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马氏珠母贝生长激素诱导跨膜蛋白基因GHITM克隆与表达分析
被引量:
3
1
作者
罗少杰
陈伟耀
+3 位作者
杨创业
王庆恒
焦钰
邓岳文
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1973-1980,共8页
生长激素诱导跨膜蛋白(growth hormone-induced transmembrane protein,GHITM)是一类在进化上高度保守的跨膜蛋白,参与机体生长发育、老化及先天免疫等过程。为探究GHITM在马氏珠母贝生长发育过程中的作用,本实验利用c DNA末端快速扩增...
生长激素诱导跨膜蛋白(growth hormone-induced transmembrane protein,GHITM)是一类在进化上高度保守的跨膜蛋白,参与机体生长发育、老化及先天免疫等过程。为探究GHITM在马氏珠母贝生长发育过程中的作用,本实验利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE),克隆得到马氏珠母贝GHITM(Pinctada martensii GHITM,Pm-GHITM)基因c DNA全长序列,并对其序列特征以及在组织中的表达进行分析。结果显示:Pm-GHITM基因c DNA全长为1 468 bp,其中,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1 017 bp,编码338个氨基酸,5'UTR长62 bp,3'UTR长389 bp,分子量约为35.48 ku,等电点(p I)为9.87;多序列及系统进化树分析表明Pm-GHITM与其他物种的GHITM有较高的同源性,与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的GHITM相似度最高,为67%;结构域分析结果表明Pm-GHITM序列中包含一个高度保守的BI-1(Bax inhibitor-1)结构域;荧光定量数据指出Pm-GHITM在马氏珠母贝的血淋巴、外套膜、足、鳃、性腺、闭壳肌以及肝胰腺中均有表达,在性腺的表达量最高,肝胰腺和闭壳肌次之,血淋巴中的表达量最低(p<0.05)。本研究可以为进一步探究Pm-GHITM在马氏珠母贝的生长发育过程中的作用做铺垫。
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关键词
马氏珠母贝
Pm-
ghitm
基因克隆
荧光定量
表达分析
原文传递
中华鳖GHITM cDNA基因克隆及表达分析
被引量:
1
2
作者
熊钢
周先文
+4 位作者
马晓
曾丹
陈贞年
康骊
王晓清
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019年第6期173-179,共7页
为研究GHITM基因在中华鳖(Trionyx sinensis)胚胎发育及生长中的作用,本研究通过RT-PCR和RACE方法获得了中华鳖GHITM全长c DNA序列;采用实时荧光定量PCR对GHITM m RNA组织表达及不同温度孵化胚胎发育过程中的表达特性进行分析。结果显示...
为研究GHITM基因在中华鳖(Trionyx sinensis)胚胎发育及生长中的作用,本研究通过RT-PCR和RACE方法获得了中华鳖GHITM全长c DNA序列;采用实时荧光定量PCR对GHITM m RNA组织表达及不同温度孵化胚胎发育过程中的表达特性进行分析。结果显示,中华鳖GHITM c DNA序列长度为2650 bp,开放阅读框为1050 bp,5’非编码区为123 bp,3’非编码区为1477 bp,编码349个氨基酸,编码蛋白的等电点为10.01,分子量为37.12kDa。GHITM编码氨基酸序列由胞外区、跨膜区和胞内区组成,7个跨膜域组成跨膜区。GHITM编码氨基酸序列的同源性分析显示,中华鳖与锦龟(Chrysemys picta bellii)和绿海龟(Chelonia mydas)同属一个分支,3种鳄鱼构成一个分支,7种鸟类形成一个分支。实时荧光定量检测显示,GHITM基因在肝脏、肌肉和脑垂体中的表达水平较高,显著高于心脏、性腺、肠、肾脏和脾脏组织(P<0.05);50 g左右和500 g左右雄性个体肝脏中的GHITM基因表达量显著高于雌性个体(P<0.05);低温胁迫孵化能显著抑制胚胎肝脏中GHITM基因的表达(P<0.05)。上述研究结果表明,GHITM基因与中华鳖生长和胚胎发育密切相关,其在中华鳖胚胎中的表达受孵化温度调节。本研究为探讨中华鳖胚胎发育和生长提供理论依据。
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关键词
中华鳖
ghitm
基因克隆
胚胎发育
组织表达
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职称材料
仿刺参ghitm基因的克隆及LPS诱导后的表达分析
被引量:
2
3
作者
高杨
王胜男
+1 位作者
叶仕根
李华
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期543-549,共7页
根据GenBank中登录的仿刺参Apostichopus japonicus ghitm基因的EST片段,采用RACE扩增法克隆了仿刺参ghitm基因的c DNA全长序列,并利用qRT-PCR技术检测了经LPS诱导后仿刺参ghitm的表达变化情况。结果表明:仿刺参ghitm基因(Aj-ghitm)的c ...
