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准噶尔盆地大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3多态性分析
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作者 麦迪娜·肖开提 牟文婷 +5 位作者 古丽阿依·包开西 罗勇军 肖吾开提·塞麦提 阿布力克木·阿布都热西提 王信惠 王启果 《热带医学杂志》 2025年第7期905-909,共5页
目的分析准噶尔盆地鼠疫疫源地内大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3的多态性,探索其鼠疫抗性差异的遗传基础。方法在准噶尔盆地东部的奇台县、阜康市和木垒哈萨克自治县捕获大沙鼠和子午沙鼠,经鼠疫菌分离培养和血清鼠疫F1抗体检测证实阴... 目的分析准噶尔盆地鼠疫疫源地内大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3的多态性,探索其鼠疫抗性差异的遗传基础。方法在准噶尔盆地东部的奇台县、阜康市和木垒哈萨克自治县捕获大沙鼠和子午沙鼠,经鼠疫菌分离培养和血清鼠疫F1抗体检测证实阴性后提取其脾脏组织DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增RT1-DMb*exon3并测序。使用ClustalW 1.83软件进行序列的多重比对分析,使用Mega 4.0软件分析不同序列的核苷酸和氨基酸组成,采用Kimura双参数模型计算遗传距离;使用DnaSP 6.0软件计算遗传多样性参数;使用Arlequin 3.0软件中的分子变异分析(AMOVA)对遗传分化指数(FST)进行检验。使用SPSS 22.0统计学软件,以t检验或MannWhitney U检验分析大沙鼠与子午沙鼠在碱基含量和氨基酸组成方面的差异。结果大沙鼠与子午沙鼠在核苷酸组成(G%:t=-2.810,P=0.010;T%:Z=4.235,P<0.001;C%:t=-2.525,P=0.020)、单核苷酸多态性位点数量和分布(大沙鼠检出4个核苷酸多态性位点,分别位于第7、202、299、313位碱基上;子午沙鼠检出10个核苷酸多态性位点,分别位于第93、138、204、298、384、411、435、126、165、329位碱基上)、单倍型数量(大沙鼠6个,子午沙鼠10个)方面存在显著差异。大沙鼠核苷酸多样性指数(π)为(0.0040±0.0004)、单倍型多样性指数(h)为(0.8330±0.0710)、平均核苷酸差异数(K)为1.7440,子午沙鼠的π、h、K分别为(0.0090±0.0010)、(1.0000±0.0450)、3.9780。大沙鼠与子午沙鼠的FST为0.920,二者存在很大的遗传分化,且大沙鼠的FST显著小于子午沙鼠(0.027 vs.0.202),提示子午沙鼠相较于大沙鼠具有更大的遗传分化。结论准噶尔盆地鼠疫疫源地内子午沙鼠相较于大沙鼠具有更高的基因多态性和更大的遗传分化,这可能与子午沙鼠较低的鼠疫感染率有关。 展开更多
关键词 大沙鼠 子午沙鼠 鼠疫抗性 RT1-DMb*exon3
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ERBB2 Exon20插入突变在晚期NSCLC患者接受一线化疗联合免疫治疗中的预后价值
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作者 王渊 张立 邱志新 《中国呼吸与危重监护杂志》 2025年第9期628-635,共8页
目的探讨ERBB2 Exon20插入突变(Exon20ins)在晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者接受一线化疗联合免疫治疗中的预后价值。方法回顾性分析2020年至2024年于四川大学华西医院接受一线化疗联合免疫治疗的ERBB2突变的... 目的探讨ERBB2 Exon20插入突变(Exon20ins)在晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者接受一线化疗联合免疫治疗中的预后价值。方法回顾性分析2020年至2024年于四川大学华西医院接受一线化疗联合免疫治疗的ERBB2突变的Ⅳ期NSCLC患者临床资料,并根据倾向性评分匹配ERBB2野生型患者,比较不同突变状态患者的临床病理特征、远处转移部位及治疗效果,主要评价指标为无进展生存期(progression-free survival,PFS),并使用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,Cox回归分析调整混杂因素。结果本研究纳入41例ERBB2突变的Ⅳ期NSCLC患者,其中22例为Exon20ins突变,19例为ERBB2其他类型突变,匹配了41例同期治疗的ERBB2野生型患者。所有患者平均年龄为(60.0±9.3)岁,男61例(74.4%)。67例(81.7%)患者接受了化疗联合免疫治疗,15例(18.3%)患者接受了化疗联合免疫治疗和抗血管生成治疗。Exon20ins组的淋巴结转移比例较ERBB2其他突变组和ERBB2野生型组升高(36.4%vs.15.8%vs.9.8%,P=0.045)。Exon20ins组中位PFS显著短于其他突变组(5.8个月vs.10.3个月,P=0.025)和野生型组(5.8个月vs.8.3个月,P=0.023)。单因素Cox回归结果表明ERBB2 Exon20ins突变是预后的不良因素(Exon20ins vs.其他ERBB2突变,HR=2.9,95%CI1.18~7.1,P=0.014;Exon20ins vs.野生型,HR=2.6,95%CI 1.25~5.6,P=0.014),而是否联合抗血管生成治疗并不影响PFS的预后(HR=0.66,95%CI 0.28~1.6,P=0.363);Cox多因素分析显示,ERBB2 Exon20ins突变为PFS的独立不良预后因素(Exon20ins vs.其他ERBB2突变,HR=3.3,95%CI 1.27~8.3,P=0.015;Exon20ins vs.野生型,HR=2.7,95%CI 1.2~5.88,P=0.014)。对化疗联合免疫治疗的67例患者的Cox回归结果表明ERBB2 Exon20ins突变仍与晚期NSCLC不良预后相关(Exon20ins vs.其他ERBB2突变,HR=3.2,95%CI 1.12~9.1,P=0.030;Exon20ins vs.野生型,HR=2.5,95%CI 1~5.88,P=0.040)。结论合并ERBB2 Exon20ins突变亚型的晚期NSCLC患者较合并其他ERBB2突变亚型和ERBB2野生型的晚期NSCLC患者使用一线化疗联合免疫治疗的预后更差,提示ERBB2 Exon20ins突变作为一种特殊的难治性突变类型,需要基于分子分型探索新型联合策略以改善生存结局。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 ERBB2 Exon20插入突变 无进展生存期 预后
