期刊文献+
共找到3,221篇文章
< 1 2 162 >
每页显示 20 50 100
猕猴桃果肉颜色性状基因及其EST-SSR标记发掘
1
作者 孙淑霞 涂美艳 +6 位作者 李靖 陈栋 宋海岩 徐子鸿 廖明安 李明章 江国良 《分子植物育种》 北大核心 2025年第5期1469-1480,共12页
果肉颜色是猕猴桃重要的品质性状,不同果肉颜色的猕猴桃在色素成分、糖和维生素C含量等方面存在很大差异。为了探究猕猴桃果肉颜色形成的分子机制,本研究以红肉猕猴桃‘红实2号’和黄肉猕猴桃‘金实1号’为研究对象,采用RNA-seq技术,通... 果肉颜色是猕猴桃重要的品质性状,不同果肉颜色的猕猴桃在色素成分、糖和维生素C含量等方面存在很大差异。为了探究猕猴桃果肉颜色形成的分子机制,本研究以红肉猕猴桃‘红实2号’和黄肉猕猴桃‘金实1号’为研究对象,采用RNA-seq技术,通过分析果实不同时期不同部位的转录组表达差异。结果表明,编码花青素合成的Achn385311(3GGT)基因可能是控制‘红实2号’内果皮呈红色的主效基因,‘金实1号’后期果肉呈深黄色可能与Achn158981(GT7)、Achn150731、Achn068721(PAO)、Achn282201(PAO)和Achn176251(UGT71A16)等基因的表达调控有关。针对差异表达的230个猕猴桃果肉颜色相关基因,利用Primer Premier 5.0设计出727对EST-SSR引物,以7份不同果肉颜色的猕猴桃基因组DNA为模板,随机选择112对引物进行有效性验证,筛选出了具有清晰的扩增产物的引物78对,有效扩增率为69.64%,58对具有多态性,多态性频率为74.36%。本研究结果为猕猴桃果实呈色机理研究及分子标记辅助育种提供了理论基础。 展开更多
关键词 猕猴桃 转录组 花青素 类胡萝卜素 est-SSR
原文传递
基于EST-SSR的钟花樱与近缘种的聚类分析及嫁接亲和性研究
2
作者 刘夔 李梓函 +4 位作者 张依 郝文洁 姜蕾 叶琦 付涛 《广西植物》 北大核心 2025年第4期761-772,共12页
该研究以16种樱属植物为研究材料,利用EST-SSR分子标记技术对其进行聚类分析,旨在为钟花樱及其近缘种的物种分类、物种资源保护、砧木选择和杂交亲本选择提供分子水平的依据和技术支持。结果表明:(1)遗传多样性分析发现17对EST-SSR引物... 该研究以16种樱属植物为研究材料,利用EST-SSR分子标记技术对其进行聚类分析,旨在为钟花樱及其近缘种的物种分类、物种资源保护、砧木选择和杂交亲本选择提供分子水平的依据和技术支持。结果表明:(1)遗传多样性分析发现17对EST-SSR引物共检测出98个等位基因,每对引物平均为5.76个,有效等位基因数(N_(e))为1.16~7.64,平均值为3.22;观察杂合度(H_(o))为0.04~0.54,平均值为0.28;期望杂合度(H_(e))为0.58~0.92,平均值为0.77;Shannon’s指数(I)为1.38~2.65,平均值为2.14;多态信息含量(PIC)为0.62~0.92,平均值为0.78。(2)聚类分析结果发现除了野生早樱和黑樱桃外,其余14个物种亲缘关系密切,聚为一大类(遗传相似系数C_(GS)为0.6531~0.9184),其中,钟花樱和高盆樱之间的亲缘关系最高(C_(GS)=0.9184),钟花樱和野生早樱之间的亲缘关系最低(C_(GS)=0.7755),因此,建议使用亲缘关系较远的野生早樱和黑樱桃与钟花樱进行杂交实验。(3)在我国南方的生产实践中,已出现以华中樱为砧木,以钟花樱为接穗嫁接的高接苗。因此,从理论上讲,与钟花樱亲缘关系较近的华中樱、山樱、散毛樱和浙闽樱等也可以作为砧木,但还应考虑砧木的抗性、长势、繁殖和寿命等。通过嫁接实验得知,华中樱和山樱作为砧木嫁接钟花樱成活率最高(≥80%),与分子实验基本一致,比较适合作为嫁接钟花樱的砧木。该研究结果为钟花樱的选育、繁殖、保护和利用以及樱属之间的物种分类提供了分子依据。 展开更多
关键词 樱属 钟花樱 遗传多样性 亲缘关系 育种 est-SSR
在线阅读 下载PDF
基于RNA-seq的冰草EST-SSR标记开发及验证 被引量:1
3
