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16S rDNA用作荧光定量PCR靶基因快速检测铜绿假单胞菌 被引量:9
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作者 薛利军 王永智 +4 位作者 任浩 童一民 赵平 朱诗应 戚中田 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期789-794,共6页
对20余种细菌16SrDNAs进行多序列比对与进化树分析,设计铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa,PA)荧光定量PCR(fluorescencequantitativePCR,FQ-PCR)特异性引物。提取PA基因组DNA,以特异性引物扩增16SrDNA靶片段,并构建重组质粒pMDT-Pfr... 对20余种细菌16SrDNAs进行多序列比对与进化树分析,设计铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa,PA)荧光定量PCR(fluorescencequantitativePCR,FQ-PCR)特异性引物。提取PA基因组DNA,以特异性引物扩增16SrDNA靶片段,并构建重组质粒pMDT-Pfr。将梯度稀释的pMDT-Pfr质粒作为模板,用于建立定量标准曲线。以SYBRGreenI荧光染料建立20μL反应体系,对不同浓度的PADNA样品进行FQ-PCR检测。同时,以金黄色葡萄球菌、伤寒杆菌、福氏志贺菌、变形杆菌、表皮葡萄球菌、大肠杆菌和结核杆菌的基因组DNA作阴性对照,验证FQ-PCR方法检测PA的特异性。结果显示,设计的FQ-PCR引物的靶向序列,仅对PA16SrDNA有高度同源性;FQ-PCR方法检测PA,其灵敏度达3.6pg/μL的基因组DNA或(2.1×103±3.1×102)拷贝/μL的16SrDNA基因,并且具有很强的特异性;从细菌DNA提取到FQ-PCR检测,可在2h左右完成PA鉴定。较传统的培养鉴定法而言,以16SrDNA作为FQ-PCR靶基因快速检测PA,具有很好的研究价值与应用前景。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 16S RDNA 荧光定量PCR 检测
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心衰超滤脱水装置配合系统化护理治疗急性失代偿性心力衰竭伴利尿剂抵抗患者的效果 被引量:2
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作者 呼延琳 陈蕊 《智慧健康》 2022年第16期141-144,149,共5页
目的分析在急性失代偿心力衰竭(ADHF)伴利尿剂抵抗患者的治疗中对患者采取心衰超滤脱水装置(FQ-16)配合系统化护理措施的治疗效果。方法将兰州大学第二医院于2017年10月-2021年11月治疗的28例患者作为本次观察对象,按照随机数字表法将... 目的分析在急性失代偿心力衰竭(ADHF)伴利尿剂抵抗患者的治疗中对患者采取心衰超滤脱水装置(FQ-16)配合系统化护理措施的治疗效果。方法将兰州大学第二医院于2017年10月-2021年11月治疗的28例患者作为本次观察对象,按照随机数字表法将患者分为观察组和对照组,对比分析两组患者分别治疗后的治疗效果。结果观察组患者临床疗效明显更高(P<0.05)。结论FQ-16配合系统化护理措施能够明显提高患者的治疗效果。 展开更多
关键词 fq-16 ADHF 利尿剂抵抗 系统化护理
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不同抗凝方式对心力衰竭超滤病人使用超滤透析器凝血的效果观察 被引量:4
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作者 汪辉丽 耿丽 《全科护理》 2017年第23期2866-2868,共3页
