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Functional and structural characterization of Norovirus GII.6 in recognizing histo-blood group antigens 被引量:3
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作者 Xin Cong Han-bo Li +5 位作者 Xiao-man Sun Jian-xun Qi Qing Zhang Zhao-jun Duan Yong Xu Wen-lan Liu 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期56-65,共10页
Noroviruses(NoVs)are the primary cause of acute gastroenteritis worldwide.Histo-blood group antigens(HBGAs)are receptors or attachment factors that affect the prevalence and host susceptibility of NoVs.GII.6 NoV is on... Noroviruses(NoVs)are the primary cause of acute gastroenteritis worldwide.Histo-blood group antigens(HBGAs)are receptors or attachment factors that affect the prevalence and host susceptibility of NoVs.GII.6 NoV is one of the predominant genotypes in humans,which recognizes the type ABO secretor of HBGAs.However,the structural basis of GII.6 NoV's interaction with HBGAs receptors remains elusive.In this study,we investigated the binding features of the GII.6 strain to HBGAs using saliva-and glycan-ELISA assays and characterized the molecular basis of the GII.6 virus that recognizes H disaccharide.We showed that the GII.6 P domain recognized some A and O secretor's saliva samples,most B secretor's saliva samples,and H disaccharide antigen,but did not bind non-secretors’saliva.Further,we determined the crystal structures of GII.6 and its complex with H disaccharides at 1.7Å,revealing that the P domain of GII.6 shares the conventional binding interface and mode of GII HBGAs.Single residue mutations at the GII.6-H binding sites could inhibit the binding of GII.6 to HBGAs,demonstrating that the interaction residues were crucial in maintaining NoV-glycan integrity.Finally,structural and sequence analyses showed that the major residues of the GII.6-H interaction were conserved among NoVs in the GII genogroup.Taken together,our study characterized the functional and structural features of GII.6 that allow it to interact with HBGAs,and shed light on NoV evolution,epidemiology,and anti-viral drug development. 展开更多
关键词 Noroviruses(NoVs) Histo-blood group antigens(HBGAs) gii.6 P protein structure H disaccharides
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GII.6型诺如病毒P蛋白原核表达及多克隆抗体制备 被引量:1
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作者 亢涛 陈伟 +4 位作者 辛斯琪 张宇洋 苑荣亮 邵聪文 井申荣 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期191-196,共6页
