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通过配体文库研究GIPC2 PDZ配体结合特点及其相互作用蛋白
1
作者 范成艳 郭正光 郑直 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第2期186-190,共5页
目的通过验证性筛选配体文库,获得GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,进而找到GIPC2的相互作用蛋白。方法 1)利用酵母双杂交的方法从已有的PDZ配体库中寻找与GIPC2的PDZ结构域配体结合特性;2)根据GIPC2的亚细胞定位和肿瘤相关功能再结合PD... 目的通过验证性筛选配体文库,获得GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,进而找到GIPC2的相互作用蛋白。方法 1)利用酵母双杂交的方法从已有的PDZ配体库中寻找与GIPC2的PDZ结构域配体结合特性;2)根据GIPC2的亚细胞定位和肿瘤相关功能再结合PDZ结构域结合序列的共同特征在蛋白质数据库中预测GIPC2的天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列依次与GIPC2 PDZ结构域或GIPC2全长进行验证反应,从而得到阳性蛋白。结果 1)GIPC2 PDZ结构域的配体结合特性是C末端最后4个氨基酸为-X-S/T-X-V/L/I,是Ⅰ类PDZ配体;2)综合GIPC2的生物学特征和GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,在蛋白质数据库中预测得到47个天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列克隆至酵母双杂交系统进行验证,最后得到10个确定的阳性蛋白。结论获得10个GIPC2相互作用蛋白。 展开更多
关键词 gipc2 PDZ结构域 蛋白质相互作用 PDZ配体库 酵母双杂交
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利用同源序列确定人GIPC2核心启动子和寻找可能的顺式作用元件
2
作者 程志凯 郑直 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第5期688-693,共6页
目的利用同源序列确定人GIPC2核心启动子区和寻找可能存在的基因调控区域。方法 1)利用Vista比对不同物种GIPC2基因编码区和非编码区序列,得到GIPC2同源序列;2)分别构建插入人和大鼠GIPC2翻译起始位点ATG上游不同长度截短片段的重组质粒... 目的利用同源序列确定人GIPC2核心启动子区和寻找可能存在的基因调控区域。方法 1)利用Vista比对不同物种GIPC2基因编码区和非编码区序列,得到GIPC2同源序列;2)分别构建插入人和大鼠GIPC2翻译起始位点ATG上游不同长度截短片段的重组质粒,转染人HEK293T细胞和大鼠PC12细胞;3)根据报告基因荧光强度推断人和大鼠GIPC2的核心启动子区;4)将人GIPC2内含子区同源序列置于核心启动子前面,构建重组质粒,转染HEK293T,HT-29和PC12细胞,检测启动子活性。结果人GIPC2核心启动子区确定为+32至+190序列区域;人和大鼠GIPC2 ATG上游一段同源序列有抑制GIPC2启动子活性的功能;人和大鼠GIPC2第一个内含子内的同源序列有促进启动子活性的功能。结论利用同源序列方法确定了人GIPC2基因的核心启动子区,并且找到能抑制和促进GIPC2启动子活性的可能的顺式作用元件。 展开更多
关键词 gipc2 核心启动子区 同源序列 基因表达调控
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结直肠癌中GIPC2表达及临床病理意义
3
作者 刘雅新 闫文卿 +6 位作者 马怡君 韩微 周彩婷 吴艳 严雪冰 徐健 王磊 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期205-208,共4页
目的探讨GIPC2在结直肠癌组织中的表达及意义。方法收集95例结直肠癌,采用免疫组化SP法检测结直肠癌组织和癌旁正常肠组织中GIPC2的表达,分析其与结直肠癌临床病理特征及预后的相关性。结果生物信息学分析和GEPIA基因库分析结果提示,GI... 目的探讨GIPC2在结直肠癌组织中的表达及意义。方法收集95例结直肠癌,采用免疫组化SP法检测结直肠癌组织和癌旁正常肠组织中GIPC2的表达,分析其与结直肠癌临床病理特征及预后的相关性。结果生物信息学分析和GEPIA基因库分析结果提示,GIPC2在结直肠癌组织中呈低表达;免疫组化标记GIPC2呈胞质阳性,其在结直肠癌组织中的阳性率明显低于癌旁正常肠组织(低表达率57.9%vs 13.7%;高表达率42.1%vs 86.3%,P<0.001);GIPC2表达与结直肠癌患者性别、年龄、肿瘤最大径和组织学分型无关(P均>0.05),与肿瘤分化程度、淋巴结转移和TNM分期相关(P均<0.05);GIPC2低表达组患者的2年生存率低于GIPC2高表达组患者(47.3%vs 72.5%,P<0.05)。结论GIPC2在结直肠癌组织中呈低表达,且与肿瘤分化程度、淋巴结转移、TNM分期及患者预后密切相关,可作为结直肠癌诊断与预后评判的潜在指标。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 gipc2 免疫组织化学
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