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云南省核桃品种遗传多样性的FISH-AFLP分析 被引量:17
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作者 宁德鲁 马庆国 +3 位作者 张雨 王滑 陆斌 裴东 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2011年第2期189-193,共5页
采用FISH-AFLP技术,选取8对E+3和M+3引物组合,对云南省林木品种审定委员会审(认)定的17个核桃品种(无性系)进行了基因组DNA分子水平上的检测,实验结果共获得987条可统计的条带,其中942条呈多态性,多态性带百分率达95.44%;17份供试核桃... 采用FISH-AFLP技术,选取8对E+3和M+3引物组合,对云南省林木品种审定委员会审(认)定的17个核桃品种(无性系)进行了基因组DNA分子水平上的检测,实验结果共获得987条可统计的条带,其中942条呈多态性,多态性带百分率达95.44%;17份供试核桃样品的遗传相似系数范围为0.606 9 0.796 4,平均为0.734 9。本研究分析了云南省审(认)定核桃品种(无性系)的遗传多样性和亲缘关系,建立了它们的指纹图谱,为下一步的核桃新品种选育、构建核桃优良种质库提供了理论指导。 展开更多
关键词 核桃 品种 遗传多样性 fish-aflp 聚类分析
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16个早实核桃良种遗传多样性的FISH-AFLP分析 被引量:16
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作者 马庆国 齐静 裴东 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2010年第5期631-636,共6页
采用FISH-AFLP技术,筛选9对E+3和M+3引物组合,对我国首批16个早实核桃良种进行了基因组DNA水平上的检测,结果表明:共获得1 072条可统计的条带,其中946条呈多态性,平均的多态性带百分率达88.12%;经9对引物检测的16个品种基因型各不相同,... 采用FISH-AFLP技术,筛选9对E+3和M+3引物组合,对我国首批16个早实核桃良种进行了基因组DNA水平上的检测,结果表明:共获得1 072条可统计的条带,其中946条呈多态性,平均的多态性带百分率达88.12%;经9对引物检测的16个品种基因型各不相同,均得到数目不等的特征带,并能将16个早实核桃良种完全区分开。研究分析了早实核桃良种的遗传多样性和亲缘关系并建立了它们的指纹图谱。 展开更多
关键词 核桃 遗传多样性 亲缘关系 fish-aflp 指纹图谱
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应用FISH-AFLP技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系 被引量:5
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作者 马庆华 陈新 +2 位作者 赵天田 刘庆忠 王贵禧 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第23期5003-5011,共9页
【目的】建立平欧杂种榛FISH-AFLP技术体系,并应用该技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系。【方法】以达维等10个主栽品种为试材,经DNA提取、PstⅠ/MseⅠ双酶切,进行FISH-AFLP反应,数据转换为"0—1"矩阵后,使用NTSYS pc 2.... 【目的】建立平欧杂种榛FISH-AFLP技术体系,并应用该技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系。【方法】以达维等10个主栽品种为试材,经DNA提取、PstⅠ/MseⅠ双酶切,进行FISH-AFLP反应,数据转换为"0—1"矩阵后,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据分析并作图。【结果】从64对引物中,筛选出15对多态性强的PstⅠ/MseⅠ引物,共获得1 739条谱带,引物平均多态带比率97.94%;平欧杂种榛主栽品种的相似性系数为0.7556—0.8543,当阈值为0.8398时,可分成4个AFLP群,其中,玉坠(84-310)、辽榛4号(85-41)和平欧69号(84-69)单独为1群,其他品种为1群;平欧杂种榛主栽品种的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.3921、0.2482和0.3957,具有较高的遗传多样性;研究获得的特征条带可用于平欧杂种榛主栽品种的快速鉴别。【结论】由于平欧杂种榛的实生选优群体是多亲本组合的混合后代,因此,该群体是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种间存在复杂的亲缘关系;研究构建的FISH-AFLP技术流程、筛选得到的引物以及分析得到的各项遗传参数,可为其他榛属植物的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 平欧杂种榛 fish-aflp 指纹图谱 亲缘关系 遗传多样性
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应用FISH-AFLP技术分析105份樱桃种质资源的亲缘关系 被引量:1
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作者 陈新 徐丽 +6 位作者 宗晓娟 王甲威 谭钺 朱东姿 魏海蓉 洪坡 刘庆忠 《山东农业科学》 2019年第11期22-27,共6页
