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LncRNA SFTA1P通过调控miR-182-5p/FN1通路促进肾透明细胞癌细胞增殖与迁移 被引量:2
1
作者 向威 吕磊 +1 位作者 郑福鑫 袁敬东 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第1期41-48,共8页
目的探讨长链非编码RNA表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)通过调控微小RNA-182-5p(miR-182-5p)/纤连蛋白1(FN1)通路促进肾透明细胞癌(ccRCC)细胞增殖与迁移的分子机制。方法应用GEPIA2软件探究TCGA数据库中SFTA1P在ccRCC组织中的表达;实时... 目的探讨长链非编码RNA表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)通过调控微小RNA-182-5p(miR-182-5p)/纤连蛋白1(FN1)通路促进肾透明细胞癌(ccRCC)细胞增殖与迁移的分子机制。方法应用GEPIA2软件探究TCGA数据库中SFTA1P在ccRCC组织中的表达;实时定量PCR(qPCR)检测SFTA1P在ccRCC组织、正常肾脏组织及ccRCC细胞系中的表达;亚细胞定位实验探究SFTA1P在ccRCC细胞系人肾细胞腺癌细胞(ACHN)中的定位;将ACHN细胞分为si-Con组、si-SFTA1P#2组、mimic NC组、miR-182-5p mimic组、anti-miR-Con组、anti-miR-182-5p组、anti-miR-182-5p+si-FN1组、si-Con+anti-miR-Con组、si-SFTA1P#2+anti-miR-Con组及si-SFTA1P#2+anti-miR-182-5p组;CCK-8与transwell小室实验检测细胞增殖与迁移能力;qPCR、Western blot和双荧光素酶报告基因实验检测SFTA1P、miR-182-5p和FN1的调控关系。结果TCGA数据库分析显示,SFTA1P在ccRCC组织中高表达(P<0.05);与正常肾脏组织比较,SFTA1P在ccRCC组织中表达升高(P<0.01);ccRCC细胞系786-O、SN12-PM6、ACHN及A498中SFTA1P表达明显高于人肾近曲小管细胞HK-2(均P<0.01);亚细胞定位实验显示SFTA1P主要分布于ACHN细胞的细胞质中;与si-Con组比较,si-SFTA1P#2组ACHN细胞增殖与迁移能力降低,FN1 mRNA及蛋白表达降低(P<0.05);与mimic NC组比较,miR-182-5p mimic组ACHN细胞FN1 mRNA及蛋白表达降低(P<0.01);与anti-miR-Con组比较,anti-miR-182-5p组ACHN细胞FN1 mRNA及蛋白表达增加,细胞增殖与迁移能力增强(P<0.05);与anti-miR-182-5p组相比,anti-miR-182-5p+si-FN1组ACHN细胞增殖与迁移能力降低(P<0.05);与si-SFTA1P#2+anti-miR-Con组比较,si-SFTA1P#2+anti-miR-182-5p组ACHN细胞增殖与迁移能力增强,FN1 mRNA及蛋白表达增加(P<0.05)。结论SFTA1P在ccRCC中高表达,其通过调控miR-182-5p/FN1通路促进ccRCC细胞的增殖与迁移。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 SFTA1P miR-182-5p fn1 增殖 迁移
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喉鳞状细胞癌中FN1表达和肿瘤相关巨噬细胞的相关性及临床意义
2
作者 王晶田 胡国斌 +4 位作者 兰利利 赵岩 吴干勋 王占龙 沈素朋 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第7期910-917,共8页
目的探讨FN1表达与喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)临床病理特征及肿瘤相关巨噬细胞表达的相关性。方法下载LSCC数据集GSE33232和GSE84957分析并筛选差异表达基因FN1,绘制受试者工作特征(receiver operating char... 目的探讨FN1表达与喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)临床病理特征及肿瘤相关巨噬细胞表达的相关性。方法下载LSCC数据集GSE33232和GSE84957分析并筛选差异表达基因FN1,绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线的关系;利用生物信息学分析FN1在LSCC中的表达,分析其表达与临床病理分级和总生存期(overall survival,OS)的关系;si-FN1敲低TU177细胞中FN1的表达,采用划痕愈合和Transwell小室实验检测FN1对LSCC体外迁移和侵袭等恶性生物学行为的影响;免疫组化法检测LSCC组织中FN1和CD163的表达并分析两者的相关性。