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基于FUNGuild的山药腐烂块茎真菌群落研究及潜在病原真菌的分离鉴定
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作者 展莉平 任雪洋 +5 位作者 张笑一 王瑞飞 孔盈利 王强 李明军 杨清香 《广西植物》 北大核心 2025年第2期347-359,共13页
为探讨山药腐烂块茎的真菌群落特征及主要病原真菌,该研究采用ITS扩增子测序技术和FUNGuild分析阐明了其真菌群落组成、网络特征及生态功能类群,并对潜在病原真菌进行了分离鉴定。结果表明:(1)山药腐烂块茎中的优势菌门为子囊菌门(Ascom... 为探讨山药腐烂块茎的真菌群落特征及主要病原真菌,该研究采用ITS扩增子测序技术和FUNGuild分析阐明了其真菌群落组成、网络特征及生态功能类群,并对潜在病原真菌进行了分离鉴定。结果表明:(1)山药腐烂块茎中的优势菌门为子囊菌门(Ascomycota),优势属包括青霉属(Penicillium)、炭疽菌属(Colletotrichum)、镰刀菌属(Fusarium)、篮状菌属(Talaromyces)和粉红螺旋聚孢霉属(Clonostachys)等。真菌生态网络呈现明显的模块化结构和高比例的正相关边数(99.33%),真菌间趋向于极强的正向合作。(2)FUNGuild分析显示,10个真菌生态功能类群与山药块茎腐烂高度相关。其中,粪腐生-未命名腐生-木腐菌和内生-植物病原真菌的相对丰度分别为33.74%和23.64%,其代表性属分别为青霉和炭疽属。此外,与植物病原和木腐菌同时相关的生态功能类群共有3个,总相对丰度为13.67%,代表性属为镰刀菌属。进一步Trait分析表明,青霉、镰刀菌等7个属真菌可能与山药块茎腐烂密切相关。(3)共分离鉴定真菌22株,隶属于6个属,包括镰刀菌属(9株)、青霉属(5株)和曲霉属(Aspergillus,4株)等。该研究结果为阐明山药块茎腐烂的发病机理、定向使用农药及筛选生防菌提供了参考依据。 展开更多
关键词 山药 扩增子测序 真菌群落 funguild 生态功能类群 植物病原真菌
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基于FUNGuild的镰刀菌根腐病发病烟株根际真菌群落研究 被引量:14
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作者 李朋发 杨龙 +3 位作者 李桂龙 徐后娟 王玉军 李忠佩 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期63-68,共6页
为了解镰刀菌根腐病发病烟株与未发病烟株在根际真菌群落结构与功能上的差异,联合应用高通量测序和FUNGuild技术研究了镰刀菌根腐病发病烟株与未发病烟株根际土壤中的真菌群落,结果表明:(1)镰刀菌根腐病发病烟株根际真菌群落的Shannon... 为了解镰刀菌根腐病发病烟株与未发病烟株在根际真菌群落结构与功能上的差异,联合应用高通量测序和FUNGuild技术研究了镰刀菌根腐病发病烟株与未发病烟株根际土壤中的真菌群落,结果表明:(1)镰刀菌根腐病发病烟株根际真菌群落的Shannon指数为4.14,而未发病烟株则高达4.71,未发病烟株根际真菌群落多样性显著高于发病烟株,镰刀菌根腐病发病烟株与未发病烟株根际土壤中的真菌群落在组成上有显著差异;(2)镰刀菌根腐病发病烟株根际真菌以病理营养型为主,占54.64%,而未发病烟株根际真菌则以腐生营养型为主,占46.10%;(3)镰刀菌根腐病发病烟株根际的病原菌相对丰度为30.73%,显著高于未发病烟株的1.12%,镰刀菌在病原菌群落中占绝对优势地位。高通量测序与FUNGuild联用可对土传病害感病烟株的根际优势病原真菌群落进行准确鉴定,可为烟草病害的防控提供科学参考。 展开更多
关键词 烟草 镰刀菌根腐病 根际 真菌 功能 funguild
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滨海盐碱地区土壤真菌对轮作种植制度的响应
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作者 刘震 吴佳璇 +7 位作者 刘媛媛 郭雪蕊 赵晓龙 周琬颜 曹平平 王玮 张楠 刘宏权 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第16期264-270,共7页
为探究滨海盐碱地区适宜的种植制度,研究在滨海盐碱地区不同轮作种植制度下土壤中微生物真菌的响应状态。采用Illumina高通量测序和FUNGuild功能预测研究方法,以撂荒(CK)为对照组,研究绿豆单作(B)、绿豆—旱碱麦轮作(GW)和玉米—旱碱麦... 为探究滨海盐碱地区适宜的种植制度,研究在滨海盐碱地区不同轮作种植制度下土壤中微生物真菌的响应状态。采用Illumina高通量测序和FUNGuild功能预测研究方法,以撂荒(CK)为对照组,研究绿豆单作(B)、绿豆—旱碱麦轮作(GW)和玉米—旱碱麦轮作(CW)土壤中微生物真菌对不同种植制度的响应。结果表明,绿豆—旱碱麦轮作组合的旱碱麦产量显著高于玉米—旱碱麦轮作组合,将绿豆纳入轮作系统中,旱碱麦的产量出现增加趋势。绿豆单作的土壤微生物α多样性显著高于对照处理,轮作种植制度真菌的Shannon指数、Simpson指数低于对照组。不同种植方式门水平上优势物种结构组成相似,子囊菌门、隐菌门、担子菌门和被孢霉门等真菌相对丰度含量较高,轮作种植制度增加了优势菌门的相对丰度。FUNGuild功能预测得出与物种结构组成分析相同的结论,轮作种植制度增加了腐生类营养型真菌,与门水平上微生物分析结果一致。绿豆—旱碱麦轮作种植制度相关真菌的富集导致绿豆—旱碱麦轮作种植制度下麦茬产量提高。研究结果表明,不同类群微生物真菌对种植制度的响应显著,轮作种植制度增加了改善土壤相关的优势菌群,且绿豆—旱碱麦轮作种植制度通过富集相关真菌提高了麦茬产量,为后期滨海盐碱地种植管理中推行轮作种植制度提供一定的科学依据。 展开更多
关键词 旱碱麦 滨海盐碱地区 微生物群落 funguild
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互花米草二次入侵对土壤胞外酶活性及真菌群落结构多样性的影响
