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番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析
被引量:
1
1
作者
杨伟
潘宇
+2 位作者
苏承刚
张兴国
李金华
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期79-85,共7页
旨在分析番茄JMJ524基因如何通过影响Sl GLD1的DNA甲基化程度来调控其表达,从而导致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息学和BSP(Bisulfite sequencing PCR)分析JMJ524抑制系和野生型的Sl GLD1的DNA甲基化程度。结果显示,分离出Sl G...
旨在分析番茄JMJ524基因如何通过影响Sl GLD1的DNA甲基化程度来调控其表达,从而导致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息学和BSP(Bisulfite sequencing PCR)分析JMJ524抑制系和野生型的Sl GLD1的DNA甲基化程度。结果显示,分离出Sl GLD1的启动子序列,发现其启动子区域含有3个GA响应的顺式作用元件;Sl GLD1的启动子区域和编码区的DNA是高度甲基化的,而且在不同组织部位和突变体中的甲基化模式是不一样的;在基因的编码区发现了两个GC岛,推测Sl GLD1的甲基化可能发生在基因的编码区;针对这两个GC岛进行的BSP分析结果表明:Sl GLD1的这两个区段的DNA Cp G是高度甲基化的,而且在JMJ524抑制系中,DNA的整体甲基化,特别是Cp G甲基化程度显著低于野生型对照M82。JMJ524抑制表达导致了Sl GLD1的基因甲基化程度降低,从而激活这个基因的表达,可能是导致番茄植株矮化的一个因素。
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关键词
JMJC
gld1
DNA甲基化
番茄
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职称材料
题名
番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析
被引量:
1
1
作者
杨伟
潘宇
苏承刚
张兴国
李金华
机构
西南大学园艺园林学院南方山地园艺学重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期79-85,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31301779)
重庆市基础与前沿研究计划一般项目(cstc2015jcyj A80030)
+1 种基金
中央高校基本业务费专项基金项目(XDJK2014B045
XDJK2016E148)
文摘
旨在分析番茄JMJ524基因如何通过影响Sl GLD1的DNA甲基化程度来调控其表达,从而导致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息学和BSP(Bisulfite sequencing PCR)分析JMJ524抑制系和野生型的Sl GLD1的DNA甲基化程度。结果显示,分离出Sl GLD1的启动子序列,发现其启动子区域含有3个GA响应的顺式作用元件;Sl GLD1的启动子区域和编码区的DNA是高度甲基化的,而且在不同组织部位和突变体中的甲基化模式是不一样的;在基因的编码区发现了两个GC岛,推测Sl GLD1的甲基化可能发生在基因的编码区;针对这两个GC岛进行的BSP分析结果表明:Sl GLD1的这两个区段的DNA Cp G是高度甲基化的,而且在JMJ524抑制系中,DNA的整体甲基化,特别是Cp G甲基化程度显著低于野生型对照M82。JMJ524抑制表达导致了Sl GLD1的基因甲基化程度降低,从而激活这个基因的表达,可能是导致番茄植株矮化的一个因素。
关键词
JMJC
gld1
DNA甲基化
番茄
Keywords
JmjC
gld1
DNA methylation
tomato
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄JMJ524基因调控SlGLD1的DNA甲基化分析
杨伟
潘宇
苏承刚
张兴国
李金华
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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