结果GSE33232和GSE84957数据集及在线数据库分析结果显示,FN1在LSCC组织中显著高表达(P<0.05),FN1高表达患者的总生存率明显降低(HR=1.6,P=0.017)。转染si-FN1后TU177细胞中FN1的表达显著降低(0.34±0.02 vs 1.00±0.03,P<0.01)。与对照组相比,FN1表达敲低可抑制TU177细胞的体外迁移(56.1±3.1 vs 19.23±1.0)和侵袭能力(480±23 vs288±20)。免疫组化结果显示,LSCC组织中肿瘤实质FN1(N-FN1)和基质细胞FN1(S-FN1)高表达[52.1%(24/46)和71.7%(33/46)];N-FN1高表达与患者病理分级、淋巴结转移有关(P<0.05),S-FN1高表达与患者年龄、淋巴结转移和TNM分期有关(P<0.05);FN1和CD163协同表达与患者病理分级、淋巴结转移和TNM分期有关(均为P<0.05)。结论FN1和CD163在LSCC患者肿瘤组织中高表达,并与患者侵袭转移等恶性进展有关,LSCC进展过程中FN1与肿瘤微环境中CD163阳性的巨噬细胞可能存在协同作用。 展开更多
关键词 喉肿瘤 鳞状细胞癌 fn1 免疫组织化学 肿瘤相关巨噬细胞 转移
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甲状腺乳头状癌中FN1和TNFRSF11B的异常表达和预后不良及肿瘤微环境变化有关
3
作者 高建 郑子芳 张国烈 《武汉大学学报(医学版)》 2025年第8期1000-1008,共9页
目的:分析FN1和TNFRSF11B在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其临床病理意义和与肿瘤微环境(TME)评分的关系。方法:使用R和R包分析TCGA⁃THCA和GSE3678数据,探索FN1和TNFRSF11B的表达和临床病理参数的关系。随后从基质细胞、免疫细胞浸润... 目的:分析FN1和TNFRSF11B在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其临床病理意义和与肿瘤微环境(TME)评分的关系。方法:使用R和R包分析TCGA⁃THCA和GSE3678数据,探索FN1和TNFRSF11B的表达和临床病理参数的关系。随后从基质细胞、免疫细胞浸润评分和肿瘤纯度分析PTC的TME,并分析靶向免疫治疗检查点。最后通过免疫组织化学方法验证FN1和TNFRSF11B在PTC的表达及临床意义。结果:TCGA⁃THCA、GSE3678以及临床样本中,一致性检出PTC中FN1高表达(P<0.001)和TNFRSF11B低表达(P<0.05);高表达的FN1和淋巴转移以及无进展生存显著相关(P<0.05);FN1高表达和TNFRSF11B低表达可显著影响TME(P<0.05);FN1和TNFRSF11B异常表达可用于靶向免疫治疗评估。结论:PTC患者FN1和TNFRSF11B的异常表达和预后不良及肿瘤微环境变化有关,可用于靶向免疫治疗评估,是有价值的诊断和治疗靶点。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 fn1 TNFRSF11B 预后 肿瘤微环境
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致癌基因FN1的耐药性预测分析
4
作者 郝彬如 叶云 《广西科技大学学报》 2025年第4期114-127,共14页
目前已有FN1与某些癌症患者预后和药物靶向作用机制方面的研究,但缺乏基于临床大数据的泛癌研究。通过生物信息学,利用TCGA和GEO数据库,借助TIMER2.0、GEPIA2.0、cBioPortal和CellMiner等分析平台及R软件,对FN1基因的表达差异、预后情... 目前已有FN1与某些癌症患者预后和药物靶向作用机制方面的研究,但缺乏基于临床大数据的泛癌研究。通过生物信息学,利用TCGA和GEO数据库,借助TIMER2.0、GEPIA2.0、cBioPortal和CellMiner等分析平台及R软件,对FN1基因的表达差异、预后情况、遗传突变、免疫和药敏性等多个角度进行泛癌分析。研究发现FN1基因与多种癌症预后具有显著相关性,且已有一些文章提出将FN1基因作为某些癌症的关键基因。FN1基因大多存在于胞外区域,主要通过与蛋白结合的生物学过程起到细胞黏附、细胞外基质组织和内胚层细胞分化等分子功能。根据免疫浸润分析和通路富集分析预测,FN1基因可能通过与癌症相关的成纤维细胞的免疫相关性或PI3K-Akt等信号通路参与人类癌症免疫治疗中的免疫逃逸,与化疗药物的耐药性有关。研究证明了FN1基因在泛癌中具有研究价值,可为攻克肿瘤治疗难关提供研究基础。 展开更多
关键词 fn1 预后 突变 免疫 富集 耐药
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FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌合并桥本甲状腺炎中的表达意义
5
作者 贾宁 蹇顺海 赵棋 《诊断病理学杂志》 2024年第4期313-317,共5页
