基于转录组测序筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关候选基因

1

作者 岳山 赵秀华 +4 位作者 孙金艳 彭福刚 张元良 李满雨 刘国君 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第11期5254-5264,共11页

【目的】以浙东白鹅(♂)与浙籽鹅F1代(♀)杂交产生的浙籽鹅F2代母鹅为研究对象,分析浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液转录组数据,筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关的候选基因,为杂交鹅的繁殖调控提供参考。【方法】采集浙籽鹅F2代产蛋期和休产... 【目的】以浙东白鹅(♂)与浙籽鹅F1代(♀)杂交产生的浙籽鹅F2代母鹅为研究对象,分析浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液转录组数据,筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关的候选基因,为杂交鹅的繁殖调控提供参考。【方法】采集浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液样本,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序(RNA-Seq)分析。利用DESeq筛选差异表达基因(DEGs),对其进行GO功能和KEGG通路富集分析,筛选与繁殖性状相关的基因。随机挑选6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】转录组测序结果显示,在产蛋期与休产期两个比较组中存在差异表达的基因4576个,其中上调基因1821个,下调基因2755个。GO功能富集分析显示,共富集到9643个GO条目,在生物过程中主要富集在钙离子跨膜转运的正调节、吞噬作用的调节、阳离子跨膜转运的正向调节等条目;在分子功能上主要富集在转移酶活性、催化活性、嘌呤核苷三磷酸结合等条目;在细胞组分中主要富集在细胞内。KEGG通路富集分析显示,共富集到157条通路,主要富集在果糖和甘露糖代谢、烟酸盐和烟酰胺代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢等通路,筛选出ADCY 5、CD 44、CCND 1是与繁殖性状相关的候选基因。实时荧光定量PCR结果与转录组测序趋势相符合,证实转录组测序结果可靠。【结论】本研究通过转录组测序筛选到3个(ADCY 5、CD 44、CCND 1)与繁殖性状相关的候选基因,为研究浙籽鹅F2代繁殖性状相关基因的功能及后续分子调控机制提供依据。 展开更多

关键词 浙籽鹅f2代 转录组 信号通路 候选基因

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A型流感病毒中国分离株PB1-F2基因进化分析 被引量：4

2

作者 黄艳艳 胡北侠 +3 位作者 文心田 曹三杰 徐栋 张秀美 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期2156-2163,共8页

【目的】明确国内鸡源H9N2禽流感病毒(AIV)的PB1-F2基因分子进化特征,并进一步全面了解国内A型流感病毒(IAV)流行株的PB1-F2的流行情况。【方法】对分离自北方发病鸡群中的14株H9N2亚型AIV进行了PB1-F2基因的克隆和序列测定,并从GenBan... 【目的】明确国内鸡源H9N2禽流感病毒(AIV)的PB1-F2基因分子进化特征,并进一步全面了解国内A型流感病毒(IAV)流行株的PB1-F2的流行情况。【方法】对分离自北方发病鸡群中的14株H9N2亚型AIV进行了PB1-F2基因的克隆和序列测定,并从GenBank数据库下载了禽源、猪源和人源H5N1和H9N2亚型AIV、人源和猪源H1N1和H3N2IAV的PB1基因共计337个,系统的对国内不同宿主来源的IAV的PB1-F2基因进行了分子进化分析。【结果】上述IAV的PB1-F2基因形成了6个不同的进化分支。推导的PB1-F2蛋白表现出长度的多态性,因IAV的HA类型和宿主来源的不同,其表达功能性PB1-F2蛋白的比率也存在差异。【结论】本研究明确了国内IAV的PB1-F2基因的系统进化特征,为该基因功能的研究提供了分子流行病学资料。 展开更多

关键词 A型流感病毒 禽流感病毒 PB1-f2 进化分析

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野禽源AIV PB1-F2基因的遗传进化及部分氨基酸位点组成分析 被引量：1

