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普通丝瓜Expansin家族基因的鉴定及其在果实膨大中的表达分析
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作者 陈敏氡 王彬 +5 位作者 白昌辉 裘波音 刘建汀 温庆放 朱海生 李永平 《园艺学报》 北大核心 2025年第6期1488-1504,共17页
为揭示普通丝瓜(Luffa cylindrica)扩展蛋白(Expansin)家族基因的组成、结构和进化过程以及在果实膨大中的作用,利用生物信息技术从普通丝瓜基因组中鉴定出50个Expansin基因,分属于EXPA(18个)、EXPB(3个)、EXLA(27个)和EXLB(2个)4个亚家... 为揭示普通丝瓜(Luffa cylindrica)扩展蛋白(Expansin)家族基因的组成、结构和进化过程以及在果实膨大中的作用,利用生物信息技术从普通丝瓜基因组中鉴定出50个Expansin基因,分属于EXPA(18个)、EXPB(3个)、EXLA(27个)和EXLB(2个)4个亚家族,其中EXLA亚家族发生4对基因串联复制和6对基因片段复制,导致该亚家族基因数量明显扩增。系统发育树显示,4个亚家族成员各自聚集成群,且与同科的黄瓜亲缘关系较近。基因结构和保守基序分析显示,4个亚家族的外显子—内含子结构和保守基序种类及分布在进化上趋于保守,可以作为亚家族分型的重要依据。启动子元件预测分析发现,Expansin基因启动子中含有大量的光诱导、厌氧诱导、茉莉酸甲酯和脱落酸元件,而数量最多的光诱导元件只在EXLA/EXLB亚家族预测到。基于RNA-seq数据筛选出8个与果实横纵径发育极显著正相关的Expansin基因,其中4个已报道的基因LcEXPA8、LcEXPA18、LcEXPA14、LcEXPA1可作为丝瓜果形控制的潜在候选基因。对另外4个基因进行RT-qPCR分析,LcEXPA15在花后4 d显著高表达,LcEXPA3、LcEXPA16和LcEXPA7在花后8~15 d显著高表达。花后2~15 d是普通丝瓜的果实膨大期,这时期的果实细胞数量增加、单细胞明显膨大、伸长。由此推测,4个Expansin可能在催化细胞生长,促进果实膨大过程中发挥重要作用。通过构建8个Expansin互作网络,提示部分Expansin可能与ERF、bHLH、TCP和GATA这4类转录因子家族存在互作。以上8个Expansin基因可作为普通丝瓜果实膨大相关候选基因进行深入研究。 展开更多
关键词 普通丝瓜 expansin 基因家族 果实膨大
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金鱼草Expansin基因家族鉴定及其抗核盘菌相关基因筛选
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作者 宋佳怡 苏芸丽 +3 位作者 郑兴艳 夏文念 杨冬梅 胡慧贞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第4期227-242,共16页
【目的】探究金鱼草(Antirrhinum majus)扩展蛋白(expansin,EXPs)在响应核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)侵染中的作用,并鉴定金鱼草EXPs基因家族,挖掘出抗核盘菌的关键候选基因,为进一步探究金鱼草EXPs基因家族的生物学功能提供基础... 【目的】探究金鱼草(Antirrhinum majus)扩展蛋白(expansin,EXPs)在响应核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)侵染中的作用,并鉴定金鱼草EXPs基因家族,挖掘出抗核盘菌的关键候选基因,为进一步探究金鱼草EXPs基因家族的生物学功能提供基础。【方法】基于金鱼草全基因组数据,利用生物信息学方法分析该家族蛋白的理化性质、二三级结构、基因结构、蛋白质结构域、系统进化、共线性以及启动子顺式作用元件。利用金鱼草抗感材料转录组测序(RNA-seq)及实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)检测AmEXPs基因在金鱼草响应核盘菌侵染过程中的表达模式。确定候选基因并构建候选基因的超表达载体,并瞬时转化入本氏烟草进行抗性初筛。【结果】金鱼草中共鉴定到32个AmEXPs,均具有保守结构域DPBB-1和Pollen allerg1,分为4个亚族(EXPA、EXPB、EXLA及EXLB),编码211‒297个氨基酸,蛋白分子量22018.69‒31787.97 Da,等电点5.01‒9.83;各亚族基因间有高度相似的结构和保守基序;每个基因的启动子都具有与激素或胁迫相关的顺式作用元件。根据表达模式挖掘出了10个候选基因,进一步对这10个候选基因进行超表达载体构建并瞬时转化入本氏烟草进行抗性初筛,发现与对照相比,AmEXP13和AmEXLB1基因可显著增强本氏烟草对核盘菌的抗性,而AmEXPA17、AmEXPA21、AmEXPA9和AmEXPA16基因则使本氏烟草表现得更易感,AmEXLB2、AmEXPB1、AmEXPA2和AmEXPA12基因则无明显差异。【结论】从金鱼草全基因组中鉴定出32个EXPs基因家族成员,其中6个EXPs基因响应核盘菌抗性,AmEXPA13和AmEXLB1这2个基因是正向介导抗病的关键候选基因,AmEXPA17、AmEXPA21、AmEXPA9和AmEXPA16这4个基因是负向介导抗病的关键候选基因。 展开更多
关键词 金鱼草 expansin基因家族 表达模式 核盘菌抗性 抗性初步筛选
