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小麦F-box/LRR类基因TaFBL14的抗逆相关表达模式及互作蛋白鉴定 被引量：5
1
作者 魏春茹 孟钰玉 +5 位作者 范润侨 李虎滢 赵伟全 于秀梅 康振生 刘大群 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期886-894,共9页
F-box家族是植物中最大的蛋白质家族之一,广泛参与植物生长发育、自交不亲和、衰老、生物/非生物胁迫等多个生物学过程。拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)等模式植物中F-box家族的研究开展较早,认识比较全面,但对重要... F-box家族是植物中最大的蛋白质家族之一,广泛参与植物生长发育、自交不亲和、衰老、生物/非生物胁迫等多个生物学过程。拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)等模式植物中F-box家族的研究开展较早,认识比较全面,但对重要的粮食作物小麦(Triticum aestivum)中F-box家族的报道还比较少。为了解F-box家族成员在小麦中响应生物/非生物逆境的情况及具体作用机制,以本实验室前期获得的F-box基因TaFBL14为研究对象,探讨了该基因在3种激素和3种非生物逆境处理下的表达模式。实时定量PCR (qRT-PCR)结果表明,水杨酸(SA)、脱落酸(ABA)、茉莉酸甲酯(MeJA)三种激素以及氯化钠(NaCl)、过氧化氢(H2O2)、聚乙二醇6000 (PEG6000)三种逆境胁迫处理后, Ta FBL14基因均呈现先升高后降低的表达趋势。经三种激素处理后,TaFBL14的表达峰值均为处理后12 h,相对于SA和ABA两种激素处理, MeJA处理可诱导TaFBL14更高的表达水平;在三种逆境胁迫下,相对于H2O2和PEG6000处理, NaCl可诱导TaFBL14更高的表达水平,且峰值出现在处理后6 h。本研究构建了酵母载体pGBKT7-TaFBL14,并以之为诱饵筛选了非亲和叶锈菌(Puccinia triticina) 05-19-43②侵染的小麦TcLr15叶片的酵母cDNA文库;钓取了11类可能与TaFBL14互作的靶蛋白;进一步的回转验证及β-半乳糖苷酶检测结果表明, TaFBL14与TaChitinase 2 (TaChi 2)存在相互作用。研究结果拓宽了对小麦中富含亮氨酸(LRR)类F-box基因功能的认识,拟为深入解析小麦中F-box/LRR基因的功能及代谢网络提供参考。 展开更多
关键词 小麦 f-box/lrr TaFBL14 表达模式 蛋白互作
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油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析 被引量：4
2
作者 左蓉 吴姗 +5 位作者 刘杰 胡鸣 程晓晖 刘越英 白泽涛 刘胜毅 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期503-514,共12页
由核盘菌引起的菌核病是一种重要的真菌性病害,筛选菌核病抗病基因对抗病育种具有重要意义。F-box基因多参与植物抗逆反应,LRR作为抗病基因的重要结构域,在植物抗病防卫中起着重要的作用。本研究通过生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中... 由核盘菌引起的菌核病是一种重要的真菌性病害,筛选菌核病抗病基因对抗病育种具有重要意义。F-box基因多参与植物抗逆反应,LRR作为抗病基因的重要结构域,在植物抗病防卫中起着重要的作用。本研究通过生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中对F-box-LRR基因进行了全基因组鉴定,基于已发表的中双11组织表达数据以及油菜不同品种中油821(抗病)和Westar(感病)接种核盘菌前后的转录组数据,对可能响应核盘菌诱导的BnF-box-LRR基因进行筛选,并结合荧光定量PCR进行验证。共鉴定到161个BnF-box-LRR基因,从系统进化树上可分为4个亚类(FBXLRR1,FBXLRR2,FBXLRR3和FBXLRR4),其中第四亚类FBXLRR4在蛋白保守序列分布以及基因结构方面,与其它三个亚类具有较大差异,且与拟南芥参与植物抗逆的同源基因聚为一类,因此推测该分支可能主要参与植物胁迫响应。表达分析表明FBXLRR4家族基因在根和叶中有较高的表达水平,且在核盘菌诱导后具有明显的表达变化,暗示这些基因可能参与油菜菌核病抗性功能。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 f-box-lrr基因家族 菌核病 基因表达
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丹参FBXL基因家族的鉴定和表达模式分析
3
作者 姚瑞阳 于海征 +1 位作者 李耀盺 张磊 《药学实践与服务》 CAS 2024年第11期461-470,共10页
目的基于基因组数据鉴定丹参F-box-LRR(FBXL)基因家族,并对其进行生物信息学与表达模式分析,为进一步深入阐明其基因功能提供依据。方法从丹参基因组数据库中鉴定出SmFBXL基因,运用生物信息学方法及在线工具分析其基因结构特征,启动子... 目的基于基因组数据鉴定丹参F-box-LRR(FBXL)基因家族,并对其进行生物信息学与表达模式分析,为进一步深入阐明其基因功能提供依据。方法从丹参基因组数据库中鉴定出SmFBXL基因,运用生物信息学方法及在线工具分析其基因结构特征,启动子顺式作用元件,编码的蛋白理化性质、系统进化、组织表达等。结果从丹参的基因组中共鉴定出104个SmFBXL基因(SmFBXL1~SmFBXL104),不均等分布于8条染色体上,上游启动子含有与植物抗逆、生长发育和激素应答等相关的顺式作用元件。构建丹参、拟南芥和大豆的FBXL家族成员的系统发育树,将104个SmFBXL基因分为7个亚族。通过同源进化分析,猜测SmFBXL36可能参与防御病原菌入侵,SmFBXL86、SmFBXL79可能在调控丹参侧根生长中起重要作用,SmFBXL11、SmFBXL40可能调节下胚轴生长。转录组数据显示SmFBXL基因在丹参不同组织中差异表达,其中13个SmFBXL基因在根和叶中的表达水平较高,可作为后续研究SmFBXL基因家族的候选基因。结论研究结果为进一步解析SmFBXL基因在丹参逆境响应及次生代谢产物生物合成中的调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 丹参 f-box-lrr基因家族 生物信息学 功能分析
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