[目的]观察两种抗凝方式在心力衰竭超滤病人使用超滤透析器脱水治疗中的效果。[方法]选取2015年11月—2016年11月住院的慢性心力衰竭失代偿期病人60例,随机分为普通肝素组和低分子肝素组各30例,观察不同的抗凝方式对心力衰竭超滤脱水透... [目的]观察两种抗凝方式在心力衰竭超滤病人使用超滤透析器脱水治疗中的效果。[方法]选取2015年11月—2016年11月住院的慢性心力衰竭失代偿期病人60例,随机分为普通肝素组和低分子肝素组各30例,观察不同的抗凝方式对心力衰竭超滤脱水透析器凝血程度的影响。[结果]两组抗凝剂的有效治疗时间、净超滤量、超滤透析器使用第8小时及第24小时管道凝血程度比较差异有统计学意义(P<0.01)。[结论]应用普通肝素抗凝方式不但能起到安全有效的抗凝效果,还可延长有效治疗时间,增加净超滤量,降低透析器凝血发生率,减轻护理工作量,节约成本。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 抗凝剂 脱水装置fq-16 透析器
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3种方法对鼻疽伯克霍尔德菌和类鼻疽伯克霍尔德菌的鉴定 被引量:2
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作者 康琳 高姗 +5 位作者 周阳 辛文文 杨浩 方瑶 毛旭虎 王景林 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1205-1209,共5页
目的用3种检测方法对同源性较高的鼻疽伯克霍尔德菌和类鼻疽伯克霍尔德菌进行鉴定,比较该3种检测方法的鉴定效果。方法分别利用基于MALDI-TOF-MS的蛋白指纹图谱方法、双重荧光定量PCR方法和16S rRNA基因序列分析方法对5株鼻疽伯克霍尔... 目的用3种检测方法对同源性较高的鼻疽伯克霍尔德菌和类鼻疽伯克霍尔德菌进行鉴定,比较该3种检测方法的鉴定效果。方法分别利用基于MALDI-TOF-MS的蛋白指纹图谱方法、双重荧光定量PCR方法和16S rRNA基因序列分析方法对5株鼻疽伯克霍尔德菌和5株类鼻疽伯克霍尔德菌进行鉴定,综合判断鉴定结果,并与传统的形态学和生化鉴定结果比较,寻找更适合于该两种菌的鉴定方法。结果在10株受试菌株中,2株排除是鼻疽伯克霍尔德菌和类鼻疽伯克霍尔德菌的可能,剩余8株之中,MALDI-TOF-MS方法正确鉴定了6株,双重荧光定量PCR方法正确鉴定了8株,16S rRNA基因序列分析方法正确鉴定4株。结论 MALDI-TOF-MS的蛋白指纹图谱方法和双重荧光定量PCR方法对鼻疽伯克霍尔德菌和类鼻疽伯克霍尔德菌具有很好的鉴定能力,16S rRNA基因序列分析方法不适合用于该2种菌的鉴定。 展开更多
关键词 鼻疽伯克霍尔德菌 类鼻疽伯克霍尔德菌 MALDI-TOF-MS fq-PCR 16S RRNA基因序列分析
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荧光定量PCR基因检测在心血管病患者术后血流感染的诊断应用 被引量:1
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作者 程军 王飞燕 +3 位作者 张思明 王恺隽 郭志超 崔凯 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第23期5290-5292,共3页
目的建立16SrRNA基因荧光定量PCR方法检测心血管病患者术后血流感染的诊断技术,以提高临床细菌检测的准确性及敏感性,缩短检测细菌的时间。方法 2010年4月-2012年3月医院对411例术后疑为血流感染的标本进行常规血液培养,同时进行细菌16S... 目的建立16SrRNA基因荧光定量PCR方法检测心血管病患者术后血流感染的诊断技术,以提高临床细菌检测的准确性及敏感性,缩短检测细菌的时间。方法 2010年4月-2012年3月医院对411例术后疑为血流感染的标本进行常规血液培养,同时进行细菌16SrRNA基因的检测,包括DNA提取、设计引物和探针、聚合酶链反应(PCR)扩增及对扩增产物荧光定量检测,比较二者的诊断阳性率、敏感性和特异性,数据采用SPSS11.0软件进行统计分析。结果荧光定量PCR方法检测血流感染的阳性患者182例,阳性率为44.3%,明显高于血液培养的15.6%,差异有统计学意义(P<0.01);若以血液培养阳性和(或)临床诊断血流感染的标准作为对照,PCR的诊断敏感性为87.9%、诊断特异性为90.6%。结论荧光定量16SrRNA基因检测的阳性率远高于血液培养,可为心血管病患者术后血流感染提供早期、敏感的病原学诊断依据。 展开更多
关键词 16S RRNA 心血管病 血流感染 荧光定量聚合酶链反应
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被动游泳运动对小鼠抑郁样行为及其肠道菌群组成的影响
