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Fancd2os基因及其编码蛋白的生物信息学分析和表达谱鉴定
被引量:
1
1
作者
李晓宾
杨红
+5 位作者
李婷
贾三三
温丽敏
白欣艳
王海龙
郭睿
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2015年第7期670-676,共7页
目的利用生物信息学手段对Fancd2os基因及其编码蛋白进行结构分析和功能预测,并检测该基因在小鼠组织中的表达。方法利用生物信息学分析软件和技术对该基因及其编码蛋白的同源性、结构定位、理化性质及表达谱等特征进行分析和比对;采用...
目的利用生物信息学手段对Fancd2os基因及其编码蛋白进行结构分析和功能预测,并检测该基因在小鼠组织中的表达。方法利用生物信息学分析软件和技术对该基因及其编码蛋白的同源性、结构定位、理化性质及表达谱等特征进行分析和比对;采用半定量RT-PCR、实时定量PCR及Western blot法分别检测Fancd2os m RNA及其编码蛋白在雄性小鼠不同组织以及不同发育阶段睾丸组织的表达;利用免疫组织化学染色方法检测Fancd2os蛋白在小鼠曲细精管中的细胞定位。结果生物信息学分析表明小鼠Fancd2os蛋白的氨基酸系列与人、大鼠和牛的同源性分别为92.1%、97.8%和93.3%,该蛋白主要定位在细胞浆,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,无信号肽,含有多个磷酸化位点;EST电子表达谱显示该基因主要在睾丸组织中表达;GEO数据库分析提示Fancd2os基因的表达可能与线粒体Clp P蛋白酶的表达密切相关;MGI Interaction Explorer数据库检索发现Fancd2os基因与95个mi RNA具有相互作用。Fancd2os基因及其编码蛋白在小鼠睾丸组织中表达量高,且具有明显的时序性,以8周龄小鼠表达水平最高;Fancd2os蛋白主要定位于曲细精管精母细胞和圆形精子细胞的胞质中。结论 Fancd2os基因为小鼠睾丸组织高表达基因,其表达水平随着睾丸的发育过程呈上调趋势,结合生物信息学分析结果,该基因可能与睾丸的发育及生精过程相关。
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关键词
fancd2os
生物信息学
表达谱
小鼠
睾丸
基因表达
原文传递
小鼠Fancd2os基因真核表达质粒的构建及其对人胚肾上皮细胞增殖和凋亡的影响
2
作者
李婷
贾三三
+5 位作者
温丽敏
白欣艳
王玉晶
王海龙
解军
郭睿
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2016年第6期571-575,581,共6页
目的构建小鼠Fancd2os基因的真核表达质粒,并分析Fancd2os基因对人胚肾上皮细胞(HEK293T)增殖和凋亡的影响。方法以小鼠睾丸组织DNA为模板扩增Fancd2os基因c DNA全长片段,并克隆至真核表达载体p3×FLAG-CMV-14,构建重组真核表达质粒...
目的构建小鼠Fancd2os基因的真核表达质粒,并分析Fancd2os基因对人胚肾上皮细胞(HEK293T)增殖和凋亡的影响。方法以小鼠睾丸组织DNA为模板扩增Fancd2os基因c DNA全长片段,并克隆至真核表达载体p3×FLAG-CMV-14,构建重组真核表达质粒p3×FLAG-CMV-14-Fancd2os。经Lipofectamine TM 2000将重组真核表达质粒瞬时转染HEK293T细胞,分别采用RT-PCR及Western blot法检测转染细胞中Fancd2os基因m RNA转录及蛋白表达情况;经CCK8法和流式细胞术分别检测过表达Fancd2os对HEK293T细胞增殖能力及紫外线诱导HEK293T细胞凋亡的影响。结果经双酶切及测序鉴定,重组真核表达质粒p3×FLAG-CMV-14-Fancd2os构建正确;转染p3×Flag-CMV-14-Fancd2os的HEK293T细胞可见Fancd2os基因m RNA转录及其蛋白表达;过表达Fancd2os的HEK293T细胞的增殖活性显著下降(P<0.05);过表达Fancd2os可显著促进紫外线诱导的HEK293T细胞凋亡(P<0.01)。结论成功构建了重组真核表达质粒p3×Flag-CMV-14-Fancd2os,过表达Fancd2os可抑制HEK293T细胞的增殖,促进其凋亡。
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关键词
fancd2os
基因
真核细胞
基因表达
HEK293T细胞
细胞增殖
细胞凋亡
原文传递
题名
Fancd2os基因及其编码蛋白的生物信息学分析和表达谱鉴定
被引量:
1
1
作者
李晓宾
杨红
李婷
贾三三
温丽敏
白欣艳
王海龙
郭睿
机构
山西医科大学基础医学院
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2015年第7期670-676,共7页
基金