作者 杨东升 李冉 +4 位作者 宝格日乐 王海伟 卢倩倩 郝水源 刘建华 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第7期891-901,共11页
冰草是小麦抗逆遗传改良的重要近缘植物,开发冰草基因组分子标记对于加快冰草的遗传育种效率和利用具有重要意义。本研究基于转录组测序(RNA-seq)技术,对2个冰草材料的幼嫩根、茎、叶片及结实期的花穗、种子进行生物信息学分析,开发高... 冰草是小麦抗逆遗传改良的重要近缘植物,开发冰草基因组分子标记对于加快冰草的遗传育种效率和利用具有重要意义。本研究基于转录组测序(RNA-seq)技术,对2个冰草材料的幼嫩根、茎、叶片及结实期的花穗、种子进行生物信息学分析,开发高多态性的EST-SSR标记并进行验证。结果表明,共获得23491793条高质量序列,其碱其长7.03 Gb,GC含量56.44%,Q30为93.04%。共获得33993条Unigene,总长度为29309958 bp。将所获Unigene与9大功能数据库进行比对,共有25614条Unigene获得功能注释,其中Nr数据库共注释24557条,GO数据库注释到66193条Unigene,按功能分为3个大类和42个亚类;共14412条Unigene注释到KEGG数据库的136条代谢通路;有11321条Unigene在KOG数据库获得注释,归属为25个功能类别;共预测到大于100 bp的CDS有7288条,SSR位点2443个,其中三碱基重复1439个,占总数的58.90%;获得EST-SSR多态性引物42对,从中随机选择10对在冰草的30个F_(2)代分离单株进行有效性验证,平均多态性比率为48.33%。以上结果说明利用RNA-seq技术大量开发的EST-SSR引物,可高效地应用于四倍体冰草产量、品质性状相关的标记开发、优异新种质指纹图谱构建及精准分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 冰草 RNA-SEQ 生物信息学分析 est-SSR标记开发 验证
在线阅读 下载PDF
异质生境下山东银莲花的转录组分析及EST-SSR分子标记开发
4
作者 单筱涵 安康 +4 位作者 周春霞 张鑫 逄玉娟 李丽霞 卞福花 《广西植物》 北大核心 2025年第1期95-107,共13页
为探究稀有物种山东银莲花在全光照的山顶灌丛和阴暗的针阔混交林下两种不同生境中的生态适应机制,并开发其EST-SSR分子标记,该研究利用Illumina高通量测序技术对开花期的山东银莲花叶片进行转录组测序,获取其功能注释和差异表达基因(DE... 为探究稀有物种山东银莲花在全光照的山顶灌丛和阴暗的针阔混交林下两种不同生境中的生态适应机制,并开发其EST-SSR分子标记,该研究利用Illumina高通量测序技术对开花期的山东银莲花叶片进行转录组测序,获取其功能注释和差异表达基因(DEGs)。结果表明:(1)转录组测序共得到53536条Unigenes序列,其中27448条成功获得注释。(2)差异表达基因5635个,1600个在山顶灌丛的山东银莲花中上调表达,其余4035个下调表达。有2460个差异表达基因注释到GO数据库2533个三级条目中,1051个差异表达基因注释到KEGG数据库的113条代谢通路中。(3)山东银莲花适应于异质生境的代谢通路主要涉及光合作用-天线蛋白通路和类黄酮生物合成通路,光合作用-天线蛋白通路中lhca 5基因上调表达,lhcb 1、lhcb 2和lhcb 3基因下调表达,类黄酮生物合成通路中chs、c 4 h、f 3′h、f 3 h、fls、ans、chi、ccoaomt和hct基因均上调表达。(4)从山东银莲花转录组数据中共获得7146个SSR位点分布于6006条Unigenes序列中,共计106种重复基序,优势重复基序为单核苷酸重复。设计合成100对EST-SSR引物中共有68对引物具有有效性,其中11对具有多态性,共扩增24个多态性片段。该研究首次开发了山东银莲花EST-SSR分子标记,为山东银莲花的保护和利用提供了重要的分子标记资源。 展开更多
关键词 异质生境 山东银莲花 转录组 est-SSR 生态适应机制
在线阅读 下载PDF
云南南涧县古茶树资源遗传多样性的EST-SSR分析
5
