
6
作者 张楠 徐荣华 +1 位作者 刘小烛 刘爱忠 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期181-188,共8页
甘油-3-磷酸酰基转移酶是植物生物合成储存油脂过程中的关键酶,对油料作物种子含油量具有重要的限制作用。本研究以植物甘油-3-磷酸酰基转移酶同源基因的保守区域序列为基础,设计简并引物,结合RACE技术,从能源植物小桐子种子中克隆获得J... 甘油-3-磷酸酰基转移酶是植物生物合成储存油脂过程中的关键酶,对油料作物种子含油量具有重要的限制作用。本研究以植物甘油-3-磷酸酰基转移酶同源基因的保守区域序列为基础,设计简并引物,结合RACE技术,从能源植物小桐子种子中克隆获得JcGPAT基因的cDNA全长序列(GenBank登录号HQ395225)。JcGPAT cDNA核苷酸序列长度为1672bp,开放阅读框为1125bp,编码375个氨基酸。该基因具有明显的GPAT基因结构域,其编码的氨基酸序列与油桐、蓖麻等植物具有很高的同源性。RT-PCR表达分析表明,该基因在小桐子发育的种子、叶、根尖等多个组织表达。 展开更多
关键词 小桐子 gpat 简并引物 基因克隆 表达分析
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GPAT/AIRC基因对白耳鸡群体肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析 被引量:5
7
作者 张学余 束婧婷 +1 位作者 韩威 陈国宏 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期557-561,共5页
以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测。结果各发现了一个单核苷酸多态性位点。各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明:GPAT基因外显子2中AA型个体的肌... 以GPAT/AIRC基因为侯选基因,以白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对GPAT基因外显子2,AIRC基因外显子8进行SNPs检测。结果各发现了一个单核苷酸多态性位点。各种基因型与胸肌IMP含量的方差分析结果表明:GPAT基因外显子2中AA型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于AB型和BB型个体,AB型个体也稍高于BB型,但差异不显著;AIRC基因外显子8中CG型个体的肌肉肌苷酸含量显著地高于GG型和CC型个体,GG型个体的胸肌肌苷酸含量也显著地高于CC型。两个基因的单倍型对IMP含量也有显著的影响:单倍型为AACG的个体比单倍型为BBCC的个体高1.006 mg/g,单倍型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用该单倍型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。 展开更多
关键词 gpat基因 AIRC基因 单核苷酸多态性 肌苷酸 单倍型 白耳鸡
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百合甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因密码子偏性分析及其表达受体选择 被引量:6
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作者 冯慧颖 梁云 +5 位作者 徐雷锋 袁迎迎 袁素霞 刘春 明军 陈丽静 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期127-137,共11页
本研究运用CodonW和Emboss中的CHIPS、CUSP软件程序对铁炮百合(Lilium longiflorum)、亚洲百合杂种系品种(Lilium‘Excite’)、王百合(Lilium regale)和毛百合(Lilium pensylvanicum)这4种百合GPAT基因(GenBank登录号分别为:JX524738,JX... 本研究运用CodonW和Emboss中的CHIPS、CUSP软件程序对铁炮百合(Lilium longiflorum)、亚洲百合杂种系品种(Lilium‘Excite’)、王百合(Lilium regale)和毛百合(Lilium pensylvanicum)这4种百合GPAT基因(GenBank登录号分别为:JX524738,JX524739,JX524740和JX524741)密码子进行偏好性分析,分别与5种单子叶和6种双子叶植物的GPAT基因密码子偏好性进行比较与系统进化分析,又与4种常用模式生物基因组密码子的偏好性进行比较分析。结果表明,4种百合GPAT基因密码子偏性均较弱,基因表达水平较低,偏好于以A/T结尾的密码子;偏好密码子基本相同。在一定程度上表明,百合的GPAT基因在属间进化中比较保守。并且发现,GPAT密码子偏好性在单、双子叶植物上体现的差异并不显著,从一定程度上表明GPAT基因在进化上的保守性较高。