山西省归国留学人员基金(2011-043)
文摘
目的利用生物信息学手段对Fancd2os基因及其编码蛋白进行结构分析和功能预测,并检测该基因在小鼠组织中的表达。方法利用生物信息学分析软件和技术对该基因及其编码蛋白的同源性、结构定位、理化性质及表达谱等特征进行分析和比对;采用半定量RT-PCR、实时定量PCR及Western blot法分别检测Fancd2os m RNA及其编码蛋白在雄性小鼠不同组织以及不同发育阶段睾丸组织的表达;利用免疫组织化学染色方法检测Fancd2os蛋白在小鼠曲细精管中的细胞定位。结果生物信息学分析表明小鼠Fancd2os蛋白的氨基酸系列与人、大鼠和牛的同源性分别为92.1%、97.8%和93.3%,该蛋白主要定位在细胞浆,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,无信号肽,含有多个磷酸化位点;EST电子表达谱显示该基因主要在睾丸组织中表达;GEO数据库分析提示Fancd2os基因的表达可能与线粒体Clp P蛋白酶的表达密切相关;MGI Interaction Explorer数据库检索发现Fancd2os基因与95个mi RNA具有相互作用。Fancd2os基因及其编码蛋白在小鼠睾丸组织中表达量高,且具有明显的时序性,以8周龄小鼠表达水平最高;Fancd2os蛋白主要定位于曲细精管精母细胞和圆形精子细胞的胞质中。结论 Fancd2os基因为小鼠睾丸组织高表达基因,其表达水平随着睾丸的发育过程呈上调趋势,结合生物信息学分析结果,该基因可能与睾丸的发育及生精过程相关。
关键词
fancd2os
生物信息学
表达谱
小鼠
睾丸
基因表达
Keywords
fancd2os
Bioinformatics
Expression profile
Mouse
Testis
Gene expression
分类号
R73-3 [医药卫生—肿瘤]
Q31 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
小鼠Fancd2os基因真核表达质粒的构建及其对人胚肾上皮细胞增殖和凋亡的影响
2
作者
李婷
贾三三
温丽敏
白欣艳
王玉晶
王海龙
解军
郭睿
机构
山西医科大学生物化学与分子生物学教研室
山西医科大学寄生虫学教研室
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2016年第6期571-575,581,共6页
基金
山西省回国留学人员科研资助项目(2011-043)
文摘
目的构建小鼠Fancd2os基因的真核表达质粒,并分析Fancd2os基因对人胚肾上皮细胞(HEK293T)增殖和凋亡的影响。方法以小鼠睾丸组织DNA为模板扩增Fancd2os基因c DNA全长片段,并克隆至真核表达载体p3×FLAG-CMV-14,构建重组真核表达质粒p3×FLAG-CMV-14-Fancd2os。经Lipofectamine TM 2000将重组真核表达质粒瞬时转染HEK293T细胞,分别采用RT-PCR及Western blot法检测转染细胞中Fancd2os基因m RNA转录及蛋白表达情况;经CCK8法和流式细胞术分别检测过表达Fancd2os对HEK293T细胞增殖能力及紫外线诱导HEK293T细胞凋亡的影响。结果经双酶切及测序鉴定,重组真核表达质粒p3×FLAG-CMV-14-Fancd2os构建正确;转染p3×Flag-CMV-14-Fancd2os的HEK293T细胞可见Fancd2os基因m RNA转录及其蛋白表达;过表达Fancd2os的HEK293T细胞的增殖活性显著下降(P<0.05);过表达Fancd2os可显著促进紫外线诱导的HEK293T细胞凋亡(P<0.01)。结论成功构建了重组真核表达质粒p3×Flag-CMV-14-Fancd2os,过表达Fancd2os可抑制HEK293T细胞的增殖,促进其凋亡。
关键词
fancd2os
基因
真核细胞
基因表达
HEK293T细胞
细胞增殖
细胞凋亡
Keywords
fancd2os
gene
Eukaryotic cells
Gene expression
HEK293T cells
Cell proliferation
Cell apoptosis
分类号
Q782 [生物学—分子生物学]
Q255 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Fancd2os基因及其编码蛋白的生物信息学分析和表达谱鉴定
李晓宾
杨红
李婷
贾三三
温丽敏
白欣艳
王海龙
郭睿
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2015
1
原文传递
2
小鼠Fancd2os基因真核表达质粒的构建及其对人胚肾上皮细胞增殖和凋亡的影响
李婷
贾三三
温丽敏
白欣艳
王玉晶
王海龙
解军
郭睿
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2016
0
原文传递
已选择
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