目的探讨FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌(PTC)合并桥本甲状腺炎(HT)中的表达意义。方法应用免疫组化方法检测FN1、PROS1在114例PTC合并HT组织与81例仅为HT组织中表达情况、临床病理特征关系及二者表达相关性。采用受试者工作特性(ROC)曲线... 目的探讨FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌(PTC)合并桥本甲状腺炎(HT)中的表达意义。方法应用免疫组化方法检测FN1、PROS1在114例PTC合并HT组织与81例仅为HT组织中表达情况、临床病理特征关系及二者表达相关性。采用受试者工作特性(ROC)曲线分析FN1、PROS1及二者联合对合并HT的PTC诊断价值。结果在合并HT的PTC组织中,FN1、PROS1表达阳性率显著高于HT组织(P<0.001)。FN1、PROS1表达均与淋巴结转移相关(均P<0.05)。Spearman分析结果示,在合并HT的PTC组织中FN1、PROS1表达水平成正相关(r=0.398,P<0.001)。ROC曲线分析显示,FN1、PROS1及二者联合检测合并HT的PTC敏感度分别为95.06%、88.89%和90.12%,特异度分别为91.23%、92.11%和95.61%。结论FN1、PROS1在合并HT的PTC组织中高表达,且阳性表达与淋巴结转移有关,对合并HT的PTC具有较高的辅助诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 诊断效能 免疫组化 fn1 PROS1
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细胞外基质蛋白FN1调控骨骼疾病及相关信号通路的研究进展
6
作者 何帅 刘锌 +3 位作者 杜斌 孙光权 席洪钟 陈浩 《解放军医学院学报》 2024年第12期1285-1291,共7页
骨代谢是一个动态平衡的过程,由成骨细胞和破骨细胞共同完成。骨吸收和骨形成在时空上的紧密偶联维持着骨重建的正常进行,成骨细胞或破骨细胞的异常分化均可能引起骨代谢的失衡并导致相关疾病。纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)基因编码的... 骨代谢是一个动态平衡的过程,由成骨细胞和破骨细胞共同完成。骨吸收和骨形成在时空上的紧密偶联维持着骨重建的正常进行,成骨细胞或破骨细胞的异常分化均可能引起骨代谢的失衡并导致相关疾病。纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)基因编码的FN1是一种重要的细胞外基质蛋白,对于多种生物学过程和组织的正常功能至关重要。一直以来FN1对骨代谢和骨骼疾病的影响关注较少,而越来越多的研究表明,FN1蛋白参与了骨代谢相关疾病中信号通路的调控。本文总结近年来FN1在骨代谢和相关骨骼疾病中的调控机制,以期为骨科疾病研究提供依据。 展开更多
关键词 纤连蛋白1 信号转导 骨骼疾病 成骨分化 骨肿瘤 骨代谢
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黔北麻羊CTSK、FN1基因生物信息学分析及其在性腺轴中的表达 被引量:4
7
作者 赵佳福 周明帅 +2 位作者 徐畅 杨秀远 陈祥 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期854-860,共7页
【目的】研究组织蛋白酶K(Cathepsin K,CTSK)和纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)基因与黔北麻羊繁殖率之间的相互关系,为研究CTSK、FN1基因调控山羊卵泡发育的分子机制提供参考。【方法】通过生物信息学方法分析黔北麻羊CTSK、FN1蛋白... 【目的】研究组织蛋白酶K(Cathepsin K,CTSK)和纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)基因与黔北麻羊繁殖率之间的相互关系,为研究CTSK、FN1基因调控山羊卵泡发育的分子机制提供参考。【方法】通过生物信息学方法分析黔北麻羊CTSK、FN1蛋白理化性质、亚细胞定位、信号肽位点和蛋白高级结构,并进行氨基酸同源性分析,构建系统发育进化树;采用荧光定量PCR法检测CTSK、FN1基因在单羔、多羔黔北麻羊性腺轴(下丘脑、垂体、子宫、输卵管、卵巢)中的表达量。【结果】CTSK、FN1基因分别编码330和2478个氨基酸,理论PI值分别为8.82和5.37,CTSK是一种具有信号肽的稳定亲水性蛋白,而FN1是一种具有信号肽的不稳定亲水性蛋白;亚细胞定位结果说明:CTSK蛋白可能主要在细胞外和内质网中发挥生物学作用,而FN1蛋白可能主要在细胞核中发挥生物学作用;高级结构预测结果显示,CTSK和FN1蛋白均主要由无规则卷曲构成;与其他动物相比,黔北麻羊CTSK、FN1基因均与反刍动物绵羊及牛的亲缘关系最近。qPCR分析表明:CTSK和FN1基因在单羔、多羔黔北麻羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢组织中均有表达,与单羔组相比,多羔组CTSK基因在卵巢、下丘脑、子宫中的表达量均极显著下调(P<0.01),而FN1基因在下丘脑和子宫中的表达均极显著上调(P<0.01),在卵巢中显著上调(P<0.05)。【结论】CTSK基因表达量与黔北麻羊的繁殖性状呈负相关,FN1基因则呈正相关,CTSK和FN1基因均是影响黔北麻羊繁殖性能的重要候选基因。 展开更多