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Abiotic stress treatment reveals expansin like A gene OfEXLA1 improving salt and drought tolerance of Osmanthus fragrans by responding to abscisic acid 被引量:4
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作者 Bin Dong Qianqian Wang +7 位作者 Dan Zhou Yiguang Wang Yunfeng Miao Shiwei Zhong Qiu Fang Liyuan Yang Zhen Xiao Hongbo Zhao 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期573-585,共13页
Sweet osmanthus(Osmanthus fragrans) is a having general approval aromatic tree in China that is widely applied to landscaping and gardening. However, the evergreen tree adaptability is limited by many environmental st... Sweet osmanthus(Osmanthus fragrans) is a having general approval aromatic tree in China that is widely applied to landscaping and gardening. However, the evergreen tree adaptability is limited by many environmental stresses. Currently, limited information is available regarding the genetic analysis and functional identification of expansin genes in response to abiotic stress in sweet osmanthus. In this study, a total of 29 expansin genes were identified and divided into four groups by genome-wide analysis from the sweet osmanthus genome. Transcriptome and quantitative Real-time PCR analysis showed that the cell wall-localized protein expansin-like A(OfEXLA1) gene was significantly induced by salt and drought treatment. Histochemical GUS staining of transgenic Arabidopsis lines in which GUS activity was driven with the OfEXLA1 promoter, GUS activity was significantly induced by salt, drought, and exogenous abscisic acid(ABA). In yeast, we found OfEXLA1overexpression significantly improved the population of cells compared with wild-type strains after NaCl and polyethylene glycol(PEG)treatment. Additionally, OfEXLA1 overexpression not only promoted plant growth, but also improved the salt and drought tolerance in Arabidopsis. To gain insight into the role of ABA signaling in the regulation of OfEXLA1 improving abiotic tolerance in sweet osmanthus, four differentially expressed ABA Insensitive 5(ABI5)-like genes(OfABL4, OfABL5, OfABL7, and OfABL8) were identified from transcriptome, and dualluciferase(dual-LUC) and yeast one hybrid(Y1H) assay showed that OfABL4 and OfABL5 might bind to OfEXLA1 promoter to accumulate the OfEXLA1 expression by responding to ABA signaling to improve abiotic tolerance in sweet osmanthus. These results provide the information for understanding the molecular functions of expansin-like A gene and molecular breeding of sweet osmanthus in future. 展开更多
关键词 Osmanthus fragrans Abiotic tolerance expansin Abscisic acid
