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‘红颜’草莓栽培种FaNCED4基因克隆与胁迫表达
1
作者 梁潇 刘丹梅 +3 位作者 姜兆彤 刁玉峰 刘文璐 袁珺 《分子植物育种》 北大核心 2025年第5期1481-1487,共7页
为进一步探究‘红颜’草莓栽培种9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因FaNCED4对非生物胁迫的响应机制及其原理,本研究采用RT-PCR结合RACE技术,克隆‘红颜’草莓栽培种FaNCED4基因,利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行数据... 为进一步探究‘红颜’草莓栽培种9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因FaNCED4对非生物胁迫的响应机制及其原理,本研究采用RT-PCR结合RACE技术,克隆‘红颜’草莓栽培种FaNCED4基因,利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行数据分析,检测在干旱、高盐、低温非生物胁迫处理下,FaNCED4蛋白在‘红颜’草莓中的表达水平。结果显示,该基因全长1526 bp,开放阅读框(ORF)长度为1203 bp,编码400个氨基酸,分子量为44.17 kDa,为无信号肽的亲水性蛋白;亚细胞定位该蛋白主要存在于细胞核中;FaNCED4蛋白二级结构包括无规卷曲(56%)、延伸链(20%)、α-螺旋(18.5%)和β-转角(5.5%);String蛋白互作网络分析显示,Fa NCED4蛋白互作的蛋白质共有10个,这些蛋白均通过类胡萝卜素途径合成ABA,参与非生物胁迫过程,应答多种胁迫并促进果实成熟,可见,FaNCED4是‘红颜’草莓ABA合成途径中的关键酶;实时荧光定量PCR结果显示,干旱、高盐、低温处理均可以不同程度地诱导FaNCED4在‘红颜’草莓中的表达。 展开更多
关键词 草莓 fanceD4 基因克隆 ABA 胁迫表达
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范可尼贫血互补群E基本特性及抗原表位的生物信息学分析 被引量：1
2
作者 王道 符淳 《激光生物学报》 CAS 2023年第1期76-88,共13页
范可尼贫血互补群E(FANCE)属于FA家族的重要成员之一,参与DNA链间交联损伤修复并在某些肿瘤中起重要作用。本研究运用生物信息学方法对FANCE的同源性、理化性质、亲/疏水性、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、蛋白结构、蛋白质互相作用、... 范可尼贫血互补群E(FANCE)属于FA家族的重要成员之一,参与DNA链间交联损伤修复并在某些肿瘤中起重要作用。本研究运用生物信息学方法对FANCE的同源性、理化性质、亲/疏水性、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、蛋白结构、蛋白质互相作用、B/T细胞优势抗原表位以及肿瘤相关性进行预测。FANCE为无信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,主要分布在细胞核和细胞质,具有较高的保守性。其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,含有2个N-糖基化、9个O-糖基化以及48个磷酸化位点,与FANCM、FANCD2、FANCC等蛋白发生相互作用。FANCE具有多个潜在的B/T细胞优势抗原表位和17个抗原决定簇,在急性髓性白血病(LAML)和皮肤黑色瘤(SKCM)中低表达,其低表达显著影响患者总生存率。这为深入研究FANCE在肿瘤中的分子机制提供理论依据,使FANCE可能成为新的治疗靶点。 展开更多
关键词 fance 生物信息学 结构 抗原表位 肿瘤
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在大肠杆菌K99(中国QH株)菌毛形成亚单位基因(fanC)的克隆和测序中发现IS1 插入序列 被引量：1
3
作者 陈溥言 杜念兴 +4 位作者 赵国屏 成志恒 邓芳 杨胜利 刘永庆 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期75-78,86,共5页
