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题名番茄果重基因功能型分子标记的开发及群体基因型分析
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作者
侯亚涛
李迎辉
邓磊
李常保
李传友
孙传龙
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机构
海南大学热带农林学院
山东农业大学生命科学学院
北京市农林科学院蔬菜研究中心
山东农业大学园艺科学与工程学院
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出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第4期98-105,共8页
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基金
山东省自然科学基金项目(ZR2024QC172)
国家自然科学基金项目(32302567)
山东省泰山学者(TSQN202312148)。
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文摘
【目的】开发并利用分子标记技术进行群体基因型分析,解析番茄(Solanum lycopersicum)果重调控关键基因Fruit weight 3.2(Fw3.2)和Fruit weight 11.3(Fw11.3)在不同驯化阶段的遗传变异规律,为番茄遗传资源的精准鉴定、高效利用和野生种质快速驯化提供有效工具。【方法】基于基因组序列比对,针对Fw3.2基因的拷贝数变异以及Fw11.3基因3′端1.4 kb的大片段插入缺失变异,分别设计了片段长度多态性分子标记。并利用上述分子标记对259份番茄材料[79份野生种醋栗番茄(S.pimpinellifolium,PIM),95份过渡种樱桃番茄(S.lycopersicum var.cerasiforme,CER),以及85份栽培种大果番茄(big-fruited S.lycopersicum,BIG)]进行基因型分析,以确定Fw3.2和Fw11.3的变异形式及其在不同番茄群体中的分布。【结果】开发的分子标记能够精准区分Fw3.2基因的拷贝数变异(fw3.2^(WT)和fw3.2^(dup))以及Fw11.3基因的大片段插入缺失变异(fw11.3-WT和fw11.3-D)。在起源种醋栗番茄群体中,大果等位基因型fw3.2^(dup)和fw11.3-WT的频率分别为0%和2.53%;在过渡种樱桃番茄群体中,这2个等位基因型的比例分别上升至10.53%和8.42%;而在栽培种大果番茄群体中,fw3.2^(dup)和fw11.3-WT的比例分别达到了69.41%和92.94%。【结论】fw3.2^(dup)和fw11.3-D等位基因可以显著提高番茄果重,且二者能够以协同增效的方式发挥作用,从而更大幅度地提高番茄果重。在番茄驯化和改良的过程中,fw3.2^(dup)和fw11.3-D大果等位基因的频率呈现出递增的趋势,表现出与果重增大的演化模式相一致的特点。
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关键词
番茄
果重
分子标记
Fw3.2
fw11.3
拷贝数变异
插入缺失变异
驯化
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Keywords
tomato
fruit weight
molecular marker
Fw3.2
fw11.3
copy number variation
insertion/deletion variation
domestication
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分类号
S641.1
[农业科学—蔬菜学]
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