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GID/CTLH结构与功能研究进展
1
作者 冯燕 李维维 +1 位作者 周泉 刘志锋 《陕西医学杂志》 2025年第6期846-851,共6页
人类C端LisH(CTLH)复合体在酵母中被称为葡萄糖诱导降解缺陷复合体(GID),是一种真核生物特有的具有E3泛素连接酶活性的多亚基复合体,从酵母到人类高度保守。酵母中GID复合体的功能主要是在给葡萄糖缺乏的细胞补充新的葡萄糖时能迅速关... 人类C端LisH(CTLH)复合体在酵母中被称为葡萄糖诱导降解缺陷复合体(GID),是一种真核生物特有的具有E3泛素连接酶活性的多亚基复合体,从酵母到人类高度保守。酵母中GID复合体的功能主要是在给葡萄糖缺乏的细胞补充新的葡萄糖时能迅速关闭糖异生过程,使得细胞从糖异生回到正常的糖酵解状态,是酵母作为单细胞生物快速响应外界环境营养条件改变、最大化利用能量和保证自身生存的机制之一。近年对高等哺乳动物中CTLH复合体的研究逐步确定了复合体亚基的组成和构象变化机制,功能研究表明CTLH复合体控制着各种必需的生理、生化途径和关键生物反应,其结构和组成的复杂性是实现这些功能的基础。现对GID/CTLH复合体的组成、结构及功能的最新研究进展进行总结,旨在为该蛋白复合体的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 C端LisH复合体 葡萄糖诱导降解缺陷复合体 E3泛素连接酶 泛素-蛋白酶体途径 泛素化修饰 糖代谢
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基于转录组的非洲菊GID1家族成员鉴定、分子特性与进化分析
2
作者 姜乃钰 《集宁师范学院学报》 2024年第3期71-77,共7页
非洲菊作为世界性鲜切花,具有观赏价值和经济价值。本研究应用生物信息学分析手段,在非洲菊全转录组中鉴定到5个赤霉素代谢相关受体蛋白GID1的家族成员(GID1-like1,GID1-like2,GID1-like3,GID1-like4,GID1-like5)。其理化性质分析结果显... 非洲菊作为世界性鲜切花,具有观赏价值和经济价值。本研究应用生物信息学分析手段,在非洲菊全转录组中鉴定到5个赤霉素代谢相关受体蛋白GID1的家族成员(GID1-like1,GID1-like2,GID1-like3,GID1-like4,GID1-like5)。其理化性质分析结果显示:非洲菊GID1家族多为酸性,具有亲水性的非分泌蛋白,多数具有跨膜结构,其主要构成元件为α-螺旋和无规则卷曲;进化树分析结果表明,非洲菊GID1家族主要为四大分支,所挖掘到的GID1-like3和GID1-like4属于第一大分支,而GID1-like1、GID1-like2、GID1-like5同属于第三大分支;家族互作网络及蛋白保守结构域预测结果显示,GID1家族可能参与植物生长发育过程中赤霉素传导过程。研究结果将为揭示GID1家族在非洲菊赤霉素代谢途径中的生物学功能及非洲菊品种优化提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 非洲菊 赤霉素 gid1 进化分析
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棉花赤霉素不敏感矮化GID1同源基因的克隆和表达分析 被引量：18
3
作者 董静 尹梦回 +6 位作者 杨帆 赵娟 覃珊 侯磊 罗明 裴炎 肖月华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1822-1830,共9页