目的 构建大肠杆菌K99菌毛表达载体。方法 通过逐级亚克隆的方法克隆k99菌毛形成亚单位基因（fanC），并进行序列测定和fanC亚单位的抗原决定簇模拟，以确定突变部位。结果 克隆了包括K99菌毛形成亚单位基因（fanC）和部分fanD基因在内... 目的 构建大肠杆菌K99菌毛表达载体。方法 通过逐级亚克隆的方法克隆k99菌毛形成亚单位基因（fanC），并进行序列测定和fanC亚单位的抗原决定簇模拟，以确定突变部位。结果 克隆了包括K99菌毛形成亚单位基因（fanC）和部分fanD基因在内的一段基因，该基因与国外报道相比明显偏大。序列测定表明：在fanC尾部多出 24bp，在fanC与 fanD，的结合部有一 800bp左右的新基因。经与基因库中大肠杆菌基因作同源性比较发现，该新基因为768bp的插入序列IS1。其他基因为K99自身fonC与fanD片段之间的过渡基因。IS1的插入未改变fanD，基因的阅读框架，只是使fanD片段末端增加了 8个氨基酸。fanC亚单位的抗原决定簇模拟结果显示，K99 fanC片段具有一个非常突出的亲水区域，根据经验它应是抗原决定簇所在的部位。结论 首次发现大肠杆菌K99基因中含有插入序列IS1。 展开更多
关键词 大肠杆菌K99 插入序列 基因同源性 抗原决定簇 模拟 中国QH株 菌毛 fanC 基因工程疫苗 亚单位 基因克隆 测序
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MIC502风扇温控系统的原理和应用 被引量：1
4
作者 李洪英 李峻 董娜 《仪器仪表用户》 2005年第6期145-146,共2页
MIC502芯片是温控集成电路IC,用于NLX／ATX电源和其它控制设备。风扇转速由外部温度传感器控制,它是由热敏电阻分压器和具有选择性的二级信号(诸如NLX“FanC”信号)组成。MIC502芯片产生的低频脉宽调制PWM输出用于驱动外部的晶体管,此... MIC502芯片是温控集成电路IC,用于NLX／ATX电源和其它控制设备。风扇转速由外部温度传感器控制,它是由热敏电阻分压器和具有选择性的二级信号(诸如NLX“FanC”信号)组成。MIC502芯片产生的低频脉宽调制PWM输出用于驱动外部的晶体管,此晶体管是由电动机驱动的。PWM通过风扁转速的控制可以使直流风扇的操作具有较低的占空比,这样可以减少噪声,并且允许使用小功率的晶体管。 展开更多
关键词 MICRF005温控集成电路 PWM脉宽调制 NLX“FanC”信号
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Fanc A基因复合杂合突变致范可尼贫血2例 被引量：2
5
作者 管国涛 戴云鹏 +5 位作者 王琦 刘丽英 高飞 孙晓君 赵平 李秀丽 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第20期1588-1590,共3页
对山东第一医科大学附属省立医院儿童血液内分泌科于2017年收治的2例范可尼贫血(FA)患儿的临床特征、化验检查结果进行综合分析,并对FA相关基因进行Sanger测序及缺失重复分析(MLPA)。2例患儿分别为4岁3个月(女)、6岁(男),主要表现为反... 对山东第一医科大学附属省立医院儿童血液内分泌科于2017年收治的2例范可尼贫血(FA)患儿的临床特征、化验检查结果进行综合分析,并对FA相关基因进行Sanger测序及缺失重复分析(MLPA)。2例患儿分别为4岁3个月(女)、6岁(男),主要表现为反复发热,乏力伴双下肢出血点。女童双下肢及腰背部散在牛奶咖啡斑,左手拇指指甲缺如,男童体格检查无明显异常。男童心脏超声见左心房、左心室大,节段性心肌损害。2例患儿骨髓活检均显示骨髓增生低下(40%)或极度低下(10%),未见巨核细胞。染色体畸变测试、单细胞凝胶电泳测试、小巨核酶标(CD 41)、CD 55、CD 59检测及染色体核型均无明显异常。基因测序分析发现2例患儿均存有 Fanc A基因的复合杂合突变,突变分别来自于父母双方。女性患儿及其父亲21号外显子存在c1838delT杂合突变,导致氨基酸移码突变p.I613Tfs*27。MLPA结果显示该女性患儿及其母亲 Fanc A基因外显子1-3杂合性缺失突变。男性患儿及家系基因测序分析发现该患儿及其母亲在41号外显子存有c4124_4125del杂合突变,导致氨基酸移码突变p.T1375Sfs*49。提示男性患儿及其父亲 Fanc A基因外显子23-40为杂合性缺失突变。对疑似FA患儿进行相关基因测序是诊断该病的主要依据。c1838delT是新发现的 Fanc A基因突变位点。 展开更多
关键词 范可尼贫血 Fanc A基因 复合杂合突变
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