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甜橙FW2.2家族基因鉴定及在果实细胞分裂期的表达分析
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作者 许园园 郭玲霞 +5 位作者 范明慧 殷姿 韩健 李菲菲 周铁 陈鹏 《浙江农林大学学报》 北大核心 2026年第2期250-259,共10页
【目的】鉴定甜橙Citrus sinensis FW2.2基因家族成员,分析FW2.2家族成员的结构特征及其在果实细胞分裂期的表达模式,为探究FW2.2在甜橙果实发育中的基因功能提供理论依据。【方法】以甜橙全基因组数据为基础筛选确定甜橙FW2.2家族成员... 【目的】鉴定甜橙Citrus sinensis FW2.2基因家族成员,分析FW2.2家族成员的结构特征及其在果实细胞分裂期的表达模式,为探究FW2.2在甜橙果实发育中的基因功能提供理论依据。【方法】以甜橙全基因组数据为基础筛选确定甜橙FW2.2家族成员。运用生物信息学方法预测分析其基因结构、序列特征、染色体定位和顺式作用元件,并与多个物种的FW2.2家族序列构建发育进化树。利用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)技术分析甜橙FW2.2家族基因在甜橙果实细胞分裂时期的表达趋势。【结果】FW2.2家族在甜橙基因组中有16个成员。它们分布在6条染色体上,长度为100~563个氨基酸,含有2个以上的保守基序,主要定位在细胞膜。进化分析表明:甜橙、番茄Solanum lycopersicum、梨Pyrus bretschneideri、桃Prunus persica、玉米Zea mays及水稻Oryza sativa中FW2.2成员分为6个亚组。顺式元件分析显示:FW2.2家族基因启动子上均含有与激素、生长发育、非生物胁迫相关的元件。基因表达分析表明:FW2.2家族成员在果实细胞分裂期的表达趋势存在差异。CsFWL5、CsFWL6、CsFWL12在果实细胞分裂期的表达量显著降低,且与细胞层数增长呈极显著负相关(P<0.01)。【结论】CsFWLs成员在进化过程中表现出一定的保守性,且跟梨、桃、番茄等作物FWLs基因序列存在相似性。甜橙FW2.2基因家族成员间功能不同,其中甜橙CsFWL5/6/12可能参与调控果实细胞分裂过程。 展开更多
关键词 甜橙 fw2.2 全基因组鉴定 细胞分裂 表达分析
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根癌农杆菌介导fw2.2和PL基因对Micro-Tom番茄的遗传转化研究 被引量:3
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作者 孙瑶 田嘉 +1 位作者 林静 李疆 《新疆农业大学学报》 CAS 北大核心 2015年第3期187-192,共6页
为了快速验证与梨果实大小、硬度相关基因fw2.2、PL是否能够通过转基因植株顺利表达。本研究利用根癌农杆菌介导Micro-Tom番茄技术,以子叶为外植体,分析不同预培养时间、菌液浓度、浸染时间、共培养时间、延迟筛选对抗性芽诱导的影响,... 为了快速验证与梨果实大小、硬度相关基因fw2.2、PL是否能够通过转基因植株顺利表达。本研究利用根癌农杆菌介导Micro-Tom番茄技术,以子叶为外植体,分析不同预培养时间、菌液浓度、浸染时间、共培养时间、延迟筛选对抗性芽诱导的影响,得出最优转化体系为:子叶预培养36h,在OD600nm值为0.4菌液中浸染6min,共培养60h,在300mg/L头孢霉素(Cef)、25mg/L卡那霉素(Kan)延迟筛选14d,转入300mg/L Cef、40mg/L Kan分化培养。分别得到转基因阳性株为42株、38株,转化率为14.9%,13.1%。初步验证了fw2.2、PL基因已经整合到Micro-Tom番茄中。 展开更多
关键词 fw2.2基因 PL基因 Micro-Tom番茄 遗传转化
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龙眼胚性愈伤组织fw2.2家族2个基因的克隆与分析 被引量:2
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作者 陈裕坤 林玉玲 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第9期1608-1613,共6页
fruit weight 2.2(fw2.2)是植物中控制果实重量的重要数量性状的主效基因。以龙眼转录组数据库为基础,采用同源克隆法及RACE技术,从龙眼的胚性愈伤组织中获得fw2.2家族的2个cDNA全长序列,命名为Dlfw2.2-1与Dlfw2.2-1,并对其核甘酸序列... fruit weight 2.2(fw2.2)是植物中控制果实重量的重要数量性状的主效基因。以龙眼转录组数据库为基础,采用同源克隆法及RACE技术,从龙眼的胚性愈伤组织中获得fw2.2家族的2个cDNA全长序列,命名为Dlfw2.2-1与Dlfw2.2-1,并对其核甘酸序列及推导的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果表明:Dlfw2.2-1基因的cDNA全长为970 bp,编码184个氨基酸;Dlfw2.2-2基因的cDNA全长为941 bp,编码175个氨基酸。Dlfw2.2-1与Dlfw2.2-2的核甘酸序列及其推导的氨基酸序列与其它植物的fw2.2具有较高的同源性,亚细胞定位于细胞质膜,不含信号肽,具有跨膜结构与典型的与PLAC8同源的富半胱氨酸蛋白(Cysteine-rich Protein)的保守结构域。植物中fw2.2系统进化树分析结果表明,Dlfw2.2-1和Dlfw2.2-2为同一分枝,与番茄和油梨的fw2.2的距离最近。因此,推测Dlfw2.2-1与Dlfw2.2-2属于fw2.2基因家族的2个成员。 展开更多
关键词 龙眼 胚性愈伤组织 fw2 2 果实重量 基因克隆 生物信息学分析
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Cloning,localization and expression analysis of two fw2.2-like genes in small-and large-fruited pear species 被引量:11