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Significance of monitoring imatinib plasma concentration in secondline treatment decisions for c-kit 11 gene-mutated gastrointestinal stromal tumors
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作者 Hai-Tao Li Yun-Yun Du +2 位作者 Zhen Huang Jin-Jin Li Jun Zhang 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 2025年第3期81-90,共10页
BACKGROUND For patients with advanced gastrointestinal stromal tumors(GISTs)carrying the ckit exon 11 mutation,imatinib(IM)at a standard dosage of 400 mg per day is the preferred first-line treatment.In cases where tr... BACKGROUND For patients with advanced gastrointestinal stromal tumors(GISTs)carrying the ckit exon 11 mutation,imatinib(IM)at a standard dosage of 400 mg per day is the preferred first-line treatment.In cases where treatment with IM fails,there is an urgent need for a more precise assessment method to determine whether to switch therapies or escalate the IM dosage.This approach will enhance clinical decision-making and optimize patient outcomes.AIM To investigate IM plasma concentration’s role in second-line treatment decisions for c-kit 11-mutated advanced GISTs post-IM failure.METHODS Patients with advanced GIST harboring c-kit 11 mutation who experienced failure with IM 400 mg per day as first-line treatment at our hospital were retrospectively analyzed.Patients were categorized into a low plasma(LP)concentration group(LP group,<1100 ng/mL)and high plasma(HP)concentration group(HP group,≥1100 ng/mL).Each group was further subdivided into Group A(dose-escalation group)and Group B(drug-switch group).Baseline characteristics were compared and Kaplan-Meier curves were used to analyze the survival of patients.RESULTS Seventy-five patients were included in the analysis.For the LP group(n=28),Group A(n=14)had longer overall survival(OS)than Group B(n=14)(P=0.02).No differences were observed between the two subgroups in disease control rate(DCR),objective response rate,and progression-free survival(PFS)(P>0.05).For the HP group(n=47),Group B(n=18)had a higher DCR and longer PFS than Group A(n=29)(P=0.008 and P=0.03,respectively).No difference in OS was observed between the two subgroups(P>0.05).CONCLUSION Increasing IM dosage for c-kit 11-mutated advanced GISTs post-IM failure may prolong OS if plasma concentration is<1100 ng/mL.Switching tyrosine kinase inhibitors may improve DCR and PFS if≥1100 ng/mL. 展开更多