为建立樱桃种质资源的FISH-AFLP技术体系并进行亲缘关系分析,本研究以国内外搜集的105份樱桃种质为对象,经DNA提取、EcoRⅠ/MseⅠ双酶切,再进行FISH-AFLP反应。扩增结果显示,筛选得到8对EcoRⅠ/MseⅠ多态性引物,可扩增出1148条谱带,平... 为建立樱桃种质资源的FISH-AFLP技术体系并进行亲缘关系分析,本研究以国内外搜集的105份樱桃种质为对象,经DNA提取、EcoRⅠ/MseⅠ双酶切,再进行FISH-AFLP反应。扩增结果显示,筛选得到8对EcoRⅠ/MseⅠ多态性引物,可扩增出1148条谱带,平均多态性比率98.61%。聚类分析和遗传多样性分析结果显示,105份樱桃栽培品种的遗传相似性系数为0.54~0.89,当阈值为0.68时,可分成7个AFLP群;有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.52、0.30、0.45,具有较高的遗传多样性。本研究结果可为今后樱桃品种鉴别和遗传多样性研究等提供理论指导。 展开更多
关键词 樱桃 fish-aflp 遗传多样性 亲缘关系
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太白红杉FISH-AFLP体系的建立
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作者 张传军 肖娅萍 王孝安 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2007年第6期619-623,共5页
分别以太白红杉的胚乳、干叶和鲜叶为材料,通过改良的CTAB法提取总DNA,经酶切连接、PCR预扩增、PCR选择性扩增、凝胶电泳等程序,建立了太白红杉的FISH-AFLP分子标记体系。结果显示:引物E-ACG/M-CAC和E-ACG/M-CAA在28份材料中扩增总带数... 分别以太白红杉的胚乳、干叶和鲜叶为材料,通过改良的CTAB法提取总DNA,经酶切连接、PCR预扩增、PCR选择性扩增、凝胶电泳等程序,建立了太白红杉的FISH-AFLP分子标记体系。结果显示:引物E-ACG/M-CAC和E-ACG/M-CAA在28份材料中扩增总带数分别为1856和2013条;以胚乳和鲜叶为材料,可以得到稳定、丰富的扩增带。FISH-AFLP体系的建立为进一步分析太白红杉的遗传多样性奠定了基础。 展开更多
关键词 太白红杉 遗传多样性 fish-aflp
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FISH-AFLP分析新疆核桃品种遗传多样性 被引量:3
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作者 何健 马庆国 +3 位作者 雪来提·牙生 孙东 孙世国 裴东 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2013年第6期730-735,共6页
采用FISH-AFLP技术,选取8对EcoRⅠ+3和MseⅠ+3引物组合,对新疆维吾尔自治区林木品种审定委员会审(认)定的24个核桃品种(无性系)、2株实生古树及4个农家类型在DNA水平上进行了多态性检测。结果表明:在获得的1 011条谱带中,981条呈多态性... 采用FISH-AFLP技术,选取8对EcoRⅠ+3和MseⅠ+3引物组合,对新疆维吾尔自治区林木品种审定委员会审(认)定的24个核桃品种(无性系)、2株实生古树及4个农家类型在DNA水平上进行了多态性检测。结果表明:在获得的1 011条谱带中,981条呈多态性,多态性百分率达97.5%;不同引物组合的有效等位基因数为1.188 71.234 7,平均为1.208 5;基因多样度为0.118 3 0.141 2,平均为0.129 7;Shannon信息指数为0.184 6 0.225 8,平均为0.206 6。总体的遗传多样性水平为中等。经8对引物检测的30个品种及类型均得到数目不等的特异带型,能将30个核桃良种及类型完全区分,建立了它们的指纹图谱。 展开更多
关键词 核桃 品种 遗传多样性 FISH—AFLP 亲缘关系
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利用花粉管通道技术将外源银白杨DNA导入黑杨 被引量:7
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作者 赵鑫闻 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期533-541,共9页
黑杨派杨树具有速生丰产、实用性强和无性繁殖能力强等优点;白杨派杨树则具有材质好和抗逆性强等优点。两个派间的许多经济性状优势互补,因此黑杨派与白杨派杂交能够获得多优势性状聚合于一体的优良杂种无性系。但黑杨派与白杨派间杂交... 黑杨派杨树具有速生丰产、实用性强和无性繁殖能力强等优点;白杨派杨树则具有材质好和抗逆性强等优点。两个派间的许多经济性状优势互补,因此黑杨派与白杨派杂交能够获得多优势性状聚合于一体的优良杂种无性系。但黑杨派与白杨派间杂交天然不育,为了克服黑杨派与白杨派间的远缘杂交障碍,利用花粉管通道技术将银白杨(Populus alba)总DNA导入辽宁杨(Populus×Liaoninggensis)×N001(P.deltoids cv.‘N001’)。获得的D1代植株通过形态学鉴定,发现其中4株明显具有供体银白杨的表型特征。进一步对其进行AFLP分子鉴定,最终确定此4株变异植株均为外源银白杨DNA的阳性转化植株。该研究初步建立了黑杨花粉管通道遗传转化体系,确定外源DNA导入黑杨的最适时间为授粉后30–72小时,适宜方法为不切柱头滴加导入法,最佳浓度为200μg·m L–1。 展开更多
关键词 fish-aflp 银白杨 黑杨组 花粉管通道法
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AFLP技术在鱼类种群分析中的应用 被引量:5