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作者 王霖 葛茂泉 +3 位作者 廖亦阳 候宁 许宏达 王维奇 《环境科学学报》 北大核心 2025年第9期426-437,共12页
为明晰互花米草二次入侵对土壤胞外酶活性及真菌群落结构的影响,以福建省互花米草治理区光滩湿地、红树林湿地和互花米草二次入侵湿地为研究对象,探讨了互花米草二次入侵对土壤胞外酶活性和真菌群落结构特征的影响.结果表明:(1)土壤碳... 为明晰互花米草二次入侵对土壤胞外酶活性及真菌群落结构的影响,以福建省互花米草治理区光滩湿地、红树林湿地和互花米草二次入侵湿地为研究对象,探讨了互花米草二次入侵对土壤胞外酶活性和真菌群落结构特征的影响.结果表明:(1)土壤碳、氮、磷循环相关的水解酶(BG、CBH、NAG、ACP)和氧化酶(PHO)活性随植物种植与入侵呈上升趋势;胞外酶化学计量分析表明,与光滩湿地相比,互花米草二次入侵湿地的土壤酶碳氮比(EEA_(C:N))显著降低了23.47%,土壤酶碳磷比和氮磷比(EEA_(C:P)和EEA_(N:P))显著增加了40.46%和82.11%(p<0.05).(2)酶活性矢量分析表明,与光滩湿地相比,红树林湿地与互花米草二次入侵湿地的矢量角度分别显著下降了15.27%和21.70%(p<0.05).(3)湿地优势真菌门和真菌属分别为子囊菌门和孢子丝菌属.与光滩湿地相比,互花米草二次入侵后土壤球囊菌门真菌显著降低了76.83%(p<0.05).(4)Mantel检验分析表明,土壤C获取酶与球囊菌门和毛霉菌门真菌,以及N获取酶与球囊菌门真菌呈极显著正相关(p<0.01),P获取酶与壶菌门真菌呈显著正相关(p<0.05).本研究对深入理解滨海湿地植物入侵机制和生态功能提升具有重要的理论和实践意义. 展开更多
关键词 互花米草 二次入侵 土壤酶活性 真菌群落 funguild功能预测
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草本枯落物厚度对风沙土壤真菌群落结构及其理化性质的影响 被引量:1
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作者 孔洁茹 翟品 +5 位作者 王瑞霞 王俊 刘慧丽 马若石 康鹏 刘秉儒 《水土保持研究》 北大核心 2025年第3期119-129,共11页
[目的]探究荒漠地区草本枯落物厚度对土壤养分和土壤真菌群落结构及功能的影响,为深入理解枯落物、微生物群落以及土壤三者相互作用提供科学依据。[方法]以毛乌素沙地西南边缘白芨滩国家级自然保护区优势草本枯落物混合物为研究材料,采... [目的]探究荒漠地区草本枯落物厚度对土壤养分和土壤真菌群落结构及功能的影响,为深入理解枯落物、微生物群落以及土壤三者相互作用提供科学依据。[方法]以毛乌素沙地西南边缘白芨滩国家级自然保护区优势草本枯落物混合物为研究材料,采用高通量测序技术分析其不同草本枯落物混合物厚度(0.7 cm,1.4 cm,2.1 cm)表层(0—5 cm)和亚表层(5—10 cm)土壤真菌群落结构及多样性特征,并且根据相关测定方法测定不同厚度草本枯落物下0—5 cm和5—10 cm土层土壤理化因子含量。[结果](1)随着草本枯落物混合物厚度的增加,表层(0—5 cm)土壤养分TN,TP,TK,AP,AK含量均升高,而且pH,SWC也有着相同的规律。(2)土壤真菌优势菌门以子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota)最为丰富,占真菌群落总数的76%以上;优势菌属以链格孢属(Alternaria)、Knufia、光黑壳属(Preussia)和Canariomyces为主。(3)不同草本枯落物混合物厚度下0—5 cm土层真菌群落的ACE指数和Simpson指数均高于5—10 cm土层,Chao 1指数和Shannon指数没有明显的变化规律。(4)不同草本枯落物混合物厚度下真菌功能群有4类营养型(病原营养型、腐生营养型、共生营养型和未指定型),其中腐生营养型占比都比较高。(5)土壤养分因子与土壤真菌群落的关系分析揭示SWC,SOM是影响土壤真菌群落分布的主要环境因子。[结论]荒漠地区草本枯落物厚度变化对0—5 cm土层土壤养分具有一定的影响,但对土壤真菌群落结构及功能没有显著影响。 展开更多
关键词 草本枯落物厚度 土壤理化性质 土壤真菌 高通量测序 多样性 funguild功能预测
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外源碳氮对农田土壤真菌群落结构及功能的影响
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作者 刘超 李仕蓉 +1 位作者 许巧玲 乔志伟 《南方农业学报》 北大核心 2025年第3期795-806,共12页
[目的]研究外源碳氮对贵州中部农田土壤真菌群落结构及功能的影响,为维持土壤生态系统健康提供理论依据。[方法]以贵州中部典型农田土壤为研究对象,设空白对照(CK)、单独添加10 g/kg葡萄糖(C)、单独添加1 g/kg尿素(N)、联合添加10 g/kg... [目的]研究外源碳氮对贵州中部农田土壤真菌群落结构及功能的影响,为维持土壤生态系统健康提供理论依据。[方法]以贵州中部典型农田土壤为研究对象,设空白对照(CK)、单独添加10 g/kg葡萄糖(C)、单独添加1 g/kg尿素(N)、联合添加10 g/kg葡萄糖和1 g/kg尿素(CN)4个处理,采用盆栽试验,种植油菜至成熟采收。测定土壤理化性质,采用Illumina高通量测序和FUNGuild功能预测工具对土壤真菌群落结构和功能类群进行分析。[结果]C、N、CN处理的土壤全氮、碱解氮和有机质含量均高于CK,其中全氮和碱解氮含量与CK差异显著(P<0.05)。土壤真菌群落Alpha多样性分析结果表明,各处理间丰富度指数、ACE指数、Chao1指数均无显著差异(P>0.05,下同);与CK相比,C、N处理的Pielou指数、Shannon指数和Simpson指数提高,而CN处理降低,但均与CK无显著差异。主坐标分析(PCoA)和多元方差分析(Adonis)结果表明,不同处理间土壤真菌群落结构差异极显著(P<0.01,下同)。