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基于GEO数据集和网络药理学探讨枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的分子生物学机制 被引量：1
1
作者 郑志锋 温小丽 +3 位作者 罗辉 白庆云 钟叶 王博龙 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2025年第2期58-67,共10页
本研究依托TCMSP数据库和SwissTarget Prediction平台预测枳实薤白桂枝汤活性成分靶基因;基于GEO数据集分析冠心病差异基因;筛选活性成分靶基因与冠心病差异基因的共有基因。借助Cytoscape软件、STRING数据库分别构建活性成分-靶基因网... 本研究依托TCMSP数据库和SwissTarget Prediction平台预测枳实薤白桂枝汤活性成分靶基因;基于GEO数据集分析冠心病差异基因;筛选活性成分靶基因与冠心病差异基因的共有基因。借助Cytoscape软件、STRING数据库分别构建活性成分-靶基因网络及PPI网络以挖掘核心成分及关键靶基因;再利用DAVID 6.8和Omicshare平台开展关键靶基因的GO富集和KEGG富集;最后使用AutoDock Vina软件将枳实薤白桂枝汤关键靶点与核心成分进行对接。发现31个枳实薤白桂枝汤活性成分通过APP、VEGFA、MAPK8、SRC、CREB1、JUN、BCL2L1、MMP9、TLR4、HSP90AA1十个关键靶基因,参与细胞凋亡过程的负调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节等主要生物过程;调控流体剪切应力和动脉粥样硬化、松弛素信号通路、雌激素信号通路、HIF-1信号通路以及多条免疫炎症信号通路;核心成分和厚朴酚能与APP、VEGFA、BCL2L1、JUN等关键靶点结合。由此可见,枳实薤白桂枝汤能多成分、多靶点协同治疗冠心病,其主要作用机制包括调控流体剪切应力和动脉粥样硬化、调节免疫炎症,抗缺氧等。 展开更多
关键词 枳实薤白桂枝汤 冠心病 网络药理学 geo数据集 分子机制
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基于GEO数据库发现促前列腺癌转移基因SERPINE1及其临床意义 被引量：2
2
作者 岳俊涛 孙慧敏 +1 位作者 雷志杰 邵晨 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2018年第8期585-590,共6页
目的分析上皮间质转换(EMT)相关基因在前列腺癌肿瘤细胞转移前后的变化,并筛选有潜在研究价值的基因,研究其临床价值,并初步探索其可能的分子机制。方法通过EMT通路的聚合酶链式反应(PCR)芯片分析两种具有不同转移能力的前列腺癌细胞表... 目的分析上皮间质转换(EMT)相关基因在前列腺癌肿瘤细胞转移前后的变化,并筛选有潜在研究价值的基因,研究其临床价值,并初步探索其可能的分子机制。方法通过EMT通路的聚合酶链式反应(PCR)芯片分析两种具有不同转移能力的前列腺癌细胞表达差异,并结合GSE16560、Kaplan-Meier、Oncomine及基因探针富集分析(GSEA)数据库筛选潜在研究对象及相关通路。结果丝氨酸蛋白酶抑制蛋白E1(SERPINE1)表达与前列腺癌中较高的Gleason评分正相关(6分vs.7分,P=0.003 2,6分vs.≥9分,P=0.001 3),转移组的SERPINE1表达高于未转移组(P=0.028 3),SERPINE1低表达组生存期长于高表达组(P=0.024 5)。Oncomine数据库显示在多种肿瘤中,152项肿瘤独立分析中SERPINE1高表达,相对应的是61项正常组织独立分析中SERPINE1低表达。Kaplan-Meier曲线分析也表明,SERPINE1在肺癌(P=0.04)、胃癌(P=0.017)、卵巢癌(P=0.009 1)中均表现为不良的预后因素。GSEA结果表明高表达SERPINE1与血管生成等过程有相关性。结论高表达SERPINE1的前列腺癌患者Gleason评分也相对较高,转移的可能性大且预后较差,同时SERPINE1可能通过影响血管生成等过程促进前列腺癌转移。 展开更多
