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FAM72基因家族与肝细胞癌预后及免疫浸润的相关性分析
1
作者 林坤鹏 巴明臣 +2 位作者 唐云强 王嘉康 林晓纯 《岭南现代临床外科》 2024年第1期14-25,共12页
目的探讨FAM72基因家族在肝细胞癌(HCC)中的表达情况及其与预后、免疫浸润的相关性。方法应用TCGA分析FAM72基因家族在HCC中的表达情况、与不同临床特征间的差异及其预后价值;TCGA和Kaplan⁃Meier plotter分析FAM72基因家族对HCC患者总... 目的探讨FAM72基因家族在肝细胞癌(HCC)中的表达情况及其与预后、免疫浸润的相关性。方法应用TCGA分析FAM72基因家族在HCC中的表达情况、与不同临床特征间的差异及其预后价值;TCGA和Kaplan⁃Meier plotter分析FAM72基因家族对HCC患者总生存期的影响;STRING构建FAM72基因家族蛋白相互作用网络;ssGSEA分析FAM72基因家族与免疫浸润细胞间的相关性;GEPIA分析FAM72基因家族与免疫细胞分子标志物及免疫检查点的相关性。结果HCC中FAM72⁃D的表达量显著高于正常肝组织(P<0.05)。FAM72A⁃D高表达组患者总生存率显著低于低表达组(P<0.05)。单因素/多因素回归分析和ROC曲线提示FAM72A⁃D可以作为影响HCC患者预后的独立危险因素(P<0.05)。蛋白互作网络分析结果提示FAM72A⁃D与多种蛋白一起参与HCC的发生发展。免疫浸润分析结果显示FAM72A⁃D表达水平与多数免疫细胞浸润水平及免疫细胞分子标志物有关,且与免疫检查点(PD⁃1、PD⁃L1、CTLA⁃4)有正相关关系。结论FAM72基因家族在HCC组织中高表达,并与免疫浸润、不良预后相关,可作为HCC预后的预测指标。 展开更多
关键词 肝细胞癌 fam72基因家族 预后 免疫浸润 生物信息学分析
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三维CT定量及定性参数与纯磨玻璃结节样肺腺癌TOP2A、BASP1、FAM72蛋白表达的相关性研究 被引量：11
2
作者 许双燕 冯涛 +1 位作者 曹宏伟 曹振东 《放射学实践》 CSCD 北大核心 2022年第5期543-549,共7页
目的:探讨纯磨玻璃结节(pGGN)样肺腺癌的三维CT定量及定性参数与拓扑异构酶2α(TOP2A)、脑酸溶性蛋白1(BASP1)、序列相似家族72成员(FAM72)蛋白表达间的相关性。方法:纳入行手术治疗的164例pGGN样肺腺癌患者作为研究对象,所有患者均行胸... 目的:探讨纯磨玻璃结节(pGGN)样肺腺癌的三维CT定量及定性参数与拓扑异构酶2α(TOP2A)、脑酸溶性蛋白1(BASP1)、序列相似家族72成员(FAM72)蛋白表达间的相关性。方法:纳入行手术治疗的164例pGGN样肺腺癌患者作为研究对象,所有患者均行胸部CT扫描,记录结节最长径、结节体积、平均CT值及是否出现分叶征、空泡征、血管集束征、充气支气管征、胸膜牵拉征和瘤肺界面模糊征。肺腺癌组织中的TOP2A、BASP1、FAM72蛋白表达水平采用免疫组织化学法进行测定。结果:164例肺腺癌患者中,TOP2A高表达94例(57.3%),低表达70例(42.7%);BASP1高表达88例(53.7%),低表达76例(46.3%);FAM72高表达96例(58.5%),低表达68例(41.5%)。单因素分析结果显示,TOP2A的表达水平与三维CT定量指标中的结节最长径、结节体积和结节平均CT值相关(P<0.05),与定性指标中的分叶征、血管集束征和充气支气管征有关(P<0.05);BASP1的表达水平与三维CT定量指标中的结节最长径和结节平均CT值有关(P<0.05),与定性指标中的分叶征、血管集束征、充气支气管征和胸膜牵拉征有关(P<0.05);FAM72的表达水平与三维CT定量指标中的结节平均CT值有关(P<0.05),与定性指标中的血管集束征、充气支气管征和胸膜牵拉征有关(P<0.05)。多因素二元Logistic分析结果显示,结节最长径、结节平均CT值和血管集束征是肺腺癌TOP2A高表达的独立预测因子(P<0.05),结节最长径、结节平均CT值、血管集束征和胸膜牵拉征是BASP1高表达的独立预测因子(P<0.05),结节平均CT值、血管集束征和充气支气管征是肺腺癌FAM72高表达的独立预测因子(P<0.05)。结论:三维CT定量及定性参数与pGGN肺腺癌TOP2A、BASP1、FAM72蛋白表达水平相关,有助于预测患者预后和制定临床治疗方案。 展开更多