根据GenBank中登录的仿刺参Apostichopus japonicus ghitm基因的EST片段,采用RACE扩增法克隆了仿刺参ghitm基因的c DNA全长序列,并利用qRT-PCR技术检测了经LPS诱导后仿刺参ghitm的表达变化情况。结果表明:仿刺参ghitm基因(Aj-ghitm)的c DNA序列全长为1325 bp,包含一个1005 bp编码334个氨基酸的开放阅读框,序列两端分别为140 bp的5'UTR和180 bp的3'UTR。序列分析结果显示,Aj-ghitm编码的蛋白含有一个8次跨膜结构域,与Gen Bank中登录的紫色球海胆GHITM蛋白的氨基酸序列相似度为65.4%,且在系统发育树中聚为一支;qRT-PCR检测结果表明,经LPS刺激可诱导仿刺参体腔细胞Aj-ghitm mRNA的表达且呈先下降后升高最后回复到接近正常水平的趋势,在24 h时上升到最高,随后下降。本研究是有关棘皮动物ghitm基因的首次报道,其结果可为进一步探讨ghitm在仿刺参抗细菌感染以及生长发育等方面的功能及作用机制提供参考。
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关键词
仿刺参
仿刺参
ghitm
基因克隆
基因表达
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职称材料
题名
马氏珠母贝生长激素诱导跨膜蛋白基因GHITM克隆与表达分析
被引量:
3
1
作者
罗少杰
陈伟耀
杨创业
王庆恒
焦钰
邓岳文
机构
广东海洋大学水产学院
广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1973-1980,共8页
基金
国家自然基金项目(31372526
31272635)
+1 种基金
广东省海洋与渔业局科技专项(Z2014009)
广东省科技厅项目(2013B020201002)共同资助
文摘
生长激素诱导跨膜蛋白(growth hormone-induced transmembrane protein,GHITM)是一类在进化上高度保守的跨膜蛋白,参与机体生长发育、老化及先天免疫等过程。为探究GHITM在马氏珠母贝生长发育过程中的作用,本实验利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA ends,RACE),克隆得到马氏珠母贝GHITM(Pinctada martensii GHITM,Pm-GHITM)基因c DNA全长序列,并对其序列特征以及在组织中的表达进行分析。结果显示:Pm-GHITM基因c DNA全长为1 468 bp,其中,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1 017 bp,编码338个氨基酸,5'UTR长62 bp,3'UTR长389 bp,分子量约为35.48 ku,等电点(p I)为9.87;多序列及系统进化树分析表明Pm-GHITM与其他物种的GHITM有较高的同源性,与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的GHITM相似度最高,为67%;结构域分析结果表明Pm-GHITM序列中包含一个高度保守的BI-1(Bax inhibitor-1)结构域;荧光定量数据指出Pm-GHITM在马氏珠母贝的血淋巴、外套膜、足、鳃、性腺、闭壳肌以及肝胰腺中均有表达,在性腺的表达量最高,肝胰腺和闭壳肌次之,血淋巴中的表达量最低(p<0.05)。本研究可以为进一步探究Pm-GHITM在马氏珠母贝的生长发育过程中的作用做铺垫。
关键词
马氏珠母贝
Pm-
ghitm
基因克隆
荧光定量
表达分析
Keywords
Pinctada martensii, Pm-
ghitm
, Gene cloning, Real-time PCR, Expression analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
中华鳖GHITM cDNA基因克隆及表达分析
被引量:
1
2
作者
熊钢
周先文
马晓
曾丹
陈贞年
康骊
王晓清
机构
湖南生物机电职业技术学院动物科技系
湖南农业大学动物科技学院
河南师范大学水产学院
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019年第6期173-179,共7页
基金
国家自然科学基金(31672640)
湖南省自然科学基金(2017JJ3134
+1 种基金
2016NK2115)
湖南省教育厅基金项目(17C0935)共同资助~~
文摘