关键词 黔北麻羊 性腺轴 CTSK基因 fn1基因 生物信息学
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甲状腺乳头状癌的FN1表达增加与BRAF突变、免疫浸润及预后不良有关 被引量:4
8
作者 陈兴 郑俊杰 +1 位作者 张爱龙 游振辉(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期1841-1847,共7页
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌... 目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测。结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平。此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路。结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 fn1 BRAF突变 免疫浸润 p53信号通路 生物信息学
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基于生物信息学分析高表达FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用 被引量:3
9
作者 李晶晶 许丁文 严慧深 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期318-323,共6页
目的研究FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用。方法运用GEPIA在线工具分析FN1在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达高低,运用km-plot分析FN1关于乳腺癌患者的生存曲线。运用GEO数据库分析FN1在阿霉素敏感性与耐药性乳腺癌细胞株中表... 目的研究FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用。方法运用GEPIA在线工具分析FN1在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达高低,运用km-plot分析FN1关于乳腺癌患者的生存曲线。运用GEO数据库分析FN1在阿霉素敏感性与耐药性乳腺癌细胞株中表达高低。进一步运用基因互作分析、基因通路富集和文本挖掘、miRNA-mRNA互作分析方法证明FN1调控乳腺癌耐药性,探索内在机制。结果FN1在乳腺癌中表达明显高于正常乳腺组织,高表达FN1患者生存率低,阿霉素耐药的乳腺癌细胞株FN1表达明显高于阿霉素敏感性乳腺癌细胞株,紫杉醇耐药的细胞系中的FNI表达显著高于敏感组,FN1表达量与达沙替尼敏感性呈负相关,与FN1高度关联的基因大部分与乳腺癌耐药性有关,基因通路富集发现细胞骨架的构建通路富集程度最高,文本挖掘显示细胞增殖、凋亡等生物学过程与FN1、乳腺癌、耐药性有显著关联。miRNA-mRNA互作分析发现,与FN1明显相关的10个微小RNA中8个已被证明与乳腺癌及乳腺癌耐药性有关。结论FN1与乳腺癌的耐药性有关。 展开更多
关键词 fn1 乳腺癌 耐药性 生物信息学
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FN1在乳腺癌组织中的表达及其与临床病理的关系 被引量:2
10
作者 陈皓 黄秋霞 +1 位作者 韦康来 冯振博 《广西医科大学学报》 CAS 2015年第2期241-244,共4页
目的:探讨乳腺癌组织中纤维连接蛋白1(FN1)的表达与临床病理的关系。方法:通过免疫组化SupervisionTM二步法检测79例乳腺癌组织和其中相应的40例癌旁乳腺组织中FN1蛋白的表达。结果:1FN1在乳腺癌组织中的表达明显高于癌旁乳腺组织(P<... 目的:探讨乳腺癌组织中纤维连接蛋白1(FN1)的表达与临床病理的关系。方法:通过免疫组化SupervisionTM二步法检测79例乳腺癌组织和其中相应的40例癌旁乳腺组织中FN1蛋白的表达。结果:1FN1在乳腺癌组织中的表达明显高于癌旁乳腺组织(P<0.01)。2FN1表达水平随组织学分级、肿瘤大小、淋巴结转移、临床分期的等级升高而增加(均P<0.05);FN1在HER2阳性中高表达(P<0.05),在ER/PR阳性中低表达(P<0.01);FN1的表达在分子亚型中存在差异(P<0.01),在HER2过表达型中明显高于Luminal型(P<0.01)。3FN1诊断乳腺癌组织的ROC曲线下面积为0.927,诊断淋巴结转移的ROC曲线下面积为0.631。结论:FN1异常表达参与乳腺癌发生发展过程。 展开更多
关键词 乳腺癌 fn1 分子亚型 转移 免疫组化 @@