3

作者 张进 李雁冰 +2 位作者 柴洪亮 张兰兰 华育平 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期674-680,共7页

在完成14株野禽源AIV PB1-F2基因克隆、测序的基础上,对其进行了同源性、遗传进化关系及氨基酸编码特征的比较分析。结果发现,H5N1亚型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1)PB1-F2的第37,48,50位氨基酸分别为精氨酸、脯... 在完成14株野禽源AIV PB1-F2基因克隆、测序的基础上,对其进行了同源性、遗传进化关系及氨基酸编码特征的比较分析。结果发现,H5N1亚型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1)PB1-F2的第37,48,50位氨基酸分别为精氨酸、脯氨酸、甘氨酸,与其他13个低致病性毒株均不相同(其分别为谷氨酰胺、谷氨酰胺、天冬氨酸)。为探讨这一现象,从NCBI Influenza Virus Resource中选取1 061个AIV毒株的PB1-F2基因序列进一步展开分析,结果表明:在第37,48,50位氨基酸位点上,97香港H5N1、其他H5N1及其他亚型AIV在此3个位点上氨基酸的构成存在着较为明显的差异,而且还呈现出了一定的规律和特点;并且研究还发现在此3个位点上,H9N2亚型毒株也表现出了较强的时间和空间分布特征。针对PB1-F2基因的遗传进化关系分析表明,H5N1及香港系毒株较其他AIV存在较远的遗传距离。随机的突变和重组似乎不足以解释这种差异及遗传距离形成的原因,其生物学意义有待于进一步探讨。 展开更多

关键词 野禽源禽流感病毒 PB1-f2基因 遗传进化 氨基酸组成

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广州地区新型H1N1流感病毒PB1-F2基因进化和变异分析

4

作者 冯发深 何霞 +5 位作者 王铸 徐霖 张定梅 关琳琳 邓瑜 曹开源 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期317-323,共7页

比较和分析2009～2011年广州地区分离到的甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因和世界各地甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因的变异情况,为该蛋白的功能和作用机制奠定基础。对分离自中国广州地区2009～2011年人类感染的17株新型H1N1和1株季节性H1N1流... 比较和分析2009～2011年广州地区分离到的甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因和世界各地甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因的变异情况,为该蛋白的功能和作用机制奠定基础。对分离自中国广州地区2009～2011年人类感染的17株新型H1N1和1株季节性H1N1流感病毒进行了PB1-F2基因克隆和序列测定,通过与GenBank数据库中68株人类新型H1N1和季节性H1N1流感病毒参考株的PB1-F2基因进行比对。结果表明,甲型流感病毒的PB1-F2基因进化树形成了2个不同的进化分支。全部2009～2011年新型H1N1流感病毒为一分支。广州地区PB1-F2基因与其它地区分离到的新型H1N1流感病毒具有高度的同源性,均为截短型变异。本实验室分离的1株季节性H1N1流感病毒也发生了第12位氨基酸截短突变。广州地区新型H1N1流感病毒PB1-F2截短蛋白与其它地区病毒相比未发生氨基酸变异,季节性H1N1流感病毒发现类似新型H1N1流感病毒PB1-F2的截短变异,提示新型H1N1流感病毒和季节性H1N1流感病毒PB1-F2可能发生早期重组。 展开更多

关键词 新型H1N1流感病毒 PB1-f2 进化分析

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粉尘螨主要变应原基因Der f2和Der f3基因改组的优化

