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基于TCGA数据库分析FNDC3B基因在胰腺癌中的表达及预后意义
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作者 洪俊强 孔祥泉 +5 位作者 杜开新 罗水英 林小艺 罗惠煌 连舒晴 廖雪洪 《中外医疗》 2021年第31期5-8,共4页
目的探讨FNDC3B基因在胰腺癌组织中的表达情况及预后意义。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)的公开数据,评估FNDC3B基因在胰腺癌组织中的表达情况。筛选后共采集了141个胰腺癌样本,根据FNDC3B的表达量中位数将样本分为FNDC3B低表达组及FND... 目的探讨FNDC3B基因在胰腺癌组织中的表达情况及预后意义。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)的公开数据,评估FNDC3B基因在胰腺癌组织中的表达情况。筛选后共采集了141个胰腺癌样本,根据FNDC3B的表达量中位数将样本分为FNDC3B低表达组及FNDC3B高表达组。采用Kaplan-Meier法对胰腺癌患者进行生存分析,采用Log-Rank检验以及Cox回归模型分析胰腺癌患者预后的影响因素,同时利用基因集富集分析(GSEA)方法预测调控通路。结果FNDC3B高表达的患者,具有更多的淋巴结转移,差异有统计学意义(P<0.05)。生存分析显示,FNDC3B高表达的胰腺癌患者预后更差(P<0.05)。单因素分析中,T分期、N分期、分子靶向治疗、放射治疗及FNDC3B影响胰腺癌患者的总生存。多因素分析中,FNDC3B表达(HR:1.861,95%CI:1.147~3.019,P=0.012)、分子靶向治疗(HR:0.363,95%CI:0.216~0.611,P<0.001)及肿瘤分级(HR:1.948,95%CI:1.198~3.167,P=0.007)是胰腺癌总生存的3个独立危险因素。GSEA结果表明,FNDC3B基因主要与癌症相关信号通路、胰腺肿瘤、ECM受体相互作用、白细胞跨内皮迁移、黏着斑、调节肌动蛋白细胞骨架、细胞因子和细胞因子受体相互作用、细胞黏附分子、黏附连接等信号通路相关。结论FNDC3B、肿瘤分级及分子靶向治疗是影响胰腺癌患者总生存的独立危险因素。FNDC3B可能是胰腺癌患者不良预后的潜在生物标志物,为今后治疗胰腺癌提供了潜在的靶点。 展开更多
关键词 fndc3b 胰腺癌 癌症基因组图谱
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miR-155-5p靶向FNDC3B基因通过NF-κB信号通路调控骨关节炎软骨细胞增殖和凋亡 被引量:5
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作者 谢进 舒莉莉 +1 位作者 苏虔 肖雄 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第7期914-918,927,共6页
目的探讨miR-155-5p对骨关节炎软骨细胞增殖和凋亡的影响及分子机制.方法分离培养软骨细胞,设置对照(NC)组、白细胞介素-1β(IL-1β)组、1、2、3、4、5组.实时荧光定量PCR(RT-qP-CR)检测miR-155-5p和Ⅲ型纤维连接蛋白结构域蛋白3B(FNDC3... 目的探讨miR-155-5p对骨关节炎软骨细胞增殖和凋亡的影响及分子机制.方法分离培养软骨细胞,设置对照(NC)组、白细胞介素-1β(IL-1β)组、1、2、3、4、5组.实时荧光定量PCR(RT-qP-CR)检测miR-155-5p和Ⅲ型纤维连接蛋白结构域蛋白3B(FNDC3B)mRNA表达水平;蛋白质印迹(West-ern blot)法检测FNDC3B、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、裂解的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(Cleaved-cas-pase-3)、磷酸化p65(p-p65)、磷酸化核因子kappaB抑制蛋白α(p-IκBα)蛋白表达;细胞计数试剂盒8(CCK-8)检测细胞存活率;流式细胞术检测细胞凋亡;双荧光素酶报告实验验证miR-155-5p和FNDC3B的靶向关系.结果IL-1β诱导的软骨细胞中miR-155-5p高表达(3.12±0.31 vs 1.00±0.10),FNDC3B mRNA(0.36±0.03 vs 1.03±0.11)和蛋白(0.40±0.04 vs 0.88±0.08)低表达(P<0.05),且IL-1β可诱导软骨细胞凋亡(20.46±2.05 vs 6.33±0.60).抑制miR-155-5p表达,IL-1β诱导的软骨细胞中细胞存活率升高(83.12±8.30 vs 49.05±4.91),细胞凋亡率降低(9.86±0.98 vs 18.26±1.80)(P<0.05);过表达FNDC3B,细胞存活率升高(89.05±8.90 vs 50.77±5.10),细胞凋亡率降低(10.66±1.08 vs 19.89±1.95)(P<0.05).miR-155-5p靶向调控FNDC3B;抑制miR-155-5p表达可抑制p-p65、p-IκBα表达;低表达FNDC3B可以部分逆转miR-155-5p低表达对IL-1β诱导的软骨细胞增殖、凋亡及NF-κB信号通路的影响.结论抑制miR-155-5p表达可能通过上调FNDC3B促进IL-1β诱导的软骨细胞增殖,抑制细胞凋亡,且其可能与NF-κB信号通路有关. 展开更多