作为赤霉素（GA）受体,GID1是其重要的信号传导组分。为研究GA在棉花发育（特别是纤维发育）中的作用,本文在EST序列的基础上克隆了6个棉花GID1同源基因（GhGID1-1-6）。多重序列分析表明,棉花GID1同源蛋白GhGID1-1-6与拟南芥和水稻的G... 作为赤霉素（GA）受体,GID1是其重要的信号传导组分。为研究GA在棉花发育（特别是纤维发育）中的作用,本文在EST序列的基础上克隆了6个棉花GID1同源基因（GhGID1-1-6）。多重序列分析表明,棉花GID1同源蛋白GhGID1-1-6与拟南芥和水稻的GID1蛋白高度同源,具有多个与GA和DELLA蛋白的结合位点以及激素敏感酯酶家族保守域HGG和GXSXG。定量RT-PCR分析表明,GhGID1-1-6基因在棉花不同器官和组织中表达水平有差异,其中GhGID1-1和GhGID1-2在花器官中高表达,GhGID1-4基因在纤维和根中优势表达。胚珠体外培养基中外加GA使GID1同源基因表达水平发生变化,GhGID1-1和GhGID1-2基因的表达水平明显受GA抑制。比较发现,在胚珠和纤维中优势表达的GID1同源基因不同,GID1基因表达水平随发育时期变化的趋势也不相同,表明棉花胚珠和纤维具有相对独立的GA信号识别系统。 展开更多
关键词 gid1 棉花 纤维发育 表达特异性
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茶树赤霉素受体基因CsGID1a的克隆与表达分析 被引量：18
4
作者 岳川 曾建明 +4 位作者 曹红利 郝心愿 章志芳 王新超 杨亚军 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期599-608,共10页
GID1作为赤霉素信号转导的受体,在赤霉素作用中具有重要作用。采用同源克隆方法,利用RT-PCR和RACE技术在茶树中克隆到赤霉素受体基因GID1的cDNA全长,命名为CsGID1a(GenBank登录号为JX235369)。该基因全长1411bp,开放阅读框1023bp,编码34... GID1作为赤霉素信号转导的受体,在赤霉素作用中具有重要作用。采用同源克隆方法,利用RT-PCR和RACE技术在茶树中克隆到赤霉素受体基因GID1的cDNA全长,命名为CsGID1a(GenBank登录号为JX235369)。该基因全长1411bp,开放阅读框1023bp,编码341个氨基酸。生物信息学分析显示,CsGID1a编码的蛋白分子量为38.53kD,理论等电点为5.62;无信号肽位点,是非分泌性蛋白,具有1个跨膜区,基因被定位于细胞核内;CsGID1a氨基酸序列具有激素敏感性脂肪酶(HSL)家族蛋白的HGG、GXSXG功能域以及羧酸酯酶典型的三级结构;与其他物种的GID1相似性均在60%以上,与葡萄的相似性最大达87%、进化关系最近。荧光定量PCR结果显示,高浓度(1.0×10-5molL-1)GA3能够下调CsGID1a的表达,5h内的表达呈下降趋势;随着越冬茶芽萌动进程,CsGID1a表达量逐渐降低,特别在3月初萌发以后变化较大,推测赤霉素及其受体基因可能与茶树越冬芽解休眠相关。 展开更多
关键词 茶树 赤霉素 gid1 表达分析 茶芽解休眠
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板栗赤霉素缺陷型短雄花序芽变的初步鉴定及CmGID1基因的表达分析 被引量：12
5
作者 李兴亮 郭献平 +3 位作者 沈元月 曹庆芹 冯永庆 秦岭 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1251-1258,共8页
利用赤霉素、细胞分裂素、脱落酸、乙烯利和吲哚乙酸分别涂抹板栗短雄花序,结果显示仅赤霉素能够抑制短雄花序顶端的细胞程序性死亡,并在一定程度上恢复短雄花序的伸长生长。通过RT-PCR扩增方法,从板栗短雄花序芽变和正常雄花序cDNA中... 利用赤霉素、细胞分裂素、脱落酸、乙烯利和吲哚乙酸分别涂抹板栗短雄花序,结果显示仅赤霉素能够抑制短雄花序顶端的细胞程序性死亡,并在一定程度上恢复短雄花序的伸长生长。通过RT-PCR扩增方法,从板栗短雄花序芽变和正常雄花序cDNA中克隆出赤霉素受体基因GID1部分序列。测序及序列分析结果表明:克隆的cDNA片段为786 bp,所推导的氨基酸序列与杨毛果GID1氨基酸序列有91%的同源性,与陆地棉、蓖麻GID1均有85%的氨基酸序列同源性。