5

作者 刘志明 姜玉新 李朝品 《热带病与寄生虫学》 2014年第1期3-6,共4页

目的优化粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因改组条件,以期获得粉尘螨变应原融合突变基因。方法 RT-PCR方法扩增粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因,用DnaseⅠ分别酶解Derf2和Derf3基因10、15、20、25、30min;酶解相同时间的Derf2和Derf3基因两两... 目的优化粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因改组条件,以期获得粉尘螨变应原融合突变基因。方法 RT-PCR方法扩增粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因,用DnaseⅠ分别酶解Derf2和Derf3基因10、15、20、25、30min;酶解相同时间的Derf2和Derf3基因两两混合,采用DNA shuffling技术对粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因进行重组,电泳检测重组子。结果以Derf1F和Derf1 R、Derf2 F和Derf2 R为引物分别在酶切10min、15min、20min、25min均可扩增出清晰条带;以Derf2 F和Der f3 R为引物在酶切10min、15min和30min的模板中亦出现PCR片段。结论通过多种条件的组合,可获得多个粉尘螨变应原Derf2和Derf3基因间的融合基因,为大规模制备高效,低价的哮喘疫苗奠定基础。 展开更多

关键词 DNA改组 Derf2 Derf3 融合基因 优化

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基于杂交F2代的家鸡经济性状研究进展 被引量：1

6

作者 赵净颖 闫世雄 +7 位作者 王秋婷 李涛 豆腾飞 张全富 柳明正 李琦华 葛长荣 贾俊静 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第11期39-42,46,共5页

家鸡F2代资源群是重要的实验模型,是按照特定的杂交选育方法产生的群体,具有遗传多样性丰富、群体性状高度分离的特点。在家鸡分子辅助选育中,家鸡F2代资源群被广泛用于影响家鸡经济性状的数量性状遗传位点(QTL)、单核苷酸(SNP)多态性... 家鸡F2代资源群是重要的实验模型,是按照特定的杂交选育方法产生的群体,具有遗传多样性丰富、群体性状高度分离的特点。在家鸡分子辅助选育中,家鸡F2代资源群被广泛用于影响家鸡经济性状的数量性状遗传位点(QTL)、单核苷酸(SNP)多态性、候选基因的筛选与鉴定的研究中,其结果可以有效地为家鸡分子选育提供理论依据。文章就国内外运用家鸡F2代资源群的研究结果进行综述,以期为家鸡分子辅助育种与开发利用提供更有力的理论依据。 展开更多

关键词 家鸡 f2代 经济性状 QTLS SNP 候选基因

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凝血酶原变异所致遗传性易栓症的研究进展

7

作者 文思源 周长青 《中外医学研究》 2025年第33期166-172,共7页

遗传性易栓症(IT)是一种由基因缺陷导致的疾病,其中,凝血酶原变异,即F2基因突变,是IT的常见类型之一。常见的凝血酶原变异包括G20210A、Arg596Leu、C20209T等,通过提高凝血酶活性或表达水平等机制,导致血液高凝。IT在临床上多表现为静... 遗传性易栓症(IT)是一种由基因缺陷导致的疾病,其中,凝血酶原变异,即F2基因突变,是IT的常见类型之一。常见的凝血酶原变异包括G20210A、Arg596Leu、C20209T等,通过提高凝血酶活性或表达水平等机制,导致血液高凝。IT在临床上多表现为静脉血栓栓塞(VTE),筛查重点为早发性、复发性及少见部位VTE以及有VTE家族史者。常规凝血检测无明显异常,需结合基因检测及蛋白C、蛋白S、抗凝血酶等综合评估。治疗上以抗凝为核心,部分高危患者往往需长期或终生用药,从而降低VTE复发风险。文章综述了目前已知的各种凝血酶原变异所致IT的流行病学、分子机制、临床表现及诊治策略。 展开更多

关键词 遗传性易栓症 f2 基因 凝血酶原 凝血因子 基因突变

暂未订购

猪CAST基因多态性与肌纤维组织学特性及屠宰性状的相关性分析 被引量：22

8

作者 武艳群 吴旧生 +2 位作者 赵晓枫 郭晓令 徐宁迎 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期65-69,共5页