目的原核表达GII.6型诺如病毒(norovirus,NoV)P蛋白和制备多克隆抗体。方法扩增NoV GII.6型P区基因并克隆至pET28a载体,转化感受态E.coli BL21(DE3),IPTG诱导进行原核表达。使用Ni-NTA亲和柱层析进行纯化,重组蛋白进行寡糖结合分析,免疫... 目的原核表达GII.6型诺如病毒(norovirus,NoV)P蛋白和制备多克隆抗体。方法扩增NoV GII.6型P区基因并克隆至pET28a载体,转化感受态E.coli BL21(DE3),IPTG诱导进行原核表达。使用Ni-NTA亲和柱层析进行纯化,重组蛋白进行寡糖结合分析,免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体血清,ELISA测定该抗体的效价,western blot(WB)检测抗体的特异性,并进行有效性评估。结果成功构建了原核表达载体GII.6P-pET28a并表达相对分子质量约40×10^3的GII.6型P蛋白;Ni柱亲和层析纯化后纯度达90%以上;寡糖结合显示GII.6型P蛋白与B、leb、H2型结合,与A、H1、lea型不结合;ELISA测得抗体的效价为1∶160000;WB显示抗体具有较高特异性;交叉实验未显示出对GII.4的亲和力。结论成功表达了GII.6型P蛋白并获得高效价的抗体,为GII.6的检测和疫苗研发提供有效工具。 展开更多
关键词 gii.6 P蛋白 寡糖结合分析 原核表达 多克隆抗体
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诺如病毒GI.6[P11]与GII.13[P16]共感染的分子特征分析 被引量:3
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作者 蒋翠莲 曹雪 +2 位作者 艾静 陈亚军 付建光 《国际病毒学杂志》 2020年第2期102-106,共5页
目的在同一个标本中检测出了两种组别的诺如病毒,对这两个诺如病毒的分子特征进行初步分析。方法利用普通RT-PCR对两个病毒的部分聚合酶区及衣壳蛋白区片段进行扩增和序列测定。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA软件及BEAST软... 目的在同一个标本中检测出了两种组别的诺如病毒,对这两个诺如病毒的分子特征进行初步分析。方法利用普通RT-PCR对两个病毒的部分聚合酶区及衣壳蛋白区片段进行扩增和序列测定。通过BioEdit软件进行序列比对分析,采用MEGA软件及BEAST软件分别构建进化树进行进化分析,Simplot软件进行重组位点分析。结果序列进化分析显示标本中确实存在两种不同型别且不同组别的诺如病毒,分别为GI.6[P11]型与GII.13[P16]型;时间进化分析显示GI.P11位于2013—2018分支,GII.13位于GII.13[P16]的2013—2018分支,平均替换速率分别为1.6×10^-3及1.9×10^-3替换/位点/年;GII.13[P16]可能的重组位点在病毒的开放读码框架1上。结论本研究对少见的共感染的两种型别重组诺如病毒进行了初步分析,为同种型别的深入研究提供了基础参考数据。 展开更多
关键词 诺如病毒 重组 GI.6[P11] gii.13[P16]
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诺如病毒河北卢龙株NHBGR59全基因组序列分析 被引量:1
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作者 敖元云 虞结梅 +2 位作者 李莉莉 靳淼 段招军 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2016年第3期266-269,共4页
目的 分析河北卢龙县腹泻儿童粪便标本中存在的诺如病毒株NHBGR59的全基因组序列,了解其基因结构特点和进化特征。方法根据454高通量测序获得的两个重叠群(contig)和诺如病毒参考株序列(GenBank登录号KM198534)设计NHBGR59特异性... 目的 分析河北卢龙县腹泻儿童粪便标本中存在的诺如病毒株NHBGR59的全基因组序列,了解其基因结构特点和进化特征。方法根据454高通量测序获得的两个重叠群(contig)和诺如病毒参考株序列(GenBank登录号KM198534)设计NHBGR59特异性引物,用重叠反转录聚合酶链反应(ReversetranscriptionPCR,RT—PCR)和cDNA末端快速扩增的技术(rapid—amplificationofcDNAends,RACE)的方法扩增其全长基因,经过分子克隆、测序获得全基因组序列,然后进行三个开放阅读框(OpenReadingFrames,ORFs)序列和系统进化树的分析。结果诺如病毒河北卢龙珠HBGR59病毒全基因组全长为7563bp(除了PolyA尾),病毒基因组分为三个ORFs:ORF1(5~5098nt)、ORF2(5079—6731nt)和ORF3(6731~7510nt),其中ORFl和ORF2之间有20bp重叠,ORF2和ORF3之间有lbp重叠。经过全基因组序列分析发现其和基因组II基因型6(genogroupIIGenotypeVI,GII.6)诺如病毒株30443同源性最高(同源性为98.O%)。ORF2以及ORF3核苷酸和氨基酸序列与株30443同源性最高(分别为97.0%,98.0%;99.0%,98.0%)。ORFI的基因和氨基酸序列与台湾暴发的急性胃肠炎GII.6株11-FJ-5(GenBank号KM461694)同源性最高(99.0%,99.3%),只在高突变P2区发生一个氨基酸突变位点:aa308D—N;其中衣壳区的氨基酸序列与其他GII-6型诺如病毒相似度为73.0%~99.3%。进化树分析发现河北卢龙株HBGR59与GII.6型株30443和11-FJ-5亲缘关系最近。结论河北卢龙株HBGR59为诺如病毒GII.6型,进化关系上与已报道的GII.6型株30443和11-FJ-5最近。 展开更多
关键词 诺如病毒 gii.6 进化树 基因组
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