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基于领域本体的生物医学语义检索机制研究——以GoPubMed和SEGoPubMed为例 被引量:3
1
作者 杜建 张士靖 《数字图书馆论坛》 2010年第7期56-61,共6页
基于领域本体对大型文本语料库的语义检索研究成为近年来信息检索领域研究的热点。GoPubMed和SEGoPubMed作为该领域研究成果的杰出代表,为PubMed存在的问题提供了良好的解决方案。对GoPubMed和SEGoPubMed语义检索机制进行深入研究后显... 基于领域本体对大型文本语料库的语义检索研究成为近年来信息检索领域研究的热点。GoPubMed和SEGoPubMed作为该领域研究成果的杰出代表,为PubMed存在的问题提供了良好的解决方案。对GoPubMed和SEGoPubMed语义检索机制进行深入研究后显示,GoPubMed应用基于语义网的语义分类工具——_GO和MeSH,将PubMed检索结果统计并对应到相应的分类导航目录,使用户利用该导航便可以快速找到自己所需要的文献,但其仍是基于布尔逻辑模型的字符串匹配机制;而比GoPubMed性能更优越的SEGoPubMed应用潜在语义分析(LSA)技术开创了语义敏感地浏览、连接大型文本语料库与本体的新模式,将具有更广泛的应用前景。 展开更多
关键词 领域本体 基因本体 医学主题词表 gopubmed SEgopubmed 潜在语义分析
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基于SCIE和GoPubMed的针灸学文献统计分析 被引量:8
2
作者 思金华 赵晨 +1 位作者 刘妮波 商洪才 《中国针灸》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1309-1314,共6页
采用文献计量法,调查2003-2013年被SCIE和PubMed收录的针灸学文献,统计分析年发文数量、国家分布、机构和地区分布,作者、期刊、学科类别、高频主题以及H指数等,阐明针灸学科的发展现状和趋势。
关键词 针灸学 SCIE gopubmed 统计分析
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基于语义搜索引擎的学科知识服务研究——以GoPubMed为例 被引量:24
3
作者 盛东方 孙建军 《图书情报知识》 CSSCI 北大核心 2015年第4期113-120,共8页
大数据环境下,人与大规模数据量之间的交互成为重要议题。从语义层面进行知识组织、挖掘和服务是学科知识服务转变的必然要求。生物医学领域的GoPubMed是基于GO本体和MeSH主题词表的语义检索工具,本文介绍了GoPubMed的工作原理与关键技... 大数据环境下,人与大规模数据量之间的交互成为重要议题。从语义层面进行知识组织、挖掘和服务是学科知识服务转变的必然要求。生物医学领域的GoPubMed是基于GO本体和MeSH主题词表的语义检索工具,本文介绍了GoPubMed的工作原理与关键技术,通过一个检索案例展示了其知识分类、计量与导航的服务功能。最后,从基于学科本体的知识组织、基于语义挖掘的知识发现和面向主题的知识可视化三个角度总结GoPubMed对学科知识服务的启示。 展开更多
关键词 本体 gopubmed 语义搜索引擎 知识发现 知识导航
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基于GoPubMed对病耻感相关文献的计量学分析 被引量:21
4
作者 李荔 刘丽娟 《中国心理卫生杂志》 CSSCI CSCD 北大核心 2017年第11期857-861,共5页
目的:探讨国内外病耻感研究现状和未来发展趋势,为进一步研究病耻感提供参考依据。方法:采用GoPubMed数据库的在线分析软件,以病耻感(stigma)为检索主题,检索病耻感相关文献。检索时限为建库起至2016年5月。对其发表的年代分布、国家与... 目的:探讨国内外病耻感研究现状和未来发展趋势,为进一步研究病耻感提供参考依据。方法:采用GoPubMed数据库的在线分析软件,以病耻感(stigma)为检索主题,检索病耻感相关文献。检索时限为建库起至2016年5月。对其发表的年代分布、国家与城市地域分布、期刊分布及核心作者等进行计量分析。结果:病耻感研究文献共检出14742篇。得到分布前20位的高频词、核心作者、核心期刊、发表论文国家(地区)分布等。文献数量呈逐年上升趋势;其中以来源于美国的文献数量和影响力居首位。美国发文5350篇(36%)排在第1位,加拿大位居第2位(1338篇,9%),中国居第6位(331篇,2%)。排名前20位的主要期刊分布在欧美国家。结论:我国病耻感研究文献在数量和质量上均还有待于进一步提高。提示国内精神卫生工作者对病耻感研究重视不够。病耻感相关研究人员需要进一步加强对慢病患者病耻感的研究。 展开更多
关键词 病耻感 文献计量学 gopubmed