采用3种限制性核酸内切酶对45头金皮(金华×皮特兰)F2代猪钙蛋白酶抑制蛋白基因(CAST)的第6外显子和第7外显子之间的片段进行了PCR-RFLP分析,结果显示在第6内含子内均检测到MspⅠ、HinfⅠ和RsaⅠ酶切多态性。根据酶切结果将CAST基... 采用3种限制性核酸内切酶对45头金皮(金华×皮特兰)F2代猪钙蛋白酶抑制蛋白基因(CAST)的第6外显子和第7外显子之间的片段进行了PCR-RFLP分析,结果显示在第6内含子内均检测到MspⅠ、HinfⅠ和RsaⅠ酶切多态性。根据酶切结果将CAST基因分为3种基因型(AACCEE、BBDDFF、ABCDEF),其基因型频率分别为0.1778,0.2222,0.6000。对背最长肌做连续性石蜡切片,分别采用苏木精-伊红和肌球蛋白重链免疫组织化学方法染色并拍照,ImageJ软件统计肌纤维横截面积、密度、直径及MHCⅠ型肌纤维的比例。采用SPSS程序分析了CAST不同基因型对金皮F2代猪肌纤维组织学特性和屠宰性状的影响。结果表明:BBDDFF基因型个体的肌纤维横截面积和眼肌面积显著地高于ABCDEF基因型个体的肌纤维横截面积和眼肌面积(P<0.05)。 展开更多

关键词 金皮f2代猪 CAST基因 肌纤维 免疫组织化学

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用RAPD方法分析水稻光敏核不育基因 被引量：36

9

作者 王京兆 王斌 +2 位作者 徐琼芳 杨代常 朱英国 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1995年第1期53-58,共6页

本文以农垦５８Ｓ与ＦＬ_２杂交所得的Ｆ_２分离群体为材料，按其育性分为不育和可育两大群体，分别以混合的可育群体核ＤＮＡ和不育群体核ＤＮＡ为模板，进行ＲＡＰＤ分析，从检测过的３００个引物中发现有２个引物在不育群体和可育群... 本文以农垦５８Ｓ与ＦＬ_２杂交所得的Ｆ_２分离群体为材料，按其育性分为不育和可育两大群体，分别以混合的可育群体核ＤＮＡ和不育群体核ＤＮＡ为模板，进行ＲＡＰＤ分析，从检测过的３００个引物中发现有２个引物在不育群体和可育群体中扩增出多态性产物。就其中一个引物对杂交亲本和Ｆ_２个体的ＲＡＰＤ分析进一步证明了这种多态的可靠性。转移杂交实验表明这个多态性产物是一种重复顺序。 展开更多

关键词 光敏核不育基因 RAPD 水稻

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PPARα基因对安卡×固始鸡资源群胴体品质的遗传效应分析 被引量：8

10

作者 田亚东 亢娟娟 +2 位作者 孙桂荣 韩瑞丽 康相涛 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第6期14-18,共5页

由793只安卡×固始鸡F2资源群为试验材料,采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法对PPARα基因的编码区进行SNP检测。结果发现,外显子4存在1个多态性位点,经限制性内切酶BspHⅠ酶切后显示出EE、EF、FF 3种基因型。利用SAS8.0软件分析不同... 由793只安卡×固始鸡F2资源群为试验材料,采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法对PPARα基因的编码区进行SNP检测。结果发现,外显子4存在1个多态性位点,经限制性内切酶BspHⅠ酶切后显示出EE、EF、FF 3种基因型。利用SAS8.0软件分析不同基因型对胴体品质的影响,结果表明,PPARα基因NC_006088:T32311C的多态性显著影响鸡的腹脂重和腹脂率(P<0.05),而对屠体重、皮下脂肪厚、肌间脂肪带宽、半净膛重和全净膛重等无显著影响(P>0.05)。EE型和EF型的腹脂重和腹脂率显著高于FF型(P<0.05),而EE型和EF型之间无显著差异(P>0.05)。PPARα基因影响脂肪代谢,可以作为分子标记用于鸡脂肪性状的分子标记辅助选择。 展开更多

关键词 鸡 f2资源群 PPARα基因 多态性 胴体品质

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1968-2014年中国甲型H3N2流感病毒PB1基因进化分析 被引量：4