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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量:6
11
作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 fn1 COL6A3
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FN1(-)及Vimentin(+)与早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的关系 被引量:4
12
作者 徐胜昔 李森 +3 位作者 石颖芳 王恒丹 李梦琴 汪志春 《实用癌症杂志》 2022年第4期577-582,共6页
目的探讨早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。方法收集111例早期乳腺癌患者的临床病理资料,临床腋窝表现为阴性,成功行前哨淋巴结活检,显示为阳性,随后行同侧腋窝淋巴结清扫,应用统计学软件对相关因素进行分析。将单因素分析有... 目的探讨早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。方法收集111例早期乳腺癌患者的临床病理资料,临床腋窝表现为阴性,成功行前哨淋巴结活检,显示为阳性,随后行同侧腋窝淋巴结清扫,应用统计学软件对相关因素进行分析。将单因素分析有统计学显著意义的因素纳入logistic多因素回归分析,找出非前哨淋巴结转移的独立风险因素。结果在单因素分析中,患者年龄、原发肿瘤大小、与淋巴管血管侵犯状况、Ki-67状态、SLN转移阳性数(SLN+)、SLN转移阴性数(SLN-)、SLN转移阳性数占SLN总数的比例(SLN+/SLN)、纤维连接蛋白1(FN1)表达以及波形蛋白(Vimentin)表达等因素在非前哨淋巴结阳性组与阴性组间有统计学差异,对以上因素采用二元logistic回归分析,结果显示原发肿瘤大小,纤维连接蛋白1(FN1)表达水平以及波形蛋白(Vimentin)表达水平,两组具有统计学上差异(P<0.05)。结论原发肿瘤大小,FN1(-)以及Vimentin(+)是早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。 展开更多
关键词 乳腺癌 非前哨淋巴结 fn1 VIMENTIN 独立风险因素
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FN1基因变异致纤维连接蛋白沉积肾小球2型的临床特点和遗传学分析
13
作者 吴卫照 袁转苹 +1 位作者 吴丹 肖贞 《中国优生与遗传杂志》 2023年第10期2133-2137,共5页
目的 探讨FN1基因变异所致纤维连接蛋白沉积肾小球疾病2型(GFND2)的临床表型及遗传学特征。方法 回顾分析2023年3月于中山市小榄人民医院儿科收治的1例以眼睑浮肿为主诉的GFND2患儿为研究对象。采集该患儿的临床数据资料,采用全医学外... 目的 探讨FN1基因变异所致纤维连接蛋白沉积肾小球疾病2型(GFND2)的临床表型及遗传学特征。方法 回顾分析2023年3月于中山市小榄人民医院儿科收治的1例以眼睑浮肿为主诉的GFND2患儿为研究对象。采集该患儿的临床数据资料,采用全医学外显子组测序(WES)对患儿及其父母行遗传学分析,并回顾国内外文献报道的FN1基因突变所致GFND2病例的临床特点以及遗传学特征。总结已报道FN1所致GFND2基因变异和临床特点的关系。结果 患儿,男,8岁,以眼睑浮肿、血尿、蛋白尿、高血压为临床特点。全医学外显子测序结果提示其携带FN1基因c.938G>T位点杂合基因变异,现国内尚未见以该位点变异的报道。连同16篇文献报道的50例FN1基因变异致病患者,主要临床表现为高血压(14/50,28%)、血尿(20/50,40%)、蛋白尿(31/50,62%)。共检出FN1基因变异16个。结论FN1基因c.938G>T(p.Gly313Val)是本例患儿的致病原因。本研究丰富了FN1相关的GFND2基因变异谱,并为临床诊断、产前诊断提供了依据。对于高血压、蛋白尿、血尿的患儿,需尽早完善基因检查明确病因。 展开更多
关键词 fn1基因 纤维连接蛋白沉积肾小球疾病2型 变异 全外显子测序
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FN1-150-5A型缝焊机控制电路的改进
14
作者 韦寿祺 《电焊机》 2000年第4期31-33,共3页
关键词 fn1-150-5A型 缝焊机 控制电路 设计
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山羊FN1基因InDel位点鉴定及其与生长性状的关联性分析 被引量:1
15
作者 吴贤锋 刘远 +2 位作者 王迎港 张富 李文杨 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期1-6,共6页
