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野菊细胞色素P450基因家族全基因组鉴定及黄酮合酶基因分析
1
作者
赵彬凯
陈诗
+3 位作者
廖家豪
雷笛
张景景
刘义飞
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025年第1期24-35,共12页
目的系统鉴定和分析野菊中细胞色素P450(CYP450)基因家族成员及其功能特性,为进一步研究其在类黄酮生物合成中的作用提供依据。方法基于二倍体野菊(Chrysanthemum indicum L.)基因组数据,利用生物信息学方法对野菊P450基因家族成员进行...
目的系统鉴定和分析野菊中细胞色素P450(CYP450)基因家族成员及其功能特性,为进一步研究其在类黄酮生物合成中的作用提供依据。方法基于二倍体野菊(Chrysanthemum indicum L.)基因组数据,利用生物信息学方法对野菊P450基因家族成员进行鉴定和分析。同时,结合转录组与类靶向代谢组筛选源于CYP93家族的黄酮合酶Ⅱ(FNSⅡ)基因,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测其在不同组织中的表达水平。结果从野菊基因组中共鉴定到460个P450基因,归属于8个家族簇的43个家族。编码蛋白质的氨基酸数量为336-1538 aa,相对分子质量范围为38.01-175.00 kDa,等电点介于5.61-9.71。染色体定位分析显示,460个P450基因在9条染色体上呈不均匀分布,启动子区域中光响应类型元件数量最多。表达模式分析显示,两个FNSⅡ基因(CindChr2G00102820.1和CindChr8G00552890.1)在湖北黄石野菊叶组织中的表达量显著高于花。结论全面分析了野菊基因组中的P450基因家族,有助于进一步探究野菊P450基因家族在类黄酮生物合成中的功能。
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关键词
野菊
P450基因家族
FNSⅡ
表达分析
暂未订购
题名
野菊细胞色素P450基因家族全基因组鉴定及黄酮合酶基因分析
1
作者
赵彬凯
陈诗
廖家豪
雷笛
张景景
刘义飞
机构
湖北中医药大学药学院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025年第1期24-35,共12页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(32270231):菊属植物TS/CYP基因簇的起源进化机制及功能研究,负责人:刘义飞。
文摘
目的系统鉴定和分析野菊中细胞色素P450(CYP450)基因家族成员及其功能特性,为进一步研究其在类黄酮生物合成中的作用提供依据。方法基于二倍体野菊(Chrysanthemum indicum L.)基因组数据,利用生物信息学方法对野菊P450基因家族成员进行鉴定和分析。同时,结合转录组与类靶向代谢组筛选源于CYP93家族的黄酮合酶Ⅱ(FNSⅡ)基因,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测其在不同组织中的表达水平。结果从野菊基因组中共鉴定到460个P450基因,归属于8个家族簇的43个家族。编码蛋白质的氨基酸数量为336-1538 aa,相对分子质量范围为38.01-175.00 kDa,等电点介于5.61-9.71。染色体定位分析显示,460个P450基因在9条染色体上呈不均匀分布,启动子区域中光响应类型元件数量最多。表达模式分析显示,两个FNSⅡ基因(CindChr2G00102820.1和CindChr8G00552890.1)在湖北黄石野菊叶组织中的表达量显著高于花。结论全面分析了野菊基因组中的P450基因家族,有助于进一步探究野菊P450基因家族在类黄酮生物合成中的功能。
关键词
野菊
P450基因家族
FNSⅡ
表达分析
Keywords
Chrysanthemum indicum
P450 gene family
fnsi
Expression analysis
分类号
R-058 [医药卫生]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
野菊细胞色素P450基因家族全基因组鉴定及黄酮合酶基因分析
赵彬凯
陈诗
廖家豪
雷笛
张景景
刘义飞
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025
0
暂未订购
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