作者 刘娇 杨雄伟 +2 位作者 何胜聪 程小毛 黄晓霞 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2025年第3期261-268,共8页
为探究栽培型古茶树阿萨姆茶(Camellia sinensis var. assamica)种质资源的遗传多样性,采用EST-SSR分子标记技术对云南南涧县无量山镇古茶园64份种质资源进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明, 20对引物共检测出223个等位基因,群体... 为探究栽培型古茶树阿萨姆茶(Camellia sinensis var. assamica)种质资源的遗传多样性,采用EST-SSR分子标记技术对云南南涧县无量山镇古茶园64份种质资源进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明, 20对引物共检测出223个等位基因,群体间平均有效等位基因数为3.48个;观测等位基因数(N_(a))为6.25;有效等位基因数(N_(e))为2.983;Shannon多样性指数(I)为1.251;Nei基因多样性指数(H)为0.646。POPGENE分析表明遗传分化系数(F_(st))为0.063,居群间存在中度分化,基因流(N_(m))为3.710。AMOVA分子方差分析表明,阿萨姆茶的遗传变异14%发生在居群间,86%发生在居群内,说明阿萨姆茶居群遗传变异主要发生在居群内部,且基因交流丰富。南涧县古茶园古茶树居群的遗传多样性丰富,这为阿萨姆茶种质资源的保护利用和新品种选育提供了科学依据。 展开更多
关键词 古茶园 古茶树 est-SSR 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
基于转录组序列的龙脑樟EST-SSR标记开发及通用性分析
6
作者 黄文丁 胡蓉 +6 位作者 赖猛 杨亮 罗馨 陈婷萱 谢文磊 谢海萍 易敏 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第5期79-86,共8页
利用MISA软件对通过转录组测序获得的187095条龙脑樟unigenes进行SSR位点检测,探讨SSR的分布规律及组成特征并设计引物,进行引物多态性和通用性分析。结果表明:在187095条unigenes中共搜索到90590个SSR位点,SSR出现频率为48.42%,平均1.9... 利用MISA软件对通过转录组测序获得的187095条龙脑樟unigenes进行SSR位点检测,探讨SSR的分布规律及组成特征并设计引物,进行引物多态性和通用性分析。结果表明:在187095条unigenes中共搜索到90590个SSR位点,SSR出现频率为48.42%,平均1.99 kb出现1个SSR位点,含有SSR位点的unigenes共计68573个,SSR发生频率为36.65%。龙脑樟EST-SSR重复类型中除单核苷酸外,二核苷酸重复类型出现频率最高,其次是三核苷酸。在检测到的21777个二核苷酸重复SSR中,重复单元AG/CT(16.06%)数量最多,为优势重复单元,其次是AT/AT(5.37%)、AC/GT(2.53%)、CG/CG(0.09%)。三核苷酸中AAG/CTT(4.37%)出现频率最高,为优势重复单元。利用Primer3.0设计并合成118对SSR引物,有96对扩增成功(81.36%),其中14对呈现多态(11.86%),在5种不同化学类型中的平均多态性信息含量(PIC)为0.381,其中有3对引物属于高多态性位点。开发的14对EST-SSR引物在同属的油樟、牛樟、黄樟、阴香、猴樟等5个物种中的通用性为100%。综上所述,基于龙脑樟转录组开发的EST-SSR标记具有较高的多态性和通用性,该方法是可行的。 展开更多
关键词 龙脑樟 转录组 est-SSR标记 通用性
在线阅读 下载PDF
冰草高蛋白含量相关EST-SSR标记开发与验证
7
作者 杨东升 刘雨雷 +5 位作者 王海伟 苏志芳 王海燕 郭利平 安琪 郝水源 《草业科学》 北大核心 2025年第9期2244-2251,共8页
