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蓼科大黄属植物CHS基因密码子偏爱性分析 被引量：8
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作者 马盛超 余鑫梅 姚慧鹏 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期2171-2178,共8页
为探究蓼科大黄属物种CHS基因密码子的偏爱性,鉴定出该类基因的最优密码子。利用EMBOSS、Codon W1.4.4和SPSS 17.0软件对24条来源于大黄属不同物种的CHS基因进行多元统计分析,以深入研究其偏爱性。结果表明,大黄属CHS基因密码子的GC_3... 为探究蓼科大黄属物种CHS基因密码子的偏爱性,鉴定出该类基因的最优密码子。利用EMBOSS、Codon W1.4.4和SPSS 17.0软件对24条来源于大黄属不同物种的CHS基因进行多元统计分析,以深入研究其偏爱性。结果表明,大黄属CHS基因密码子的GC_3含量最高,其与GC_(12)的相关性检验未达到显著水平。ENC-plot分析显示,24条CHS基因的ENC值均低于预期值。以上证明了自然选择是CHS基因密码子偏爱性形成的主导因素。筛选出的26个最优密码子中,17个密码子的第3位碱基为G/C,表明CHS基因最优密码子偏爱以G/C结尾。 展开更多
关键词 大黄属CHS基因 密码子偏爱性 gc12 GC3 ENC 最优密码子
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