各处理土壤样品中,子囊菌门(Ascomycota)(相对丰度78.06%~85.49%)、担子菌门(Basidiomycota)(相对丰度1.26%~2.74%)、毛霉门(Mucoromycota)(相对丰度1.29%~2.52%)为优势菌门,镰刀菌属(Fusarium)、木霉属(Trichoderma)、绿僵菌属(Metarhizium)、葡萄孢属(Botrytis)等10个属是优势菌属。冗余分析(RDA)结果显示,土壤全氮含量是影响真菌群落结构的关键因子,多元回归及随机森林模型分析结果表明,土壤有机质含量与真菌群落丰富程度关系最密切。FUNGuild预测结果表明,各处理的土壤真菌群落可划分为7种营养类型,CN处理可提高共生营养型真菌的相对丰度,并降低病理营养型、病理—腐生营养型真菌的相对丰度;进一步分析发现,7种营养类型真菌可被划分为22种功能类群,各处理的优势功能类群有明显区别。分段结构方程模型分析结果表明,木霉属对共生营养型有极显著的直接影响。[结论]外源碳氮添加会引起土壤真菌群落多样性变化并改变真菌群落结构,土壤全氮和有机质含量是影响土壤真菌群落结构和丰富程度的重要因素,外源碳氮联合添加有利于共生营养型真菌生长,同时有助于降低病理营养型真菌在土壤中的相对丰度。 展开更多
关键词 土壤真菌 群落结构 功能类群 外源碳氮 高通量测序 funguild
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油茶根腐病根际土壤、根系内真菌群落结构和多样性分析 被引量:2
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作者 杨娅琳 吴峰婧琳 +5 位作者 陈健鑫 武自强 刘丽 张东华 马焕成 伍建榕 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期121-135,共15页
为明确患根腐病的油茶在不同病情等级下根系和根际土壤内真菌群落组成、多样性、功能特征及与环境因子的关系,以德宏州梁河县的油茶为研究对象,利用高通量测序技术对5个病情等级的油茶根系及根际土壤内真菌的转录间隔区(internal transc... 为明确患根腐病的油茶在不同病情等级下根系和根际土壤内真菌群落组成、多样性、功能特征及与环境因子的关系,以德宏州梁河县的油茶为研究对象,利用高通量测序技术对5个病情等级的油茶根系及根际土壤内真菌的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列进行测序。结果表明,染病油茶根系及根际土壤内的真菌群落多样性(Shannon指数)降低,根系中真菌总OTUs(operational taxonomic units)、特有OTUs和丰富度(Chao1指数)呈先增加后减少的趋势;根际土壤中染病油茶真菌群落的均匀度和丰富度上升。门水平上,子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)为根系及根际土壤中共同的优势菌门,球囊菌门(Glomeromycota)和被孢囊门(Mortierellomycota)在根系中丰度表现为逐级递减的趋势。属水平上,患病后油茶根系内树状孢属(Dendrosporium)、暗双胞属(Cordana)、Matsushimamyces、无柄盘菌属(Pezicula)、黑孢盘属(Melanconium)的丰度明显上升。油茶林下土壤真菌群落结构的主要影响因子为速效钾、有机质、pH、速效磷,真菌群落与环境因子联合分析结果表明,部分有益菌和磷含量呈正相关,部分病原菌和钾含量呈负相关。FUNGuild功能分析表明,油茶根系及根际土壤中真菌以腐生型为主,健康油茶中共生营养型真菌丰度最高,染病后逐渐降低;从Ⅱ级病害以后的油茶根系内植物病原功能群开始成为优势功能群。综上所述,油茶患病后真菌的多样性减少,根系内部分有益真菌丰度减少,植物病原菌和腐生菌增加,丛枝菌根真菌的定殖在调节油茶病健关系中发挥着重要的作用。针对德宏州梁河县的油茶基地,需要多施钾肥和磷肥,减少氮肥的施用,可提高部分有益菌的丰度,降低病原菌的丰度,从而减轻油茶根腐病的发生。 展开更多
关键词 油茶根腐病 真菌多样性 群落结构 土壤理化性质 funguild功能
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南亚热带乡土树种与桉树人工林土壤真菌群落多样性和功能类群的比较 被引量:2
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作者 席守鸿 明安刚 +2 位作者 谭玲 何江 覃林 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1232-1244,共13页
营造乡土树种人工林和桉树人工林是我国南亚热带森林经营的常见模式。为探究土壤真菌群落多样性及功能对乡土树种和桉树人工林的响应特征与机制,该研究以南亚热带4个乡土树种人工林[马尾松(Pinus massoniana)、火力楠(Michelia macclur... 营造乡土树种人工林和桉树人工林是我国南亚热带森林经营的常见模式。为探究土壤真菌群落多样性及功能对乡土树种和桉树人工林的响应特征与机制,该研究以南亚热带4个乡土树种人工林[马尾松(Pinus massoniana)、火力楠(Michelia macclurei)、米老排(Mytilaria laosensis)、红锥(Castanopsis hystrix)]和外来树种尾巨桉(Eucalyptus urophylla×E.grandis)人工林为对象,基于各林分土壤(0~20 cm)真菌18S rRNA高通量测序数据,利用FUNGuild数据库,比较分析乡土树种与尾巨桉人工林土壤真菌群落多样性和功能类群的差异特性及影响的主导土壤环境因子。结果表明:(1)5个研究林分的土壤真菌优势门均为子囊菌门和担子菌门,但不同乡土树种林分与尾巨桉林的土壤真菌优势目存在差异。(2)尾巨桉林土壤真菌群落α多样性高于乡土树种人工林,其群落组成结构也与乡土树种人工林存在显著差异(P<0.05)。(3)4个乡土树种人工林土壤的腐生营养型的相对丰度高于尾巨桉林,并且火力楠林和米老排林土壤丛枝菌根真菌的相对丰度明显高于尾巨桉林,尾巨桉林土壤共生营养型以及外生菌根真菌和木材腐生菌的相对丰度明显高于乡土树种人工林。(4)pH是导致尾巨桉林与乡土树种人工林土壤真菌群落多样性和功能类群差异的主要土壤环境因子。综上认为,在南亚热带地区将尾巨桉林改建成火力楠林或米老排林可提高土壤养分水平,提升土壤生态功能。 展开更多