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蓝花耧斗菜Expansin基因家族的全基因组鉴定及其在盐胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 马艳梅 于海航 +2 位作者 沈轩羽 肖芳丽 白云 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期42-51,共10页
扩展蛋白(EXP)可以调节细胞壁组分间松弛度和增强细胞壁的柔韧性,在植物适应环境胁迫过程中起着关键作用。为探究蓝花耧斗菜EXP家族成员特征及其在盐胁迫下表达模式,挖掘蓝花耧斗菜耐盐基因,利用生物信息学方法对蓝花耧斗菜AcEXP家族进... 扩展蛋白(EXP)可以调节细胞壁组分间松弛度和增强细胞壁的柔韧性,在植物适应环境胁迫过程中起着关键作用。为探究蓝花耧斗菜EXP家族成员特征及其在盐胁迫下表达模式,挖掘蓝花耧斗菜耐盐基因,利用生物信息学方法对蓝花耧斗菜AcEXP家族进行全基因组鉴定及分析,并通过RNA-seq表达数据和qRT-PCR分析其在盐胁迫下的表达模式。结果表明,蓝花耧斗菜全基因组包含27个EXP基因,分布于6条染色体及1个scaffold上;蛋白质二级结构以β-折叠和无规则卷曲为主;27个EXP均定位于细胞壁。系统发育树显示,AcEXP家族成员被划分为4个亚家族(EXPA、EXPB、EXLA、EXLB),同一亚族成员具有相似的基因结构和蛋白保守基序。AcEXP的启动子区域富含多个植物激素响应元件和胁迫响应元件。利用转录组数据,对盐胁迫下AcEXP的表达模式分析表明,21个EXP响应盐胁迫,在根系和叶片中的表达模式存在差异。AcEXPA8/9/12,AcEXPB1、AcEXLB1、AcEXLB2在叶片和根系中均差异表达,且qRT-PCR结果进一步验证了AcEXP基因在盐胁迫下的表达模式。该研究全面分析了蓝花耧斗菜EXP基因家族成员的基本特征及在盐胁迫下的表达变化,初步证明AcEXPA8/9/12、AcEXPB1、AcEXLB1、AcEXLB2参与了盐胁迫应答过程并作出积极响应。 展开更多
关键词 蓝花耧斗菜 扩展蛋白 全基因组鉴定 盐胁迫 表达分析
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植物细胞壁松弛因子——Expansin研究进展 被引量:8
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作者 张安 曹清河 +4 位作者 周志林 赵冬兰 李昂 李元元 唐君 《江苏农业科学》 北大核心 2013年第6期11-13,共3页
就Expansin的发现与来源、基因家族分类与基因结构、功能、作用机理等方面展开论述,旨在让人们系统地了解Expansin的研究进展,并为未来通过调控Expansin的表达来调控植物的生长发育、提高作物产量、延长贮藏时间等生产应用提供参考。
关键词 expansin 扩张蛋白 膨胀素 细胞壁 研究进展
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桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根结线虫侵染后的诱导表达分析 被引量:3
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作者 张倩 曹珂 +3 位作者 朱更瑞 方伟超 王新卫 王力荣 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期1-10,共10页
【目的】探索扩张蛋白(EXPANSIN)基因家族在桃抗南方根结线虫过程中的作用。【方法】首先对桃基因组中的EXPANSIN基因家族进行生物信息学分析,然后利用转录组测序对EXPANSIN基因在南方根结线虫侵染免疫型(‘红根甘肃桃1号’)和高感型(... 【目的】探索扩张蛋白(EXPANSIN)基因家族在桃抗南方根结线虫过程中的作用。【方法】首先对桃基因组中的EXPANSIN基因家族进行生物信息学分析,然后利用转录组测序对EXPANSIN基因在南方根结线虫侵染免疫型(‘红根甘肃桃1号’)和高感型(‘贝蕾’)桃种质根系后的不同时期的表达丰度进行分析。【结果】桃EXPANSIN基因家族有27个成员,这些成员分布在8条染色体上,以第2和第5号染色体上最多,均为5个。基因结构分析显示,这些基因包含1~5个外显子,大部分EXPANSIN基因包含DPBB_1和Pollen_allerg_1保守结构域,聚类分析将这27个成员分为2大类,其中有8个与拟南芥中已注释的与线虫侵染过程中巨细胞形成有关的蛋白质聚在一起,均属于EXPA亚类。转录组分析表明,这8个EXPANSIN基因在对南方根结线虫免疫和高感2种种质不同时期的表达趋势存在明显差异,其中ppa010314m、ppa010226m在‘贝蕾’中表达量随侵染上调,而在‘红根甘肃桃1号’中上调不明显,这2个基因可能是参与南方根结线虫侵染过程中巨细胞形成的关键基因。【结论】桃EXPANSIN家族成员在结构上高度保守,其中多个成员可能参与调控桃抗南方根结线虫过程。 展开更多
关键词 expansin基因家族 南方根结线虫 抗性
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植物细胞壁扩展蛋白(Expansins)研究进展 被引量:4
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作者 童斌 饶景萍 +1 位作者 任小林 李嘉瑞 《中国农学通报》 CSCD 2005年第9期112-115,120,共5页
