目的通过泛癌分析探讨序列相似性家族110成员B(family with sequence similarity 110 member B,FAM110B)在多种肿瘤中的表达水平及其与临床预后、肿瘤异质性和免疫相关基因表达等的相关性。方法采用TCGA和GTEx数据库比较FAM110B在泛癌...目的通过泛癌分析探讨序列相似性家族110成员B(family with sequence similarity 110 member B,FAM110B)在多种肿瘤中的表达水平及其与临床预后、肿瘤异质性和免疫相关基因表达等的相关性。方法采用TCGA和GTEx数据库比较FAM110B在泛癌组织和正常组织中的mRNA表达差异。SanggerBox平台和TISIDB数据库分析FAM110B mRNA表达水平与不同临床分期、组织学分级及患者总生存期的关系。cBioPortal数据库和GSCALite平台分析FAM110B的遗传变异,探讨其基因表达水平与免疫调节基因表达、免疫检查点、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和抗癌药物敏感性的相关性。qRT-PCR和Western blot检测FAM110B在胰腺癌细胞系中的mRNA和蛋白质表达水平。采用独立样本t检验评估组间差异的显著性,Spearman相关系数评价变量之间的相关性,生存分析采用Log-rank检验。结果FAM110B在多种肿瘤中异常表达(P<0.05),且与患者的总生存期相关,其中以胰腺癌最为显著(P<0.001)。体外试验结果显示FAM110B在胰腺癌细胞PANC-1中高表达(P<0.01),其表达量与病理T期和组织学分级相关(P<0.001)。此外,FAM110B mRNA表达水平还与多种免疫调节基因的表达水平相关,其在多种肿瘤中的mRNA表达与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性存在相关性(P<0.05)。结论FAM110B与多种癌症的预后、免疫和肿瘤异质性有关,在多种癌症的基础研究和临床治疗方面有一定的应用价值。展开更多
文摘目的通过泛癌分析探讨序列相似性家族110成员B(family with sequence similarity 110 member B,FAM110B)在多种肿瘤中的表达水平及其与临床预后、肿瘤异质性和免疫相关基因表达等的相关性。方法采用TCGA和GTEx数据库比较FAM110B在泛癌组织和正常组织中的mRNA表达差异。SanggerBox平台和TISIDB数据库分析FAM110B mRNA表达水平与不同临床分期、组织学分级及患者总生存期的关系。cBioPortal数据库和GSCALite平台分析FAM110B的遗传变异,探讨其基因表达水平与免疫调节基因表达、免疫检查点、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和抗癌药物敏感性的相关性。qRT-PCR和Western blot检测FAM110B在胰腺癌细胞系中的mRNA和蛋白质表达水平。采用独立样本t检验评估组间差异的显著性,Spearman相关系数评价变量之间的相关性,生存分析采用Log-rank检验。结果FAM110B在多种肿瘤中异常表达(P<0.05),且与患者的总生存期相关,其中以胰腺癌最为显著(P<0.001)。体外试验结果显示FAM110B在胰腺癌细胞PANC-1中高表达(P<0.01),其表达量与病理T期和组织学分级相关(P<0.001)。此外,FAM110B mRNA表达水平还与多种免疫调节基因的表达水平相关,其在多种肿瘤中的mRNA表达与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性存在相关性(P<0.05)。结论FAM110B与多种癌症的预后、免疫和肿瘤异质性有关,在多种癌症的基础研究和临床治疗方面有一定的应用价值。
