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题名葫芦fw3.2基因的克隆及表达差异分析
被引量：1
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作者
刘洪岩
包颖
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机构
曲阜师范大学生命科学学院
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出处
《曲阜师范大学学报（自然科学版）》
CAS
2018年第4期81-86,共6页
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基金
国家级大学生创新创业训练计划(201710446071)
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文摘
作为调控果实重量的主效QTLs(quantitative trait loci)之一,fw3.2可以通过促进细胞分裂影响果实大小.尽管fw3.2基因已在多种植物中被识别和分离,但在葫芦中的研究却未见报道.本研究首次对葫芦(Lagenaria siceraria)的fw3.2进行克隆和测序,该基因全长1980bp,由2个外显子和1个内含子组成,编码534个氨基酸.同时,在果实大小不同的两个葫芦变种之间fw3.2基因编码区完全一致.系统发育和同源比对分析显示,该基因属于CYP78A5基因家族,与甜瓜和黄瓜中同源基因的序列一致度可高达92%,在葫芦科中高度保守.此外,该基因在2个葫芦变种的叶、花和果实中均有表达,且在果实增长初期,小葫芦中表达强于大葫芦.这种表达态势可能和两种葫芦的细胞分裂高峰期不同有关.本研究为进一步揭示葫芦果型变异的分子机制提供了必要的科学依据.
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关键词
葫芦
fw3.2
果实重量
基因克隆
表达分析
果实成熟期
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Keywords
Gourd
fw3.2
fruit mass
gene cloning
expression analysis
fruit ripening period
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分类号
Q941
[生物学—植物学]
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题名番茄果重基因功能型分子标记的开发及群体基因型分析
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作者
侯亚涛
李迎辉
邓磊
李常保
李传友
孙传龙
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机构
海南大学热带农林学院
山东农业大学生命科学学院
北京市农林科学院蔬菜研究中心
山东农业大学园艺科学与工程学院
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出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第4期98-105,共8页
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基金
山东省自然科学基金项目(ZR2024QC172)
国家自然科学基金项目(32302567)
山东省泰山学者(TSQN202312148)。
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文摘
【目的】开发并利用分子标记技术进行群体基因型分析,解析番茄(Solanum lycopersicum)果重调控关键基因Fruit weight 3.2(Fw3.2)和Fruit weight 11.3(Fw11.3)在不同驯化阶段的遗传变异规律,为番茄遗传资源的精准鉴定、高效利用和野生种质快速驯化提供有效工具。【方法】基于基因组序列比对,针对Fw3.2基因的拷贝数变异以及Fw11.3基因3′端1.4 kb的大片段插入缺失变异,分别设计了片段长度多态性分子标记。并利用上述分子标记对259份番茄材料[79份野生种醋栗番茄(S.pimpinellifolium,PIM),95份过渡种樱桃番茄(S.lycopersicum var.cerasiforme,CER),以及85份栽培种大果番茄(big-fruited S.lycopersicum,BIG)]进行基因型分析,以确定Fw3.2和Fw11.3的变异形式及其在不同番茄群体中的分布。【结果】开发的分子标记能够精准区分Fw3.2基因的拷贝数变异(fw3.2^(WT)和fw3.2^(dup))以及Fw11.3基因的大片段插入缺失变异(fw11.3-WT和fw11.3-D)。在起源种醋栗番茄群体中,大果等位基因型fw3.2^(dup)和fw11.3-WT的频率分别为0%和2.53%;在过渡种樱桃番茄群体中,这2个等位基因型的比例分别上升至10.53%和8.42%;而在栽培种大果番茄群体中,fw3.2^(dup)和fw11.3-WT的比例分别达到了69.41%和92.94%。【结论】fw3.2^(dup)和fw11.3-D等位基因可以显著提高番茄果重,且二者能够以协同增效的方式发挥作用,从而更大幅度地提高番茄果重。在番茄驯化和改良的过程中,fw3.2^(dup)和fw11.3-D大果等位基因的频率呈现出递增的趋势,表现出与果重增大的演化模式相一致的特点。
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关键词
番茄
果重
分子标记
fw3.2
Fw11.3
拷贝数变异
插入缺失变异
驯化
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Keywords
tomato
fruit weight
molecular marker
fw3.2
Fw11.3
copy number variation
insertion/deletion variation
domestication
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分类号
S641.1
[农业科学—蔬菜学]
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