Expansins(EXP)是一类植物细胞壁蛋白,它能诱导分离细胞壁的延伸生长及依赖pH调节的细胞扩展生长。在生长的组织中,细胞壁若要打破约束而扩展体积,必须取决于胞壁的生物合成与维持结构完整性及强度的壁松弛协调机制。Expansins的生物学... Expansins(EXP)是一类植物细胞壁蛋白,它能诱导分离细胞壁的延伸生长及依赖pH调节的细胞扩展生长。在生长的组织中,细胞壁若要打破约束而扩展体积,必须取决于胞壁的生物合成与维持结构完整性及强度的壁松弛协调机制。Expansins的生物学作用是多样化的。它参与了细胞增大,果实软化,花粉管及根系生长以及植物细胞衰老等过程。现已发现两大类expansins基因家族,称之为α-expansin和β-expansin,它们都是由多基因家族组成。本文对EXP的发现,基因家族分类及其在植物发育、生长及衰老各阶段的生理作用机制等研究进展进行了综述;并对EXP的应用前景给予一定阐述。 展开更多
关键词 植物 细胞壁蛋白 扩展蛋白(expansins) 生长发育 植物细胞壁 扩展 生理作用机制 延伸生长 细胞衰老 基因家族
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基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析 被引量:2
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作者 方智振 林炎娟 +3 位作者 姜翠翠 周丹蓉 潘少霖 叶新福 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期919-928,共10页
【目的】Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用。本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异... 【目的】Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用。本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达。【方法】基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析。【结果】鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176~460 aa,分子量在19.21~51.33 kD,等电点4.62~9.83,大部分为位于细胞外的稳定亲水蛋白。系统进化树分析表明李Expansin家族成员可分为4个组:22个EXPA、6个EXPB、1个EXPLA和4个EXPLB。所有李Expansin蛋白质均具有保守的DPBB1和Pollenallerg1结构域。保守基序分析表明,同一组Expansin成员具有相似的基序组成。9个Expansin基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达。【结论】Expansin在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异。本研究结果可为解析李Expansin家族基因在果实成熟过程中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 转录组 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
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Expansin超级家族的进化与命名 被引量:7
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作者 牛艳梅 沈文涛 周鹏 《广东农业科学》 CAS CSCD 2007年第8期133-135,共3页
综述了expansin基因家族的命名法和进化研究的最新进展,介绍了expansin超级家族的发现过程和定义,分析了其基因结构和进化状况,详述了expansin这个超级家族成员的命名法则。
关键词 expansin 进化 命名
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香蕉果实expansin cDNA克隆及序列分析 被引量:8
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作者 陆旺金 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期40-42,共3页
提取成熟香蕉果肉的RNA并分离mRNA,以mRNA反转录合成cDNA,以该cDNA为模板,设计expansin的简并引物,进行RT PCR(退火温度为50℃).得到的扩增产物纯化后与pGEM T Easy载体连接,转化大肠杆菌,任意挑选2个阳性克隆,进行序列分析,结果得到2... 提取成熟香蕉果肉的RNA并分离mRNA,以mRNA反转录合成cDNA,以该cDNA为模板,设计expansin的简并引物,进行RT PCR(退火温度为50℃).得到的扩增产物纯化后与pGEM T Easy载体连接,转化大肠杆菌,任意挑选2个阳性克隆,进行序列分析,结果得到2个序列相同的expansin的cDNA基因片段,命名为MA Exp3(以示与已登录的香蕉MA Exp1和MA Exp2的区别).MA Exp3中存在expansin基因的保守区域,即8个半胱氨酸残基和3个色氨酸残基,它编码177个氨基酸,与MA Exp1的核苷酸同源性为74 2%,氨基酸同源性为86 4%. 展开更多
关键词 香蕉 果实 expansin CDNA克隆 序列分析 大肠杆菌 阳性克隆 基因片段 核苷酸同源性 氨基酸同源性
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三七Expansin家族基因的鉴定及生物信息分析 被引量:2