关键词 miR-155-5p fndc3b 骨关节炎 软骨细胞 增殖 凋亡 NF-ΚB信号通路
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CircFNDC3B调节miR-107/HMGA1轴对胃癌细胞恶性生物学行为的影响 被引量:1
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作者 李雪龙 李志仁 杨妮 《解剖学研究》 CAS 2024年第3期257-264,271,共9页
目的探讨环状RNA FNDC3B(CircFNDC3B)调节微小RNA-107/高迁移率家族蛋白A1(miR-107/HMGA1)轴对胃癌(GC)细胞恶性生物学行为的影响。方法体外培养正常胃上皮细胞GES-1和人胃癌细胞系AGS、HCG27、MKN28、BGC-823,RT-qPCR检测CircFNDC3B、m... 目的探讨环状RNA FNDC3B(CircFNDC3B)调节微小RNA-107/高迁移率家族蛋白A1(miR-107/HMGA1)轴对胃癌(GC)细胞恶性生物学行为的影响。方法体外培养正常胃上皮细胞GES-1和人胃癌细胞系AGS、HCG27、MKN28、BGC-823,RT-qPCR检测CircFNDC3B、miR-107和HMGA1表达,筛选出最佳细胞系。双荧光素酶报告基因实验验证miR-107与CircFNDC3B、HMGA1的靶向关系;选择BGC-823细胞进行转染,将细胞分为si-NC组、si-CircFNDC3B组、si-CircFNDC3B+NC inhibitor、si-CircFNDC3B+miR-107 inhibi-tor组、miR-NC组、miR-107 mimics组、miR-107 mimics+pcDNA、miR-107 mimics+HMGA1组,MTT法检测细胞增殖;Transwell检测细胞迁移和侵袭能力;流式细胞技术检测细胞凋亡;Western blot检测Ki67、Cyclin D1、Bcl-2、cleaved caspase3、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达。结果在胃癌细胞系中CircFNDC3B、HMGA1表达显著增加,miR-107表达显著下降(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-107与CircFNDC3B、HMGA1具有靶向关系;沉默CircFNDC3B表达或过表达miR-107可显著抑制细胞增殖、迁移、侵袭和EMT,促进细胞凋亡(P<0.05);抑制miR-107表达或过表达HMGA1可逆转沉默CircFNDC3B或过表达miR-107对BGC-823细胞增殖、迁移、侵袭和EMT的抑制作用(P<0.05)。结论CircFNDC3B在胃癌细胞中高表达,沉默CircFNDC3B通过调节miR-107/HMGA1轴抑制胃癌细胞恶性生物学行为。 展开更多
关键词 胃癌细胞 环状RNA fndc3b 微小RNA-107/高迁移率家族蛋白A1 恶性生物学行为
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circFNDC3B调控巨噬细胞极化对口腔鳞状细胞癌细胞凋亡和GPNMB/CD44轴的作用机制
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作者 易笑冉 张乾 +2 位作者 石佳佩 严梦 刘俊杰 《解剖学研究》 CAS 2024年第6期540-545,共6页
目的探讨circFNDC3B调控巨噬细胞极化对口腔鳞状细胞癌细胞凋亡和GPNMB/CD44轴的作用机制。方法将过表达circFNDC3B质粒转染到M0型巨噬细胞中,分为con组和circFNDC3B组,RT-PCR检测巨噬细胞中CD16、TLR2、CD206和CD14相对表达量;将con组... 目的探讨circFNDC3B调控巨噬细胞极化对口腔鳞状细胞癌细胞凋亡和GPNMB/CD44轴的作用机制。方法将过表达circFNDC3B质粒转染到M0型巨噬细胞中,分为con组和circFNDC3B组,RT-PCR检测巨噬细胞中CD16、TLR2、CD206和CD14相对表达量;将con组和circFNDC3B组巨噬细胞和OSCC细胞系SCC-25共培养,设为M0-con组和M0-circFNDC3B组;Transwell法检测细胞侵袭;流式细胞术检测细胞凋亡能力;蛋白质印迹法检测细胞中GPNMB和CD44蛋白表达。结果与con组相比,circFNDC3B组巨噬细胞中M1型巨噬细胞标志蛋白CD16、TLR2相对表达量均降低(P<0.01);M2型巨噬细胞标志蛋白CD206、CD14相对表达量均升高(P<0.01)。与M0-con组相比,M0-circFNDC3B组细胞侵袭数目及细胞中GPNMB和CD44蛋白表达明显增加,细胞凋亡率显著降低(P<0.01)。结论circFNDC3B可促进M2型巨噬细胞极化抑制口腔鳞状细胞癌细胞凋亡,其机制可能和激活GPNMB/CD44轴有关。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 来源于Ⅲ型纤维连接蛋白域蛋白3B 环状RNA 巨噬细胞极化 凋亡 GPNMB/CD44轴