【目的】转录组候选基因纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)对于骨分化、骨形成和骨细胞迁移起关键作用。对FN1基因预测突变位点进行DNA池检测,并与山羊生长性状进行关联分析,以期为山羊的遗传育种和性状改良提供分子标记。【方法】利用... 【目的】转录组候选基因纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)对于骨分化、骨形成和骨细胞迁移起关键作用。对FN1基因预测突变位点进行DNA池检测,并与山羊生长性状进行关联分析,以期为山羊的遗传育种和性状改良提供分子标记。【方法】利用DNA池检测和PCR-RFLP技术,分析福清山羊、努比亚黑山羊和简阳大耳羊中FN1基因的7个预测突变位点的遗传多态性,并与其生长性状进行关联分析。【结果】通过DNA池检测和PCRRFLP发现,7个预测位点中只有Del66652位点存在多态性,且在3个山羊群体中都只存在Ⅱ和ID基因型,都不处于哈迪温伯格平衡(P>0.05),多态性信息含量小于0.25。关联分析发现,努比亚黑山羊ID基因型个体的管围显著优于Ⅱ基因型(P<0.05),ID基因型的胸围指数极显著优于Ⅱ基因型(P<0.01)。简阳大耳羊ID基因型个体的胸围指数和管围指数显著优于Ⅱ基因型(P<0.05)。【结论】Del66652位点与努比亚山羊和简阳大耳羊的生长性状显著相关,且ID基因型为优势基因型。Del66652位点可作为影响山羊生长性状的分子标记位点,为提高山羊生长性状的品种改良提供研究基础。 展开更多
关键词 山羊 fn1基因 插入缺失(InDel) 生长性状 关联分析
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Regulation of FN1 degradation by the p62/SQSTM1-dependent autophagy-lysosome pathway in HNSCC 被引量:14
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作者 Xinchen Liu Lin Meng +6 位作者 Xing Li Daowei Li Qilin Liu Yumeng Chen Xiangwei Li Wenhuan Bu Hongchen Sun 《International Journal of Oral Science》 SCIE CAS CSCD 2020年第4期327-337,共11页
Epithelial–mesenchymal transition(EMT)is involved in both physiological and pathological processes.EMT plays an essential role in the invasion,migration and metastasis of tumours.Autophagy has been shown to regulate ... Epithelial–mesenchymal transition(EMT)is involved in both physiological and pathological processes.EMT plays an essential role in the invasion,migration and metastasis of tumours.Autophagy has been shown to regulate EMT in a variety of cancers but not in head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC).Herein,we investigated whether autophagy also regulates EMT in HNSCC.Analyses of clinical data from three public databases revealed that higher expression of fibronectin-1(FN1)correlated with poorer prognosis and higher tumour pathological grade in HNSCC.Data from SCC-25 cells demonstrated that rapamycin and Earle’s balanced salt solution(EBSS)promoted autophagy,leading to increased FN1 degradation,while 3-methyladenine(3-MA),bafilomycin A1(Baf A1)and chloroquine(CQ)inhibited autophagy,leading to decreased FN1 degradation.On the other hand,autophagic flux was blocked in BECN1 mutant HNSCC Cal-27 cells,and rapamycin did not promote autophagy in Cal-27 cells;also in addition,FN1 degradation was inhibited.Further,we identified FN1 