期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到2篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
基于生物学信息技术分析GAS2L3在胶质瘤中的表达及意义 被引量：2
1
作者 石爽 钟佳成 +7 位作者 刘备 张彪 杨彪 牛文勇 李柏成 覃川 钟东 张正保 《临床神经外科杂志》 2022年第2期142-147,155,共7页
目的通过对癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和GTEx数据库中胶质瘤和正常脑组织的基因测序数据进行挖掘,探讨GAS2L3在正常脑组织和不同等级的胶质瘤中差异及其可能对胶质瘤细胞的影响,以期建立胶质瘤治疗的新靶点。方法通过基因表达谱交互分析(... 目的通过对癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和GTEx数据库中胶质瘤和正常脑组织的基因测序数据进行挖掘,探讨GAS2L3在正常脑组织和不同等级的胶质瘤中差异及其可能对胶质瘤细胞的影响,以期建立胶质瘤治疗的新靶点。方法通过基因表达谱交互分析(GEPIA)网站分析TCGA和GTEx数据库中GAS2L3在高级别胶质瘤和低级别胶质瘤与正常脑组织中的表达差异。从TCGA数据库中获取702例胶质瘤组织的RNA测序数据与临床信息,首先分析GAS2L3与胶质瘤的等级与预后的相关性;其次通过单因素与多因素的回归分析分析GAS2L3的风险比;最后通过相关性分析计算GAS2L3与增殖、侵袭、凋亡和血管形成的相关性。在以上数据中,按照log FC>1且P<0.05的标准筛选GAS2L3高表达与GAS2L3低表达胶质瘤中的差异表达基因,并通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其在胶质瘤中的调控方式,基因集富集分析(GSEA)其对细胞信号通路的影响。结果通过GEPIA网站分析发现GAS2L3表达量在低级别胶质瘤与正常脑组织无明显差异,但高表达于胶质母细胞瘤中。GAS2L3在TCGA胶质瘤数据中与胶质瘤的等级正相关,与胶质瘤的预后负相关。单因素与多因素的回归分析发现GAS2L3是胶质瘤预后的不良因素。相关性分析显示GAS2L3与胶质瘤的增殖明显相关。在GAS2L3高表达与低表达胶质瘤中发现2887个差异基因,GO和KEGG富集其影响的信号通路,GSEA分析发现GAS2L3激活细胞周期信号通路。结论GAS2L3基因可能在胶质瘤的诊断和临床治疗中有重要的意义。 展开更多
关键词 胶质瘤 gas2l3 生物信息学 差异分析
暂未订购
基于生物信息学探索GAS2L3在肝癌中的表达与意义
2
作者 吴琼 丁寿鹏 蔡子涵 《医学信息》 2025年第7期10-17,共8页
目的 探索GAS2L3在肝癌中的表达,探讨其潜在的机制。方法 通过qRT-PCR技术检测GAS2L3在肝正常组织和肝癌组织中的表达差异,用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)进行验证,利用ROC曲线评价GAS2L3对肝癌诊断的准确性,采... 目的 探索GAS2L3在肝癌中的表达,探讨其潜在的机制。方法 通过qRT-PCR技术检测GAS2L3在肝正常组织和肝癌组织中的表达差异,用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)进行验证,利用ROC曲线评价GAS2L3对肝癌诊断的准确性,采用Kaplan-Meier法、单因素及多因素COX回归分析GAS2L3表达与肝癌预后关系,利用GEO数据库验证生存关系,利用GAS2L3与临床变量构建列线图,基于GAS2L3差异分析获得基因功能途径富集,通过ESTIMATE、CIBERSORT及TIMER数据库分析GAS2L3与免疫浸润的相关性。结果 经过生信分析和实验验证发现,GAS2L3在肝癌组织中的表达量高于正常组织,并且其表达与肝癌的T分期、临床病理分期以及肝癌分级密切相关。GAS2L3对肝癌的诊断的AUC为0.827。同时,生存分析显示GAS2L3高的患者预后差;单因素和多因素COX分析显示,高表达的GAS2L3可作为肝癌的独立生物标志物。此外,GO、KEGG和GSEA富集分析显示,GAS2L3可能参与细胞核分裂和减数分裂细胞周期过程,主要富集于细胞周期、神经活性配体-受体相互作用和尼古丁成瘾通路。GAS2L3表达与肿瘤纯度和免疫浸润相关。结论 GAS2L3在肝癌中高表达,肝癌中GAS2L3的上调与低生存率和免疫浸润显著相关,GAS2L3可作为肝癌预后的潜在生物标志物和免疫治疗靶点。 展开更多
关键词 肝癌 gas2l3 生物信息学 TCGA数据库 GEO数据库
暂未订购
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部