关键词 Gastrointestinal stromal tumor C-kit exon 11 IMATINIB Plasma concentration Second-line treatment
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Expert consensus on the diagnosis and treatment of non-small cell lung cancer with MET alteration
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作者 Huijing Feng Yang Xia +106 位作者 Wenxian Wang Chunwei Xu Qian Wang Zhengbo Song Ziming Li Jinpu Yu Wenzhao Zhong Zhijie Wang Yongchang Zhang Jingjing Liu Shirong Zhang Xiuyu Cai Anwen Liu Wen Li Ping Zhan Hongbing Liu Tangfeng Lyu Liyun Miao Lingfeng Min Gen Lin Long Huang Jingping Yuan Zhansheng Jiang Xingxiang Pu Chuangzhou Rao DongqingLyu Zongyang Yu Xiaoyan Li Chuanhao Tang Chengzhi Zhou Qi Mei Hui Guo Qian Chu Rui Meng Xuewen Liu Jingxun Wu Jin Zhou Zhengfei Zhu Weiwei Pan Fei Pang Meizhen Hu Kai Wang Fan Wu Bingwei Xu Ling Xu Liping Wang Youcai Zhu Jisheng Li Yanru Xie Xinqing Lin Jing Cai Lin Wang Yingying Du Wang Yao Xuefei Shi Xiaomin Niu Dongmei Yuan Yanwen Yao Jing Kang Jiatao Zhang Chao Zhang Wenbin Gao Jianhui Huang Yinbin Zhang Pingli Sun Hong Wang Mingxiang Ye Dong Wang Zhaofeng Wang Yue Hao Zheng Wang Bing Wan Donglai Lyu Xiaodong Jiao Lin Shi Gang Lan Shengjie Yang Yanhong Shang Yina Wang Bihui Li Gang Jin Kang Zheng Jun Ma Wenfeng Li Zhang Zhang Zhongwu Li Yuan Li Zhefeng Liu Xuelei Ma Nong Yang Lin Wu Qiming Wang Guansong Wang Zhuan Hong Jiandong Wang Meiyu Fang Yong Fang Xixu Zhu Yi Shen Ke Wang Xiubao Ren Yiping Zhang Shenglin Ma Junping Zhang Yong Song Wenfeng Fang Yuanzhi Lu 《Cancer Biology & Medicine》 2025年第3期237-265,共29页
Alterations in the mesenchymal-epithelial transition factor(MET)gene are critical drivers of non-small cell lung cancer(NSCLC).In recent years advances in precision therapies targeting MET alterations have significant... Alterations in the mesenchymal-epithelial transition factor(MET)gene are critical drivers of non-small cell lung cancer(NSCLC).In recent years advances in precision therapies targeting MET alterations have significantly expanded treatment options for NSCLC patients.These alterations include MET exon 14 skipping mutations(MET exon 14 skipping),MET gene amplifications,MET point mutations(primarily kinase domain mutations),and MET protein overexpression.Accurate identification of these alterations and appropriate selection of patient populations and targeted therapies are essential for improving clinical outcomes.The East China Lung Cancer Group,Youth Committee(ECLUNG YOUNG,Yangtze River Delta Lung Cancer Cooperation Group)has synthesized insights from China’s innovative drug development landscape and clinical practice to formulate an expert consensus on the diagnosis and treatment of NSCLC patients with MET alterations.This consensus addresses key areas,such as optimal testing timing,testing methods,testing strategies,quality control measures,and treatment approaches.By offering standardized recommendations,this guidance aims to streamline diagnostic and therapeutic processes and enhance clinical decision-making for NSCLC with MET alterations. 展开更多