degradation through the lysosome-dependent degradation pathway using the proteasome inhibitor MG132.Data from immunoprecipitation assays also showed that p62/SQSTM1 participated as an autophagy adapter in the autophagy–lysosome pathway of FN1 degradation.Finally,data from immunoprecipitation assays demonstrated that the interaction between p62 and FN1 was abolished in p62 mutant MCF-7 and A2780 cell lines.These results indicate that autophagy significantly promotes the degradation of FN1.Collectively,our findings clearly suggest that FN1,as a marker of EMT,has adverse effects on HNSCC and elucidate the autophagy–lysosome degradation mechanism of FN1. 展开更多
关键词 inhibited INVASION fn1
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FN1在胃癌组织和细胞中的表达及意义 被引量:6
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作者 姚远 李胜昔 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第16期2831-2835,共5页
目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析... 目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析FN1表达水平与胃癌预后的关系。结果:Oncomine数据库分析FN1在多种肿瘤组织中表达增加,与胃正常组织相比,FN1在胃癌组织中表达增加,并具有统计学差异(P=1.41E-5)。FN1 mRNA在人胃癌细胞系SGC7901中表达水平增高,在胃癌组织中FN1蛋白表达增加。KM Plotter数据库分析结果显示FN1表达量与胃癌患者总体生存率存在相关性,即高表达FN1的患者总体生存率较差。结论:FN1在胃癌组织和细胞中的表达高于正常组织和细胞,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 Oncomine数据库 KMPlotter数据库 纤维连接蛋白1 预后
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LncRNA XIST、miR-204及FN1在甲状腺乳头状癌中的表达及意义
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作者 孙茂林 张文伟 +6 位作者 姜立伟 臧传善 秦作荣 王效军 孙彦 刘明波 邱杰 《临床医学进展》 2021年第7期3033-3046,共14页
目的:探讨LncRNA XIST,miR-204及FN1在PTC组织和癌旁组织及LncRNA XIST在PTC细胞系中的表达及意义。方法:应用Real-time PCR技术检测20例甲状腺乳头状癌和其癌旁组织中LncRNA XIST,miR-204及FN1的表达情况,应用QPCR检测3株甲状腺癌细胞... 目的:探讨LncRNA XIST,miR-204及FN1在PTC组织和癌旁组织及LncRNA XIST在PTC细胞系中的表达及意义。方法:应用Real-time PCR技术检测20例甲状腺乳头状癌和其癌旁组织中LncRNA XIST,miR-204及FN1的表达情况,应用QPCR检测3株甲状腺癌细胞系(BCPAP, TPC-1, KTC-1) LncRNA XIST、miR-204-5p的表达水平,应用荧光原位杂交(FISH)检测PTC细胞系BCPAP中LncRNA XIST的表达定位,应用双荧光素酶报告基因检测人293T细胞的LncRNA XIST、miR-204及FN1相互作用。结果:与癌旁组相比,PTC癌组织组的LncRNA XIST的表达水平显著上调(p 【0.05),PTC癌组织组的FN1的表达水平极显著上调(p 【0.01),而PTC癌组织组的miR-204-5p的表达水平极显著下调(p 【0.01),差异均具有统计学意义;BCPAP细胞的LncRNA XIST的表达水平最高,且miR-204-5p的表达水平最低;LncRNA XIST主要在细胞质中表达;LncRNA XIST与miR-204有相互作用(p 【0.05),FN1与miR-204有相互作用(p 【0.05)。结论:LncRNA XIST在甲状腺乳头状癌中高表达,miR-204在甲状腺乳头状癌中低表达,FN1在甲状腺乳头状癌中高表达;LncRNA XIST,miR-204及FN1相互作用,参与甲状腺乳头状癌的发生发展,并可为甲状腺乳头状癌潜在诊断标志物和治疗靶点的寻找提供理论依据,LncRNA XIST可能是甲状腺乳头状癌诊断和治疗的一个新靶点。 展开更多
