系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种累及多器官的自身免疫性疾病。8p23区域的FAM167A-BLK基因座是SLE既往全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)报道的热点区域。为探索该区域内功能SNP(single-nu...系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种累及多器官的自身免疫性疾病。8p23区域的FAM167A-BLK基因座是SLE既往全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)报道的热点区域。为探索该区域内功能SNP(single-nucleotide polymorphism)对其相关基因BLK和FAM167A调控的作用,本研究利用GCTA软件和fnGWAS进行一系列功能注释,筛选出潜在的功能SNP,并通过双荧光素酶报告基因实验、shRNA敲低和CRISPR/dCas9敲低等功能实验进行验证。结果显示,该区域有4个功能SNP对BLK表达具有等位基因特异性增强效应,但对FAM167A无显著影响。同时,BLK可调控FAM167A表达。FAM167A可能是SLE的潜在致病基因。本研究深化了对FAM167A-BLK区域的遗传变异调控机制的理解,为解析SLE的发生机制研究提供了新视角。展开更多
本研究旨在分析序列相似性家族135成员A(Family With Sequence Similarity 135 Member A, FAM135A)基因和丝/酪氨酸蛋白激酶3(Serine/Threonine Protein Kinase 3, STK3)基因的多态性位点与山羊产羔数的关联。基于Sequenom MassARRAY SN...本研究旨在分析序列相似性家族135成员A(Family With Sequence Similarity 135 Member A, FAM135A)基因和丝/酪氨酸蛋白激酶3(Serine/Threonine Protein Kinase 3, STK3)基因的多态性位点与山羊产羔数的关联。基于Sequenom MassARRAY SNP技术对FAM135A和STK3基因的4个候选位点进行分型,并分析了云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中4个候选位点的遗传学特征,同时将这些突变位点与云上黑山羊的繁殖性能(包括产羔数、初生窝重和断奶窝重)作了关联分析。结果显示,在不同繁殖力品种(济宁青山羊和辽宁绒山羊)中,FAM135A基因的g.91260230 G>T和g.91261141 G>A位点以及STK3基因的g.16434985 C>T位点基因型的分布存在着极显著差异(P <0.01);而不同繁殖力品种中STK3基因的g.16648187 C>T位点的基因型分布却没有明显差异(P>0.05)。关联分析结果表明,g.91260230 G>T位点的各基因型在云上黑山羊的产羔数、初生窝重和断奶窝重上都没有明显差异(P>0.05);但g.91261141 G>A位点与产羔数和初生窝重显著相关,GG型产羔数和窝重均显著高于AG型(P <0.05);g.16434985 C>T位点TT型的初生窝重显著高于CT型(P <0.05),但该位点的各基因型对山羊的产羔数和断奶窝重并没有显著影响(P>0.05);g.16648187 C>T位点与山羊的产羔数和初生窝重之间都没有显著关联(P>0.05)。综上,本研究发现FAM135A基因的g.91261141 G>A位点是云上黑山羊产羔数与初生窝重选择的潜在遗传标记。STK3基因的g.16434985 C>T位点适合初生窝重的选择。展开更多
