-
题名FAM91A1可能是乳腺癌患者的独立预后因子
- 1
-
-
作者
王睿
邓俊
施廷鑫
张志兆
王成方
张毅
齐晓伟
-
机构
陆军军医大学第一附属医院乳腺甲状腺外科
陆军军医大学第一附属医院江北院区心胸外科
陆军军医大学基础医学院
-
出处
《中华乳腺病杂志(电子版)》
CSCD
2024年第5期274-280,共7页
-
基金
国家重点研发计划子课题(2022YFC2403401)
重庆市杰出青年自然科学基金(CSTB2023NSCQ-JQX0012)
重庆市技术创新与应用发展重点项目(CSTB2022TIAD-KPX0168)。
-
文摘
目的研究FAM91A1表达是否能作为乳腺癌独立预后因子,并探讨其可能的影响机制。方法利用UALCAN数据库中的“TCGA”模块获得FAM91A1在乳腺癌各个分型中的mRNA表达,同时从TCGA数据库获得1101例乳腺癌患者表达谱及临床数据,将患者按FAM91A1表达量中位值(37.653)分成低表达组(n=550)和高表达组(n=551)。使用R 4.4.1软件包进行生存分析,比较FAM91A1高、低表达的乳腺癌患者的OS差异。采用Cox回归分析寻找乳腺癌患者OS的影响因素。分析FAM91A1与免疫检查点的相关性,同时使用Spearman相关性分析描述FAM91A1与肿瘤突变负荷的相关性。利用STRING网站及GEPIA2数据库构建FAM91A1相关基因数据集,采用GO及KEGG富集分析研究FAM91A1功能及相关通路,利用MiRTarbase数据库构建FAM91A1相关ceRNA网络并用StarBase数据库进行验证。结果TCGA数据库中FAM91A1 mRNA在正常人群、Luminal型、HER-2阳性型及三阴型乳腺癌患者中的表达差异有统计学意义(P<0.001)。生存分析显示,FAM91A1基因高表达组患者与低表达组患者的OS比较差异没有统计学意义(HR=1.36,95%CI:0.91~2.05,P=0.133)。Cox回归分析显示年龄(HR=1.453,95%CI:1.128~1.875,P=0.004)、临床分级(HR=1.773,95%CI:1.125~2.794,P=0.014)、M分期(HR=2.155,95%CI:1.365~3.403,P<0.001)和FAM91A1表达(HR=1.297,95%CI:1.031~1.631,P=0.026)是1101例乳腺癌患者OS的影响因素。免疫检查点LGLEC15、LAG3、PDCD1、HAVCR2、CD274、PDCD1LG2表达在FAM91A1高、低表达组间具有明显差异(P均<0.001),FAM91A1表达与肿瘤突变负荷呈正相关(P<0.001)。GO功能富集分析发现FAM91A1相关基因数据集多富集在小分子与脂质等代谢生物过程,在外部封装结构、细胞单元格边沿等细胞成分中,以及酶激活剂活性、GTP酶激活剂活性、金属肽酶活性等分子功能中。在KEGG通路富集分析中,FAM91A1相关基因多富集在ABC转运蛋白通路、脂肪酸代谢通路等。利用在线数据库,共得到1个miRNA(hsa-mir-15a-5p)和7个lncRNA(LINC01128、ERI3-IT1、FGD5-AS1、LINC02035、TUG1、XIST、ARMCX5-GPRASP2)组成的FAM91A1相关ceRNA网络。结论FAM91A1可能是乳腺癌的独立预后因子,且与免疫浸润、ABC转运蛋白通路及脂肪酸代谢密切相关。
-
关键词
乳腺肿瘤
生物信息学
预后
fam91a1
-
Keywords
Breast neoplasms
Bioinformatics
Prognosis
fam91a1
-
分类号
R737.9
[医药卫生—肿瘤]
-
