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昆虫病毒gp37/fusolin基因研究进展 被引量：2
1
作者 李朝飞 庞义 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2003年第11期16-18,共3页
昆虫病毒gp37 fusolin基因属病毒复制非必需基因 ,其编码的蛋白能形成一种纺锤形包涵体 (spindlebodies,SBs) ,该包涵体内不含有病毒粒子。Fusolin蛋白形成的SBs与纯化的Fusolin蛋白均能提高靶昆虫对杆状病毒的敏感性 ,推测GP37蛋白也... 昆虫病毒gp37 fusolin基因属病毒复制非必需基因 ,其编码的蛋白能形成一种纺锤形包涵体 (spindlebodies,SBs) ,该包涵体内不含有病毒粒子。Fusolin蛋白形成的SBs与纯化的Fusolin蛋白均能提高靶昆虫对杆状病毒的敏感性 ,推测GP37蛋白也具有类似的功能。对gp37 fusolin基因的深入研究 。 展开更多
关键词 杆状病毒 痘病毒 gp37/fusolin基因 病毒增效剂
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生物信息学分析FAM83D在乳腺癌中的表达及其临床意义
2
作者 李福平 代引海 +1 位作者 杜志勇 詹嘉立 《安徽医药》 2025年第8期1597-1602,I0005-I0008,共10页
目的利用生物信息学分析手段评估序列相似性为83的家族成员D(FAM83D)在乳腺癌中的表达及预后价值。方法收集2022年10月至2023年5月基因表达综合(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达谱交互分析(GEPIA)2、人类蛋白谱(HPA)和肿瘤亚群基... 目的利用生物信息学分析手段评估序列相似性为83的家族成员D(FAM83D)在乳腺癌中的表达及预后价值。方法收集2022年10月至2023年5月基因表达综合(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达谱交互分析(GEPIA)2、人类蛋白谱(HPA)和肿瘤亚群基因表达和生存分析门户(UALCAN)等数据库中FAM83D在乳腺癌中的表达数据及其与临床分期相关性数据,并分析FAM83D的表达与分子分型和TP53突变之间的相关性。此外,实时荧光定量PCR进一步证实FAM83D在乳腺癌细胞的表达情况。利用Kaplan-Meier plotter数据库分析FAM83D的表达对乳腺癌病人生存的影响,并对FAM83D和其他相关病理参数进行单因素、多因素Cox回归分析,构建列线图预后模型。利用功能富集分析门户(DAVID 6.8)对FAM83D进行富集分析。通过肿瘤免疫评估综合数据库(TIMER 2.0)和肿瘤免疫系统交互数据库门户(TISIDB)分析了FAM83D的表达与乳腺癌中免疫微环境具有一定的关联性。结果FAM83D在乳腺癌组织和细胞中高表达,FAM83D的mRNA水平在乳腺癌组织中表达水平(3.11±0.64、4.43±1.45、3.10±1.24)明显高于正常乳腺组织(3.09±0.24,1.64±0.81,0.83±0.61),各组比较均差异有统计学意义(P<0.05),并与乳腺癌病人肿瘤分期、分子分型和TP53突变状态密切相关(均P<0.05)。高表达的FAM83D提示乳腺癌病人更短的总生存期(OS)(HR=2.12,P<0.001)、无复发生存时间(RFS)(HR=2.11,P<0.001)、进展后生存时间(PPS)(HR=1.72,P=0.006)和无远处转移生存时间(DMFS)(HR=2.83,P<0.001)。FAM83D、年龄、M分期和绝经状态可作为乳腺癌病人的独立预后因素(HR=1.29,2.41,5.09,2.91;均P<0.05)。基因本体(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)富集分析结果显示,FAM83D不仅发挥着与微管、管蛋白结合的功能,还在细胞周期和P53等相关信号通路显著富集。FAM83D的表达与乳腺癌中B细胞和辅助T细胞2等免疫细胞的浸润呈正相关,而与自然杀伤细胞和细胞样树突状细胞等免疫细胞的浸润呈负相关。此外,FAM83D的表达还与免疫刺激因子PVR、ULBP1,免疫抑制因子IDO1、LAG3和趋化因子CCL7、CXCL10的表达呈正相关。结论FAM83D在乳腺癌组织中高表达,与病人不良预后有关,可作为乳腺癌预后生物标志物。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 基因序列 纺锤体蛋白 序列相似性为83的家族成员D 生物信息学 预后标志物 免疫浸润
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中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒gp^(37)基因的序列分析 被引量：1
3
作者 邓菲 陈新文 +2 位作者 Basil.M.Arif Just.M.Vlak 胡志红 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第S1期38-45,共8页
昆虫杆状病毒的 gp37基因与昆虫痘病毒纺锤体蛋白 (fusolin)基因具有较高的同源性。本研究通过末端测序法和引物步移法双向测定了中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 (HaSNPV)gp37基因的核苷酸全序列。HaSNPV的 gp37基因开放阅读框为 84 ... 昆虫杆状病毒的 gp37基因与昆虫痘病毒纺锤体蛋白 (fusolin)基因具有较高的同源性。本研究通过末端测序法和引物步移法双向测定了中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 (HaSNPV)gp37基因的核苷酸全序列。HaSNPV的 gp37基因开放阅读框为 84 0个核苷酸 ,共编码 2 79个氨基酸 ,预计蛋白质分子量为 31kDa。在 gp37基因起始密码子上游有一典型的杆状病毒晚期转录启动子结构GTAAG和两个TATAboxes。HaSNPVGP37前 18个氨基酸有很强的疏水性 ,可能是分泌信号肽序列。 16种GP37/Fusolin的氨基酸序列同源性比较分析表明 ,HaSNPVGP37与其它gp37基因的同源性较高 ( 4 0 60 % ) ,与痘病毒的Fusolin的同源性达 30 % 4 0 %左右。这些蛋白有 5个高度保守区 ,预计这 5个保守区为GP37/Fusolin的功能区。 展开更多
关键词 gp^37基因 fusolin基因 中国棉铃虫单粒包埋型核多角体病毒 核苷酸全序列
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