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作者 李雪娇 早浩龙 +4 位作者 卢迎春 赵雁 向贵生 范伟 杨生超 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第19期6365-6375,共11页
扩展蛋白(Expansins)作为细胞壁松弛蛋白,是调控细胞壁延展的重要调节因子,参与调控植物细胞壁松弛、细胞膨大与胁迫反应等过程。本研究从三七基因组中共鉴定到24个Expansins基因,其中,EXPA亚家族成员17个,EXPB亚家族成员3个,EXLA亚家... 扩展蛋白(Expansins)作为细胞壁松弛蛋白,是调控细胞壁延展的重要调节因子,参与调控植物细胞壁松弛、细胞膨大与胁迫反应等过程。本研究从三七基因组中共鉴定到24个Expansins基因,其中,EXPA亚家族成员17个,EXPB亚家族成员3个,EXLA亚家族成员1个,EXLB亚家族成员3个,系统进化分析显示它们与不同物种间有一定亲缘关系,表明该家族基因具有一定保守性。通过分析6个生长时期的三七主根中Expansins家族基因表达热图,发现Pn EXP15、Pn EXP17、Pn EXP22、Pn EXP24在三七主根发育过程中显著高表达,可能参与调控细胞壁松弛来调节三七主根的发育,以促进三七主根的膨大。本研究为深入探索三七扩展蛋白家族基因的功能、物种间的进化关系和三七分子育种提供科学参考依据。 展开更多
关键词 三七 expansin 生物信息 基因表达
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苎麻expansin家族成员鉴定与表达分析 被引量:2
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作者 石亚亮 钟意成 +4 位作者 黄坤勇 牛娟 孙志民 陈建华 栾明宝 《中国麻业科学》 2023年第4期145-151,共7页
苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究... 苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究首先在苎麻中苎1号基因组数据库挖掘到24个扩展蛋白基因家族成员,通过生物信息学方法对其分子量、等电点、信号肽、亚细胞定位、motif及基因结构进行分析和预测。系统进化树结果显示:扩展蛋白包括α亚族成员17个、β亚族4个、α类亚族1个和β类亚族2个,共分为3类;expansin家族同一进化支蛋白结构域比较保守且有一个特有的motif。然后,利用苎麻茎皮扩展蛋白基因家族成员转录组表达分析和qRT-PCR验证,发现两个基因在两个纤维细度差异显著的品种及其5个不同生长期表达量差异显著。该结果有助于了解苎麻expansin家族的进化,为影响苎麻纤维发育和纤维细度相关基因及其功能的研究奠定基础。 展开更多
关键词 苎麻 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
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植物抗逆性与细胞壁expansin的关系概述 被引量:2
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作者 时向东 方圆 程传策 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第4期10-13,共4页
Expansin是在高等植物细胞壁中发现的一类富含羟脯氨酸的与细胞壁伸展性有关的糖蛋白,它在植物发育过程以及植物抗逆性方面均有作用。为此,综述了植物在经历低温、不同土壤水分、病害和盐害等逆境条件以及正常生长条件下expansin在细胞... Expansin是在高等植物细胞壁中发现的一类富含羟脯氨酸的与细胞壁伸展性有关的糖蛋白,它在植物发育过程以及植物抗逆性方面均有作用。为此,综述了植物在经历低温、不同土壤水分、病害和盐害等逆境条件以及正常生长条件下expansin在细胞壁的积累变化情况,并对expansin的应用前景给予一定的阐述。 展开更多
关键词 细胞壁expansin 植物发育 抗逆性
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枯草芽孢杆菌Expansin蛋白的原核表达及活性分析 被引量:1
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作者 叶凯霞 朱华琛 +1 位作者 赵庆新 陈洪生 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期977-982,共6页
目的原核表达枯草芽孢杆菌Expansin蛋白,并分析其促进多糖糖化的活性。方法以过夜培养的Bacillus subtilis subsp. Subtilis subtilis str. 168基因组为模板合成expansin基因;在引物的N-端添加6-his tag,PCR合成融合基因6his-expansin,... 目的原核表达枯草芽孢杆菌Expansin蛋白,并分析其促进多糖糖化的活性。方法以过夜培养的Bacillus subtilis subsp. Subtilis subtilis str. 168基因组为模板合成expansin基因;在引物的N-端添加6-his tag,PCR合成融合基因6his-expansin,构建重组质粒6his-expansin-6his-p ET28a(+)[heh-pET28a(+)],转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达融合蛋白6His-Expansin-6His(HEH);并对表达条件进行优化。