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人类GABARAPL2基因的亚细胞定位 被引量:2
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作者 陈政 张坚萱 +1 位作者 辛玉蓉 蒋滢 《生物学杂志》 CAS CSCD 2002年第1期15-18,共4页
为了对GABARAPL2 (GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2 )基因的功能进行初步分析 ,首先通过同源比较的方法将序列与其同源物进行比较 ,发现GABARAPL2的氨基酸序列与GABARAP(GABAA 受体相关蛋白 )高度同源 ,而GABARAP已证实通过结合细胞骨架... 为了对GABARAPL2 (GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2 )基因的功能进行初步分析 ,首先通过同源比较的方法将序列与其同源物进行比较 ,发现GABARAPL2的氨基酸序列与GABARAP(GABAA 受体相关蛋白 )高度同源 ,而GABARAP已证实通过结合细胞骨架的微管蛋白 ,使GABAA 受体聚集、定位在细胞膜上。本文采用PCR法从人脑组织的cDNA文库中扩增出GABARAPL2的cDNA ,克隆至T质粒载体中进行测序验证 ,然后以此为模板 ,引物中引入酶切位点再次PCR ,扩增出GABARAPL2的开放阅读框 ,并将其插入到加强型绿色荧光蛋白融合表达载体EGFP中 ,将绿色荧光蛋白标记的GABARAPL2和GABARAP分别转染HLF细胞株。结果两种蛋白的分布情况基本一致 ,在细胞质内和核内均有分布 ,而且核内的分布较胞质为多。结构功能域分析表明 ,GABARAPL2含有蛋白激酶C磷酸化位点和酪氨酸激酶磷酸化位点 ,可能通过磷酸化参与细胞骨架的变化。结论GABARAPL2和GABARAP不仅在胞质中作为受体相关蛋白协助受体的聚集、定位 。 展开更多
关键词 gabarapl2 同源比较 结构域 GFP融合蛋白 细胞学定位 人类基因定位
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血清中WIBG、ZNF706和GABARAPL2在早期类风湿关节炎中的诊断价值 被引量:1
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作者 赵蕾 张志华 +4 位作者 白春强 姜凤云 梁志强 王雪燕 郝长来 《广东医学》 CAS 北大核心 2017年第16期2470-2472,共3页
目的探讨血清中WIBG、ZNF706、GABARAPL2对早期类风湿关节炎(ERA)患者的诊断价值。方法收集ERA患者61例,晚期类风湿关节炎(LRA)34例,其他风湿病31例及健康对照(HC)39例,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测WIBG、ZNF706和GABARAPL2的水平,... 目的探讨血清中WIBG、ZNF706、GABARAPL2对早期类风湿关节炎(ERA)患者的诊断价值。方法收集ERA患者61例,晚期类风湿关节炎(LRA)34例,其他风湿病31例及健康对照(HC)39例,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测WIBG、ZNF706和GABARAPL2的水平,并行统计学分析。结果血清WIBG、ZNF706及GABARAPL2在ERA组明显高于LRA组、其他风湿病组及HC组,差异均有统计学意义(P<0.05)。WIBG、ZNF706和GABARAPL2单独及联合检测在ERA组敏感度达47.5%、36.6%、37.7%、75.4%,特异度为97.1%、97.1%、95.2%、91.3%。三者联合检测的阳性率在ERA组类风湿因子(RF)阴性时达到64.0%,抗CCP抗体阴性时达57.1%,两者均阴性时达到60.0%。结论血清WIBG、ZNF706和GABARAPL2在ERA组高表达,为早期诊断ERA的生物学标记物,是抗CCP抗体和(或)RF阴性时ERA诊断的有效补充。 展开更多
关键词 ZNF706 gabarapl2 早期类风湿关节炎 早期诊断
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人类GABARAPL2基因的染色体定位
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作者 陈政 蒋滢 +2 位作者 王尉平 蒋菊香 辛玉蓉 《生物学杂志》 CAS CSCD 2001年第3期19-21,18,共4页
为了确定人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2基因在染色体上的位置 ,根据该基因cDNA的 3′非翻译区序列设计一对RH定位引物 ,以人 /鼠体细胞辐射杂种板Genebridge4(GB4) panel和G3 panel试剂盒中的杂种细胞株基因组DNA为模板 ,在一定的... 为了确定人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2基因在染色体上的位置 ,根据该基因cDNA的 3′非翻译区序列设计一对RH定位引物 ,以人 /鼠体细胞辐射杂种板Genebridge4(GB4) panel和G3 panel试剂盒中的杂种细胞株基因组DNA为模板 ,在一定的条件下进行PCR扩增 ,琼脂糖凝胶电泳结果分别输入Sanger和Stanford网站的RH定位分析系统进行统计学分析。结果PCR法在一些杂种细胞株中扩增出特异的目的片段 ,并经测序验证了其准确性。凝胶电泳结果在Sanger网站统计分析表明该基因与 16号染色体上的AFM 3 4 0 ye5 ,AFM 2 92xh5 ,AFM 3 2 0wf1,AFMa0 66xd5 ,AFM 2 49xc5位标紧密连锁 ;在Stanford网站统计分析表明该基因与 16号染色体上的SHGC— 14 5 7,SHGC— 5 3 4 15 ,SHGC— 6782 ,SHGC— 2 2 2 8,SHGC— 14 62 9位标紧密连锁 ,LOD值均大于 3。整合分析该染色体区带的物理图、遗传图及细胞图谱后 ,最终将基因定位在染色体 16q2 2 .3区带的D16s3 0 16和D16s5 15位标之间。结论放射杂交定位法是一种新颖便捷的基因定位的方法 ,通过此法成功地进行了人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2基因的定位。 展开更多
