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耳聋相关蛋白FCHSD2内耳相互作用蛋白的筛选与鉴定
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作者 翟晓燕 杜嘉妮 +1 位作者 洪银珊 杨彦玲 《延安大学学报(医学科学版)》 2025年第3期31-39,共9页
目的以耳聋相关蛋白FCH和双SH3结构域蛋白2(FCH and double SH3 domains protein 2,FCHSD2)为钓饵,利用酵母双杂交筛选FCHSD2内耳相互作用蛋白,对蛋白相互作用进行验证,通过生物信息学分析FCHSD2与其内耳互作候选蛋白可能参与的信号转... 目的以耳聋相关蛋白FCH和双SH3结构域蛋白2(FCH and double SH3 domains protein 2,FCHSD2)为钓饵,利用酵母双杂交筛选FCHSD2内耳相互作用蛋白,对蛋白相互作用进行验证,通过生物信息学分析FCHSD2与其内耳互作候选蛋白可能参与的信号转导通路,为揭示FCHSD2功能缺失导致渐进性听力障碍的分子机制提供新的线索。方法构建pBD-Gal4-musFchsd2钓饵蛋白载体,通过酵母双杂交技术筛选鸡内耳cDNA文库筛选FCHSD2互作蛋白;利用免疫共沉淀和荧光共定位实验验证候选蛋白与FCHSD2的相互作用;通过生物信息学分析FCHSD2与候选蛋白共富集信号通路。结果FCHSD2在酵母系统中无自激活活性且无毒性,筛选获得内吞蛋白1(Intersectin1,ITSN1)、含SH3结构域的GRB2样蛋白1(SH3 domain-containing GRB2-like protein 1,SH3GL1)和泛素连接酶E2 I(Ubiquitin-conjugating enzyme E2 I,UBE2I)等候选互作蛋白;实验验证显示候选蛋白与FCHSD2存在相互作用;功能富集分析显示FCHSD2与ITSN1、SH3GL1等可能参与内吞、肌动蛋白聚合调控等过程。结论内吞相关蛋白(ITSN1、SH3GL1)及泛素连接酶UBE2I与FCHSD2存在相互作用,它们与FCHSD2在内吞、肌动蛋白聚合调控等过程有富集。我们的研究为解析FCHSD2缺失引发静纤毛紊乱及渐进性听力损失的分子通路提供了关键靶点线索。 展开更多
关键词 fchsd2 酵母双杂交 免疫共沉淀 荧光共定位 生物信息学
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FCHSD2:肺鳞状细胞癌潜在的预后生物标志物 被引量:1
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作者 蒋代顺 张璐 刘义 《临床与病理杂志》 CAS 2023年第6期1074-1085,共12页
目的:探讨Fer/Cip4同源性(Fer/Cip4 homology,FCH)和双Src同源性3(Src homology 3,SH3)结构域2(FCH and double SH3 domains 2,FCHSD2)在肺鳞状细胞癌(squamous cell lung cancer,LUSC)中的表达情况,并分析其与患者预后的关系。方法:采... 目的:探讨Fer/Cip4同源性(Fer/Cip4 homology,FCH)和双Src同源性3(Src homology 3,SH3)结构域2(FCH and double SH3 domains 2,FCHSD2)在肺鳞状细胞癌(squamous cell lung cancer,LUSC)中的表达情况,并分析其与患者预后的关系。方法:采用肿瘤免疫评估资源2(Tumor Immune Estimation Resource 2,TIMER2)进行泛癌分析,发现FCHSD2的表达差异。用Kaplan-Meier绘图仪评估FCHSD2对LUSC的预后价值,使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据进行确认。并通过定量RT-PCR检测4种NSCLC细胞系和人支气管上皮样细胞中FCHSD2信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达情况。通过Coexpedia肿瘤数局库分析了FCHSD2共表达的前100个基因,对其功能进行富集分析,并在Sangerbox 3.0平台探究FCHSD2表达与免疫微环境的关系,最终预测FCHSD2的调控微RNA(microRNA,miRNA),并利用RNA相互作用百科全书(Encyclopedia of RNA Interactomes,ENCORI)平台建立LUSC潜在的miRNA-mRNA调控网络。结果:生存分析显示FCHSD2 mRNA水平的降低与LUSC患者OS的降低显著相关。用GO进行功能注释富集分析和KEGG通路富集分析,得到与磷酸转移酶活性、肝素结合等结果相关。且浸润水平随着FCHSD2表达的变化而变化,呈正相关。最终预测出了FCHSD2的调控miRNA,并构建了潜在的miRNA-mRNA调控网络。结论:FCHSD2基因有望成为新型LUSC预后标志物,为LUSC精准治疗策略选择提供重要依据。 展开更多
关键词 肺鳞状细胞癌 预后标志物 fchsd2
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