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水稻3-磷脂酰肌醇激酶FAB1/PIKfyve基因家族的鉴定及功能分析
1
作者
徐忆纯
梁婉琪
+1 位作者
王灿华
余婧
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第22期7309-7318,共10页
FAB1/PIKfyve是催化3-磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns3P)形成3,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns(3,5)P_(2))过程的关键酶,其产物PtdIns(3,5)P_(2)在真核细胞发育中发挥重要功能。为探寻PtdIns(3,5)P_(2)在水稻生殖发育过程中的功能,本研究结合生物信...
FAB1/PIKfyve是催化3-磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns3P)形成3,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns(3,5)P_(2))过程的关键酶,其产物PtdIns(3,5)P_(2)在真核细胞发育中发挥重要功能。为探寻PtdIns(3,5)P_(2)在水稻生殖发育过程中的功能,本研究结合生物信息学和遗传学方法,对水稻FAB1/PIKfyve基因进行鉴定,分析其理化性质、基因结构、保守结构域、系统进化、顺式作用元件和组织表达模式并利用CRISPR/Cas9基因编辑技术获得osfab1b突变体。生物信息学分析结果显示,水稻基因组中共鉴定到9个FAB1基因家族成员;基因结构分析显示FAB1家族基因结构存在差异,外显子数量为8~12个;保守结构域分析表明仅Os FAB1A和Os FAB1B含有N端FYVE结构域,其余成员具有Cpn60_(T)CP1结构域和PIPKc激酶结构域;系统进化分析提示FAB1家族功能在单双子叶植物中具有高度保守性;FAB1基因上游调控区域顺式元件预测发现多种生长发育相关、光响应以及激素和胁迫响应顺式元件;组织表达模式分析显示大多数FAB1基因为泛表达,其中FAB1C亚类基因在内外稃中的高表达提示其可能参与花器官发育。最后通过CRISPR/Cas9系统得到osfab1b突变体,经碘染观察花粉活力无明显异常,暗示FAB1家族在水稻生殖发育调控中存在功能冗余。本研究结果为单子叶模式植物水稻中磷脂酰肌醇调控网络及其生物学功能的研究提供了理论参考。
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关键词
水稻(Oryza
sativa)
fab1
/PIKfyve基因家族
3
5-二磷酸磷脂酰肌醇
CRISPR/Cas9
原文传递
磷酸肌醇激酶FAB1调控拟南芥根毛伸长
2
作者
姚玉婷
马家琦
+2 位作者
冯晓莉
潘建伟
王超
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期126-136,共11页
FAB1/PIKfyve是介导PI(3,5)P2(磷脂酰肌醇3,5-二磷酸)生物合成的磷酸肌醇激酶。在动物和酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,PI(3,5)P2参与调控胞内膜运输,但在植物中的研究较少。该文通过分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)FAB1的T-DNA...
FAB1/PIKfyve是介导PI(3,5)P2(磷脂酰肌醇3,5-二磷酸)生物合成的磷酸肌醇激酶。在动物和酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,PI(3,5)P2参与调控胞内膜运输,但在植物中的研究较少。该文通过分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)FAB1的T-DNA插入突变体的表型解析PI(3,5)P2的生物学功能。拟南芥FAB1基因家族包含FAB1A、FAB1B、FAB1C和FAB1D四个基因。研究发现,fab1a/b呈现雄配子体致死的表型。利用遗传杂交获得fab1b/c/d三突变体,发现FAB1B、FAB1C和FAB1D功能缺失导致根毛相比野生型变短,经FAB1特异性抑制剂YM201636处理后的野生型中也观察到相似的短根毛表型。此外,fab1b/c/d三突变体中DR5转录水平降低。同时,外源施加生长素类似物2,4-D和NAA能部分恢复fab1b/c/d植株短根毛的表型,但fab1b/c/d突变体对生长素转运抑制剂(1-NOA和TIBA)的敏感性与野生型相似。此外,FAB1B/C/D功能缺失使根毛中ROS的含量减少且影响肌动蛋白的表达。上述结果表明,FAB1B/C/D通过调控生长素分布、ROS含量和肌动蛋白的表达影响拟南芥根毛伸长。
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关键词
fab1
根毛
生长素
活性氧
肌动蛋白
拟南芥
原文传递
人源性胃癌抗体IgG1Fab噬菌体表面展示文库的构建
3
作者
韩者艺
何凤田
+6 位作者
陈宝军
乔泰东
王海燕
韩英
郑建勇
吴开春
樊代明
《第四军医大学学报》
北大核心
2001年第12期1061-1063,共3页
目的 利用噬菌体表面展示技术 ,构建人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .方法 从胃癌手术患者胃一级站淋巴结中提取总 RNA,反转录成 c DNA后 ,用PCR扩增人 Ig G1Fd段及κ轻链 ,并克隆至噬菌粒载体p COMB3中 ,转化宿主菌株 XL...
