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NWChem与GAMESS-US软件在有机小分子计算中的性能分析
1
作者
张宝花
金钟
《科研信息化技术与应用》
2014年第5期57-64,共8页
本文围绕13个不同规模的有机小分子体系,考察了NWChem与GAMESS-US软件在DFT/B3LYP理论级别及不同基组下计算的能量和结构变化、优化步数及自洽迭代时间等,探讨了优化算法及处理技巧。同时,本文对NWChem软件并行性能分析的结果表明,对于...
本文围绕13个不同规模的有机小分子体系,考察了NWChem与GAMESS-US软件在DFT/B3LYP理论级别及不同基组下计算的能量和结构变化、优化步数及自洽迭代时间等,探讨了优化算法及处理技巧。同时,本文对NWChem软件并行性能分析的结果表明,对于中到大体系,计算规模为32处理器/核及以上时可以获得更好的计算效率。通过本项研究有助于更好的使用NWChem与GAMESSUS软件。文中提供的软件测试和分析思路同样适用于其他量化软件,同时NWChem并行分析也为量子化学程序提供了软件并行效率改进方面的参考。
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关键词
有机分子
结构优化
NWChem
gamess-us
性能分析
原文传递
题名
NWChem与GAMESS-US软件在有机小分子计算中的性能分析
1
作者
张宝花
金钟
机构
中国科学院计算机网络信息中心
出处
《科研信息化技术与应用》
2014年第5期57-64,共8页
基金
中国科学院计算机网络信息中心一三五规划重点培育方向专项(CNIC_PY_1404)
文摘
本文围绕13个不同规模的有机小分子体系,考察了NWChem与GAMESS-US软件在DFT/B3LYP理论级别及不同基组下计算的能量和结构变化、优化步数及自洽迭代时间等,探讨了优化算法及处理技巧。同时,本文对NWChem软件并行性能分析的结果表明,对于中到大体系,计算规模为32处理器/核及以上时可以获得更好的计算效率。通过本项研究有助于更好的使用NWChem与GAMESSUS软件。文中提供的软件测试和分析思路同样适用于其他量化软件,同时NWChem并行分析也为量子化学程序提供了软件并行效率改进方面的参考。
关键词
有机分子
结构优化
NWChem
gamess-us
性能分析
Keywords
organic molecules geometry optimization NWChem
gamess-us
performance analysis
分类号
TP311.5 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
NWChem与GAMESS-US软件在有机小分子计算中的性能分析
张宝花
金钟
《科研信息化技术与应用》
2014
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