11

作者 郭艳 颜文娟 +5 位作者 邓斐 余慧燕 王慎骄 汤奋扬 祁贤 卫平民 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期593-600,共8页

【目的】分析季节性H3N2流感病毒PB1基因序列的变异情况,揭示H3N2流感病毒PB1基因的分子特征与进化趋势。【方法】对1968-2014年中国地区82株人H3N2毒株、2012-2014年江苏省分离的81株甲型H3N2流感病毒、6株SIV和4株AIV H3N2亚型PB1、PB... 【目的】分析季节性H3N2流感病毒PB1基因序列的变异情况,揭示H3N2流感病毒PB1基因的分子特征与进化趋势。【方法】对1968-2014年中国地区82株人H3N2毒株、2012-2014年江苏省分离的81株甲型H3N2流感病毒、6株SIV和4株AIV H3N2亚型PB1、PB1-F2基因进行分子进化分析。【结果】1968-2014年中国H3N2流感毒株PB1核苷酸和氨基酸相似性分别为90.91%-100%和96.91%-100%。系统进化树分析,1968-2014年共173株H3N2流感病毒总体上分为4个分支,2002-2014年分离毒株位于第IV分支上,1968-1994年分离毒株位于第II和III分支;猪源H3N2亚型分布于第I、II、IV分支上;分子特征显示PB1氨基酸52、113、179、216、576、586、619、621、709位在2002年以后发生适应性改变,替换了原来的氨基酸;PB1-F2基因编码截断型蛋白长度有52、34、25、24、11 aa(猪源),PB1-F2蛋白毒力关键位点上未出现高致病性特征突变。【结论】自1968年起H3N2亚型PB1基因变异逐步趋于稳定,且PB1-F2截断型毒株正逐渐成为一类新的进化特征,但PB1基因与其他亚型之间发生重配以及关键毒力位点的变异仍应是监测的重点。 展开更多

关键词 H3N2流感病 PB1基因 PB1-f2蛋白 进化分析

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转基因抗虫水稻后代农艺性状变异的比较研究 被引量：8

12

作者 俞朝 冯英 薛庆中 《中国农学通报》 CSCD 2006年第10期75-79,共5页

采用群体分离法(Bulksergeantanalysis,BSA)和比较分析方法,以转基因水稻高代材料与非转基因水稻杂交得到的3个F2群体和1个DH群体为材料,分析遗传背景与外源基因对转基因水稻后代农艺性状变异的影响。结果发现,父本的遗传背景对农艺性... 采用群体分离法(Bulksergeantanalysis,BSA)和比较分析方法,以转基因水稻高代材料与非转基因水稻杂交得到的3个F2群体和1个DH群体为材料,分析遗传背景与外源基因对转基因水稻后代农艺性状变异的影响。结果发现,父本的遗传背景对农艺性状表现存在一定的影响;在消除环境因素影响的条件下,F2群体中外源基因对农艺性状变异起到重要作用,并促使农艺性状的分离程度增加。而DH群体中尽管外源基因促进株系变异系数增加,但对主要农艺性状变异的作用不显著。说明组织培养是产生农艺性状变异的主要原因,而外源基因的导入增加了农艺性状变异发生的机会。 展开更多

关键词 外源基因 水稻 农艺性状 DH群体 f2群体

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利用“永久F_2”群体进行小麦幼苗根系性状QTL分析 被引量：16

13

作者 李卓坤 彭涛 +2 位作者 张卫东 谢全刚 田纪春 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期442-448,共7页