关键词 Mesenchymal-epithelial transition factor MET exon 14 skipping mutation MET amplification non-small cell lung cancer precision medicine targeted therapy tyrosine kinase
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12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析 被引量:6
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作者 袁峰 苗永旺 +4 位作者 李大林 汤守锟 许政 霍金龙 祁宏 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期575-580,共6页
催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个... 催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个核苷酸组成,在不同物种中具有高度保守性。序列分析发现水牛中该外显子的第109位碱基处有C>T替换,为沉默突变,与泌乳性状之间无显著相关性。在9个沼泽型水牛群体中均检测到该突变位点,其中PBA基因在7个沼泽型水牛群体中为优势基因,PBB基因在德宏和富钟群体中为优势基因,沼泽型水牛群体中PBA基因频率在0.400~0.917之间,群体平均值为0.629±0.049,具有地域分布特征。在3个河流型水牛群体中,第109位核苷酸处均为C,未检测到多态。提示河流型水牛与沼泽型水牛已有较大的遗传分化。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 催乳素 Exon4 测序 PCR-SSCP
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西农萨能羊乳腺脂肪酸合酶基因exon 9-15的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 王海滨 罗军 +3 位作者 武会娟 韩雪峰 单翠燕 张宁 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期828-833,共6页
【目的】山羊FAS基因exon 9-15编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶(acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT)区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15进行克隆和序列分析。【... 【目的】山羊FAS基因exon 9-15编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶(acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT)区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15进行克隆和序列分析。【方法】以处于泌乳期28d的西农萨能羊乳腺组织mRNA反转录的cDNA为模板,通过RT-PCR方法首次扩增出西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15的cDNA序列全长及exon 8的3′端和exon 16的5′端部分cDNA序列(GenBank收录号为DQ915966),并对其进行了同源性分析和功能预测。【结果】克隆片段全长1449bp,其中包括exon 9-15共1388bp、exon 8的3′端9bp和exon 16的5′端52bp,编码483个氨基酸,包含编码的AT/MT区域951bp(454~1404nt);西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15与牛(NM_001012669),人(NM_004104),大鼠(NM_017332)和鸡(NM_205155)核苷酸序列相似度分别为95%、85.7%、82.7%、73.2%,氨基酸相似度分别为92.9%、77.7%、82.3%、64.7%;exon 10较其它物种缺失1个氨基酸。【结论】克隆获得西农萨能羊FAS基因片段全长1449bp,外显子9-15大小分别为463、185、190、95、135、204和116bp;核苷酸及氨基酸序列与牛相应序列的同源性均高于其它物种;AT/MT区域的活性位点在各物种间均为高度保守的丝氨酸,但西农萨能羊exon 10较其它物种缺失1个氨基酸,这可能对AT/MT区域的空间构象及其生理功能产生重要影响。本研究为西农萨能羊FAS基因cDNA全长克隆以及基因功能研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 山羊 乳腺组织 脂肪酸合酶基因 EXON 9-15
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a-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶基因EXON 7突变形成A311血型基因亚型 被引量:6