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GOPubMed:基于GO和MeSH的信息检索与分析研究 被引量:20
5
作者 张士靖 杜建 《医学信息学杂志》 CAS 2009年第7期6-11,共6页
GOPubMed是一种基于PubMed的结果可视化和后处理类型的智能搜索引擎。从工作原理、关键技术以及扩展功能3个方面对其性能进行解析。研究显示,GOPubMed利用基于语义网的语义分类工具——GO(Gene Ontology,基因本体)和MeSH,对PubMed检索... GOPubMed是一种基于PubMed的结果可视化和后处理类型的智能搜索引擎。从工作原理、关键技术以及扩展功能3个方面对其性能进行解析。研究显示,GOPubMed利用基于语义网的语义分类工具——GO(Gene Ontology,基因本体)和MeSH,对PubMed检索结果进行分类,帮助用户快速地找出最相关的命中文献,实现语义网与生物医学信息检索的完美结合,并能对检索结果从多角度进行可视化统计分析。 展开更多
关键词 PUBMED gopubmed 搜索引擎 基因本体 语义网 可视化
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GoPubMed用于医学科技查新的信息分析 被引量:18
6
作者 许培扬 张玢 《医学信息学杂志》 CAS 2008年第10期25-28,49,共5页
采用GoPubMed在线信息分析软件将医学科技查新课题的相关文献进行统计分析,包括文献的研究主题、著者、期刊、年代、城市和国家的分布。医学科技查新中对相关文献进行定性与定量相结合的分析方法,以保证科技查新更为全面、客观、准确。
关键词 gopubmed 医学科技查新 医学信息分析
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基于GoPubMed可视化分析万古霉素耐药研究情况 被引量:3
7
作者 黄金路 霍炎 +5 位作者 万丽丽 杨全军 李婕 干润 陈鹏果 郭澄 《中国临床药学杂志》 CAS 2017年第2期96-101,共6页
目的通过可视化分析工具对万古霉素耐药研究情况进行可视化分析。方法以"vancomycin resistance"为主题词,利用智能检索引擎GoPubMed检索相关文献,并运用在线分析工具对万古霉素耐药的研究情况进行可视化分析。结果共检索到3 ... 目的通过可视化分析工具对万古霉素耐药研究情况进行可视化分析。方法以"vancomycin resistance"为主题词,利用智能检索引擎GoPubMed检索相关文献,并运用在线分析工具对万古霉素耐药的研究情况进行可视化分析。结果共检索到3 597篇有关万古霉素耐药的文献。从发表数量上看,可分为3个阶段:2000年以前的上升期,2000-2012年的平稳期,2012年以后的下降期。相对研究兴趣指数在2000年达到高峰,之后呈降低趋势。这些文献主要分布在欧洲、北美洲和亚洲,其中美国在万古霉素耐药方面发表的文献数量占首位,我国排第5位。美国的发表数量远高于我国,为10.5倍。在城市分布方面,波士顿居首位。刊载万古霉素耐药的杂志最多的是《Antimicrobial Agents Chemotherapy》,为309篇,占总量的8.6%。从作者文献产量角度分析,以COURVALIN P、JONES R、TENOVER F、DONSKEY C发表万古霉素耐药文章数量较多,位居前4,分别为52、42、36、31篇。结论尽管以"vancomycin resistance"为主题词检索Go Pub Med,我国学者发表的中文文章未被全部检索到,但把检索到的文献作为样本可部分反映万古霉素耐药研究的状况。通过分析发现由于人们对细菌耐药的重视并采取有效措施,使得万古霉素耐药好转,但仍需十分关注万古霉素耐药情况的发生。 展开更多
关键词 抗菌药物 耐药菌株 万古霉素耐药 gopubmed 可视化分析
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基于GoPubMed针灸治疗抑郁症的文献计量学分析 被引量:4
8
作者 安春平 吴海燕 +1 位作者 胡妮娜 郝丙辉 《针灸临床杂志》 2017年第4期54-57,共4页
目的:分析PubMed中收录的针灸治疗抑郁症相关文献,以了解应用针灸治疗抑郁症的概况。方法:应用GoPubMed检索针灸治疗抑郁症的相关文献,获得从主题、出版年限、期刊、作者所属国家和城市等方面分析的可视化结果。结果:PubMed中共收录文献... 目的:分析PubMed中收录的针灸治疗抑郁症相关文献,以了解应用针灸治疗抑郁症的概况。方法:应用GoPubMed检索针灸治疗抑郁症的相关文献,获得从主题、出版年限、期刊、作者所属国家和城市等方面分析的可视化结果。结果:PubMed中共收录文献845篇,最近10年保持稳定增长的趋势;文献中高频词有抑郁、人类、针灸、针灸疗法、焦虑等;发文期刊主要分布在中国、英国、美国。结论:针灸治疗抑郁症的文献量逐年增加,但影响仍然有限。针灸治疗抑郁症的相关动物研究很难应用到临床实践,也缺乏确切的疗效证明,这些阻碍了针灸临床研究的发展。 展开更多