产物经Ni-NTA纯化,检测其与多糖降解酶(polysaccharide degrading enzyme,PDE)(纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶)及多糖复合酶(polysaccharide complex enzyme,PCE)制剂的协同活性(synergistic activity,SA)。结果经双酶切鉴定,重组质粒heh-p ET28a(+)构建正确;融合蛋白HEH在0. 05 mmol/L IPTG 30℃诱导30 h的最适表达条件下,表达量约为1. 2 mg/m L,其相对分子质量为26 400,目的蛋白纯度达95%;该蛋白与纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶的SA分别为171. 53%、61. 95%、230. 00%,与PCE降解滤纸(filter paper)、秸秆(rice straw)的SA分别为312. 83%、356. 59%。结论重组的融合蛋白HEH与PDE均具有较高的协同作用,为Expansin在生物质木质纤维素糖化领域的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 expansin 原核细胞 基因表达 多糖糖化 协同活性
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扩张蛋白(Expansin)研究进展 被引量:19
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作者 高英 王学臣 《中国农学通报》 CSCD 2005年第7期82-86,164,共6页
扩张蛋白是一类细胞壁酶蛋白,能够通过打断细胞壁多聚物之间的氢键诱导酸依赖的细胞壁延展和压力松弛。其由两类多基因家族编码,分别命名为α-expansin、β-expansin,每类扩张蛋白基因家族又有很多的基因成员。扩张蛋白已在不同的种属... 扩张蛋白是一类细胞壁酶蛋白,能够通过打断细胞壁多聚物之间的氢键诱导酸依赖的细胞壁延展和压力松弛。其由两类多基因家族编码,分别命名为α-expansin、β-expansin,每类扩张蛋白基因家族又有很多的基因成员。扩张蛋白已在不同的种属植物中被鉴定存在,并且大量的扩张蛋白基因被克隆。研究表明:每一个扩张蛋白基因在高度特定的位点和高度特定的细胞类型中表达,其表达在时间、空间上受到严格的调控且受到激素和环境因子的调控。目前认为扩张蛋白几乎参与了植物的整个发育过程:除具有增大细胞的功能外,扩张蛋白在细胞生长、种子萌发、根毛形成、根系生长、叶原基形成、叶子生长发育、果实成熟、器官脱离,以及花粉管生长方面起着重要的作用。就此最新研究进展,作一综合阐述。 展开更多
关键词 扩张蛋白 研究进展 蛋白基因 多基因家族 花粉管生长 细胞壁 细胞类型 环境因子 细胞生长 发育过程 种子萌发 根系生长 原基形成 生长发育 果实成熟 多聚物 酶蛋白 植物 表达 高度 调控 位点 根毛 器官
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Expansin的研究进展 被引量:13
16
作者 陈爱国 陈进红 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2003年第6期752-758,共7页
随着对植物生长机制的不断深入研究 ,发现expansin蛋白具明显而广泛的促进生长的作用。简述了expansin蛋白的生化特性及其对细胞壁的松弛机制 。
关键词 膨胀素 细胞壁松弛 组织定位 水稻
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玉米扩展蛋白Expansin基因家族定位及基因表达模式分析 被引量:3
17
作者 姜志磊 周琳 +1 位作者 武奉慈 宋新元 《生物技术进展》 2018年第1期34-40,F0003,共8页
扩展蛋白(Expansin)是一类能够使植物细胞壁松弛的活性蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。利用PLAZA、NCBI、Maize GDB、Uniprot、PLEXdb等基因组数据库,获得玉米Expansin家族的基因序列、染色体基因座位、蛋白质序列以及长度,构... 扩展蛋白(Expansin)是一类能够使植物细胞壁松弛的活性蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。利用PLAZA、NCBI、Maize GDB、Uniprot、PLEXdb等基因组数据库,获得玉米Expansin家族的基因序列、染色体基因座位、蛋白质序列以及长度,构建玉米Expansin基因家族系统进化树,进行基因组织表达谱的分析。结果表明,玉米基因组中含有93个Expansin基因,分布于玉米的9条染色体上;多数Expansin具有250~300个氨基酸;玉米Expansin基因家族有40个Expansin A(EXPA)、47个Expansin B(EXPB)、6个Expansin-like A(EXLA),未发现Expansin-like B(EXLB);44个玉米Expansin基因在不同玉米组织中特异表达。该研究结果不仅为玉米扩展蛋白的深入研究奠定了基础,而且为其他研究人员对基因信息的获取提供了参考。 展开更多
关键词 玉米 扩展蛋白 生物信息学
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Genome-wide analysis of expansins and their role in fruit spine development in cucumber(Cucumis sativus L.) 被引量:8