为了研究小麦苗期根系性状的遗传,以小麦品种花培3号和豫麦57的杂交DH群体组配了一套含168个杂交组合的"永久F2"群体。利用WinRHIZO根系分析系统测定四叶一心期小麦水培幼苗根系总长度、直径、表面积、体积、根尖数、最大根... 为了研究小麦苗期根系性状的遗传,以小麦品种花培3号和豫麦57的杂交DH群体组配了一套含168个杂交组合的"永久F2"群体。利用WinRHIZO根系分析系统测定四叶一心期小麦水培幼苗根系总长度、直径、表面积、体积、根尖数、最大根长、茎叶干重、根干重及根茎干重比9个性状。采用复合区间作图法分析幼苗根系8个性状的QTL,定位了7个加性效应QTL和12对上位性互作QTL,包括加性效应、显性效应,加加互作、加显互作和显显互作,分布在1A、1D、2A、2B、2D、3A、3B、5D、6D和7D染色体上,单个QTL可解释0.01%～11.91%的遗传变异。在染色体2D上XWMC41至XBARC349.2区间检测到同时控制总根长和根干重的一个QTL。上位性对苗期根系生长发育有重要作用。试验结果表明,苗期根系性状的遗传机制较复杂,因此在育种中要综合考虑根系各性状之间的关系,保证根系协调统一、发达健壮。 展开更多

关键词 小麦 “永久f2”群体 根系性状 QTL定位 基因效应

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雄性不交换条件下F_2群体进行基因定位的计算方法 被引量：1

14

作者 李宏 《生物数学学报》 CSCD 2001年第1期114-121,共8页

本文提出在雄性不交换条件下，在Ｆ２群体中进行基因定位的计算方法．

关键词 雄性不变换 f2群体 基因定位 连锁值

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彩色小麦F_2代种皮颜色遗传规律 被引量：1

15

作者 何秀平 张正斌 +1 位作者 徐萍 杨引福 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期35-40,共6页

用蓝粒小麦和紫粒小麦杂交,对F2代单株和单穗粒色遗传分离比例进行分析表明,F2代疯狂分离,出现了多种分离类型。籽粒颜色分离强度在单株水平大于单穗水平,2种颜色分离大于3种颜色分离。紫蓝粒同穗主要受2对基因互作控制,基因间互作类型... 用蓝粒小麦和紫粒小麦杂交,对F2代单株和单穗粒色遗传分离比例进行分析表明,F2代疯狂分离,出现了多种分离类型。籽粒颜色分离强度在单株水平大于单穗水平,2种颜色分离大于3种颜色分离。紫蓝粒同穗主要受2对基因互作控制,基因间互作类型多少依次是抑制作用、互补作用和重叠作用。红蓝粒同穗主要受2对基因互作控制,其次是受1对基因控制,再次受3对基因互作控制;2对基因互作类型多少依次是互补作用、抑制作用和重叠作用。红紫粒同穗,红白粒同穗和蓝白粒同穗均由2对基因控制。各籽粒颜色间的显隐性关系是红粒对紫粒是显性,红粒和紫粒对蓝粒是显性,红粒、紫粒和蓝粒对白粒是显性。因此,除了紫粒表现果皮遗传,蓝粒表现花粉直感外,紫粒和蓝粒杂交后代中粒色还存在复杂的基因互作模式,基因剂量效应等遗传效应。 展开更多

关键词 彩色小麦 f2 种皮颜色 遗传比例 基因

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固始鸡与安卡鸡F_2资源群Myf5基因PCR-SSCP分析条件的优化

16

作者 黄煌 马新红 +4 位作者 康相涛 韩瑞丽 孙桂荣 亢娟娟 刘凯 《家畜生态学报》 2010年第1期34-37,共4页

为进行固始鸡与安卡鸡F2资源群Myf5基因的多态性研究,建立适合于该资源群的Myf5基因PCR-SSCP分析方法,对影响单链构象多态性(SSCP)图谱分辨率的凝`胶浓度、甘油浓度、电泳电压、电泳温度、电泳时间、PCR产物与上样缓冲液的比例、电泳缓... 为进行固始鸡与安卡鸡F2资源群Myf5基因的多态性研究,建立适合于该资源群的Myf5基因PCR-SSCP分析方法,对影响单链构象多态性(SSCP)图谱分辨率的凝`胶浓度、甘油浓度、电泳电压、电泳温度、电泳时间、PCR产物与上样缓冲液的比例、电泳缓冲液浓度、上样量等影响因素进行了比较系统的优化试验研究。结果表明:凝胶浓度10%、甘油浓度50%、上样量10μL、PCR产物与变性缓冲液比例为10∶10、电泳缓冲液为1×TBE、室温下300 V预电泳10 min后120 V电压电泳16 h,染色后条带细而清晰,能够准确分辨各基因型,为试验SSCP分析的最佳条件组合。 展开更多

