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题名云南省新型肠道病毒EV80的基因特征分析
被引量：1
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作者
田炳均
丁峥嵘
张杰
赵智娴
汤晶晶
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机构
云南省疾病预防控制中心
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出处
《中国病毒病杂志》
CAS
2014年第1期29-33,共5页
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基金
国家自然科学基金(81160198)
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文摘
目的对云南省3株新型肠道病毒EV80的基因特征进行分析。方法对3株EV80病毒VP1区基因进行RT-PCR和基因测序,并在NCBI、EBI和DDBJ三大基因库搜索EV80VP1区基因序列,用MEGA5.0软件计算所得序列的核苷酸和氨基酸相似性,并做基因树进行基因特征分析。结果共检索到35株EV80的VP1区基因序列,去除序列太短不能分析的2株,对云南株和基因库中共33株进行了分析。33株病毒可分为4个基因型,原型株USA-CA67-10387单独聚成一组,为基因型A,云南株和山东株同属基因型D,为中国特有的基因型。结论虽然目前全世界新型肠道病毒EV80的分离数不多,但其地理分布较为广泛,不同国家、地区的毒株大都为不同的基因型,具有基因多样性特点。本研究对今后中国开展新型肠道病毒EV80的分子流行病学研究和传播链的发现和疫情处置提供了实验室基础。
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关键词
新型肠道病毒
ev80
VP1区基因
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Keywords
Newer enterovirus
ev80
VP1 gene
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分类号
R373.2
[医药卫生—病原生物学]
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