经氨基酸序列功能分析,推测该GID1序列是板栗有编码功能的赤霉素受体基因,命名为CmGID1(GenBank登录号为HQ651231)。实时荧光定量PCR结果显示,从花序萌发至花药萌发前期,除其中一个时期(5月23日)外,芽变短雄花序CmGID1的表达量均高于正常雄花序;在花序的快速生长期,芽变短雄花序CmGID1表达量显著高于正常雄花序(P<0.01);且赤霉素处理后恢复生长的短雄花序CmGID1表达量显著降低(P<0.01)。综合试验结果,初步揭示了该短雄花序为一个赤霉素缺陷型突变体。 展开更多
关键词 板栗 短雄花序 gid1 GA缺陷型突变体 实时定量PCR
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GID钻井液在渤中油田的研究和应用 被引量：8
6
作者 苗海龙 李国钊 王昌军 《钻井液与完井液》 CAS 2009年第2期90-92,共3页
渤海油田渤中地区明化镇组泥岩中黏土含量较高,水敏性较强,钻井时易发生泵压上升、扭矩增大、憋漏地层或者卡钻等复杂情况。为解决上述作业风险,采用聚胺(PF-UHIB)作为主要的抑制剂,研制开发出了GID钻井液。该钻井液抑制性强,能够有效... 渤海油田渤中地区明化镇组泥岩中黏土含量较高,水敏性较强,钻井时易发生泵压上升、扭矩增大、憋漏地层或者卡钻等复杂情况。为解决上述作业风险,采用聚胺(PF-UHIB)作为主要的抑制剂,研制开发出了GID钻井液。该钻井液抑制性强,能够有效抑制水敏性泥页岩的水化膨胀,并且抗无用土相侵害能力强,同时具有优良的润滑性和储层保护效果。在BZ28-2S油田的应用表明,GID钻井液性能稳定,具有良好的抗温稳定性和润滑性、低的滤失性,封堵性以及储层保护效果好,起下钻顺畅,井眼规则,能满足大斜度井钻进携砂的要求,能有效地抑制泥岩的水化膨胀和分散,避免钻头泥包和钻屑黏连成块,同时提高了起钻效率。 展开更多
关键词 gid钻井液 包被抑制剂 井眼稳定 防地层损害
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玉米赤霉素受体基因ZmGID1a的克隆及功能研究 被引量：3
7
作者 白文钦 胡明瑜 +4 位作者 潘晓雪 蒋晓英 吴红 雷开荣 罗明 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2019年第1期133-140,共8页
为研究赤霉素(GA)受体GID (gibberellin insensitive dwarf),克隆编码玉米GID的同源基因ZmGID1a,分析其在物种间的保守性和系统进化关系。通过实时定量PCR分析该基因在玉米中的表达特性以及不同激素对该基因表达水平的影响。亚细胞定位... 为研究赤霉素(GA)受体GID (gibberellin insensitive dwarf),克隆编码玉米GID的同源基因ZmGID1a,分析其在物种间的保守性和系统进化关系。通过实时定量PCR分析该基因在玉米中的表达特性以及不同激素对该基因表达水平的影响。亚细胞定位确定蛋白在细胞核和膜上,利用酵母双杂技术分析Zm GID1a与GA负调控因子玉米DELLA-8和DELLA-9的互作。还分析了表达Zm GID1a转基因烟草的生理指标。这些结果表明Zm GID1a和其他已报道的同源蛋白功能相似。 展开更多
关键词 玉米 gid1a基因 亚细胞定位 蛋白互作 烟草转基因
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基于GiD的有限元前处理和后处理可视化 被引量：5
8
作者 汤井田 公劲喆 《地球物理学进展》 CSCD 北大核心 2010年第1期186-195,共10页