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作者 TIAN Jia ZENG Bin +3 位作者 LUO Shu-ping LI Xiu-gen WU Bin LI Jiang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期282-294,共13页
Fruit size is one of the most important agronomic characters,which is mainly determined by cell number and cell size.However,our current knowledge about pear is largely unknown.Through counting of pear mesocarp cells ... Fruit size is one of the most important agronomic characters,which is mainly determined by cell number and cell size.However,our current knowledge about pear is largely unknown.Through counting of pear mesocarp cells at different stages,we found that the cell number,rather than the cell size,is responsible for the differences between small- and large-fruited cultivars.Fruit weight-2.2(fw2.2) is an important quantitative trait locus(QTL) affecting fruit weight in tomato and functions as a negative regulator in carpel cell division.To get more insights into this QTL in pear fruit development,we isolated two putative homologous fw2.2 genes,which were designated as fw2.2-like(PbFWL) genes.PbFWLs encode Cys-rich proteins with the CCXXXXCPC motif and belong to the PLAC8 superfamily.In addition,results from the subcellular localization indicated that PbFWLs were localized in the plasma membrane.The expression profile of the PbFWL genes by qRT-PCR showed they expressed higher in small-sized fruit cultivar than that in large-sized fruit cultivar during the cell division period.In summary,our data suggest that these two PbFWLs might be negatively related to the cell division in pear fruit. 展开更多
关键词 pear fruit size fw2.2 subcellular localization gene expression cell division
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梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库构建及互作蛋白的筛选 被引量:1
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作者 赛静忆 温玥 +1 位作者 郝志超 田嘉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1877-1888,共12页
【目的】筛选与FWL1互作的蛋白,为研究FWL1基因调节果实大小机理提供依据。【方法】以杜梨、库尔勒香梨、鸭梨、早美香为材料,提取4个梨品种果实细胞分裂关键时期的果肉组织混样RNA。构建梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库,并鉴... 【目的】筛选与FWL1互作的蛋白,为研究FWL1基因调节果实大小机理提供依据。【方法】以杜梨、库尔勒香梨、鸭梨、早美香为材料,提取4个梨品种果实细胞分裂关键时期的果肉组织混样RNA。构建梨幼果FWL1膜系统酵母双杂交三框cDNA文库,并鉴定文库质量。构建诱饵载体并转化酵母菌,筛选与FWL1互作的蛋白,对初步筛选出的阳性酵母克隆进行测序并在NCBI中进行Blast比对,确定候选互作蛋白。【结果】文库库容约为3×10^(7) CFU,大于1×10^(7) CFU,平均插入片段大于1000 bp,阳性率为≥98%。诱饵载体无自激活功能,利用共转化方法,筛选出272个与FWL1互作的蛋白质。【结论】梨幼果膜系统酵母双杂交三框cDNA文库符合酵母双杂文库的基本条件,适用于后期筛选相互作用的蛋白。筛选出的272个互作蛋白在果实发育过程中表达不同,其中collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1和metallothionein-like protein可能与梨果实大小发育有关。 展开更多
关键词 果实大小 fw2.2 三框cDNA文库 互作蛋白筛选
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