为研究GHITM基因在中华鳖(Trionyx sinensis)胚胎发育及生长中的作用,本研究通过RT-PCR和RACE方法获得了中华鳖GHITM全长c DNA序列;采用实时荧光定量PCR对GHITM m RNA组织表达及不同温度孵化胚胎发育过程中的表达特性进行分析。结果显示,中华鳖GHITM c DNA序列长度为2650 bp,开放阅读框为1050 bp,5’非编码区为123 bp,3’非编码区为1477 bp,编码349个氨基酸,编码蛋白的等电点为10.01,分子量为37.12kDa。GHITM编码氨基酸序列由胞外区、跨膜区和胞内区组成,7个跨膜域组成跨膜区。GHITM编码氨基酸序列的同源性分析显示,中华鳖与锦龟(Chrysemys picta bellii)和绿海龟(Chelonia mydas)同属一个分支,3种鳄鱼构成一个分支,7种鸟类形成一个分支。实时荧光定量检测显示,GHITM基因在肝脏、肌肉和脑垂体中的表达水平较高,显著高于心脏、性腺、肠、肾脏和脾脏组织(P<0.05);50 g左右和500 g左右雄性个体肝脏中的GHITM基因表达量显著高于雌性个体(P<0.05);低温胁迫孵化能显著抑制胚胎肝脏中GHITM基因的表达(P<0.05)。上述研究结果表明,GHITM基因与中华鳖生长和胚胎发育密切相关,其在中华鳖胚胎中的表达受孵化温度调节。本研究为探讨中华鳖胚胎发育和生长提供理论依据。
关键词
中华鳖
ghitm
基因克隆
胚胎发育
组织表达
Keywords
Trionyx sinensis
ghitm
Gene cloning
Embryonic development
Tissue expression
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
Q575 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
仿刺参ghitm基因的克隆及LPS诱导后的表达分析
被引量:
2
3
作者
高杨
王胜男
叶仕根
李华
机构
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期543-549,共7页
基金
国家"十二五"科技支撑计划项目(2011BAD13B03)
海洋公益性行业科研专项(201405003)
文摘
根据GenBank中登录的仿刺参Apostichopus japonicus ghitm基因的EST片段,采用RACE扩增法克隆了仿刺参ghitm基因的c DNA全长序列,并利用qRT-PCR技术检测了经LPS诱导后仿刺参ghitm的表达变化情况。结果表明:仿刺参ghitm基因(Aj-ghitm)的c DNA序列全长为1325 bp,包含一个1005 bp编码334个氨基酸的开放阅读框,序列两端分别为140 bp的5'UTR和180 bp的3'UTR。序列分析结果显示,Aj-ghitm编码的蛋白含有一个8次跨膜结构域,与Gen Bank中登录的紫色球海胆GHITM蛋白的氨基酸序列相似度为65.4%,且在系统发育树中聚为一支;qRT-PCR检测结果表明,经LPS刺激可诱导仿刺参体腔细胞Aj-ghitm mRNA的表达且呈先下降后升高最后回复到接近正常水平的趋势,在24 h时上升到最高,随后下降。本研究是有关棘皮动物ghitm基因的首次报道,其结果可为进一步探讨ghitm在仿刺参抗细菌感染以及生长发育等方面的功能及作用机制提供参考。
关键词
仿刺参
仿刺参
ghitm
基因克隆
基因表达
Keywords
Apostichopus japonicus
Aj-
ghitm
gene cloning
gene expression
分类号
Q954.4 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马氏珠母贝生长激素诱导跨膜蛋白基因GHITM克隆与表达分析
罗少杰
陈伟耀
杨创业
王庆恒
焦钰
邓岳文
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
原文传递
2
中华鳖GHITM cDNA基因克隆及表达分析
熊钢
周先文
马晓
曾丹
陈贞年
康骊
王晓清
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2019
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
仿刺参ghitm基因的克隆及LPS诱导后的表达分析
高杨
王胜男
叶仕根
李华
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
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职称材料
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