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肠道病毒C组96型(EV-C96)新疆株的全基因组序列分析
被引量:
3
1
作者
孙强
刘莹
+7 位作者
唐海淑
李晓嫘
严冬梅
祝双利
王东艳
崔惠
许文波
张勇
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期332-340,共9页
肠道病毒C组96型(EV-C96)是C组肠道病毒的一种新型肠道病毒,在临床上多与急性弛缓性麻痹等疾病相关联,世界分布较广,近年来陆续在中国、芬兰等多个国家的急性弛缓性麻痹患者、腹泻患者、健康人群或环境标本中分离到。为探究在我国新疆...
肠道病毒C组96型(EV-C96)是C组肠道病毒的一种新型肠道病毒,在临床上多与急性弛缓性麻痹等疾病相关联,世界分布较广,近年来陆续在中国、芬兰等多个国家的急性弛缓性麻痹患者、腹泻患者、健康人群或环境标本中分离到。为探究在我国新疆地区流行的EV-C96毒株的基因特征与进化特征,本研究对2011年从我国新疆地区一名急性弛缓性麻痹病例及一名接触者中分离到的两株EV-C96进行了全基因组序列测定,随后与全球EV-C96流行株以及C组肠道病毒原型株进行进化分析,与C组肠道病毒代表株进行核苷酸和氨基酸相似性分析和重组分析。结果显示,两株新疆EV-C96毒株与原型株以及1991年在我国山东地区分离的毒株等早期流行株分布于两个分支,且在基因组结构的多个区域核苷酸差异性较大,同时其非结构蛋白区域与其它型别的C组肠道病毒之间存在重组。EV-C96可能通过重组方式发生毒力改变,需加强C组肠道病毒在我国的监测,提升对其所导致的暴发疫情进行应急处置的能力。本研究揭示了EV-C96的起源进化,证实了C组肠道病毒多个型别之间的重组关系,为我国肠道病毒的防控提供科学依据。
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关键词
ev-c96
新型肠道病毒
全基因组序列
基因特征
基因重组
原文传递
题名
肠道病毒C组96型(EV-C96)新疆株的全基因组序列分析
被引量:
3
1
作者
孙强
刘莹
唐海淑
李晓嫘
严冬梅
祝双利
王东艳
崔惠
许文波
张勇
机构
中国疾病预防控制中心
新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心免疫规划科
中国科学院生物安全大科学研究中心
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期332-340,共9页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(项目号:31900140),题目:宿主IFITM3蛋白精氨酸甲基化修饰调节抗流感病毒作用研究
艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”科技重大专项(项目号:2017ZX10104001),题目:基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究
+2 种基金
艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”国家科技重大专项(项目号:2018ZX10713002),题目:病毒性传染病病原谱和病毒基因变异变迁规律研究
艾滋病、肝炎等传染病防治“十三五”国家科技重大专项(项目号:2018ZX10101002-005-008),题目:“一带一路”重要传染病流行规律及预警应对技术研究
北京市自然科学基金-海淀原始创新联合基金(基金号:L192014),题目:EVA71疫苗大规模应用后对我国手足口病病原谱的影响及其保护效果评价研究。
文摘
肠道病毒C组96型(EV-C96)是C组肠道病毒的一种新型肠道病毒,在临床上多与急性弛缓性麻痹等疾病相关联,世界分布较广,近年来陆续在中国、芬兰等多个国家的急性弛缓性麻痹患者、腹泻患者、健康人群或环境标本中分离到。为探究在我国新疆地区流行的EV-C96毒株的基因特征与进化特征,本研究对2011年从我国新疆地区一名急性弛缓性麻痹病例及一名接触者中分离到的两株EV-C96进行了全基因组序列测定,随后与全球EV-C96流行株以及C组肠道病毒原型株进行进化分析,与C组肠道病毒代表株进行核苷酸和氨基酸相似性分析和重组分析。结果显示,两株新疆EV-C96毒株与原型株以及1991年在我国山东地区分离的毒株等早期流行株分布于两个分支,且在基因组结构的多个区域核苷酸差异性较大,同时其非结构蛋白区域与其它型别的C组肠道病毒之间存在重组。EV-C96可能通过重组方式发生毒力改变,需加强C组肠道病毒在我国的监测,提升对其所导致的暴发疫情进行应急处置的能力。本研究揭示了EV-C96的起源进化,证实了C组肠道病毒多个型别之间的重组关系,为我国肠道病毒的防控提供科学依据。
关键词
ev-c96
新型肠道病毒
全基因组序列
基因特征
基因重组
Keywords
ev-c96
New enterovirus
Whole-genome sequence
Gene characteristics
Gene recombination
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肠道病毒C组96型(EV-C96)新疆株的全基因组序列分析
孙强
刘莹
唐海淑
李晓嫘
严冬梅
祝双利
王东艳
崔惠
许文波
张勇
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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已选择
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参考文献
引证文献
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