关键词 前列腺癌 SERPINE1 geo数据库 临床预后 EMT 血管生成
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大数据下的地缘环境可视分析研究探讨 被引量：12
3
作者 温荟琦 蒋秉川 +1 位作者 万刚 任琰 《测绘科学》 CSCD 北大核心 2018年第12期77-84,共8页
针对大数据时代数据量急剧增多,难以对地缘环境进行定量分析的问题,该文提出了一种运用大数据技术进行地缘环境研究的有效途径,通过可视分析和多视图协同交互的方法,达到定量分析地缘环境的目的,从而使最终决策更加客观、科学。该文重... 针对大数据时代数据量急剧增多,难以对地缘环境进行定量分析的问题,该文提出了一种运用大数据技术进行地缘环境研究的有效途径,通过可视分析和多视图协同交互的方法,达到定量分析地缘环境的目的,从而使最终决策更加客观、科学。该文重点介绍了可视分析技术在地缘环境分析中的应用,并以“一带一路”沿线国家相关数据为基础,建立了地缘环境分析模型和可视分析模型,对地缘关系、地缘组织和地缘体进行了可视分析,最后给出了原型系统的框架设计和初步实现。 展开更多
关键词 地缘环境 大数据 “一带一路” 信息可视化 可视分析 多视图协同交互
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基于对象流的地缘环境时空分析模型
4
作者 赵文双 江南 +1 位作者 陈云海 曹一冰 《地球信息科学学报》 CSCD 北大核心 2022年第8期1432-1444,共13页
地缘环境时空分析是对地缘体、地缘关系及地缘结构进行的解析、评价和预测,是把握地缘环境空间特征、关联关系演化规律的重要途径。本文采用文献研究、类比归纳、建模研究等方法,提出地缘环境对象是地理信息世界中对现实地缘环境实体抽... 地缘环境时空分析是对地缘体、地缘关系及地缘结构进行的解析、评价和预测,是把握地缘环境空间特征、关联关系演化规律的重要途径。本文采用文献研究、类比归纳、建模研究等方法,提出地缘环境对象是地理信息世界中对现实地缘环境实体抽象后的数字化表达,地缘环境对象流是对象间物质、信息和能量数据交互过程的总称,与地缘关系间存在映射关系,对地缘环境态势和演化过程具有关键作用。在对地缘环境对象流相关概念和内涵解析的基础上,探讨了地缘环境对象流的数据表达与组织方法,构建了地缘环境分析模型,模型从地缘环境系统构成出发,将地缘环境对象流的分析逻辑和数据模型结合,分别建立地缘环境对象流分析原理的逻辑表达及地缘环境对象化数据组织体系,在数据支持下利用数据分析算法来确定地缘环境对象与地缘关系间的映射函数,实现面向应用场景和具体问题的地缘环境分析。本文对地缘环境分析模型进行了验证,以“印太地区”地缘经济环境分析为例,基于2009—2018年该区域经济水平排位前10的国家经济数据,进行了地缘经济实体特征的抽象、贸易对象流的数据表达与组织、数据分析及地缘关系测度,分析了贸易流的时空变化过程、地缘影响力以及地缘关系群组等,验证了模型在面向具体场景的地缘环境分析中的有效性。 展开更多
关键词 地缘环境 地缘关系 地缘体 地缘环境对象 地缘环境对象流 对象化数据 时空分析 地缘环境分析模型
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安徽东部地区金矿资源GIS评价 被引量：2
5
作者 唐永成 曹静平 高章红 《安徽地质》 2000年第2期111-119,共9页
应用GIS进行金矿资源评价是一项较为复杂的系统工程。建设好地学空间数据库是资源评价的基础 ,正确建立资源评价模型和确定地质变量是资源评价的技术核心。依据区内成矿地质条件和矿化特征 ,采用“WMR”
关键词 地学空间数据库建设 评价方法与工作流程 评价模型与地质变量 数学模型与计算方法 评价结果
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