关键词 放射杂交作图 gabarapl2基因 PCR 染色体位标 基因定位
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GABARAPL2在IFN-γ诱导的HeLa细胞抑制弓形虫生长中发挥重要功能
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作者 Zhang Zhao-xia Gu Hao-rong Li Qi 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期426-426,共1页
弓形虫病是由刚地弓形虫引起的人畜共患病,呈全球性流行。弓形虫感染可导致健康动物的机会性或潜伏性感染,免疫缺陷者如艾滋病、器官移植、恶性肿瘤等常显示显著的全身症状。弓形虫是细胞内寄生虫,能够感染所有有核细胞。弓形虫感染细胞... 弓形虫病是由刚地弓形虫引起的人畜共患病,呈全球性流行。弓形虫感染可导致健康动物的机会性或潜伏性感染,免疫缺陷者如艾滋病、器官移植、恶性肿瘤等常显示显著的全身症状。弓形虫是细胞内寄生虫,能够感染所有有核细胞。弓形虫感染细胞后,在细胞内形成纳虫空泡(PV),保护其不被宿主固有免疫机制发现,并在PV内增殖。 展开更多
关键词 弓形虫感染 gabarapl2 细胞抑制 IFN 重要功能
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SIK2‑mediated phosphorylation of GABARAPL2 facilitates autophagosome–lysosome fusion and rescues neurodegeneration in an Alzheimer’s disease model
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作者 Xiaoman Dai Ziling Ye +7 位作者 Chen Wang Yufei Huang Yun Chen Tianqing Han Weijie Gao Xin Wu Jing Zhang Xiaochun Chen 《Translational Neurodegeneration》 2025年第1期947-968,共22页
Background Defective autophagic flux is implicated in Alzheimer’s disease(AD),but the molecular mechanisms underlying this process are not fully understood.Salt-inducible kinase 2(SIK2)is associated with autophagic f... Background Defective autophagic flux is implicated in Alzheimer’s disease(AD),but the molecular mechanisms underlying this process are not fully understood.Salt-inducible kinase 2(SIK2)is associated with autophagic function.However,its specific involvement in autophagic flux regulation and AD pathogenesis remains unclear.Methods We evaluated hippocampal SIK2 expression and its age-related changes in postmortem AD patients and 5×FAD mice by bioinformatics analysis,immunofluorescence,qPCR,and Western blotting.To investigate the functional role of SIK2,we employed adeno-associated virus-mediated SIK2 knockdown and overexpression in combination with behavioral tests(Morris water maze),electrophysiological recordings(long-term potentiation,LTP),and ultrastructural analysis(electron microscopy)to evaluate cognitive function and synaptic plasticity.Autophagic flux was measured using LC3B/p62 turnover assays,mRFP-GFP-LC3 tandem fluorescence assay,and transmission electron microscopy.Mechanistic insights were gained through co-immunoprecipitation assay,GST-pull down assay,phosphoproteomics,and site-directed mutagenesis.Additionally,phosphorylation-mimetic(S72E)and