关键词 针灸 抑郁症 gopubmed 文献计量学
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利用GoPubMed对媒介生物性疾病研究文献计量学分析 被引量:1
9
作者 孙燕群 徐智慧 +3 位作者 熊丽林 王冲 何隆华 张守刚 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2016年第2期164-167,共4页
目的了解媒介生物性疾病研究发表文献情况,为从事媒介生物性疾病相关研究人员提供参考。方法以媒介生物性疾病研究文献为对象,采用GoPubMed数据库在线分析软件,分析相关文献的年度、国家和城市分布、来源期刊、研究主题及研究作者。结... 目的了解媒介生物性疾病研究发表文献情况,为从事媒介生物性疾病相关研究人员提供参考。方法以媒介生物性疾病研究文献为对象,采用GoPubMed数据库在线分析软件,分析相关文献的年度、国家和城市分布、来源期刊、研究主题及研究作者。结果共检索到文献3 214篇,文献数量呈逐年上升趋势;其中来源于美国的文献数量和影响力居首位,以柯林斯堡最多;《美国热带医学与卫生》杂志文献176篇,居首位;发文量最多作者为Roehrig J,共55篇。结论 GoPubMed是一种优秀的集检索与统计功能于一体的工具;揭示了媒介生物性疾病研究的现状和发展趋势;我国媒介生物性疾病研究文献在数量和质量上均有待提高。 展开更多
关键词 gopubmed 媒介生物性疾病 文献计量分析
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基于GoPubMed有关高原病研究文献的信息分析 被引量:1
10
作者 宋欣 苏叶 +1 位作者 刘娜 马骏涛 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2016年第6期29-33,54,共6页
依托Pub Med数据库,采用Go Pub Med进行检索,从研究内容、发文作者、地区分布、发文时间等方面分析有关高原病的研究文献,获得高原病研究的主题内容、年代、地区分布、期刊、核心作者等信息,并利用结构方程模型对高原病研究文献量的影... 依托Pub Med数据库,采用Go Pub Med进行检索,从研究内容、发文作者、地区分布、发文时间等方面分析有关高原病的研究文献,获得高原病研究的主题内容、年代、地区分布、期刊、核心作者等信息,并利用结构方程模型对高原病研究文献量的影响因素进行分析,探索与高原病研究的相关趋势,最后提出了借鉴印度德里的经验,将我国相对分散的高原病研究资源进行适当集中,加强国内外科研人员的相互协作,加大高原医学研究的支持力度,在进行大规模非战争军事行动(如救灾)时应结合我国高原、高山地貌比例高、高原人口较多、地质灾害多发等特点,将我国的高原病救治机构适当向高原腹地前移等建议。 展开更多
关键词 PUBMED gopubmed 高原病 信息分析
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专业化的语义智能搜索引擎GoPubMed 被引量:11
11
作者 李健康 《图书馆论坛》 CSSCI 北大核心 2009年第6期152-154,176,共4页
GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件。通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间,检索者可以很快了解检索... GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件。通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间,检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等。 展开更多
关键词 语义搜索引擎 智能检索 基因本体 gopubmed
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利用SCI和GoPubMed进行文献计量分析以研究学科发展趋势——以中医药学为例 被引量:11
12
作者 刘丹雯 《现代情报》 CSSCI 2012年第3期119-124,共6页
运用文献计量法,从发表年度、国家、科研机构、期刊分布、学科类别和高频主题等不同维度,对2000-2010年SCI和GoPubMed中检索到的中医药学相关文献进行统计分析,初步探究中医药学的现状及发展趋势,为相关研究者和决策者适时调整科研策略... 运用文献计量法,从发表年度、国家、科研机构、期刊分布、学科类别和高频主题等不同维度,对2000-2010年SCI和GoPubMed中检索到的中医药学相关文献进行统计分析,初步探究中医药学的现状及发展趋势,为相关研究者和决策者适时调整科研策略、发展政策等提供参考和依据,发挥学科馆员在高校图书馆参考咨询服务中应有的作用。 展开更多