关键词 土壤真菌群落 Illumina MiSeq高通量测序 funguild数据库 乡土树种人工林 桉树人工林
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中国典型水稻土真菌群落多样性与功能特征及其影响因素 被引量:2
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作者 叶婷娥 林美芬 +4 位作者 余超凡 肖余俊 成立文 郑毅 王维奇 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第10期6068-6076,共9页
为了探究水稻土真菌群落多样性与功能及其影响因素,选取5个中国典型水稻土为研究对象,利用高通量测序技术对土壤真菌群落组成及多样性进行对比分析,并利用FUNGuild微生态工具进行功能预测,分析其环境影响因素.结果表明:①从多样性指数... 为了探究水稻土真菌群落多样性与功能及其影响因素,选取5个中国典型水稻土为研究对象,利用高通量测序技术对土壤真菌群落组成及多样性进行对比分析,并利用FUNGuild微生态工具进行功能预测,分析其环境影响因素.结果表明:①从多样性指数来看黑龙江(HLJ)土壤样本真菌群落多样性显著低于其他4个地区(P<0.05),云南(YN)稻田土壤的真菌群落丰富度最高,显著高于其他地区(P<0.05),而海南(HN)、江西(JX)和山东(SD)土壤样本较为接近,5种典型稻田土壤真菌门水平平均相对丰度最高的是Ascomycota(子囊菌门),平均相对丰度最高菌属是Tausonia;②真菌以腐生营养型所占比例最大,其相应环境功能较强;③土壤真菌的物种丰度与土壤TP、EC和BD呈极显著相关(P<0.01),冗余分析亦发现,土壤TP是真菌群落以及腐生功能类群变化的主要驱动因子.以上研究结果表明,不同样本之间稻田土壤真菌群落多样性和结构特征存在较大差异,土壤理化性质的改变通过影响真菌菌属的相对丰度,进而影响真菌的群落结构.研究结果可为基于真菌多样性和功能的稻田可持续管理提供理论参考. 展开更多
关键词 真菌 群落结构 多样性 funguild功能预测 稻田土壤
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冻融季温带森林土壤真菌群落结构及功能类群对不同土壤有机碳输入的响应 被引量:4
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作者 陈羽彤 张利敏 +1 位作者 王思琪 周利军 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2244-2255,共12页
根系与凋落物有机碳输入变化对土壤生物群落的影响研究是目前学术界关注的热点问题,但冻融季不同有机碳输入方式将对土壤真菌群落结构及功能类群产生何种影响尚不明确。土壤真菌群落是调节森林生态系统稳定性的重要因素,有助于维持生态... 根系与凋落物有机碳输入变化对土壤生物群落的影响研究是目前学术界关注的热点问题,但冻融季不同有机碳输入方式将对土壤真菌群落结构及功能类群产生何种影响尚不明确。土壤真菌群落是调节森林生态系统稳定性的重要因素,有助于维持生态系统生产力时间尺度的稳定性。为了探索冻融季温带森林土壤真菌群落对控制根系和凋落物有机碳输入方式的响应特征,通过在帽儿山生态站设置4种碳源输入控制处理植物残体添加去除(DIRT):去除凋落物仅根系输入处理、去除根系仅凋落物输入处理、无碳源输入处理和同时进行根系与凋落物输入处理,采用ITS rDNA高通量测序技术和FUNGuild功能预测平台,来分析控制根系和凋落物有机碳输入方式对温带森林土壤真菌群落结构和功能类群的影响。研究结果显示:(1)不同有机碳输入方式改变了土壤真菌类群的多度:与自然生长状态下有机碳输入方式相比,根系有机碳输入比凋落物有机碳输入对土壤真菌类群多度影响更明显,去除根系碳源输入处理使真菌群落中子囊菌门含量升高19.52%,担子菌门含量下降16.77%。(2)有机碳输入方式对土壤真菌群落功能类群产生影响:与自然生长状态下有机碳输入方式相比,去除根系碳源输入处理使群落内腐生营养型真菌、病原营养型真菌数量占比增加9.79%、1.22%;去除凋落物碳源输入处理下群落内腐生营养型、病原营养型真菌数量占比下降7.58%、0.85%。(3)有机碳输入方式对真菌群落结构的影响与土壤理化环境因子有关,微生物氮的含量是主导土壤真菌群落结构出现显著差异的关键因子。以上结果表明有机碳输入方式对土壤真菌群落结构及功能类群有重要调控作用,研究结果丰富了温带森林土壤微生物群落的研究内容,为研究土壤微生态环境的变化对生态系统过程的影响提供理论支持和参考依据,此外未来的研究应重点关注不同季节间凋落物和根系输入处理对土壤真菌群落的长期影响。 展开更多
关键词 植物残体添加去除 funguild功能预测 高通量测序 alpha多样性 冻融季
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不同岩茶产区土壤碳氮磷钾生态化学计量比及其对真菌多样性的影响 被引量:1
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作者 王霖 廖亦阳 +7 位作者 李先德 吴春梅 王佳娜 侯丽 吴琪梦 张永勋 沈长华 王维奇 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1007-1017,共11页