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作者 刘衍春 刘毅 +5 位作者 赵卫军 郑凌 马玲 薛敏 吴敏慧 孙俊 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期821-824,共4页
本研究对1例产生抗A抗体的血清学正反定型不符的A血型标本进行血型血清学分析及基因分析,以了解其分子基础。采用试管法进行血型血清学的检测,采用PCR-SSP对A基因进行扩增分析,采用Sanger测序法对A血型糖基转移酶基因进行测序分析。结... 本研究对1例产生抗A抗体的血清学正反定型不符的A血型标本进行血型血清学分析及基因分析,以了解其分子基础。采用试管法进行血型血清学的检测,采用PCR-SSP对A基因进行扩增分析,采用Sanger测序法对A血型糖基转移酶基因进行测序分析。结果表明:血清学正反定型不符,初定为A亚型;PCR-SSP扩增检测结果有O、A血型基因的存在;对ABO基因第6外显子测序发现存在c.261delG,显示有O基因;对A、O基因第7外显子进行特异性扩增测序分析显示,在A单倍型基因第7外显子出现c.467 C>T、c.626 G>A的突变,在O单倍型基因第7外显子出现c.646T>A、681G>A、771C>T、829G>A等突变。结论:该献血者在A基因第7外显子的c.626G>A是新的等位基因突变,c.467 C>T是SNP;新突变的GenBank序列号是KC690281,被BGMUT命名为1个新的A等位基因亚型A311。 展开更多
关键词 a-1 3-N-乙酰半乳糖胺转移酶基因 EXON 7基因突变 A311血型基因亚型
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GHR基因exon 9和exon 10多态性与西农萨能奶山羊产奶性能的相关分析 被引量:3
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作者 孙瑞萍 王利心 +4 位作者 朱广琴 王建刚 宋宇轩 梁昭义 曹斌云 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期70-74,共5页
针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型... 针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型和NT型,纯化测序发现有1个SNP位点,NN型与NT型相比在该片段第241 bp处有1个G→T的突变;NN和NT基因型之间产奶量的最小二乘均值差异显著(P<0.05):NN基因型在各胎次产奶量和平均产奶量等指标上均好于NT基因型,其中在第3胎的产奶量和第4胎产奶量2项指标上都达到显著水平(P<0.05)。研究结果提示:GHR基因exon 9对奶山羊产奶量有显著影响,因此认为GHR基因exon 9位点可作为奶山羊高产奶量的标记辅助选择的有效分子标记。 展开更多
关键词 西农萨能奶山羊 PCR—SSCP GHR基因 产奶性能 EXON
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内蒙古地区3个马品种ELA-DRA*exon2的PCR-SSCP分析 被引量:3
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作者 孟青龙 李金莲 +2 位作者 石有斐 孙玉江 芒来 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第5期42-44,共3页
为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结... 为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果表明,150匹马中共出现6种基因型:3种纯合子分别记为AA,BB和CC型,均为3条带;3种杂合子分别记为AB,BC和AC型,均为4条带。其中A等位基因频率最高,B次之,而C只在三河马中出现。因此说三河马ELA_DRA*exon2的多态性比锡尼河马和巴尔虎马丰富。 展开更多
关键词 ELA—DRA exon2 PCR—SSCP 多态性
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水牛催乳素基因第3外显子群体遗传特征分析 被引量:2
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作者 袁峰 苗永旺 +4 位作者 李大林 刘丽仙 熊飞 刘伟 贡潘偏抽 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期312-316,共5页
催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛... 催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛共12个群体275个个体PRL exon 3的遗传变异,结果表明:水牛PRL exon 3由108个核苷酸组成,编码36个氨基酸,在水牛群体中未检测到单核苷酸多态性位点(SNPs),PRL exon 3与水牛产奶量之间没有直接相关性。通过序列比对发现在不同物种中PRL exon 3具有高度保守性。但在PRL第2内含子(intron 2)的2 265 nt和2 335 nt分别检测到G>A突变和C>T突变,其中2 335 nt位点突变仅在2头槟榔江水牛中检测到。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 催乳素 EXON 3 PCR—SSCP
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利用PCR-RFLP分析eNOS基因exon7BanⅡ酶切位点的遗传多态性 被引量:2
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作者 谢卫兵 李月琴 +4 位作者 周广新 林琳 海戎 云泓若 周天鸿 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 2000年第4期32-35,共4页