百合GPAT基因密码子偏性与几种双子叶植物的更相近,某些双子叶植物也是该基因的适宜导入受体。在系统进化分析中,基于相对同义密码子使用度(RSCU)的聚类结果与基于CDS构成的聚类结果存在一定的差异,但均可在一定程度上反映物种间的进化关系。与4种模式生物密码子使用频率比较发现,4种百合与受体生物的差异情况比较一致,百合GPAT的密码子偏好性与受体生物酵母和大肠杆菌的基因组密码子偏好性均有较大的不同,表明需要对百合GPAT基因的部分密码子进行优化改造,才能使其在以上受体中高效的表达。百合GPAT与拟南芥基因组密码子使用频率差值较少,表明百合GPAT在拟南芥受体中的表达效率较高;而百合GPAT在烟草受体中的表达效率一般。对于转化植物的选择,拟南芥优于烟草。为准确预测百合GPAT基因的异源表达,为接下来选择其适宜的表达系统以及提高该基因在受体表达系统中的表达效率,进行有效的功能验证提供了有效的参考。 展开更多
关键词 百合 甘油-3-磷酸酰基转移酶(gpat)基因 密码子偏性 系统进化关系 转化受体选择
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冷胁迫下王百合GPAT基因保守区克隆及表达分析 被引量:10
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作者 陈丽静 孙春玉 +3 位作者 钟鸣 阮燕晔 明军 雷家军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1726-1731,共6页
以王百合为试验材料,通过同源克隆和巢式PCR方法从4℃低温诱导的王百合试管苗中分离得到了王百合GPAT基因的保守区序列,采用DNAman软件和BLASTN对该序列进行分析并分别从蛋白和基因角度分析了GPAT基因在4℃冷诱导情况下的表达情况.结果... 以王百合为试验材料,通过同源克隆和巢式PCR方法从4℃低温诱导的王百合试管苗中分离得到了王百合GPAT基因的保守区序列,采用DNAman软件和BLASTN对该序列进行分析并分别从蛋白和基因角度分析了GPAT基因在4℃冷诱导情况下的表达情况.结果显示:(1)该保守区长744 bp,推测其编码247个氨基酸,氨基酸序列存在1个高度保守的区域(WIAPSGGRDRP),经过Blast比对分析发现,该保守区序列为LPLAT基因超级家族酶类的催化活性区,此家族多为催化酰基辅酶A(acylCoAs)或者酰基载体蛋白(acylACPs)中的酰基与受体蛋白结合的酰基转移酶类.(2)冷诱导促进GPAT基因的表达,随冷诱导时间延长,基因表达量不断增大,诱导4 h有大量表达,16 h表达量达到最高,16 h之后表达量随着冷诱导时间的延长逐渐下降,72 h时的表达量与0 h处理时基本一致.研究表明,GPAT在百合抵抗冷胁迫的过程中具有重要的作用. 展开更多
关键词 王百合 冷诱导 甘油-3-磷酸酰基转移酶(gpat) 简并引物 保守区 同源性
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GPAT基因表达载体的构建及对非洲菊的遗传转化 被引量:5
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作者 尹梅 程在全 +2 位作者 夏小环 张伟媚 陈善娜 《西南农业学报》 CSCD 2007年第1期91-94,共4页
运用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT和QS115质粒中的诱导型启动子串联后,插入带有终止子PinⅡ的表达载体pCAMBIA1300质粒中。并用PCR和酶切等多种方法进行鉴定。构建后的载体经PCR和酶切鉴定... 运用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT和QS115质粒中的诱导型启动子串联后,插入带有终止子PinⅡ的表达载体pCAMBIA1300质粒中。并用PCR和酶切等多种方法进行鉴定。构建后的载体经PCR和酶切鉴定表明目的基因和启动子均已按预计方式插入载体的指定位置。用农杆菌介导的方法将它们转化到非洲菊中,获得了潮霉素的抗性植株,并通过PCR扩增验证,有抗性苗含有这个抗冷基因。 展开更多
关键词 甘油-3-磷酸转豌酶(gpat)基因 诱导型启动子 构建 转化 非洲菊
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岷江百合LiGPAT基因的克隆及生物信息学分析 被引量:4
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作者 陈丽静 颜楠楠 +4 位作者 尹元元 张丽 钟鸣 马慧 李天来 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2984-2993,共10页