关键词 固始鸡与安卡鸡f2资源群 Myf5基因 PCR-SSCP 正交试验 分析条件优化

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绵羊Myf5基因多态性与胴体性状的相关性分析 被引量：2

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作者 任思睿 任亭亭 +6 位作者 胡慧宇 刘明军 李文蓉 张宁 张雪梅 刘晨曦 贺三刚 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第2期38-42,135,共6页

为研究特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊Myf5基因多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)及其与胴体性状之间的关系,试验采用PCR测序技术和飞行时间质谱检测分型方法对434只特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊的Myf5基因SNPs进... 为研究特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊Myf5基因多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)及其与胴体性状之间的关系,试验采用PCR测序技术和飞行时间质谱检测分型方法对434只特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊的Myf5基因SNPs进行分型,并将分型结果与其胴体性状(胴体重、胴体长、踝骨宽、臀宽、胸宽、肩宽和胸深)进行关联分析。结果表明:在Myf5基因上共发现了5个SNPs位点,即A116460176G、rs604841316、rs416158998、rs588855095和rs412277497。其中rs416158998属于内含子突变,在特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊中表现为中度多态[0.25<多态信息含量(PIC)<0.5],不处于Hard-Weinberg平衡状态(P≤0.05),与胸宽、肩宽和臀宽呈显著或者极显著相关(P<0.05或P<0.01)。rs588855095属于内含子突变,在绵羊中表现为低度多态(PIC≤0.25),处于Hard-Weinberg平衡状态(P>0.05),与臀宽呈显著相关(P<0.05)。rs412277497属于外显子上丝氨酸到半胱氨酸的错义突变,在绵羊中表现为中度多态(0.250.05),与胴体长、胸宽和肩宽呈显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01)。A116460176G和rs604841316与胴体性状相关性不显著(P>0.05)。说明Myf5基因中rs416158998、rs588855095和rs412277497位点可以为培育优良新品种绵羊提供可参考的遗传标记。 展开更多

关键词 特克赛尔×哈萨克横交f2代绵羊 Myf5基因 核苷酸多态性 胴体性状 相关性分析

原文传递

绵羊MyoG基因多态性与胴体体尺性状的相关性分析 被引量：2

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作者 任思睿 胡慧宇 +6 位作者 任亭亭 刘明军 李文蓉 张宁 张雪梅 刘晨曦 贺三刚 《草食家畜》 2021年第6期1-9,共9页

MyoG基因是对与产肉性状相关的重要候选基因之一。筛选MyoG基因与胴体体尺性状相关的遗传变异分子标记,对开展肉用生产性状分子选育具有重要的意义。本研究以特克塞尔×哈萨克横交F2代绵羊为实验群体,进行MyoG基因的SNPs多态性与胴... MyoG基因是对与产肉性状相关的重要候选基因之一。筛选MyoG基因与胴体体尺性状相关的遗传变异分子标记,对开展肉用生产性状分子选育具有重要的意义。本研究以特克塞尔×哈萨克横交F2代绵羊为实验群体,进行MyoG基因的SNPs多态性与胴体体尺性状之间的相关性分析。首先,随机选择50只特哈横交F2代绵羊,采用DNA双向测序技术筛选MyoG基因单核苷酸多态位点(SNPs),得到6个SNP位点。然后,采用Sequenom MassARRAY○RSNP检测方法对384只绵羊MyoG基因6个SNPs进行分型。并将得到434只绵羊的6个SNPs基因型与其胴体重、胴体长、胸宽、肩宽、胸深、臀宽和踝骨宽7个胴体性状进行关联分析结果显示MyoG基因rs407552631、rs40016030、rs600781279和rs4102122554个SNPs与胴体体尺性状相关,它们均位于内含子区域。其中,rs600781279中的GG和AG与个体踝骨宽显著相关;rs407552631中的GT和TT与胴体长、肩宽、臀宽和踝骨宽显著相关;rs410212255中的GA和GG与胸深显著相关;rs400160301中的GA与胴体长、臀宽和踝骨宽显著相关,AA与胴体长、肩宽、胸深、臀宽和踝骨宽显著相关,GG与肩宽、胸深和臀宽显著相关。本研究为今后绵羊胴体性状分子选育提供了参考。 展开更多