目前在地球物理数值计算领域,尚缺乏简便易行的可视化的前处理和后处理方法.这使得复杂计算模型较难建立和分析,也使得已有计算程序较难与生产实际相结合.本文以直流电法三维有限元数值模拟前后处理为例,研究了通用三维前后处理软件GiD... 目前在地球物理数值计算领域,尚缺乏简便易行的可视化的前处理和后处理方法.这使得复杂计算模型较难建立和分析,也使得已有计算程序较难与生产实际相结合.本文以直流电法三维有限元数值模拟前后处理为例,研究了通用三维前后处理软件GiD在地球物理有限元前处理和后处理中的应用方法.通过编写用户自定义"问题类型",建立并输出了可用于已有有限元计算程序的初始模型.计算过程结束之后,通过调用GiDpost后处理函数库,使计算程序方便的生成特定格式的后处理文件.最后,将前处理、计算和后处理功能整合,成功实现整个过程的图形化.与目前其他地球物理有限元前后处理方法相比,此套方法效率高、简单易行,最重要的是通用性好,可适用于各种已有的地球物理有限元计算程序. 展开更多
关键词 gid 地球物理 有限元 前处理 后处理
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基于GID的程序界面设计及应用 被引量：3
9
作者 姚纬明 牛志伟 李同春 《水利水电科技进展》 CSCD 2003年第3期22-24,共3页
利用有限元前后处理软件GID提供的用户自定制功能和TCL/TK语言,在GID中进行可视化界面设计,使有限元计算程序GEHOMadrid与前后处理软件GID有机地结合起来,从而避免了为计算程序准备大量数据的烦琐工作,简化了有限元程序的使用.
关键词 有限元法 gid 前后处理 程序界面
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针叶树GID1同源基因分离鉴定与功能预测 被引量：2
10
作者 张运城 周长虹 +1 位作者 钮世辉 李伟 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期40-48,共9页
GID1作为赤霉素(GA)受体蛋白,是GA信号通路的重要组成部分,其编码基因GID1在被子植物中已经被广泛克隆,但在针叶树种中的研究十分滞后。为了分离针叶树GA受体GID1基因并推测其功能,本研究以拟南芥GID1s序列为探针,在油松高质量参考转录... GID1作为赤霉素(GA)受体蛋白,是GA信号通路的重要组成部分,其编码基因GID1在被子植物中已经被广泛克隆,但在针叶树种中的研究十分滞后。为了分离针叶树GA受体GID1基因并推测其功能,本研究以拟南芥GID1s序列为探针,在油松高质量参考转录组内筛选并鉴别出了油松GID1直系同源基因;基于该基因序列同源克隆了樟子松、白皮松、赤松GID1基因,通过BLAST获得了日本落叶松、火炬松、白云杉与挪威云杉的GID1-like基因;对针叶树GID1基因进行序列保守性、蛋白结构和组织表达活性分析。结果表明:针叶树种很可能只含有一个GID1基因,该基因在针叶树中具有很高的保守性;虽然与被子植物GID1之间的序列一致性较低,但其保持GA亲和活性所必需的氨基酸残基十分保守,与其下游DELLA蛋白相互作用的功能域与结构同样十分保守,推测其在针叶树GA信号转导中具有受体功能;表达分析显示GID1在挪威云杉不同组织和油松雌雄球花不同发育阶段间表达较为稳定,表明GID1可能广泛参与这些组织的发育过程,针叶树GA信号调控通路中GA受体的转录调控可能并不是核心调控机制。研究结果为GID1基因在针叶树生长发育过程中的分子调控机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 赤霉素 针叶树 gid1基因 分离鉴定 功能预测
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基于GiD的钢桁梁桥有限元建模研究 被引量：2
11
作者 李兴田 张丽萍 《兰州交通大学学报》 CAS 2016年第6期24-28,共5页
基于GiD有限元前后处理器,结合计算机图形学,利用TCL/TK编程语言和OpenGL图形函数库,研究了钢桁梁桥有限元模型显示的技术和方法,实现了钢桁梁桥有限元模型的三维可视化,为有限元计算的前后处理器和自编求解器的结合提供了方法和思路.