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作者 Xiaoping Liu Shaoyun Dong +5 位作者 Han Miao Kailiang Bo Caixia Li Yingying Yang Xingfang Gu Shengping Zhang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2022年第6期757-768,共12页
Cucumber is one of the most widely consumed vegetables worldwide,and the fruit spine is an important fruit quality trait.Expansins play critical roles in fruit development;however,the regulation of expansins in cucumb... Cucumber is one of the most widely consumed vegetables worldwide,and the fruit spine is an important fruit quality trait.Expansins play critical roles in fruit development;however,the regulation of expansins in cucumber fruit spine development has not been reported.In this study,33 expansin genes were identified in the cucumber genome V3;additionally,expansin genes in Citrullus lanatus,Cucumis melo,Cucurbita maxima,Lagenaria siceraria,and Benincasa hispida were also identified.Phylogenetic analysis of expansin proteins in Cucurbitaceae and Arabidopsis showed that they evolved separately in each plant species.Phylogenetic analysis showed that C.maxima was derived earlier than the other five Cucurbitaceae species.The expression of CsEXPA2,CsEXPA14,and CsEXLA3 varied in cucumber lines with different fruit spine densities.A yeast two-hybrid assay showed that a putative auxin transporter encoded by numerous spine gene(ns)interacts with CsEXLA2,which may be involved in the development of the numerous spines in cucumber.These results provide novel insights into the expansins related to plant development and fruit spine development in cucumber. 展开更多
关键词 CUCUMBER expansinS Phylogenetic analysis COLLINEARITY Gene expression Fruit spine
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Cloning and Sequence Analysis of Expansin Genes from Litchi chinensis Fruit 被引量:4
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作者 LUWang-jin JIANGYue-ming 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第6期658-662,共5页
Using PCR degenerate primers, designed with reference to the sequences of the conserved amino acids of known expansins, to amplify cDNA fragments in litchi fruit by RT-PCR, two different cDNA fragments , named as Lc-E... Using PCR degenerate primers, designed with reference to the sequences of the conserved amino acids of known expansins, to amplify cDNA fragments in litchi fruit by RT-PCR, two different cDNA fragments , named as Lc-Exp1 and Lc-Exp2 , were cloned. Lc-Exp1 and Lc-Exp2 was respectively composed of 531 bp encoding 177 amino acids and 537 bp encoding 179 amino acids. Eight cysteine residues and three tryp-tophan residues, which is supposed to be the characteristics of expansins, are conserved in both Lc-Exp1 and c-Exp2. In addition, the homology between the two expansins is 71. 6% at nucleotide acid sequences and 76.3% at amino acid sequences. The homology of Lc-Exp1 with Fa-Exp2 or Pp-Exp1 was 92.7% or 92.1%, but that of Lc-Exp2 with Fa-Exp2 or Pp-Exp1 was only 77. 4% or 76.3% at amino acid sequences. 展开更多