关键词 MYOG基因 特哈杂交f2代 SNP 胴体性状 相关性分析

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MSTN基因g+6723G>A位点与胴体体尺、不同部位肌肉重等胴体性状的关联分析 被引量：1

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作者 雷熙 刘晨曦 +4 位作者 贺三刚 彭新荣 毛林军 刘明军 齐·阿拉达尔 《草食家畜》 2022年第6期1-8,共8页

为探究MSTN基因g+6723G>A对绵羊胴体相关性状的影响。本文以Texel×Altay杂交进行MSTN基因的导入,经繁殖后的横交F2代羊为实验群体,对208只F2代羔羊体重、体尺及胴体性状指标进行测量和关联分析。横交F2代羊MSTN基因3’UTR检测出... 为探究MSTN基因g+6723G>A对绵羊胴体相关性状的影响。本文以Texel×Altay杂交进行MSTN基因的导入,经繁殖后的横交F2代羊为实验群体,对208只F2代羔羊体重、体尺及胴体性状指标进行测量和关联分析。横交F2代羊MSTN基因3’UTR检测出3种基因型,两个等位基因。其基因型频率以AG型最高,G为优势等位基因;分析发现,不同基因型中AA基因型的体重、胴体重、左带臀腿重量显著高于GA与GG基因型(P<0.05),GG基因型尾部脂肪显著高于AA基因型(P<0.05),GA基因型尾部脂肪与GG基因型无差异显著(P>0.05),在不同基因型间AA与GG基因型出生重、眼肌长、臀宽差异显著(P<0.05),其他指标无显著差异(P>0.05)。本研究结果表明,MSTN基因g+6723G>A位点对绵羊的生长性状有影响,该位点可作为绵羊生长发育的候选遗传标记,为绵羊选种选育提供重要参考。 展开更多

关键词 绵羊 MSTN基因 横交f2代 生长性状 基因型频率

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利用PCR-SSCP方法检测滩湖杂交羊F_2代Fec^B基因 被引量：4

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作者 于洋 梁小军 高蕙兰 《畜牧与饲料科学》 2018年第9期1-3,共3页

为开展滩羊多胎新品种(系)培育工作,采用PCR-SSCP方法对549份滩湖杂交羊F_2代血液样品中的Fec^B基因进行检测。结果表明,检测样本中不存在BB基因型,B+基因型频率为52%,++基因型频率为48%,等位基因B的频率为26%,等位基因B+的频率为74%。... 为开展滩羊多胎新品种(系)培育工作,采用PCR-SSCP方法对549份滩湖杂交羊F_2代血液样品中的Fec^B基因进行检测。结果表明,检测样本中不存在BB基因型,B+基因型频率为52%,++基因型频率为48%,等位基因B的频率为26%,等位基因B+的频率为74%。提示结合传统选种方法,选留B+基因型的公母羊交配,可显著改善滩羊Fec^B基因的基因型结构和基因频率,有利于提高群体的产羔数量。 展开更多

关键词 滩湖杂交羊f2代 Fec^B基因 PCR-SSCP 基因型频率

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