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苹果矮化中间砧“SH6”中GID2基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 王恩莹 晁琳珂 +2 位作者 郝素晓 卢艳芬 姚允聪 《安徽农业科学》 CAS 2021年第9期104-108,112,共6页
探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制。从苹果矮化砧木“SH6”中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下... 探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制。从苹果矮化砧木“SH6”中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下的表达情况。序列分析表明,GID2-1基因的CDS序列长度为591 bp,GID2-2为597 bp,分别编码196、198个氨基酸的蛋白质;GID2基因具有F-box结构域。qRT-PCR分析表明,在GA处理下,表达量下调;相反,在PAC处理下其表达量上调。结果表明,GID2基因可能在苹果生长发育方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 SH6 gid2 生长发育 生物信息学 赤霉素
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日本发现可控制水稻高度增加粮食产量蛋白质GID2
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《中国稻米》 2003年第3期43-43,共1页
关键词 日本 水稻 高度控制 粮食产量 蛋白质 gid2 赤霉素
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日本发现可使粮食增产的蛋白质GID2
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《吉林农业农村经济信息》 2003年第5期17-17,共1页
关键词 日本 蛋白质gid2 粮食 产量 营养水平
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花生赤霉素代谢途径中三个基因家族鉴定与分析
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作者 朱丹青 向雪林 +7 位作者 汪柏丞 禹晨晏 徐国凤 袁鹏辉 刘登望 曾宁波 罗梓楠 李林 《花生学报》 北大核心 2024年第4期15-27,共13页
为了探究花生赤霉素代谢途径中3个基因家族DELLA、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1(GID1)、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF2(GID2)在花生中的功能,利用生物信息学方法对其进行鉴定,并系统分析其理化性质、定位信息、基因结构、蛋白结构... 为了探究花生赤霉素代谢途径中3个基因家族DELLA、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1(GID1)、GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF2(GID2)在花生中的功能,利用生物信息学方法对其进行鉴定,并系统分析其理化性质、定位信息、基因结构、蛋白结构、保守基序、系统进化树、顺势作用元件及表达模式。结果表明,花生DELLA基因家族包含6个成员,均有共同的保守基序且都含有DELLA或DELLA superfamily结构域,外显子均有1个;花生GID1基因家族有57个成员,都含有Abhydrolase_3结构域,但仅有3个共有的保守基序;花生GID2基因家族成员11个,都含有F-box的结构域且外显子均有1个,但仅有3个共有的保守基序。3个基因家族在染色体上呈不均匀分布,且在染色体两端分布的数量较多;系统进化分析发现,赤霉素代谢途径的3个基因都与大豆的亲缘关系较近,其启动子区域含有大量的顺式作用元件,花生赤霉素代谢途径中51.35%基因家族成员有赤霉素响应元件;大多赤霉素响应元件的基因在各个组织中表达水平低,部分基因主要是在籽仁和果皮的发育阶段表达较高。以上研究丰富了我们对花生赤霉素代谢途径中DELLA、GID1、GID2基因家族的理解,为后续花生赤霉素代谢途径中3个基因家族功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 花生 DELLA GID1 gid2 基因家族 生物信息学分析 赤霉素代谢途径
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山药DoSCF108基因的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 李钰婷 周芸伊 +3 位作者 肖冬 何龙飞 詹洁 王爱勤 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第4期1084-1092,共9页
为研究F-box蛋白GID2在DELLA蛋白介导赤霉素调节山药块茎膨大发育的分子机理,本研究根据转录组序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术克隆到一个山药F-box蛋白GID2基因,在利用生物信息学软件对其序列进行分析的同时通过RT-qPCR技术分析了赤... 为研究F-box蛋白GID2在DELLA蛋白介导赤霉素调节山药块茎膨大发育的分子机理,本研究根据转录组序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术克隆到一个山药F-box蛋白GID2基因,在利用生物信息学软件对其序列进行分析的同时通过RT-qPCR技术分析了赤霉素及其抑制剂多效唑(PP333)诱导下该基因在山药块茎膨大初期的表达动态。结果显示,从GH16山药块茎cDNA中克隆到一个长604 bp片段。该片段具有长522 bp的完整开放阅读框(ORF),编码173个氨基酸。预测其分子量为19.02 kD,等电点为9.23,属不稳定亲水蛋白,亚细胞定位在细胞核上,与DELLA蛋白互作系数最大。与已报道的48个物种F-box蛋白GID2氨基酸序列同源性在45.83%~93.64%之间,其中与薯蓣(XM_039286227)同源性最高,达93.64%。推测该基因属于F-box蛋白GID2家族,命名为DoSCF108(GenBank No.MW239683)。RT-qPCR结果表明,在山药块茎膨大初期,DoSCF108基因受外源GA3诱导,相对表达量显著提高,抑制剂PP333处理则相反,不同品种之间存在较大差异。综上所述,山药DoSCF108为F-box蛋白GID2基因,可能参与DELLA介导赤霉素调控山药块茎生长和发育。 展开更多
关键词 山药(Dioscorea opposite) F-box蛋白gid2 表达分析
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日本发现可使粮食增产的蛋白质
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作者 何德功 《世界农业》 北大核心 2003年第6期61-61,共1页
关键词 日本 粮食产量 gid2蛋白质 赤霉素 植物茎增高 控制作用
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日本发现可使粮食增产的蛋白质
7
《中外科技信息》 北大核心 2003年第6期68-68,共1页
关键词 农作物 植物茎 生长机理 gid2”蛋白质 赤霉素 基因技术 粮食产量
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