目的 利用噬菌体表面展示技术 ,构建人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .方法 从胃癌手术患者胃一级站淋巴结中提取总 RNA,反转录成 c DNA后 ,用PCR扩增人 Ig G1Fd段及κ轻链 ,并克隆至噬菌粒载体p COMB3中 ,转化宿主菌株 XL 1- Blue,以辅助噬菌体M13K0 7超感染噬菌粒文库 ,构建成人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .结果 得到一个含克隆数为 1.2× 10 6 ,实际滴度约为 2 .5 6× 10 1 5 pfu· L- 1的 Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库 .结论 Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库的成功构建 ,为下一步利用亲和富集筛选技术 。
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关键词
胃肿瘤
肿瘤
噬菌体
胃癌
IgG1Fab
展示文库
暂未订购
超级酷车——福特FAB 1
4
《汽车之友》
2004年第2期12-12,共1页
关键词
福特
fab1
汽车
车型设计
动力性能
车辆配置
操控性能
原文传递
题名
水稻3-磷脂酰肌醇激酶FAB1/PIKfyve基因家族的鉴定及功能分析
1
作者
徐忆纯
梁婉琪
王灿华
余婧
机构
上海交通大学生命科学技术学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第22期7309-7318,共10页
基金
国家重点研发项目(2016YFD0100902)
国家自然科学基金项目(31700276)。
文摘
FAB1/PIKfyve是催化3-磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns3P)形成3,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PtdIns(3,5)P_(2))过程的关键酶,其产物PtdIns(3,5)P_(2)在真核细胞发育中发挥重要功能。为探寻PtdIns(3,5)P_(2)在水稻生殖发育过程中的功能,本研究结合生物信息学和遗传学方法,对水稻FAB1/PIKfyve基因进行鉴定,分析其理化性质、基因结构、保守结构域、系统进化、顺式作用元件和组织表达模式并利用CRISPR/Cas9基因编辑技术获得osfab1b突变体。生物信息学分析结果显示,水稻基因组中共鉴定到9个FAB1基因家族成员;基因结构分析显示FAB1家族基因结构存在差异,外显子数量为8~12个;保守结构域分析表明仅Os FAB1A和Os FAB1B含有N端FYVE结构域,其余成员具有Cpn60_(T)CP1结构域和PIPKc激酶结构域;系统进化分析提示FAB1家族功能在单双子叶植物中具有高度保守性;FAB1基因上游调控区域顺式元件预测发现多种生长发育相关、光响应以及激素和胁迫响应顺式元件;组织表达模式分析显示大多数FAB1基因为泛表达,其中FAB1C亚类基因在内外稃中的高表达提示其可能参与花器官发育。最后通过CRISPR/Cas9系统得到osfab1b突变体,经碘染观察花粉活力无明显异常,暗示FAB1家族在水稻生殖发育调控中存在功能冗余。本研究结果为单子叶模式植物水稻中磷脂酰肌醇调控网络及其生物学功能的研究提供了理论参考。
关键词
水稻(Oryza
sativa)
fab1
/PIKfyve基因家族
3
5-二磷酸磷脂酰肌醇
CRISPR/Cas9
Keywords
Rice(Oryza sativa)
fab1
/PIKfyve gene family
Phosphatidylinositol 3
5-bisphosphate
CRISPR/Cas9
分类号
S511 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
磷酸肌醇激酶FAB1调控拟南芥根毛伸长
2
作者
姚玉婷
马家琦
冯晓莉
潘建伟
王超
机构
兰州大学生命科学学院
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期126-136,共11页
基金
国家自然科学基金(No.31801193)
国家自然科学基金重大研究计划-细胞器-培育(No.91754104)
+1 种基金
国家自然科学基金国际(地区)合作研究(No.31820103008)
兰州大学“中央高校基本科研业务费专项资金”自由探索项目(No.lzujbky-2018-28)。