为探索百合的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,本试验选取了抗寒能力极强的岷江百合(Lilium regale)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF区序列,全长1 212 bp,编码403个氨基酸,分子量约为45.4 k D,Gen Bank登录号为JX... 为探索百合的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,本试验选取了抗寒能力极强的岷江百合(Lilium regale)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF区序列,全长1 212 bp,编码403个氨基酸,分子量约为45.4 k D,Gen Bank登录号为JX524740。通过同源序列比对发现,Li GPAT基因编码的氨基酸与单子叶植物油棕GPAT基因编码的氨基酸的一致性最高,达到67.17%。利用在线软件SMART进行分析,表明Li GPAT氨基酸在169~315序列存在一个Pls C结构域,这就说明Li GPAT蛋白属于酰基转移酶家族成员,且所有的活性位点都位于这个区域,具有酰基转移酶的活性。通过在线软件TMHMM Server 2.0预测分析揭示Li GPAT氨基酸序列不存在跨膜区域,可能是一个可溶性蛋白。利用在线软件Plant-m PLoc预测表明,Li GPAT蛋白质的亚细胞定位为叶绿体。 展开更多
关键词 岷江百合 甘油-3-磷酸酰基转移酶(gpat) 聚合酶链式反应 生物信息学分析
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柑橘类植物GPAT基因片段克隆和SNP分析 被引量:7
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作者 吴波 刘勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期51-56,共6页
甘油-3-磷酸酰基转移酶基因是与植物抗冷性强弱密切相关的基因。根据已报道的各种植物GPAT基因的氨基酸序列上前后两个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从琯溪蜜柚、马家柚、莽山野橘等8种柑橘类植物中克隆得到315bp的GPAT基... 甘油-3-磷酸酰基转移酶基因是与植物抗冷性强弱密切相关的基因。根据已报道的各种植物GPAT基因的氨基酸序列上前后两个保守区设计1对简并引物,采用RT-PCR技术,分别从琯溪蜜柚、马家柚、莽山野橘等8种柑橘类植物中克隆得到315bp的GPAT基因片段。使用DNA Star5.0软件对8个片段序列进行同源性比较,8个片段的核苷酸同源性高达97.8%,与其它植物GPAT基因核苷酸序列的同源性都在72.5%以上;经过氨基酸序列推导,每个GPAT基因片段分别编码105个氨基酸,8个片段的氨基酸同源性为95.2%,与其它植物GPAT基因的氨基酸序列同源性在68.9%以上。试验克隆所得8种柑橘类植物GPAT基因片段序列存在明显的单核苷酸变异,在14个核苷酸位点存在SNPs(single nucleotide polymorphisms),导致6个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/22.5bp,核苷酸变异度为4.45%,氨基酸变异度为5.71%。采用NJ聚类法对克隆片段的核苷酸序列进行了遗传多样性分析。 展开更多
关键词 柑橘类植物 gpat 基因克隆 SNP 序列分析
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甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPATs)的研究进展 被引量:6
13
作者 田增有 李开济 +1 位作者 门秀丽 吴静 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期103-107,共5页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferases,GPATs)催化甘油三酯和甘油磷脂合成的第一步反应。目前在哺乳动物已发现四种亚型GPAT1-4,其中GPAT1和GPAT2定位于线粒体外膜,而GPAT3和GPAT4定位于内质网。GPATs在调节细... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferases,GPATs)催化甘油三酯和甘油磷脂合成的第一步反应。目前在哺乳动物已发现四种亚型GPAT1-4,其中GPAT1和GPAT2定位于线粒体外膜,而GPAT3和GPAT4定位于内质网。GPATs在调节细胞甘油三酯和磷脂含量中起着重要的作用。基因过表达和敲除实验证实GPATs在肝脏脂肪变性、胰岛素抵抗和肥胖的发生发展过程中起着重要作用,并且部分亚型影响泌乳、精子发生等过程。本文将就GPATs各亚型的功能特点进行综述。 展开更多
关键词 甘油-3-磷酸酰基转移酶 gpats 甘油三酯合成
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新干特早柚GPAT基因5’端克隆及序列分析 被引量:4
14
作者 吴波 刘勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期915-918,共4页