关键词 文献计量学 SCI gopubmed 学科发展 中医药学
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专业的语义智能搜索引擎Quertle——与GoPubMed的比较研究 被引量:5
13
作者 施李丽 《图书馆学研究》 CSSCI 北大核心 2012年第16期51-54,83,共5页
GoPubMed是基于PubMed的语义智能搜索引擎,Quertle是以PubMed为主要数据源的语义智能搜索引擎,两者都是基于本体向未来语义检索发展的尝试。GoPubMed最大的检索特色是对检索结果的分类统计和可视化。Quertle在本体技术和自然语言处理技... GoPubMed是基于PubMed的语义智能搜索引擎,Quertle是以PubMed为主要数据源的语义智能搜索引擎,两者都是基于本体向未来语义检索发展的尝试。GoPubMed最大的检索特色是对检索结果的分类统计和可视化。Quertle在本体技术和自然语言处理技术的支撑下,形成了Power TermTM检索,能识别单词大写时的特定含义,将检索提问与关系网进行匹配查找获得高度相关的检索结果。 展开更多
关键词 Quertle gopubmed 语义搜索引擎 本体 自然语言处理
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基于GoPubMed对慢性非传染性疾病患者药学监护研究的文献计量学分析 被引量:1
14
作者 张楠 杨慧鹃 +2 位作者 闫阔 蔡泓敏 夏文斌 《药物流行病学杂志》 CAS 2019年第4期272-276,共5页
目的:了解全球对慢性非传染性疾病(以下简称"慢病")患者药学监护的研究现状。方法:在GoPubMed网站首页搜索框内输入"‘Chronic Disease’[mesh] AND ‘Pharmaceutical Care’[mesh]"进行检索,搜集PubMed数据库中关... 目的:了解全球对慢性非传染性疾病(以下简称"慢病")患者药学监护的研究现状。方法:在GoPubMed网站首页搜索框内输入"‘Chronic Disease’[mesh] AND ‘Pharmaceutical Care’[mesh]"进行检索,搜集PubMed数据库中关于对慢病患者药学监护的文献,检索时限为建库至2018年6月19日,利用Go Pub Med网站的统计功能,分析相关文献的发表年份、主题、国家和刊载期刊等情况。结果:共检索到4 110篇文献。2008年以来每年发表相关文献超过200篇。发表对慢病患者药学监护相关文献较多的国家依次是美国(1 530篇)、英国(266篇)和加拿大(233篇),我国发表相关文献76篇。结论:近年来对慢病患者药学监护相关研究日益受到关注,我国相关研究较少,做好对慢病患者药学监护的实践与研究对于保障患者用药安全、充分发挥药师专业作用具有重要意义。 展开更多
关键词 慢性非传染性疾病 药学监护 gopubmed网站 文献计量学
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Gopubmed有关医院图书馆学研究的信息分析 被引量:7
15
作者 张新凤 《现代情报》 2009年第11期131-133,共3页
采用GoPubmed数据库的在线分析软件对有关医院图书馆学研究的文献信息分析,获得Pubmed数据库中有关医院图书馆学研究的文献概貌,为我国医学图书馆学研究提供借鉴。
关键词 gopubmed 信息分析 医院图书馆
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利用GoPubMed对针灸治疗腰痛英文文献的计量分析 被引量:1
16
作者 赵菲 高日阳 《广州中医药大学学报》 CAS 2016年第4期607-611,共5页
【目的】了解针灸治疗腰痛的英文文献分布特点和主要研究方向,为腰痛的治疗和研究提供参考。【方法】利用Go Pub Med工具以及文献计量学方法和聚类分析法,对Pub Med数据库中针灸治疗腰痛的英文文献从其发表年代、国家分布、期刊收录情... 【目的】了解针灸治疗腰痛的英文文献分布特点和主要研究方向,为腰痛的治疗和研究提供参考。【方法】利用Go Pub Med工具以及文献计量学方法和聚类分析法,对Pub Med数据库中针灸治疗腰痛的英文文献从其发表年代、国家分布、期刊收录情况、核心著者及合作者、高频主题词等方面进行分析。【结果】共检索出英文文献345篇。针灸治疗腰痛的英文文献数量在2007年和2010年2次达到高峰,之后趋于平稳。国外开展针灸治疗腰痛的国家有29个,其中美国的发文数量最多,达到59篇,占总发文量的17.1%,居于首位;中国排名第二,发文总数44篇,占12.8%。针灸治疗腰痛的英文文献主要收录于核心期刊。核心著者及合作者检索结果显示针灸治疗腰痛的研究多由团队合作完成。高频主题词共有20个,反映了针灸治疗腰痛研究的热点。【结论】运用Go Pub Med从文献计量角度对针灸治疗腰痛的英文文献进行分析,其结果提示国外研究热点主要集中在腰痛的治疗研究和腰痛的调查研究方面;国内临床科研工作者应加强向世界推广针灸在临床、科研研究中的成果,促进针灸和中医药走向世界。 展开更多