关键词 肺腺癌 磨玻璃结节 体层摄影术 X线计算机 TOP2A BASP1 fam72
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基于多数据库分析FAM72A在肝癌中的表达及意义 被引量：2
3
作者 萧正康 马丹丹 +2 位作者 李中虎 张智勇 蔡逊 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2020年第7期1111-1117,共7页
目的基于多数据库探讨FAM72A在肝癌中的表达差异及临床意义。方法利用HPA数据库分析FAM72A在人正常组织表达概况和FAM72A在肿瘤细胞中的定位。采用GEPIA和Oncomine数据库分析FAM72A在人肝癌组织与人正常肝组织间的表达差异。利用LinkedO... 目的基于多数据库探讨FAM72A在肝癌中的表达差异及临床意义。方法利用HPA数据库分析FAM72A在人正常组织表达概况和FAM72A在肿瘤细胞中的定位。采用GEPIA和Oncomine数据库分析FAM72A在人肝癌组织与人正常肝组织间的表达差异。利用LinkedOmics平台分析FAM72A表达量与肝癌患者临床病理特征的关系。Kaplan-Meier Plotter平台分析FAM72A表达与患者预后的关系。联合cBioPortal和STRING数据库构建FAM72A在肝癌中的共表达分子调控网络,并使用DAVID平台进行共表达基因的KEGG通路富集分析和GO生物途经富集分析。结果FAM72A在人体正常肝组织中低表达,在肿瘤细胞中主要定位于囊泡、细胞膜及细胞质中。FAM72A在肝癌组织中表达高于正常肝组织(P<0.05)。FAM72A表达量与患者年龄(P=0.0068)、病理分期(P=0.018)、T分期(P=0.022)、人种(P=0.034)相关。FAM72A高表达组患者与低表达组患者相比预后更差(P=0.00012)。FAM72A在肝癌中的共表达基因集主要参与DNA转录、DNA转录的调控、细胞分裂、细胞核分裂等过程(FDR<0.05)。KEGG通路富集分析显示这些基因参与了细胞周期、RNA转运、剪接体、DNA复制、P53信号通路、碱基切除修复等相关通路(FDR<0.05)。构建了肝癌中FAM72A高度相关共表达分子的调控网络。结论FAM72A在肝癌组织中高表达,且高表达FAM72A患者的预后较差。FAM72A表达量与人种、年龄、病理分期相关,有望成为肝癌靶向治疗的新靶点和判断肝癌预后的新标志物。 展开更多
关键词 肝癌 fam72A 数据库挖掘 预后
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血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3在AFP阴性肝细胞癌患者中的表达及临床预后价值 被引量：2
4
作者 武彩虹 钱成荣 +3 位作者 银广悦 侯学伶 韩玉成 田雪梅 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第11期1353-1358,共6页
目的探讨血清外泌体长链非编码RNA(LncRNA)00853、LncRNA FAM72D-3在甲胎蛋白(AFP)阴性肝细胞癌(AFP-NHCC)患者中的表达及临床预后意义。方法选取2018年12月至2019年6月该院诊治的AFP-NHCC患者102例为AFP-NHCC组,以同期于该院行健康体... 目的探讨血清外泌体长链非编码RNA(LncRNA)00853、LncRNA FAM72D-3在甲胎蛋白(AFP)阴性肝细胞癌(AFP-NHCC)患者中的表达及临床预后意义。方法选取2018年12月至2019年6月该院诊治的AFP-NHCC患者102例为AFP-NHCC组,以同期于该院行健康体检的体检健康者80例为对照组。