目的 :探讨内皮型一氧化氮合酶基因多态性与妊高征的相关性。方法 :应用PCR -RFLP技术检测了 12例正常女性的内皮型一氧化氮合酶基因第 7外显子。结果 :发现 12例正常女性中有 4例的基因型是eNOS/GG ,有 8例的基因型是eNOS/GT ,未检测到... 目的 :探讨内皮型一氧化氮合酶基因多态性与妊高征的相关性。方法 :应用PCR -RFLP技术检测了 12例正常女性的内皮型一氧化氮合酶基因第 7外显子。结果 :发现 12例正常女性中有 4例的基因型是eNOS/GG ,有 8例的基因型是eNOS/GT ,未检测到eNOS/TT型的个体。等位基因A1(eNOS/G)的频率为 66 7% ,等位基因A2 (eNOS/T)的频率为 33 3%。结论 :广东女性人群存在内皮型一氧化氮合酶第 7外显子BanⅡ酶切位点遗传多态性。 展开更多
关键词 ENOS基因 exon7外显子 多态性 BanhⅡ酶切位点
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常见JAK2基因突变的筛检及在BCR-ABL阴性骨髓增殖病中的临床意义 被引量:5
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作者 徐修才 伍权 +2 位作者 郑南 丁凯阳 刘欣 《中国实验诊断学》 2014年第4期557-560,共4页
目的建立多重等位基因特异性聚合酶链反应检测JAK2基因5种常见突变的方法,并评价在3种常见的骨髓增殖性疾病中的临床意义。方法对149例BCR-ABL融合基因为阴性的骨髓增殖性疾病(MPD)患者,包括73例真性红细胞增多症(PV)、51例原发性血小... 目的建立多重等位基因特异性聚合酶链反应检测JAK2基因5种常见突变的方法,并评价在3种常见的骨髓增殖性疾病中的临床意义。方法对149例BCR-ABL融合基因为阴性的骨髓增殖性疾病(MPD)患者,包括73例真性红细胞增多症(PV)、51例原发性血小板增多症(ET)和25例原发性骨髓纤维化(IMF)患者;并结合临床及实验室其他检查资料,对其在该类疾病诊断和鉴别诊断中的价值进行评估。20名急性白血病患者和15名健康志愿者作为对照组进行研究。所有病例的骨髓或外周血标本抽提DNA后用建立的多重PCR方法进行平行检测。结果①149例MPD患者中共检出118例患者存在JAK2基因突变,总突变率为79.2%。其中PV患者阳性68例,JAK2V617F突变65例、JAK2exon12突变3例,阳性率93.2%(68/73);ET患者检测出阳性35例,其中34例为V617F突变,JAK2exon12突变1例,阳性率为68.6(35/51);IMF患者阳性15例,均为JAK2V617F突变,阳性率为60%(15/25)。②JAK2突变阳性的MPD患者和突变阴性MPD的临床资料相比较,两组在患者性别,发病年份方面的差异无统计学意义。研究发现两组PV患者的白细胞[(19.5士7.6)×109/L vs(7.1土1.1)×109/L,P=0.0005]、血小板计数[(498士172)×109/L vs(206士114)×109/L,P=0.0004]、ET患者的血红蛋白[(152士18)g/L vs(112士11)g/L,P<O.OO01]、白细胞计数[(16.2士5.2)×109/L vs(9.3士3.4)×109/L,P<0.0001]以及IMF患者的白细胞[(15.1士3.8)×109/L vs(9.3土1.6)×109/L,P=0.0001]差异均有统计学意义。结论建立的多重PCR方法可以同时检测5种JAK2基因突变,可在临床上推广使用。与JAK2突变阴性的MPD患者相比较,突变阳性的患者有更明显的骨髓增殖紊乱特征。 展开更多
关键词 骨髓增殖性疾病 JAK2 exon12 突变 聚合酶链反应
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CYP1A1基因多态性和吸烟对肺癌的易感性 被引量:1
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作者 杨翠军 刘芳 +2 位作者 孙黎 刘进军 刘开扬 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期616-618,共3页
目的采用PCR-RFLP技术测定CYP1A1的mspI和exon 7位点多态性,并观察两者及吸烟对肺癌易感性的影响。方法研究采用等位基因特异性扩增和PCR-RFLP技术,分析CYP1A1基因3'端限制性内切酶mspI和exon 7位点基因的基因多态性。结果 CYP1A1的... 目的采用PCR-RFLP技术测定CYP1A1的mspI和exon 7位点多态性,并观察两者及吸烟对肺癌易感性的影响。方法研究采用等位基因特异性扩增和PCR-RFLP技术,分析CYP1A1基因3'端限制性内切酶mspI和exon 7位点基因的基因多态性。结果 CYP1A1的mspI和exon 7位点各自基因型分布频率均无显著性差异(χ2=1.34,P>0.05);其中mspI突变型TC和CC患肺癌的相对危险性增加(OR=1.18,P<0.05;OR=1.49,P<0.05);exon 7突变型Ile/Val和Val/Val患肺癌的相对危险性亦增加(OR=1.35,P<0.05;OR=2.70,P<0.05);两多态位点联合作用分析,表明携带突变基因的个体肺癌易感性较高(OR=4.42,P<0.05)。对肺癌易感性与吸烟的关系分析,吸烟者患肺癌的危险性是不吸烟者1.77倍(χ2=5.72,P<0.05);携带突变基因且吸烟者肺癌易感性显著增加(OR=2.16,P<0.05;OR=2.63,P<0.05)。结论 CYP1A1突变型基因可能增加肺癌的易感性;CYP1A1突变型基因与吸烟之间存在协同作用,明显提高了患肺癌的风险性。 展开更多
关键词 CYP1A1 肺癌 EXON 7 MSPI 吸烟
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真性红细胞增多症基因组学与疾病进展的关系 被引量:2
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作者 赵迎旭 白洁 +6 位作者 张磊 盛梦瑶 石慧 邢文 杨逢春 艾丽梅 周圆 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第6期517-521,共5页