关键词 gopubmed 针灸 腰痛 PubMed数据库 聚类分析 英文文献
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GoPubMed在药物研发信息挖掘中的应用 被引量:5
17
作者 王海燕 《医学信息学杂志》 CAS 2013年第6期64-67,共4页
采用GoPubMed数据库的在线分析软件进行科技查新,对国内外1983-2012年发表的钩虫抗凝肽研究文献信息进行数据挖掘,获得其研究文献主题、年代、地区分布、期刊、核心作者等相关信息,探索与药物研发密切相关的重组基因产物和药物作用机制。
关键词 gopubmed 信息分析 钩虫抗凝肽 凝血因子
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具有分类统计分析功能的生物医学检索系统——GoPubMed 被引量:5
18
作者 钟伶 《预防医学情报杂志》 CAS 2010年第1期40-43,共4页
目的介绍新型检索系统GoPubMed,比较常用的检索系统与GoPubMed在分类统计功能中的差别。方法剖析GoPubMed的各分类统计功能模块与特点,并将GoPubMed的分类统计功能与具有类似功能的常用检索系统相比较。结果GoPubMed的分类与统计功能较... 目的介绍新型检索系统GoPubMed,比较常用的检索系统与GoPubMed在分类统计功能中的差别。方法剖析GoPubMed的各分类统计功能模块与特点,并将GoPubMed的分类统计功能与具有类似功能的常用检索系统相比较。结果GoPubMed的分类与统计功能较为细致与深入,并且是基于本体向未来语义检索发展的一种尝试。结论GoPubMed基于基因本体(Gene Ontology,GO)与医学主题词表(Medical Subject Headings,Mesh)、蛋白质仓库(Universal Protein Resource,UniProt)将PubMed的检索结果进行分类统计,反映文章全文中的主题概念,通过分类统计将文献中隐含的信息显性表达,为用户了解相关主题概况,快速、准确找到所需要的信息提供帮助。 展开更多
关键词 gopubmed 基因本体 MESH 分类统计
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基于GoPubMed对诺如病毒研究文献计量学分析 被引量:1
19
作者 宋灿磊 王新科 +1 位作者 李淑华 高霞 《公共卫生与预防医学》 2017年第6期75-78,共4页
目的探究诺如病毒研究的现况及发展趋势,从而为相关研究提供参考依据。方法以诺如病毒文献为研究对象,以Go Pub Med为检索与统计工具,对诺如病毒研究的主题、时间、来源、分布、作者和文献数量发展趋势进行信息分析。结果共检索到4 890... 目的探究诺如病毒研究的现况及发展趋势,从而为相关研究提供参考依据。方法以诺如病毒文献为研究对象,以Go Pub Med为检索与统计工具,对诺如病毒研究的主题、时间、来源、分布、作者和文献数量发展趋势进行信息分析。结果共检索到4 890篇文献,文献数量呈逐年上升趋势;其中来源于美国的文献数量和影响力居首位,发文总数655篇,日本发文量排第2名(185篇),中国发文量排第3名(165篇);文献发文量前10名中美国所占城市最多(5个),以亚特兰大最多(76篇),东京和伦敦位居第2、3位(57篇和46篇),北京位居第4位(40篇);诺如病毒英文文献主要收录于国外核心期刊,其中Journal of Virology杂志发文总数居首(76篇);核心著者及合作者检索结果显示诺如病毒的研究由多个合作团队完成。高频主题词共有20个,反映了诺如病毒研究的热点。结论 Go Pub Med是一种优秀的集检索与统计功能于一体的文献检索工具;揭示了诺如病毒研究的现状和发展趋势;我国诺如病毒研究文献在数量和质量上均有待提高。 展开更多
关键词 诺如病毒 gopubmed 文献计量分析
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利用GoPubMed对甲状腺癌与辐射的文献计量分析 被引量:2
20
作者 朱玉兰 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2013年第9期44-46,共3页
介绍了GoPubMed在甲状腺癌与辐射文献计量分析中的的应用。
关键词 gopubmed 甲状腺癌 辐射 文献计量分析
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