关键词 gid 钢桁梁桥 有限元 可视化
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赤霉素的代谢途径及其受体GID1的功能研究进展 被引量：6
12
作者 齐蒙 李国瑞 +1 位作者 黄凤兰 陈永胜 《种子科技》 2017年第4期122-123,共2页
双萜类激素赤霉素(GA)在植物发育的整个生命周期中都起调节作用。生理学和遗传学表明,活性赤霉素可促进植物发芽和生长,在一些物种中,诱导开花的同时调节花、果实和种子的发育。GA的分子机制包括赤霉素(GA)的代谢、转运、感知,及发出信... 双萜类激素赤霉素(GA)在植物发育的整个生命周期中都起调节作用。生理学和遗传学表明,活性赤霉素可促进植物发芽和生长,在一些物种中,诱导开花的同时调节花、果实和种子的发育。GA的分子机制包括赤霉素(GA)的代谢、转运、感知,及发出信号调节信号回路在赤霉素(GA)途径和其他途径之间控制植物生长和发育对植物内部和外部诱因作出响应。 展开更多
关键词 赤霉素 gid1 赤霉素代谢途径 分子机制
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一种基于EPC GID-96型食品供应链追溯标签编码方案设计 被引量：2
13
作者 舒远仲 吴小玲 戴海辉 《物流工程与管理》 2017年第4期81-84,共4页
统一合理的标签编码方案是构建食品供应链追溯系统的基础。因此,通过对RFID标签技术、EPC编码结构、编码规则与特点的研究选用独立性强、无目标种类限制的通用标识符EPC GID-96,对EPC各代码段合理分配,为食品供应链追溯提供标签编码参考... 统一合理的标签编码方案是构建食品供应链追溯系统的基础。因此,通过对RFID标签技术、EPC编码结构、编码规则与特点的研究选用独立性强、无目标种类限制的通用标识符EPC GID-96,对EPC各代码段合理分配,为食品供应链追溯提供标签编码参考,该编码体系具有通用性。 展开更多
关键词 RFID标签 EPC编码 gid-96 编码方案 食品供应链追溯
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梨赤霉素受体基因GID1的鉴定及表达分析 被引量：5
14
作者 刘若南 陶星宇 +3 位作者 焦玉茹 袁凯莉 张绍铃 陶书田 《植物生理学报》 CSCD 北大核心 2021年第7期1527-1537,共11页
赤霉素受体(gibberellin insensitive dwarf,GID1)是赤霉素信号转导过程中关键介质,在调节植物生长发育中起到重要作用。本文采用生物信息学分析方法对梨(Pyrus spp.)中GID1基因家族进行鉴定并研究其在不同组织和果实发育过程中表达情... 赤霉素受体(gibberellin insensitive dwarf,GID1)是赤霉素信号转导过程中关键介质,在调节植物生长发育中起到重要作用。本文采用生物信息学分析方法对梨(Pyrus spp.)中GID1基因家族进行鉴定并研究其在不同组织和果实发育过程中表达情况。结果表明,梨基因组存在50个GID1基因,其中包括3个直系同源基因。其染色体分布广泛,除1号和8号染色体以外均有分布。亚细胞定位预测表明大多定位于质膜,发挥信号接收和传递的作用。大多数基因仅有1个外显子,不存在内含子,且保守基序motif 1、2、4和8为大部分基因所共有;PbGID1启动子区域含有多个光和激素响应元件。RT-qPCR结果表明,PbGID1在根、叶和果实中高表达,在茎和花粉中几乎不表达;PbGID1受到赤霉素响应,表达量显著增加。RNA-seq表达量分析表明,PbGID1在果实发育各个时期均有表达。 展开更多
关键词 梨 gid1基因 基因组学 表达分析
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基于GID的UBI系统研究 被引量：3
15
作者 彭江琴 刘南杰 +1 位作者 仲浩 赵海涛 《微型机与应用》 2014年第22期51-53,共3页