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下调FNDC3B表达对舌鳞癌细胞增殖和侵袭迁移影响 被引量:2
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作者 钟兆铭 洪敏 +3 位作者 孙传政 徐圆圆 陈晓 梁进 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2018年第16期1136-1141,共6页
目的转移和复发是舌鳞癌治疗失败的主要原因,明确其转移复发的机制是提高疗效和预后的关键。本研究旨在检测Ⅲ型纤维连接蛋白域蛋白3B(fibronectin typeⅢdomain containing 3B,FNDC3B)在舌鳞癌细胞株中的表达,并探讨下调其表达对人舌... 目的转移和复发是舌鳞癌治疗失败的主要原因,明确其转移复发的机制是提高疗效和预后的关键。本研究旨在检测Ⅲ型纤维连接蛋白域蛋白3B(fibronectin typeⅢdomain containing 3B,FNDC3B)在舌鳞癌细胞株中的表达,并探讨下调其表达对人舌鳞癌细胞体外增殖和侵袭迁移能力的影响。方法实时定量荧光PCR (realtime fluorescence quantitative polymerase chain reaction,PCR)及蛋白质印迹法检测舌鳞癌细胞株中FNDC3B的表达情况,构建稳定沉默FNDC3B舌鳞癌细胞株并通过Real-time PCR及蛋白质印迹法检测沉默的效率。平板克隆、四唑盐(methyl thiazolyl tetrazolim,MTT)比色法和Transwell实验分别检测沉默FNDC3B对舌鳞癌细胞增殖及侵袭迁移的影响。结果 Realtime PCR及蛋白质印迹法结果证实,FNDC3B在舌鳞癌细胞中的表达明显高于人正常舌上皮细胞。Transwell侵袭和迁移实验发现,3组沉默组TCA8113侵袭细胞数目分别为26.67±2.96、59.33±5.36和102.0±7.55,明显少于对照组的172.7±13.28,F=60.347,P<0.05;3组沉默组TCA8113迁移细胞数目分别为39.33±7.31、75.33±5.36和117.3±6.57,明显少于对照组的207.0±10.21,F=90.903,P<0.05。与空载体对照组相比,稳定沉默FNDC3B的舌鳞癌细胞株的增殖及侵袭迁移能力明显降低,P<0.05。结论 FNDC3B在舌鳞癌细胞中高表达,下调FNDC3B表达显著降低舌鳞癌细胞的增殖及侵袭迁移能力。 展开更多
关键词 舌鳞癌 fndc3b 细胞增殖 细胞侵袭 细胞迁移
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蜂胶中CAPE对HGF诱导的HepG2细胞侵袭和迁移能力的抑制作用 被引量:6
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作者 王紫燕 王莹莹 +1 位作者 曾晓雄 张红城 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期203-209,共7页
目的:探讨咖啡酸苯乙酯(phenethyl caffeate,CAPE)对肝细胞生长因子(hepatocyte growth factor,HGF)诱导的人肝癌细胞系(Hep G2细胞)侵袭和迁移的抑制作用及机制。方法:将实验分为对照组(HGF=0 ng/m L;CAPE=0μmol/L)、诱导组(HGF=20 ng... 目的:探讨咖啡酸苯乙酯(phenethyl caffeate,CAPE)对肝细胞生长因子(hepatocyte growth factor,HGF)诱导的人肝癌细胞系(Hep G2细胞)侵袭和迁移的抑制作用及机制。方法:将实验分为对照组(HGF=0 ng/m L;CAPE=0μmol/L)、诱导组(HGF=20 ng/m L;CAPE=0μmol/L)和荷药组(HGF=20 ng/m L;CAPE分别为2.5、5.0、7.5、10.0μmol/L),测定细胞黏附率,Transwell小室模拟细胞侵袭和迁移能力以及划痕实验测定细胞迁移率,蛋白免疫印迹(Western blot)法检测ELMO1、MAP4K4和FNDC3B表达。结果:与对照组比较,诱导组表现出显著的促进细胞黏附和迁移作用,荷药组中表现出对HGF诱导的细胞黏附和迁移具有显著的抑制作用(P<0.05)。Transwell小室实验结果表明CAPE对HGF诱导的Hep G2细胞侵袭和迁移作用有抑制作用。Western blot结果显示,诱导组和对照组相比ELMO1和MAP4K4表达显著上调,荷药组和诱导组相比ELMO1和MAP4K4表达显著下调(P<0.05);诱导组表达FNDC3B较对照组显著下降(P<0.05),荷药组FNDC3B表达量较诱导组增加,但结果不显著(P>0.05)。结论:CAPE能够抑制HGF诱导的Hep G2细胞的黏附、侵袭和迁移。CAPE通过上调FNDC3B和下调ELMO1、MAP4KE的表达,抑制Hep G2细胞的侵袭和迁移能力。 展开更多
关键词 咖啡酸苯乙酯 细胞侵袭 细胞迁移 ELMO1 MAP4K4 fndc3b
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