本文以福建武夷山正岩茶、半岩茶和洲茶产区为研究对象,系统分析并阐明不同岩茶产区土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)、钾(K)含量及其生态化学计量比对真菌群落组成和功能的影响。结果表明:(1)不同岩茶产区土壤C、N含量差异不显著,半岩茶产区P... 本文以福建武夷山正岩茶、半岩茶和洲茶产区为研究对象,系统分析并阐明不同岩茶产区土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)、钾(K)含量及其生态化学计量比对真菌群落组成和功能的影响。结果表明:(1)不同岩茶产区土壤C、N含量差异不显著,半岩茶产区P含量显著高于正岩茶及洲茶产区(P<0.05),正岩茶产区K含量最高,3个产区之间K含量均呈现显著差异(P<0.05);(2)在正岩茶、半岩茶和洲茶产区,子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉菌门(Mortierellomycota)分别是主要真菌门类,毛壳菌属(Chaetomium)是正岩茶产区真菌优势属,沙蜥属(Saitozyma)是半岩茶和洲茶产区的真菌优势属;(3)FUNGuild功能预测结果表明,在正岩茶产区中,动物病原–内生–附生–真菌寄生–植物病原–木质腐生真菌相对丰度最高;在半岩茶产区中,内生–凋落物腐生–土壤腐生–未定义腐生真菌丰度最高,而未定义腐生真菌在洲茶产区丰度最高;(4)Mantel检验结果显示,岩茶产区土壤真菌群落主要受C∶K、N∶K和P∶K的影响。K与毛壳菌属、镰刀菌属(Fusarium)和曲霉菌属(Aspergillus),C∶K、N∶K、P∶K与沙蜥属呈极显著正相关(P<0.01);N与青霉菌属(Penicillium),P与沙蜥属呈显著正相关(P<0.05);C与镰刀菌属,K与沙蜥属,C∶N与毛壳菌属、青霉菌属和木霉属(Trichoderma)呈极显著负相关(P<0.01);N与镰刀菌属,K与被孢霉属(Mortierella),C∶K、N∶K与毛壳菌属、镰刀菌属和曲霉菌属呈显著负相关(P<0.05)。总之,不同岩茶产区土壤真菌群落主要受C、N、P、K计量比影响,而养分含量对真菌群落影响不显著。本研究对评估茶园土壤健康,提升茶园土壤生态系统功能具有重要意义。 展开更多
关键词 碳氮磷钾 生态化学计量比 真菌 funguild功能预测 岩茶产区
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基于高通量测序分析青皮核桃表面真菌的多样性
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作者 张琴 康明丽 +4 位作者 赵茹 宋丽君 集贤 何爱民 吉洋洋 《保鲜与加工》 CAS 北大核心 2024年第8期102-108,共7页
为明确青皮核桃表面的真菌多样性特征,以‘绿岭一号’青皮核桃为试材,利用高通量测序法分析‘绿岭一号’青皮核桃表面真菌群落组成及其多样性,并采用FUNGuild数据库预测真菌群落生态功能。结果表明,青皮核桃表面的真菌一共有4个门、14... 为明确青皮核桃表面的真菌多样性特征,以‘绿岭一号’青皮核桃为试材,利用高通量测序法分析‘绿岭一号’青皮核桃表面真菌群落组成及其多样性,并采用FUNGuild数据库预测真菌群落生态功能。结果表明,青皮核桃表面的真菌一共有4个门、14个纲、12个目、18个科和18个属。子囊菌门(Ascomycota)是青皮核桃表面真菌的主要真菌门类,相对丰度为97%,主要属类为葡萄座腔菌属(Botryosphaeria)、炭疽菌属(Colletotrichum)、有孢汉逊酵母属(Hanseniaspora)、链格孢霉属(Alternaria)、螺旋聚孢霉属(Clonostachys)、间座壳菌属(Diaporthe)、镰刀菌属(Fusarium)。真菌FUNGuild功能预测结果表明:青皮核桃采后主要以病理营养型真菌为主,其次为腐生营养型,其占比分别为28.42%和18.94%。使用高通量测序技术确定了青皮核桃采后腐烂病病原菌的主要类群,为青皮核桃腐烂病的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 青皮核桃 高通量测序 真菌群落多样性 腐烂病 funguild数据库
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基于高通量测序技术的大连童牛岭风景区土壤真菌群落特征研究 被引量:1
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作者 郝然 赵雨晨 +4 位作者 尚佳航 杨红 孙晓东 李琳琳 吕国忠 《林业调查规划》 2024年第2期124-131,共8页
为了解大连市童牛岭风景区土壤真菌多样性及其功能区的变化趋势,采用多点取样法,在景区几个代表性功能区收集土壤样品,利用高通量测序技术对土壤真菌进行检测。结果表明,此次分析土壤真菌包括9个门,33个纲,82个目,170个科,312个属,407... 为了解大连市童牛岭风景区土壤真菌多样性及其功能区的变化趋势,采用多点取样法,在景区几个代表性功能区收集土壤样品,利用高通量测序技术对土壤真菌进行检测。结果表明,此次分析土壤真菌包括9个门,33个纲,82个目,170个科,312个属,407个种。景区土壤真菌多样性在多种因素的综合影响下,不同功能区之间均表现出明显的差异,总的趋势是人流量较少区域最高,路旁草地次之。 展开更多
关键词 真菌多样性 群落结构 高通量测序 funguild功能预测 童牛岭风景区 大连
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黑果枸杞不同组织内生真菌群落组成及生态功能分析 被引量:12
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作者 顾美英 张志东 +8 位作者 唐光木 古丽尼沙·沙依木 张丽娟 朱静 唐琦勇 楚敏 艾尼江·尔斯满 欧提库尔·玛合木提 徐万里 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1254-1267,共14页