目的研究135例真性红细胞增多症(PV)患者ASXL1、TET2、IDH1、IDH2、SETBP1、MPL515、JAK2V617F及JAK2 exon12基因突变情况,综合评判PV后骨髓纤维化(PPMF)疾病进展与基因组学特征。方法用Sanger方法对ASXL1、TET2、IDH1、IDH2、SETBP1、M... 目的研究135例真性红细胞增多症(PV)患者ASXL1、TET2、IDH1、IDH2、SETBP1、MPL515、JAK2V617F及JAK2 exon12基因突变情况,综合评判PV后骨髓纤维化(PPMF)疾病进展与基因组学特征。方法用Sanger方法对ASXL1、TET2、IDH1、IDH2、SETBP1、MPL515和JAK2 exon12基因进行测序;用巢式等位基因特异性PCR方法检测JAK2V617F突变,对突变患者用Taqman-MGB探针检测突变负荷。分析基因突变与PPMF疾病进展的关系。应用Logis-tic多因素分析分析PV后继发PPMF的危险因素。结果 PV患者ASXL1、TET2、IDH1、IDH2的突变率分别为7.69%(8/104)、5.26%(1/19)、0.08%(1/120)、和0.08%(1/121)。未发现SETBP1、MPL515突变者。PV患者JAK2总突变率为82.22%(111/135)。其中JAK2 exon12突变率为2.96%(4/135)。PPMF患者中,ASXL1突变率高达31.82%(7/22)。ASXL1与JAK2V617F负荷(V617F%)呈正相关(rs=0.298,P=0.002),ASXL1突变组的血红蛋白低于未突变组,白细胞、V617F%≥50%比例、血栓栓塞比例及继发PPMF比例高于未突变组(P<0.05);ASXL1突变、V617F%≥50%和脾大是PPMF的危险因素。结论 ASXL1突变可能通过某种机制促进V617F%增高,参与PPMF的发生和发展。 展开更多
关键词 真性红细胞增多症 基因组学 ASXL1 TET2 IDH1 IDH2 SETBP1 MPL515 JAK2 exon12
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MTNR1A基因ExonⅡ T/C突变与绵羊季节性繁殖的关联性分析 被引量:1
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作者 张伟 石国庆 +1 位作者 邓双义 王世银 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1582-1586,共5页
【目的】分析MTNR1A基因ExonⅡT/C突变与绵羊季节性繁殖性状的关联性,为深入研究MTNR1A基因在绵羊繁殖活动中的作用机制打下基础。【方法】以季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊为研究对象,采用PCR-... 【目的】分析MTNR1A基因ExonⅡT/C突变与绵羊季节性繁殖性状的关联性,为深入研究MTNR1A基因在绵羊繁殖活动中的作用机制打下基础。【方法】以季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊为研究对象,采用PCR-SSCP及测序技术检测MTNR1A基因ExonⅡT/C突变在4个绵羊品种群体中的分布情况,并分析其与绵羊季节性繁殖性状的关联性。【结果】MTNR1A基因ExonⅡT/C突变致使MTNR1A蛋白的胞内无规卷曲结构域构象发生变化。在4个绵羊品种群体MTNR1A基因ExonⅡ处均可检测到T/C突变,其中阿勒泰羊和小尾寒羊中以TT基因型为主,T等位基因频率分别为C等位基因的3.4和11.2倍;在中国美利奴羊(军垦型)中则以TC基因型为主,TC基因型频率分别为TT和CC基因型的17.6和19.6倍;在湖羊中3种基因型的分布无明显差异。在阿勒泰羊群体中MTNR1A基因ExonⅡT/C突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而在中国美利奴羊(军垦型)、湖羊和小尾寒羊群体中处于极度不平衡状态(P<0.01)。【结论】在季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊群体MTNR1A基因ExonⅡ处均可检测到T/C突变,但该突变与绵羊的季节性繁殖性状无关联。 展开更多
关键词 绵羊 MTNR1A基因 ExonⅡ T/C突变 季节性繁殖 PCR-SSCP
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羊驼催乳素受体基因(PRLR)exon10的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 张巧灵 董常生 +1 位作者 贺俊平 姜俊兵 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期321-325,共5页
通过氰仿/异戊醇法从羊驼血液和组织中提取羊驼基因组DNA,首次扩增出羊驼PRLR基因(Prolactin Receptor,PRLR)exon10序列(GenBank登录号为DQ206831),并与其它动物相应区域作了同源性比较,结果表明:羊驼PRLR基因exon10的开放阅... 通过氰仿/异戊醇法从羊驼血液和组织中提取羊驼基因组DNA,首次扩增出羊驼PRLR基因(Prolactin Receptor,PRLR)exon10序列(GenBank登录号为DQ206831),并与其它动物相应区域作了同源性比较,结果表明:羊驼PRLR基因exon10的开放阅读框为1133bp,包括1046bp的编码区和87bp的拖尾区;同源性比较显示,羊驼PRLR基因exon10的核苷酸序列与哺乳动物(牛、绵羊、猪、狗、兔、大鼠等)的同源性较高,达80%,氨基酸序列的同源性则≥66%,而与鱼类的同源性则较低,仅为40%~45%。 展开更多
关键词 羊驼 催乳素受体基因 exon10 克隆
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蒙古马与其他品种马的ELA-DRA* exon2多态性分析 被引量:1