文摘
FAB1/PIKfyve是介导PI(3,5)P2(磷脂酰肌醇3,5-二磷酸)生物合成的磷酸肌醇激酶。在动物和酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,PI(3,5)P2参与调控胞内膜运输,但在植物中的研究较少。该文通过分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)FAB1的T-DNA插入突变体的表型解析PI(3,5)P2的生物学功能。拟南芥FAB1基因家族包含FAB1A、FAB1B、FAB1C和FAB1D四个基因。研究发现,fab1a/b呈现雄配子体致死的表型。利用遗传杂交获得fab1b/c/d三突变体,发现FAB1B、FAB1C和FAB1D功能缺失导致根毛相比野生型变短,经FAB1特异性抑制剂YM201636处理后的野生型中也观察到相似的短根毛表型。此外,fab1b/c/d三突变体中DR5转录水平降低。同时,外源施加生长素类似物2,4-D和NAA能部分恢复fab1b/c/d植株短根毛的表型,但fab1b/c/d突变体对生长素转运抑制剂(1-NOA和TIBA)的敏感性与野生型相似。此外,FAB1B/C/D功能缺失使根毛中ROS的含量减少且影响肌动蛋白的表达。上述结果表明,FAB1B/C/D通过调控生长素分布、ROS含量和肌动蛋白的表达影响拟南芥根毛伸长。
关键词
fab1
根毛
生长素
活性氧
肌动蛋白
拟南芥
Keywords
fab1
root hair
auxin
ROS
actin
Arabidopsis thaliana
分类号
Q945 [生物学—植物学]
原文传递
题名
人源性胃癌抗体IgG1Fab噬菌体表面展示文库的构建
3
作者
韩者艺
何凤田
陈宝军
乔泰东
王海燕
韩英
郑建勇
吴开春
樊代明
机构
第四军医大学西京医院全军消化病研究所
第四军医大学西京医院胃肠外科
出处
《第四军医大学学报》
北大核心
2001年第12期1061-1063,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目 !(3 9870 742 )
文摘
目的 利用噬菌体表面展示技术 ,构建人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .方法 从胃癌手术患者胃一级站淋巴结中提取总 RNA,反转录成 c DNA后 ,用PCR扩增人 Ig G1Fd段及κ轻链 ,并克隆至噬菌粒载体p COMB3中 ,转化宿主菌株 XL 1- Blue,以辅助噬菌体M13K0 7超感染噬菌粒文库 ,构建成人源性胃癌抗体 Ig G1Fab噬菌体表面展示文库 .结果 得到一个含克隆数为 1.2× 10 6 ,实际滴度约为 2 .5 6× 10 1 5 pfu· L- 1的 Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库 .结论 Ig G1Fab片段的噬菌体表面展示文库的成功构建 ,为下一步利用亲和富集筛选技术 。
关键词
胃肿瘤
肿瘤
噬菌体
胃癌
IgG1Fab
展示文库
Keywords
stomach neoplasms
antibodies, neoplasms
bacteriophages
分类号
R730.3 [医药卫生—肿瘤]
R392-33 [医药卫生—免疫学]
暂未订购
题名
超级酷车——福特FAB 1
4
出处
《汽车之友》
2004年第2期12-12,共1页
关键词
福特
fab1
汽车
车型设计
动力性能
车辆配置
操控性能
分类号
U469.11 [机械工程—车辆工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻3-磷脂酰肌醇激酶FAB1/PIKfyve基因家族的鉴定及功能分析
徐忆纯
梁婉琪
王灿华
余婧
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
0
原文传递
2
磷酸肌醇激酶FAB1调控拟南芥根毛伸长
姚玉婷
马家琦
冯晓莉
潘建伟
王超
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
3
人源性胃癌抗体IgG1Fab噬菌体表面展示文库的构建
韩者艺
何凤田
陈宝军
乔泰东
王海燕
韩英
郑建勇
吴开春
樊代明
《第四军医大学学报》
北大核心
2001
0
暂未订购
4
超级酷车——福特FAB 1
《汽车之友》
2004
0
原文传递
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