探究了新疆盐生植物黑果枸杞不同组织中内生真菌群落的组成及多样性,为深入研究盐碱、干旱等环境下内生真菌与宿主的互作机制,筛选和开发促生、防病和抗逆等功能的有益内生真菌资源提供科学依据。利用ITS高通量测序技术比较黑果枸杞不... 探究了新疆盐生植物黑果枸杞不同组织中内生真菌群落的组成及多样性,为深入研究盐碱、干旱等环境下内生真菌与宿主的互作机制,筛选和开发促生、防病和抗逆等功能的有益内生真菌资源提供科学依据。利用ITS高通量测序技术比较黑果枸杞不同组织真菌群落组成及差异,并采用FUNGuild数据库预测真菌群落生态功能。测序共获得高质量内生真菌序列354058条,涉及291个OTUs,分属于9门、19纲、34目、50科、60属。α多样性指数分析表明,根、果中真菌群落多样性和丰富度程度较高,叶居中,花的多样性最低,茎的丰富度最低。对黑果枸杞内生真菌群落组成和优势菌群的分析表明,子囊菌门为优势菌门,花、叶、果、茎和根中相对丰度分别为86.85%、72.36%、75.97%、84.44%和85.02%。链格孢属为黑果枸杞植株中的核心属,不同组织中均有分布,在花、叶、果、茎和根中占比分别为85.41%、69.79%、47.07%、79.94%和36.97%。较优势的菌尚有枝孢属、枝顶孢属、新凸轮孢菌属、茎点霉属和楔孢黑粉菌属等真菌。这些菌多具有促生、抗逆等特性,在宿主对盐碱、干旱等极端环境的适应性方面有着潜在功能。各组织独有属的相对丰度均未超过1%。共有菌和独有菌在不同组织中的组成和相对丰度差异较大。经FUNGuild软件平台解析显示,黑果枸杞中病理-腐生-共生营养型的相对丰度最高,在花、叶、果、茎和根中分别为85.41%、69.84%、47.24%、79.98%和37.09%。果和叶中含多种相对丰度≥1%的条件致病菌,而根中腐生真菌种类较多。黑果枸杞中蕴含着功能丰富的内生真菌菌群,在不同组织中的组成及其生态功能差异较大,同时还含有大量未鉴定出种属和未定义的功能菌群,这些可为黑果枸杞功能菌群发掘提供数据参考。 展开更多
关键词 植物内生真菌 生态位 群落多样性 ITS rDNA funguild
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长期施肥对黄棕壤水稻土真菌群落结构的影响 被引量:5
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作者 刘东海 张智 +4 位作者 乔艳 李双来 陈云峰 李菲 胡诚 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1112-1124,共13页
【目的】探究长期不同施肥措施对黄棕壤水稻土土壤肥力和真菌群落结构的影响,为绿色农业提供理论依据。【方法】位于湖北武汉的黄棕壤水稻土长期施肥定位试验始于1981年,包括5个施肥处理:不施肥(CK)、单施氮肥(N)、氮磷钾化肥(NPK)、常... 【目的】探究长期不同施肥措施对黄棕壤水稻土土壤肥力和真菌群落结构的影响,为绿色农业提供理论依据。【方法】位于湖北武汉的黄棕壤水稻土长期施肥定位试验始于1981年,包括5个施肥处理:不施肥(CK)、单施氮肥(N)、氮磷钾化肥(NPK)、常量有机肥(OM)、氮磷钾+常量有机肥(OMNPK)。2020年5月,在各处理小区内取0—20 cm土层土壤样品,利用Illumina MiSeq高通量测序技术、FUNGuild和生态网络方法,综合分析了土壤养分含量、酶活性、真菌群落结构。【结果】1)与CK比较,N处理降低了土壤速效养分含量,NPK处理维持了土壤养分稳定,OM和OMNPK处理显著提高了土壤速效养分含量。OMNPK处理显著降低了α-葡萄糖苷酶、硫酸酯酶活性,却显著提高了β-纤维二糖苷酶活性;OM和OMNPK处理提高了亮氨酸氨基肽酶活性,却降低了乙酰氨基葡萄糖苷酶活性,N和NPK处理对这两种酶活性的影响与之相反。2)与CK相比,N处理显著降低了真菌多样性,而NPK和OM处理显著提高了真菌多样性。菌群结构在N、NPK、OM处理间明显不同,而OM、OMNPK和CK处理比较接近。LEfSe分析结果发现,N处理土壤中的差异物种是Entrophospora属和Sympoventuriaceae科,OMNPK处理的差异物种是Microascales目和Microascaceae科,OM处理的差异物种是盘菌目(Pezizales)、Pyronemataceae科和Pseudaleuria属。冗余分析结果显示,β-葡萄糖苷酶、β-木糖苷酶、磷酸酶、亮氨酸氨基肽酶、乙酰氨基葡萄糖苷酶、硫酸酯酶和pH是影响土壤真菌群落结构的重要因素。3)施肥提高了病理营养型(pathotroph)真菌的相对丰度,减少了腐生营养型(saprotroph)真菌的相对丰度。与CK比较,N、NPK、OM和OMNPK处理的病理营养型真菌相对丰度分别提高了190.5%、141.4%、71.5%和250.2%,腐生营养型真菌相对丰度分别降低了30.6%、33.3%、19.4%和49.5%,共生营养型(symbiotroph)真菌相对丰度分别提高了310.8%、956.8%、424.3%和435.1%。各施肥处理相比,OM处理病理营养型真菌相对丰度最低,而OMNPK处理最高。病理营养型中,OMNPK、N、NPK和OM处理的动物性病原体丰度比CK分别提高了322%、184%、105%和85%;N和NPK处理较CK处理还显著提高了植物性病原体丰度,OMNPK和OM处理对植物性病原体丰度无显著影响。有机肥处理提高了真菌网络的边数、正相关数、平均加权度、图密度、网络直径和连接部件,增强了网络的复杂性。【结论】长期施用有机肥能够培肥地力,增加真菌群落的多样性和物种交互复杂性,减少病理营养型真菌相对丰度,而有机无机肥配合施用提高土壤肥力的效果显著高于单施有机肥,但也增加了动物性病原体丰度,增加了病害的潜在风险。 展开更多
关键词 黄棕壤水稻土 长期施肥 真菌群落结构 funguild 生态网络
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黑老虎内生真菌及根际土壤真菌的群落结构与生态功能分析 被引量:4
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作者 刘涛 马楠 +3 位作者 金吉芬 彭志军 李兴忠 汪得凯 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期869-879,共11页