实时荧光定量PCR检测血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3水平;比较两组血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3水平,分析血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3水平与临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier生存分析血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3对AFP-NHCC患者生存预后的影响;采用单因素及多因素Cox回归分析影响AFP-NHCC患者生存预后的因素。结果AFP-NHCC组血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3相对表达水平分别为3.12±0.86、2.95±0.78,明显高于对照组的1.22±0.36、1.16±0.28(t=17.546、19.552,P<0.05)。血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3与AFP-NHCC患者BCLC分期、病理分化程度及肝内淋巴结转移有关(P<0.05)。LncRNA 00853高表达组患者中位生存时间为29.31个月(95%CI 26.36~32.26)明显低于低表达组患者的32.41个月(95%CI 32.55~34.51),差异有统计学意义(Log-rankχ^(2)=4.844,P=0.028)。LncRNA FAM72D-3高表达组患者中位生存时间为30.43个月(95%CI 27.81~33.04),明显低于低表达组患者的32.61个月(95%CI 30.64~34.76),差异有统计学意义(Log-rankχ^(2)=4.576,P=0.032)。BCLC分期B~C期、病理低分化程度、伴有肝内淋巴结转移、LncRNA 00853高表达及LncRNA FAM72D-3高表达是影响AFP-NHCC患者生存预后的独立危险因素。结论AFP-NHCC患者血清外泌体LncRNA 00853、LncRNA FAM72D-3水平升高,是影响AFP-NHCC生存预后的独立危险因素。 展开更多
关键词 血清外泌体 长链非编码RNA00853 长链非编码RNA fam72D-3 甲胎蛋白阴性肝细胞癌 预后
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FAM72D与肺腺癌筛查、预后及生物学机制分析 被引量：1
5
作者 郑泰浩 李明 +5 位作者 张晓月 彭媛 郭政军 黄秀 凌丰宇 杨镇洲 《重庆医学》 CAS 2021年第7期1081-1086,共6页
目的探讨FAM72D在肺腺癌(LUAD)中的表达变化及其与预后的关系,并进行生物学机制的预测。方法从TCGA获取原始数据,采用Kaplan-Meier生存分析、单变量Cox分析、多变量Cox分析、表达差异分析、临床相关性分析FAM72D在评估LUAD患者预后中的... 目的探讨FAM72D在肺腺癌(LUAD)中的表达变化及其与预后的关系,并进行生物学机制的预测。方法从TCGA获取原始数据,采用Kaplan-Meier生存分析、单变量Cox分析、多变量Cox分析、表达差异分析、临床相关性分析FAM72D在评估LUAD患者预后中的作用;采用基因集富集分析预测FAM72D的潜在作用机制,并利用TIMER数据库分析FAM72D与LUAD免疫浸润之间的相关性。结果FAM72D的高表达与LUAD患者的预后不良有关(P<0.05),是LUAD患者的独立预后指标。与正常肺组织比较,FAM72D表达在LUAD组织中明显上调,FAM72D高表达与高龄呈负相关,与男性、临床分期、T分期呈正相关,差异有统计学意义(P<0.05)。GSEA结果显示细胞周期、同源重组、剪接体、RNA降解、DNA复制、P53通路等相关基因集明显富集于FAM72D高表达。TIMER数据库分析显示,LUAD患者FAM72D表达水平与B细胞、巨噬细胞渗透水平呈负相关,与中性粒细胞的渗透水平呈正相关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论FAM72D可作为LUAD早期诊断和预测预后的生物标志物。 展开更多
关键词 肺腺癌 fam72D 诊断 预后 生物信息学
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