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作者 陈文迪 张诗琪 +3 位作者 王亚楠 李咏贤 刘颖 徐宏伟 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第5期52-62,共11页
被动游泳运动可诱发小鼠抑郁样行为,游泳环境的改变已成为抑郁样行为严重程度影响因素之一。观察不同水质、水温及持续时间对被动游泳小鼠抑郁样行为的影响,并初步探讨肠道菌群组成与抑郁样行为的关系。通过不同条件下的被动游泳运动建... 被动游泳运动可诱发小鼠抑郁样行为,游泳环境的改变已成为抑郁样行为严重程度影响因素之一。观察不同水质、水温及持续时间对被动游泳小鼠抑郁样行为的影响,并初步探讨肠道菌群组成与抑郁样行为的关系。通过不同条件下的被动游泳运动建立抑郁样行为小鼠模型。采用糖水偏好实验及强迫游泳实验评价其行为学变化;采用16S rDNA高通量测序技术及实时荧光定量PCR技术对小鼠肠道菌群进行分子生态学分析。被动游泳16周后,各模型组小鼠体质量及糖水偏爱度均较正常对照组降低,而不动时间则有所延长。其中,室温海水游泳15 min小鼠体质量及糖水偏爱度降低程度最大,不动时间最长,与正常对照组比较,均具有显著性差异(P<0.05)。各模型组小鼠肠道菌群Chao指数、Shannon指数及PCoA分析均较正常对照组具有显著性差异(P<0.05),其从门水平到属水平的丰度也发生不同程度改变。其中,室温海水游泳15 min小鼠肠道菌群组成变化程度最大,并发生拟杆菌属、普氏菌属等多个菌属的富集以及乳杆菌属丰度的减少,实时荧光定量PCR实验也得到了较为一致的结果(P<0.05)。以上结果表明,被动游泳运动可导致小鼠抑郁样行为的发生,其肠道菌群组成也发生明显改变;同时,菌群组成的改变会随着抑郁样行为的严重程度而有所变化。 展开更多
关键词 游泳运动 抑郁样行为 肠道菌群 16S rDNA高通量测序 实时荧光定量PCR 小鼠
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基于16S rDNAs的快速检测血液细菌污染的荧光定量PCR研究 被引量:4
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作者 王永智 薛利军 +4 位作者 任浩 赵平 朱诗应 李冕 戚中田 《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》 CAS 2007年第4期203-209,共7页
目的探讨快速筛选血液及血液制品中细菌污染的方法。方法对20余种常见致病性细菌的16SrDNAs进行多序列比对,设计扩增细菌16SrDNAs基因的荧光定量PCR(FQ-PCR)通用引物。以12种致病菌、2种真菌、1种支原体、1种病毒和人基因组DNA为模板,... 目的探讨快速筛选血液及血液制品中细菌污染的方法。方法对20余种常见致病性细菌的16SrDNAs进行多序列比对,设计扩增细菌16SrDNAs基因的荧光定量PCR(FQ-PCR)通用引物。以12种致病菌、2种真菌、1种支原体、1种病毒和人基因组DNA为模板,验证通用引物检测细菌的特异性。通用引物扩增金黄色葡萄球菌16SrDNA靶片段,构建标准质粒pMDT-Bfr,并建立FQ-PCR定量标准曲线。分别以金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌作为革兰阳性和革兰阴性细菌代表菌,以其不同浓度的DNA为模板进行FQ-PCR反应,检验该方法的敏感性。抽提梯度稀释的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌模拟血液细菌污染标本的总DNA作为FQ-PCR反应模板,检验基于16SrDNAs的FQ-PCR作为血液细菌污染检测方法的敏感性。结果设计的FQ-PCR通用引物有较高的特异性,仅能检测出细菌的16SrDNAs;用该方法检测革兰阳性和革兰阴性菌,对于浓度在103拷贝/μl以上的16SrDNAs基因都可以准确定量;以该方法检测血液细菌污染模拟标本,灵敏度可达到105CFU/ml。结论初步建立了以16SrDNAs作为FQ-PCR靶基因快速检测血液细菌污染的方法。该方法特异性强、灵敏度高、成本低廉,具有很好的研究价值与应用前景。 展开更多
关键词 细菌污染 16S rDNAs 荧光定量PCR
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