关键词 Litchi chinensis Sonn. fruit expansin cDNA cloning Sequence analysis
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Overexpression of the apple expansin-like gene MdEXLB1 accelerates the softening of fruit texture in tomato 被引量:4
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作者 CHEN Yan-hui XIE Bin +7 位作者 AN Xiu-hong MA Ren-peng ZHAO De-ying CHENG Cun-gang LI En-mao ZHOU Jiang-tao KANG Guo-dong ZHANG Yan-zhen 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第12期3578-3588,共11页
Fruit firmness is an important quality trait of apple fruit texture,and the pre-harvest ripening period is the key period for the formation of apple fruit texture.Expansin is a cell wall loosing protein family that ha... Fruit firmness is an important quality trait of apple fruit texture,and the pre-harvest ripening period is the key period for the formation of apple fruit texture.Expansin is a cell wall loosing protein family that has four subfamilies:α-expansin(EXPA),β-expansin(EXPB),expansin-like A(EXLA),and expansin-like B(EXLB).In this study,we investigated the key period of pre-harvest texture formation in‘Golden Delicious’apples based on fruit longitudinal diameter,transverse diameter,firmness,tissue structure,respiration intensity,ethylene release rate,and expansin activity.Within the 10 days before harvest,the fruit was found to reach maturity.Semi-quantitative RT-PCR revealed that most of the expansins were expressed at the ripening stage before harvest.The biological function of the EXLB subfamily gene,MdEXLB1,was further identified,and its subcellular localization on the cell wall was confirmed by transient transformation experiments.Compared with the wild type(WT),the transgenic tomato lines overexpressing MdEXLB1 had lower plant height,earlier fruiting period,fewer days for fruit ripening,higher fruit maturity,lower fruit firmness,higher fruit expansin activity,more discrete flesh cell structure,and accelerated fruit ripening process.Overall,this is the first study to propose that the apple EXLB subfamily gene,MdEXLB1,has biological functions and plays an important role in promoting fruit ripening and softening. 展开更多
关键词 fruit firmness expansin APPLE transgenic tomato
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