采用5’-RACE技术从新干特早柚(Citrus grandiscv.Xingantezaoyou)叶片中克隆出一条长832 bp的GPAT基因5’端cDNA片段(GenBank登录号:DQ193970)。序列分析结果表明:该cDNA片段序列与其它科属植物的GPAT基因序列的同源性差异较大,除与同... 采用5’-RACE技术从新干特早柚(Citrus grandiscv.Xingantezaoyou)叶片中克隆出一条长832 bp的GPAT基因5’端cDNA片段(GenBank登录号:DQ193970)。序列分析结果表明:该cDNA片段序列与其它科属植物的GPAT基因序列的同源性差异较大,除与同类植物——温州蜜柑(Citrus unshiu)的同源性高达98.9%,与红花(Carthamus tinctorius)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、非洲油棕榈(Elaeis guineensis)、豌豆(Pisum sati-vum)、蚕豆(Vicia faba)的同源性分别为62.5%、54.6%、48.2%、47.4%、46.9%;其所编码的氨基酸序列与红花、拟南芥、非洲油棕榈、豌豆、辣椒的同源性分别为51.6%、60%、45.1%、48%、52.3%,与细菌(Bacillusamyloliquefaciens)的同源性仅为18.9%,说明GPAT基因的氨基酸序列具有种属特异性。 展开更多
关键词 新干特早柚 gpat RACE 基因克隆 序列分析
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用保守氨基酸区段序列分离克隆几种云南高原作物GPAT基因cDNA片段 被引量:1
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作者 杨明挚 陈善娜 +4 位作者 刘继梅 谭德勇 鄢波 黄兴奇 陈莉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期39-40,共2页
用分子生物学技术分别成功地从南瓜及黑子南瓜、水稻、油菜中得到了GPAT基因cDNA片段中约315bp的片段,并用T4连接酶分别克隆到了pGEMT载体系统上。这一片段在不同科的植物中其片段大小并无差别,但限制性酶切表明... 用分子生物学技术分别成功地从南瓜及黑子南瓜、水稻、油菜中得到了GPAT基因cDNA片段中约315bp的片段,并用T4连接酶分别克隆到了pGEMT载体系统上。这一片段在不同科的植物中其片段大小并无差别,但限制性酶切表明其内部序列确实存在有差异。从南瓜中得到的GPATcDNA部分片段经HindⅢ酶切,得到了一个约100多bp和一个约200bp的片段,与前人所发表的南瓜GPATcDNA序列(在该片段的111bp处有一个hindⅢ的酶切位点)相符。 展开更多
关键词 南瓜 水稻 油菜 gpat基因 CDNA片段
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猪GPAT基因SNPs位点分析和表达规律的研究 被引量:1
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作者 杨俊静 李海涛 +2 位作者 张冬杰 杨秀芹 刘娣 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期19-23,共5页
为了进一步探索谷氨酰胺磷酸核糖焦磷酸酰胺转移酶GPAT基因与肉质、风味性状的关系,采用PCR-SSCP方法分析其遗传多态性、采用Real time PCR方法分析其组织表达规律。在外显子1和14寻找到了3个单核苷酸多态位点,结果表明,各等位基因在民... 为了进一步探索谷氨酰胺磷酸核糖焦磷酸酰胺转移酶GPAT基因与肉质、风味性状的关系,采用PCR-SSCP方法分析其遗传多态性、采用Real time PCR方法分析其组织表达规律。在外显子1和14寻找到了3个单核苷酸多态位点,结果表明,各等位基因在民猪、大白、长白、杜洛克、北京黑猪和野家杂交猪中的分布存在着极显著的差异(P<0.01)。GPAT在所检测的12种组织中均表达,其中肝脏中表达量最高。研究结果为肉质和风味性状分子标记的确定提供了基础。 展开更多
关键词 民猪 gpat PCR-SSCP REAL-TIMEPCR
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柑橘类植物和其它植物的GPAT和SOD基因分子进化分析 被引量:1
17
作者 吴波 刘勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期162-167,共6页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因和超氧化物歧化酶(SOD)基因是与植物抗寒和抗逆密切相关的2个基因。为了研究柑橘类植物之间以及和其它植物之间上述两基因的分子进化的异同,已经获得的数种柑橘类植物的GPAT基因、SOD基因氨基酸序列和... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)基因和超氧化物歧化酶(SOD)基因是与植物抗寒和抗逆密切相关的2个基因。