为探讨黑老虎(Kadsura coccinea)根际土壤和组织内生真菌菌群的组成及其生态功能,该研究采用ITS高通量测序技术对成熟黑老虎(根、茎、叶)内生真菌及根际土壤真菌群落结构、多样性和生态功能进行了分析。结果表明:(1)从12个样品中共获得2... 为探讨黑老虎(Kadsura coccinea)根际土壤和组织内生真菌菌群的组成及其生态功能,该研究采用ITS高通量测序技术对成熟黑老虎(根、茎、叶)内生真菌及根际土壤真菌群落结构、多样性和生态功能进行了分析。结果表明:(1)从12个样品中共获得2241个可操作分类单元(OTU),涉及10门、41纲、95目、212科、367属,内生真菌(根、茎、叶)和根际土壤真菌OTU数分别为386、536、258、1435个,其中共有的OTU为18个。在门水平上,黑老虎内生真菌及根际土壤真菌优势群落均为子囊菌门和担子菌门,其中子囊菌门在叶和茎中占比分别高达96.99%和95.37%;在属水平上,黑老虎根际土壤真菌中腐生真菌被孢霉属占比较高(为13.5%),叶和茎等生长旺盛的组织中子囊菌门未分类属和痂囊腔菌属占比较高。(2)α多样性分析结果显示,黑老虎根际土壤真菌群落的丰度和多样性明显高于内生真菌,茎中内生真菌丰度显著高于根和叶,而根、茎和叶组织间内生真菌多样性差异不显著;PCoA分析结果显示,叶和茎的真菌群落结构相似性更高。(3)利用FUNGuild数据库进行的功能预测分析结果显示,黑老虎根际土壤真菌和内生真菌含有大量的未分类菌群;功能已分类菌群中,病理寄生型功能群在生长旺盛的组织中占比较高。该研究结果为黑老虎优异功能菌的筛选和发掘提供了理论依据。 展开更多
关键词 黑老虎 高通量测序 ITS 内生真菌 根际土壤真菌 多样性 funguild
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热带海草泰来草沉积物真菌的群落结构、功能与分子生态网络研究 被引量:2
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作者 凌娟 梁童茵 +6 位作者 岳维忠 黄小芳 孙翠慈 张健 张煜航 周卫国 董俊德 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期64-75,共12页
真菌是海草床生态系统的重要组成部分,它们在维持海草健康和生态系统碳氮等营养元素循环方面发挥着重要作用。为了阐明海草床生态系统真菌的群落结构及功能,文章以热带海草泰来草(Thalassia hemprichii)沉积物为主要研究对象,通过Illumi... 真菌是海草床生态系统的重要组成部分,它们在维持海草健康和生态系统碳氮等营养元素循环方面发挥着重要作用。为了阐明海草床生态系统真菌的群落结构及功能,文章以热带海草泰来草(Thalassia hemprichii)沉积物为主要研究对象,通过Illumina Miseq高通量测序技术分析海南岛和西沙群岛两个研究区域泰来草沉积物真菌的群落结构与物种多样性,并利用FUNGuild数据库对真菌营养类型进行预测和功能注释。研究结果表明,子囊菌门(Ascomycota)(相对丰度24.30%~76.20%)和担子菌门(Basidiomycota)(相对丰度4.98%~52.24%)为两个研究区域的共同优势种群,但是子囊菌门真菌的相对丰度在两个研究区域间存在显著性差异(p<0.05),两个区域内共有的海草沉积物真菌分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs)数量占比为5.15%,其相对丰度为31.19%。两个研究区域泰来草沉积物真菌群落的α多样性指数中的香农指数(Shannon)和系统发育多样性(phylogenetic diversity)以及β多样性之间都存在显著性差异(p<0.05)。FUNGuild功能预测分析表明,大部分真菌的营养类型尚未确定(72.11%~91.92%),其中能够确定的主要营养类型为共生营养型(symbiotroph)、腐生营养型(saprotroph)和病理营养型(pathotroph),3种营养型可以进一步分为41个生态功能群。基于随机矩阵理论(random matrix theory,RMT)构建的两个研究区域海草泰来草沉积物真菌分子生态网络结果显示,海南岛泰来草沉积物真菌网络结构更加复杂,其平均聚类系数更高、平均连通度更高、密度更高,该真菌群落可能对外界环境变化更为敏感,而西沙群岛海草沉积物真菌群落的模块化程度更高,其中粪壳菌纲(Sordariomycetes)为分子生态网络中的关键类群。 展开更多
关键词 海草床生态系统 真菌群落 funguild 营养类型 分子生态网络
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生物有机肥调控的碱性植烟土壤微生物群落多样性特征 被引量:26
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作者 濮永瑜 包玲凤 +8 位作者 杨佩文 沈广材 张庆 尹兴盛 施竹凤 裴卫华 刘月静 杨光伟 杨明英 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期780-789,共10页
【目的】解析保山山地碱性植烟土壤微生物群落多样性特征,考察深耕配施生物有机肥对土壤质量退化的阻遏效果,为区域植烟土壤的优化管理提供理论依据。【方法】以深耕(30 cm)为主处理,生物有机肥培肥为副处理,设置随机区组试验,分析测试... 【目的】解析保山山地碱性植烟土壤微生物群落多样性特征,考察深耕配施生物有机肥对土壤质量退化的阻遏效果,为区域植烟土壤的优化管理提供理论依据。【方法】以深耕(30 cm)为主处理,生物有机肥培肥为副处理,设置随机区组试验,分析测试土壤主要理化性质、酶活性和微生物群落结构组成;解析土壤主要理化性质和酶活性与微生物种群丰度间的关系。【结果】深耕+化肥+生物有机肥处理(处理CS)显著降低土壤容重和pH,分别降低28.64%和9.21%;显著提高土壤有机质、全磷、速效磷和速效钾含量及蔗糖酶和脲酶活性,分别提高31.54%、21.63%、165.31%、77.34%、21.68、27.95%和238.55%。Alpha和Beta多样性分析结果表明,各处理细菌Chao1指数和Shannon指数差异不显著;处理CS显著提高真菌Chao1指数和Shannon指数(P<0.05),促进细菌和真菌群落差异性增强,对真菌群落结构组成的影响更为显著。群落结构组成结果表明,处理CS显著提高了变形菌门(Proteobacteria)和被孢霉门(Mortierellomycota)的种群丰度,分别提高74.32%和280.70%;降低了放线菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Actinobacteria)和担子菌门(Basidiomycota)的种群丰度,分别降低12.83%、21.88%、36.57%和70.04%。LEfSe分析表明,处理CS导致属水平的细菌和真菌显著差异性物种增加。BugBase表型预测和FUNGuild功能预测结果表明,处理CS显著影响土壤微生物功能类群,其中,致病性细菌和植物病原真菌丰度显著下降。相关性结果表明,土壤容重和pH是影响土壤细菌和真菌群落结构的主要理化因子。【结论】深耕配施生物有机肥降低土壤容重和pH,增加有机质和养分含量,促进土壤微生物功能多样性形成,提高土壤酶活性,是碱性植烟土壤质量提升的有效措施。 展开更多