关键词 LncRNA XIST基因 miR-204基因 fn1基因 甲状腺乳头状癌
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结肠癌组织中SATB1、FN1和PDGFRB蛋白表达水平及临床意义 被引量:5
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作者 林玲 吕黄勇 +1 位作者 聂川 韩峰 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第8期1333-1337,共5页
目的:探讨结肠癌组织中特异AT序列结合蛋白1(special AT-rich sequence binding protein,SATB1)、纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)和血小板衍生生长因子受体(platelet-derived growth factor receptor,PDGFRB)蛋白表达水平及临床意义... 目的:探讨结肠癌组织中特异AT序列结合蛋白1(special AT-rich sequence binding protein,SATB1)、纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)和血小板衍生生长因子受体(platelet-derived growth factor receptor,PDGFRB)蛋白表达水平及临床意义。方法:选取2012年1月至2012年12月在我院肛肠科住院的42例结肠癌患者组织作为病理,并选取癌旁组织(距肿瘤边缘>5 cm)作为对照,用免疫组织化学法检测SATB1、FN1和PDGFRB蛋白的表达水平,分析它们与结肠患者临床病理参数间的关系及结肠癌患者术后生存期的关系。结果:SATB1、FN1和PDGFRB在结肠癌组织中阳性表达率分别为57.1%(24/42)、61.9%(26/42)和66.7%(28/42),在癌旁组织中阳性表达率分别为9.5%(4/42)、7.1%(3/42)和9.5%(4/42),差异有统计学意义(P<0.05);SATB1、FN1和PDGFRB表达水平与年龄和性别不相关;与TNM分期、肿瘤分化程度和有无转移相关;随访发现,13例结肠癌患者死亡,生存29例,中位生存时间为34个月;进行二分类Logistic逐步回归分析,结果显示,SATB1、FN1、PDGFRB、肿瘤浸润深度和有转移是结肠癌患者生存结局的独立危险因素。结论:SATB1、FN1和PDGFRB在结肠癌组织中高表达,与结肠癌的发生和发展密切相关,可作为判断患者预后的指标。 展开更多
关键词 结肠癌 SATB1 fn1 PDGFRB
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FN1在GBM中的表达差异及对预后的影响
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作者 张钰霄 肖博 《生物技术》 CAS 2022年第6期772-778,共7页
[目的]探究纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及对患者预后的影响,为GBM的早期诊断和治疗提供生物标志物。[方法]CCLE数据库分析FN1在不同肿瘤细胞系中的表达;UALCAN和GEPIA2数据库分析FN1在GBM... [目的]探究纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及对患者预后的影响,为GBM的早期诊断和治疗提供生物标志物。[方法]CCLE数据库分析FN1在不同肿瘤细胞系中的表达;UALCAN和GEPIA2数据库分析FN1在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达差异;The Human Protein Atlas数据库分析FN1蛋白在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达;GEPIA2数据库分析FN1在肿瘤组织中的异常表达对GBM患者总体生存率和无病生存率的影响;DAVID 6.8在线软件对FN1相关基因进行KEGG通路富集。[结果]在所有类型肿瘤细胞系中,GBM肿瘤细胞系中FN1 mRNA表达水平中排第八;FN1在GBM肿瘤组织中的表达高于正常组织(***P<0.001和*P<0.05),并且FN1高表达后GBM患者的总体生存率和无病生存率均降低(P=0.028和P=0.0056);KEGG分析结果表明与FN1正相关的基因富集通路有57个,癌症通路位于第三位。[结论]FN1在GBM中明显上调,是GBM诊断和预后的有效生物标志物。 展开更多
关键词 多形性胶质母细胞瘤 fn1 TCGA 生物标志物 生存率
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