为了研究柑橘类植物之间以及和其它植物之间上述两基因的分子进化的异同,已经获得的数种柑橘类植物的GPAT基因、SOD基因氨基酸序列和通过检索GenBank数据库获得的相关序列为试验数据,使用PAUP4.0软件,通过最大简约法,分别构建GPAT基因、Fe/Mn-SOD基因、Cu/Zn-SOD基因和总SOD基因的分子系统进化树。GPAT基因分子系统进化树分析结果表明,GPAT基因在单子叶和双子叶植物中的进化差异不大,在柑橘类植物中的进化差异较大;Fe/Mn-SOD基因分子系统进化树分析结果表明,该基因分子进化与植物自身的抗逆能力有密切关系;Cu/Zn-SOD基因分子系统进化树分析结果表明,该基因在进化上是相当保守的。总SOD基因分子系统进化树分析结果表明,SOD基因的进化和聚类并不是以植物的科属是否相同或相近为依据的,而是以该基因所结合的金属离子的不同来分类的;Cu/Zn-SOD基因和Fe/Mn-SOD基因来源于不同的祖先基因,前者较后者保守。 展开更多
关键词 柑橘类植物 gpat SOD 分子进化分析
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甘蓝型油菜GPAT6基因启动子的克隆与表达载体构建 被引量:1
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作者 胡学芳 刘聪 +1 位作者 肖旦望 熊兴华 《作物研究》 2014年第5期467-471,共5页
通过同源PCR克隆的方法,首次从甘蓝型油菜中克隆了甘油-3-磷酸酰基转移酶6(sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 6,GPAT6)基因长1 110 bp的启动子,并将其成功构建到植物表达载体pBI121上。重组载体可用于转化拟南芥,探究甘蓝型油菜... 通过同源PCR克隆的方法,首次从甘蓝型油菜中克隆了甘油-3-磷酸酰基转移酶6(sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 6,GPAT6)基因长1 110 bp的启动子,并将其成功构建到植物表达载体pBI121上。重组载体可用于转化拟南芥,探究甘蓝型油菜GPAT6基因的组织表达特征。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 gpat6基因 启动子 基因克隆 表达载体构建
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PBI121/GPAT质粒的构建及对非洲菊转化
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作者 尹梅 程在全 +2 位作者 夏小环 陈志伟 陈善娜 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期717-720,共4页
为提高植物抗寒性,本文构建一个植物表达载体,并对非洲菊进行转化。用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT插入表达载体pB I121质粒取代该质粒上原有的GUS基因,并用PCR和酶切进行鉴定。用农杆菌介... 为提高植物抗寒性,本文构建一个植物表达载体,并对非洲菊进行转化。用已克隆的强抗冷植物兵豆的甘油-3-磷酸转酰酶(GPAT)基因构建表达载体,将GPAT插入表达载体pB I121质粒取代该质粒上原有的GUS基因,并用PCR和酶切进行鉴定。用农杆菌介导的方法将该质粒转化到非洲菊中。结果表明该植物表达载体构建成功,同时对非洲菊高效转化体系进行探索,获得卡那霉素抗性苗7苗。 展开更多
关键词 甘油-3-磷酸转酰酶(gpat) 构建 转化 非洲菊
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PGL-ELISA与GPAT的对照研究
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作者 李桓英 翁小满 +1 位作者 邵兰 栗绍刚 《中国麻风皮肤病杂志》 北大核心 1990年第2期74-78,共5页
用PGL-ELISA与GPAT对照研究,检测了47例麻风病人、103名麻风家内接触者、15例活动性结核和100名非流行区正常人的血清抗PGL抗体水平,结果表明二试验有较高的符合率,且GPAT抗体滴度与PGL-ELISA抗体OD值之间有较好的相关性。100名正常人... 用PGL-ELISA与GPAT对照研究,检测了47例麻风病人、103名麻风家内接触者、15例活动性结核和100名非流行区正常人的血清抗PGL抗体水平,结果表明二试验有较高的符合率,且GPAT抗体滴度与PGL-ELISA抗体OD值之间有较好的相关性。100名正常人和15例结核病人的阳性率分别为5%和6.7%,多菌型和少菌型麻风病人的阳性率分别为93.3%和59.8%,与PGL-ELISA相比,GPAT是一项简便快速、具较好特弹性和敏感性的麻风筛检试验。但为了适应现场实验的需要,应进一步探讨用干血滤纸片法做GPAT,以提高其敏感性。 展开更多
关键词 麻风病人 多菌型 干血滤纸片 活动性结核 gpat PGL-ELISA 抗体滴度 非流行区 筛检 血清学试验
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