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森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆
被引量:
4
1
作者
周厚成
李刚
+2 位作者
赵霞
康兆茹
郭蔼光
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1630-1638,共9页
本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基...
本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基酸残基,有21个Fv MADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布;68个Fv MADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为"RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF"。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了Fa MADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族,c DNA全长1 167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。
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关键词
草莓
MADS-BOX
转录因子
生物信息学
famads1
基因
原文传递
题名
森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆
被引量:
4
1
作者
周厚成
李刚
赵霞
康兆茹
郭蔼光
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1630-1638,共9页
基金
河南省基础与前沿技术项目(132300410034)
公益性行业(农业)科研专项(201003064-7)
文摘
本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基酸残基,有21个Fv MADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布;68个Fv MADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为"RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF"。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了Fa MADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族,c DNA全长1 167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。
关键词
草莓
MADS-BOX
转录因子
生物信息学
famads1
基因
Keywords
Fragaria
MADS-box
transcription factor
bioinformatics
famads1 gene
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆
周厚成
李刚
赵霞
康兆茹
郭蔼光
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
原文传递
已选择
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参考文献
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