non-phosphorylatable(S72A)mutants of GABA type A receptor-associated protein-like 2(GABARAPL2)were intrahippocampally delivered to 5×FAD mice to explore their effects.Results Our study identified SIK2 as a critical regulator that is progressively downregulated in hippocampal neurons of AD patients and 5×FAD mice,correlating with spatial memory deficits.Reducing SIK2 levels exacerbates cognitive impairment and amyloid-β(Aβ)plaque burden in mice,whereas restoring SIK2 levels mitigates these deficits,restores LTP amplitude,reverses synaptic ultrastructural pathology,and reduces Aβdeposition.Mechanistically,SIK2 enhances autophagic flux by phosphorylating GABARAPL2 at Ser72,a modification essential for autophagosome–lysosome fusion.Remarkably,hippocampal delivery of the phosphorylation-mimetic GABARAPL2-S72E mutant replicated the beneficial effects of SIK2,alleviating Aβpathology and synaptic dysfunction in 5×FAD mice.In contrast,the nonphosphorylatable S72A mutant failed to show any protective effects.Conclusions These findings establish the SIK2–GABARAPL2 axis as a novel signaling cascade governing autophagic flux through lysosomal fusion competence.Dysfunction in this axis contributes to Aβdeposition in AD,offering new insights into the pathogenic mechanisms underlying autophagosome–lysosome fusion in AD and highlighting its potential as a therapeutic target. 展开更多
关键词 Autophagic flux Salt-inducible kinase 2 Alzheimer’s disease gabarapl2 Autophagosome-lysosome fusion Neurodegeneration
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肺动脉高压相关线粒体自噬生物标志物及其作用的分析与验证 被引量:2
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作者 李菲菲 黄钰钦 +3 位作者 陈若霞 叶冰冰 苏丹艳 庞玉生 《广西医科大学学报》 CAS 2024年第3期419-429,共11页
目的:通过生物信息学方法筛选肺动脉高压(PAH)相关线粒体自噬差异表达基因,为进一步研究线粒体自噬提供新依据。方法:从高通量基因表达数据库(GEO)下载PAH相关数据集,分为测试集和验证集,从分子签名数据库(MSigDB)和通路统一数据库下载... 目的:通过生物信息学方法筛选肺动脉高压(PAH)相关线粒体自噬差异表达基因,为进一步研究线粒体自噬提供新依据。方法:从高通量基因表达数据库(GEO)下载PAH相关数据集,分为测试集和验证集,从分子签名数据库(MSigDB)和通路统一数据库下载线粒体自噬相关基因,筛选线粒体自噬相关的PAH差异表达基因并进行基因本体论(GO)注释分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、蛋白质—蛋白质互作分析等。通过验证集验证生物标记物,将具有显著性差异且差异趋势一致的关键基因进行ROC验证,并收集先天性心脏病(CHD)相关PAH(PAH-CHD)及CHD共32例患儿外周血进行关键基因实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)表达验证。结果:收集到数据集GSE113439、GSE15197、GSE117261作为测试集,GSE38267作为验证集,共得到11个PAH相关线粒体自噬差异表达基因,这些基因主要富集在线粒体自噬—动物、神经退行性疾病—多种疾病通路、自噬—动物、志贺氏菌病、粘附连接、胞吞、帕金森病等通路中,其中5个关键基因(GABARAPL2,OPTN,RNF41,SRC,UBB)在合并数据集和验证集PAH组和正常组(Normal组)存在显著性差异且差异趋势一致。GABARAPL2,OPTN,UBB mRNA在PAH-CHD外周血的表达与预测趋势一致,而GABARAPL2 mRNA在PAH-CHD组外周血中表达显著升高(P<0.05)。结论:GABARAPL2可能在PAH相关线粒体自噬中起调控作用,具体的机制仍需要进一步的体内和体外验证。 展开更多
关键词 gabarapl2 线粒体自噬 肺动脉高压 差异基因 生物信息学
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