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作者 孙冬芳 李永振 董丽娜 《南方水产》 2009年第6期71-75,共5页
文章介绍了扩增性片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术的原理和应用程序,概述了AFLP技术在鱼类种质资源、种群鉴别和地理分化及种群自我恢复能力等分析研究中的应用现状和应用前景。并期望AFLP种群分析技... 文章介绍了扩增性片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术的原理和应用程序,概述了AFLP技术在鱼类种质资源、种群鉴别和地理分化及种群自我恢复能力等分析研究中的应用现状和应用前景。并期望AFLP种群分析技术也将在鱼类洄游、捕捞量配额分配及生态学等研究中有重要应用。 展开更多
关键词 扩增性片段长度多态性 鱼类种群分析
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花椰菜--黑芥渐渗系和异附加系的获得与分析 被引量:4
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作者 吕晶 刘凡 +3 位作者 宗梅 韩硕 王幼平 王桂香 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期456-468,共13页
以花椰菜—黑芥体细胞杂种自交及回交后代为材料,结合形态学特征,分子标记和荧光原位杂交(FISH)等群体分析技术,在16份高代回交及自交材料中筛选获得了花椰菜类型渐渗系材料12份,偏花椰菜类型异附加系材料4份。形态学调查及FISH分析表明... 以花椰菜—黑芥体细胞杂种自交及回交后代为材料,结合形态学特征,分子标记和荧光原位杂交(FISH)等群体分析技术,在16份高代回交及自交材料中筛选获得了花椰菜类型渐渗系材料12份,偏花椰菜类型异附加系材料4份。形态学调查及FISH分析表明:12份渐渗系材料除茎、叶等营养器官特征与花椰菜近似外,已具有较正常的花球形成,染色体数为18条,均来源于花椰菜;植株花粉母细胞减数分裂行为基本正常。SSR和AFLP分子标记检测表明,渐渗系材料除扩增到数量不等的黑芥多态性位点外,还扩增到埃塞俄比亚芥特异的多态性位点和少量新位点,另外发现渐渗系材料有丢失亲本花椰菜多态性位点的现象。FISH分析4份异附加系材料的染色体组成,结果显示:PFCN29BC2S1-4为9条花椰菜染色体附加8条黑芥染色体;PFCN15-2S1BC5-6-2和PFCN29BC4-37-7为16条花椰菜染色体分别附加7条和14条黑芥染色体;PFCN29BC4-38-5为花椰菜染色体附加了5~7条黑芥染色体。 展开更多
关键词 花椰菜 黑芥 渐渗系 SSR AFLP FISH
原文传递
The molecular characterization of maize B chromosome specific AFLPs 被引量:8
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作者 ZHONG XIA QI, Hui ZENG, Xiu LAN LI, CHENG BIN CHEN, WEN QIN SONG, RUI YANG CHEN The College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第1期63-68,共6页
The origin and evolution of B chromosomes could be explained by the specific DNA sequence on them. But the specific sequences known were quite limited. To investigate maize B chromosome sqicific DNA sequeces, maize ge... The origin and evolution of B chromosomes could be explained by the specific DNA sequence on them. But the specific sequences known were quite limited. To investigate maize B chromosome sqicific DNA sequeces, maize genomes with and without B chromosomes were analyzed by AFLP. Only 5 markers were found specific to genomes with B chromosomes among about 2000 AFLP markers. Southern hybridization and sequence analysis revealed that only the sequence of M8-2D was a B chromosome specific sequence. This sequence contained the telomeric repeat unit AGGGTTT conserved in plant chromosome telomeres. In addition, the sequence of M8-2D shared low homology to clones from maize chromosome 4 centromere as well. M8-2D were localized to B chromosome centrorneric and telomeric regions. 展开更多
关键词 MAIZE B chromosome AFLP FISH.
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