关键词 生物有机肥 碱性植烟土壤 微生物群落 Illumina MiSeq测序 BugBase表型预测 funguild功能预测
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黔中地区马尾松林下杜鹃根部内生真菌群落组成及其生态功能 被引量:45
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作者 熊丹 欧静 +3 位作者 李林盼 杨舒婷 何跃军 李朝婵 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期1228-1239,共12页
探索黔中马尾松(Pinus massoniana)林下杜鹃(Rhododendron simsii)根内生真菌物种多样性和生态功能。采集黔中乌当(WD)、孟关(MG)、龙里(LL)3个地区马尾松林下杜鹃的发根,提取真菌DNA进行高通量测序。分析真菌Alpha多样性,借助FUNGuild... 探索黔中马尾松(Pinus massoniana)林下杜鹃(Rhododendron simsii)根内生真菌物种多样性和生态功能。采集黔中乌当(WD)、孟关(MG)、龙里(LL)3个地区马尾松林下杜鹃的发根,提取真菌DNA进行高通量测序。分析真菌Alpha多样性,借助FUNGuild注释平台解析真菌的生态功能类别,探索真菌群落中的核心微生物组,并结合网络图展示菌群之间的关联性。结果,3个地区的杜鹃根部内生真菌多样性非常丰富,WD地区杜鹃内生真菌多样性和丰富度最高。试验共获得有效序列425799条,817个可操作分类单元(OTU),分属于6门19纲52目103科154属,主要隶属于子囊菌门(81.2%)、接合菌门(5.8%)和担子菌门(4.7%);优势纲、目、科分别为:散囊菌纲(43.0%)、散囊菌目(39.2%)、发菌科(39.2%);在属的水平上,青霉属(38.60%)占比最高,其次是木霉属(7.20%)、拟盘多毛孢属(6.10%)。根部的真菌拥有多种生态功能群,如未定义腐生菌(194 OTU)、植物病原菌(20 OTU)、土壤腐生菌(18 OTU)、外生菌(14 OTU)、地衣共生真菌(10 OTU)、杜鹃类菌根真菌(5 OTU)、木腐生菌(5 OTU)、丛枝菌根(4 OTU)、内生菌(2 OTU)、动物病原菌(8 OTU),以及多种混合营养型类群21类,102个Undefined种类在FUNGuild数据库中没有参考信息。根部真菌可以形成生态位共享模式,而且不同功能群之间存在耦合性,核心基因组与关键物种以真菌组形成的生态功能团表现。 展开更多
关键词 杜鹃 内生真菌 多样性 营养型 funguild
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黄泥田土壤真菌群落结构和功能类群组成对施肥的响应 被引量:23
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作者 聂三安 王祎 +4 位作者 雷秀美 赵丽霞 林瑞余 王飞 邢世和 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期2721-2729,共9页
研究长期不同施肥黄泥田土壤真菌群落组成和功能特性,深入认识真菌对不同施肥的响应机理,可以为合理施肥和保证农田土壤健康发展提供科学依据.设置不施肥(CK)、单施无机肥(NPK)、无机肥配施农家肥(NPKM)、无机肥加秸秆还田(NPKS)4个处理... 研究长期不同施肥黄泥田土壤真菌群落组成和功能特性,深入认识真菌对不同施肥的响应机理,可以为合理施肥和保证农田土壤健康发展提供科学依据.设置不施肥(CK)、单施无机肥(NPK)、无机肥配施农家肥(NPKM)、无机肥加秸秆还田(NPKS)4个处理,采用Illumina高通量测序和FUNGuild对不同施肥处理下黄泥田土壤真菌群落结构和功能群进行分析.结果表明:从门水平上看,土壤真菌群落主要由子囊菌、担子菌和接合菌构成,且以子囊菌为主(47%~74%).NPKM和NPKS处理中子囊菌的相对丰度分别为49%和47%,显著低于CK(71%)和NPK(74%)处理,从目水平上看,减少的主要为肉座菌、格孢腔菌和散囊菌.NPKM和NPKS处理担子菌相对丰度分别为18%和28%,高于CK(14%)和NPK(10%)处理,从目水平上看,增加的主要为银耳菌、糙孢伏革菌和伞菌.与CK相比,单施无机肥降低了担子菌含量.不同施肥处理均在一定程度上增加了接合菌门的丰度,从目水平看,以内囊霉菌和粪蛙霉菌为主.NPK处理真菌α多样性指数显著低于其他处理,NPKM和NPKS处理的丰富度指数(Chao1和ACE)高于CK和NPK处理.不同处理之间真菌的营养类型以腐生营养型为主(48%~57%),NPKM和NPKS处理的共生营养型真菌相对丰度为17%,显著高于CK和NPK处理,增加的以丛枝菌根真菌、外生菌根真菌为主.NPK处理动物病原菌含量(10%)显著高于其他处理.冗余分析(RDA)结果表明,土壤含水量、孔隙度和盐度是影响真菌群落结构和功能类群组成的主要因子,其次为有机质和总氮.长期单施无机肥降低真菌种群多样性,增加致病菌含量,不利于土壤健康,而有机无机肥配施可在一定程度上提高真菌种群丰富度指数和共生真菌比例,有利于保持黄泥田稻田土壤健康的生态环境和真菌群落的多样性. 展开更多
关键词 真菌 功能类群 高通量测序 funguild 施肥
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