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作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 刘淑娟 芒来 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第3期345-350,共6页
本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带... 本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带;三种杂合子分别记为AB、BC和AC型,均为4条带;且AA和AB两种基因型是所研究的各类型马的优势基因型。纯血马和三河马的PIC和He值均较高,属于高度多态,4个类型蒙古马均属于中度多态。聚类分析表明三大品种各聚一支,各类型蒙古马中锡尼河马和巴尔虎马关系较近。 展开更多
关键词 ELA-DRA* exon2 PCR-SSCP 多态性
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乌苏里貉GHR基因第10外显子SNP分析 被引量:1
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作者 荣敏 李伟 +3 位作者 李鑫 任二军 刘洁 邢秀梅 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第1期126-129,共4页
为了研究乌苏里貉资源群体中GHR基因的单核苷酸多态性(SNP),试验选取生长性状差异较大的两个乌苏里貉群体分别构建DNA池,对GHR基因的第10外显子进行PCR扩增并测序。结果表明:发现5个SNP位点,分别为T911C、C1112T、G1454A、G1522A、C2279... 为了研究乌苏里貉资源群体中GHR基因的单核苷酸多态性(SNP),试验选取生长性状差异较大的两个乌苏里貉群体分别构建DNA池,对GHR基因的第10外显子进行PCR扩增并测序。结果表明:发现5个SNP位点,分别为T911C、C1112T、G1454A、G1522A、C2279T。其中T911C为错义突变,可导致苯丙氨酸改变为亮氨酸;C1112T为错义突变,可导致丝氨酸改变为苯丙氨酸;G1454A为同义突变,氨基酸不发生改变;G1522A为错义突变,可导致精氨酸改变为赖氨酸;C2279T为错义突变,可导致丝氨酸改变为亮氨酸。表明这4个错义突变的SNP位点有可能与乌苏里貉生长性状相关。 展开更多
关键词 乌苏里貉 GHR基因 exon10 SNP 多态性
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BMY牛MSTN基因exon2克隆及序列分析 被引量:3
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作者 和占星 亐开兴 +5 位作者 张继才 王安奎 金显栋 杨国荣 昝林森 黄必志 《中国牛业科学》 2013年第4期1-5,共5页
[目的]克隆BMY牛MSTN基因外显子2的序列,以期分析其遗传变异。[方法]通过对PCR产物进行克隆,比较哺乳动物MSTN基因外显子2之间的同源性,并构建其系统发育关系。[结果]通过PCR扩增,对PCR产物克隆得到BMY牛MSTN基因exon2序列为372bp编... [目的]克隆BMY牛MSTN基因外显子2的序列,以期分析其遗传变异。[方法]通过对PCR产物进行克隆,比较哺乳动物MSTN基因外显子2之间的同源性,并构建其系统发育关系。[结果]通过PCR扩增,对PCR产物克隆得到BMY牛MSTN基因exon2序列为372bp编码124个氨基酸残基,牛亚科物种间的核苷酸同源性较高,在98.7%~100.0%之间,BMY牛、瘤牛、牦牛与大额牛079-gayal(Bosfrontalis)的氨基酸序列一致,而日本和牛在第89位发生了天冬酰胺(Asn)→丝氨酸(Ser)的突变。构建的牛亚科几个物种之间的系统发育关系表明,含有瘤牛血统的BMY牛与瘤牛、牦牛的关系较近,且大额牛079-gayal与瘤牛的关系也近,推测大额牛在其形成历史中曾经受过瘤牛的基因渐渗。牛亚科物种的牦牛、大额牛、日本和牛、瘤牛与BMY牛聚为一支,而与水牛的关系较远。人与黑猩猩、猕猴聚为明显的一支。[结论]BMY牛MSTN基因外显子2长度为372bp,系统聚类分析表明BMY牛含有瘤牛血统和典型的瘤牛特征。 展开更多
关键词 BMY牛 MSTN基因exon 2 系统发育关系
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PI3KCA基因高频突变位点与子宫颈鳞癌关系的初步研究 被引量:1
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作者 彭立平 查晓 +3 位作者 张国楠 程佳 樊英 黄建鸣 《肿瘤预防与治疗》 2010年第5期367-370,共4页
目的:探讨宫颈鳞癌与PIK3CA基因高频突变点E542K、E545k和H1047R的关系。方法:随机选择50例病理确诊宫颈鳞癌组织作为实验组,患者本人的外周血作为对照组,提取其基因组DNA,用巢式-PCR方法扩增PIK3CA基因exon9和exon20基因片段并测序分... 目的:探讨宫颈鳞癌与PIK3CA基因高频突变点E542K、E545k和H1047R的关系。方法:随机选择50例病理确诊宫颈鳞癌组织作为实验组,患者本人的外周血作为对照组,提取其基因组DNA,用巢式-PCR方法扩增PIK3CA基因exon9和exon20基因片段并测序分析。结果:实验组均发现exon9 E542K位点突变,相应外周血DNA检测也发现相同突变,PI3KCA基因与定位染色体22q11.2的Cat Eye Syndrome基因片段具有高度重合现象。改变引物设计发现50例样本中E542K和E545k位点分别发现2例突变,H1047R位点未发现突变。对照组未见突变。结论:宫颈鳞癌组织中PIK3CA基因exon9(E542K和E545k)和exon20 H1047R位点在其它实体肿瘤中具有较高突变频率的PI3KCA基因,而在宫颈鳞癌中的突变率较小。 展开更多
关键词 PIK3CA 宫颈癌 基因突变 exon9 exon20 CAT Eye SYNDROME
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