针对传统车险中用户关系管理不明显、个性化增值服务少、保费不合理等问题,基于GID技术对UBI系统进行研究。在车联网"端-管-云"架构的基础上,提出了新型的UBI系统模型,从信息感知、初步数据处理、数据传递、云端的驾驶行为数... 针对传统车险中用户关系管理不明显、个性化增值服务少、保费不合理等问题,基于GID技术对UBI系统进行研究。在车联网"端-管-云"架构的基础上,提出了新型的UBI系统模型,从信息感知、初步数据处理、数据传递、云端的驾驶行为数据挖掘和车主的费率等方面对UBI系统进行模块化功能描述和分析。系统的功能分析表明,基于GID的UBI系统在车险行业有很好的应用前景。 展开更多
关键词 gid UBI 车联网 车险
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基于GID二次开发的复杂模型建模及瞬变电磁三维正演 被引量：1
16
作者 曾友强 武军杰 李貅 《地球物理学进展》 CSCD 北大核心 2015年第5期2412-2419,共8页
基于时域有限差分(FDTD)的瞬变电磁三维正演已经基本实现,但是复杂三维体的建模还存在问题,从而影响瞬变电磁对于复杂模型响应规律的分析.本文针对复杂模型的几何建模及Yee元胞的网格剖分问题,基于GID软件平台进行了二次开发,编写了&quo... 基于时域有限差分(FDTD)的瞬变电磁三维正演已经基本实现,但是复杂三维体的建模还存在问题,从而影响瞬变电磁对于复杂模型响应规律的分析.本文针对复杂模型的几何建模及Yee元胞的网格剖分问题,基于GID软件平台进行了二次开发,编写了"FDTD问题类型",通过编写代码,获得了能够直接应用于FDTD三维正演的网格剖分节点数据.文中利用GID软件对实际采矿巷道、隧道内TBM机模型、以及矿体模型进行建模,并采用FDTD方法进行正演计算.计算结果表明,基于二次开发的GID的可视化建模能够满足目前复杂模型建模的需求,为瞬变电磁FDTD三维正演模拟提供有力的支持. 展开更多
关键词 gid软件 可视化 三维建模 瞬变电磁法 FDTD
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在GID程序内整合有限元本体程序的研究 被引量：1
17
作者 吕艳萍 白凤军 +1 位作者 潘钦锋 陈福全 《福建工程学院学报》 CAS 2005年第4期315-318,共4页
讨论了利用GID科学可视化前后处理程序实现有限元程序的整合方法,重点介绍了前处理程序模版文件的格式以及无需更改有限元本体程序即可同GID接口的处理方法。研究表明,可以用GID作为有限元前后处理程序完成有限元程序的可视化。
关键词 有限元 gid 科学计算可视化
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参薯GID1基因家族的挖掘和特征分析 被引量：2
18
作者 蔡校森 吴晓龙 +1 位作者 黄东益 夏薇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第24期8029-8034,共6页
参薯属于薯蓣科薯蓣属,是热区重要的薯类作物,具有很高的营养价值和药用价值。GID1基因是赤霉素受体蛋白,在植物的生长和发育中起关键作用。本研究采用生物信息学方法对参薯基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、系统进化、保... 参薯属于薯蓣科薯蓣属,是热区重要的薯类作物,具有很高的营养价值和药用价值。GID1基因是赤霉素受体蛋白,在植物的生长和发育中起关键作用。本研究采用生物信息学方法对参薯基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、系统进化、保守基序以及表达模式等进行分析,通过分子实验筛选DELLA2-PGBKT7自激活抑制剂3-AT的浓度,酵母双杂交实验验证参薯GID1的互作基因。结果表明,参薯基因组中含有4个GID1家族成员,各成员都含有1个内含子。系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白处于两个不同分支,参薯中GID1C-1和GID1C-4处于同一分支,GID1C-2和GID1C-3处于同一分支。保守基序分析发现,参薯中GID1C-1和GID1C-4含有10个完整的蛋白保守序列。表达模式分析结果显示,DaGID1C-1和DaGID1C-4在块茎、叶片和零余子中表达较高。分子实验表明:随着菌液稀释倍数和3-AT浓度的增加,DELLA2-PGBKT7自激活抑制效果显著。酵母双杂交实验表明,DELLA2是GID1C-1和GID1C-4的互作基因。 展开更多
关键词 参薯(Dioscorea alata L.) gid1基因 生物信息学分析 酵母双杂交实验
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杜梨PbGID1家族基因克隆、CRISPR/Cas9载体构建及遗传转化 被引量：1
19
作者 宋平丽 李刚 +3 位作者 许建锋 马青翠 亓宝秀 张玉星 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期15-22,共8页
为明确杜梨赤霉素受体(GID1)的生物学功能,以杜梨为试材,通过同源克隆方法得到PbGID1s基因,利用生物信息学分析软件构建基因结构并设计靶位点;利用酶切-连接方法将带有靶点的sgRNA表达盒构建至CRISPR/Cas9表达载体上;通过农杆菌介导方法... 为明确杜梨赤霉素受体(GID1)的生物学功能,以杜梨为试材,通过同源克隆方法得到PbGID1s基因,利用生物信息学分析软件构建基因结构并设计靶位点;利用酶切-连接方法将带有靶点的sgRNA表达盒构建至CRISPR/Cas9表达载体上;通过农杆菌介导方法,将CRISPR/Cas9表达载体转化至杜梨子叶中。结果表明,在杜梨基因组中克隆得到4个PbGID1s,分别命名为PbGID1b-1、PbGID1b-2、PbGID1c-1、PbGID1c-2,基因结构分析显示该家族基因均由2个外显子和1个内含子组成;氨基酸序列比对发现,PbGID1s均具有GID1家族所特有的HGG和GXSXG保守结构域;将含有5个靶位点的sgRNA表达盒成功构建至pYLCRISPR/Cas9P_(35S)-N植物表达载体上,可同时对该家族4个基因进行编辑;杜梨遗传转化试验结果表明,共计浸染595粒杜梨子叶,获得抗性芽176个,阳性植株33株,转化效率达到5.55%。成功构建了可以同时靶向杜梨PbGID1s家族基因的CRISPR/Cas9载体,通过农杆菌介导,成功将该载体转化至杜梨子叶,并获得阳性植株。 展开更多
关键词 杜梨 GA受体 gid1 CRISPR/Cas9 遗传转化
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苹果矮化中间砧“SH6”中GID2基因的克隆及生物信息学分析 被引量：2
20
作者 王恩莹 晁琳珂 +2 位作者 郝素晓 卢艳芬 姚允聪 《安徽农业科学》 CAS 2021年第9期104-108,112,共6页
探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制。从苹果矮化砧木“SH6”中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下... 探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制。从苹果矮化砧木“SH6”中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下的表达情况。序列分析表明,GID2-1基因的CDS序列长度为591 bp,GID2-2为597 bp,分别编码196、198个氨基酸的蛋白质;GID2基因具有F-box结构域。qRT-PCR分析表明,在GA处理下,表达量下调;相反,在PAC处理下其表达量上调。结果表明,GID2基因可能在苹果生长发育方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 SH6 gid2 生长发育 生物信息学 赤霉素
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