粗蛋白含量是冰草(Agropyron)重要的营养品质性状之一。为获得与冰草粗蛋白含量紧密相关的EST-SSR标记,本试验以蒙古冰草(A.mongolicum)、航道冰草(A.cristatum)及其杂交加倍后代四倍体冰草F_(2)分离群体为材料,基于群体分离分析法(BSA... 粗蛋白含量是冰草(Agropyron)重要的营养品质性状之一。为获得与冰草粗蛋白含量紧密相关的EST-SSR标记,本试验以蒙古冰草(A.mongolicum)、航道冰草(A.cristatum)及其杂交加倍后代四倍体冰草F_(2)分离群体为材料,基于群体分离分析法(BSA)技术,利用42对EST-SSR引物进行PCR扩增,开发、筛选冰草高蛋白含量相关的ESTSSR标记,并通过F_(2)分离单株进行标记位点验证和相关性分析。结果表明:获得1个与粗蛋白含量相关的分子标记SSR-BC5-82,该标记与粗蛋白含量呈极显著相关关系(P<0.01),准确度高、可靠性强。本研究结果对高效创制四倍体冰草高蛋白新种质及丰富冰草分子标记类型具有重要意义。 展开更多
关键词 冰草 高蛋白含量 est-SSR标记 开发 验证
在线阅读 下载PDF
基于EST-SSR分子标记的艾种质资源遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建
8
作者 马钰洋 陈昌婕 +3 位作者 王明星 方艳 苗玉焕 刘大会 《中国中药杂志》 北大核心 2025年第9期2356-2364,共9页
探讨不同艾种质资源的遗传多样性及遗传进化关系,为艾种质鉴定、品种选育及资源保护提供依据。以192份艾种质资源为研究对象,利用艾转录组数据筛选设计简单重复序列(EST-SSR)引物,对不同艾种质资源进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并利用... 探讨不同艾种质资源的遗传多样性及遗传进化关系,为艾种质鉴定、品种选育及资源保护提供依据。以192份艾种质资源为研究对象,利用艾转录组数据筛选设计简单重复序列(EST-SSR)引物,对不同艾种质资源进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并利用荧光毛细管电泳技术检测,分析其遗传多样性并构建DNA指纹图谱。从设计的197对引物中共筛选出28对具有多态性且条带清晰的引物,从中共检测到278个等位基因,平均每对引物检测到9.900 0个等位基因,平均有效等位基因为1.407 2个。艾种质资源的Shannon′s多样性信息指数(I)介于0.148 1~0.418 0,平均为0.255 7;多态信息含量(PIC)变化范围为0.454 5~0.878 0,平均为0.766 9,表现出较高的多态性。聚类分析可将艾种质资源分为3大类,其中类群Ⅰ包含136份种质,类群Ⅱ包含45份种质,类群Ⅲ包含11份种质。主成分分析将资源分为3个类群,与聚类结果基本一致。Mantel test检测显示,艾种群的遗传变异在一定程度上受到地理距离的影响,但影响不大。Structure分析显示有190份种质材料的Q≥0.6,其基因来源较单一。进一步从28对引物中筛选出了8对核心引物,能够将各种质进行区分,并基于这8对核心引物成功构建了192份艾种质资源的DNA指纹图谱。EST-SSR分子标记可用于艾遗传多样性和亲缘关系的研究,可为艾种质资源的品种鉴定和分子辅助育种提供理论支撑。 展开更多
关键词 est-SSR 遗传多样性 聚类分析 DNA指纹图谱
原文传递
基于EST复合菌的化工业废水处理实验研究
9
作者 宋桂栋 《山西化工》 2025年第5期251-254,共4页
为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正... 为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正常运行实验三个阶段。通过对比分析启动实验与正常运行实验的数据,评估EST复合菌在处理化工业废水中的性能。研究结果表明,EST复合菌在提高废水处理效率、增强难降解有机物去除能力及稳定系统运行方面表现出色。 展开更多
关键词 est复合菌 化工业 废水 处理 实验
在线阅读 下载PDF
基于转录组测序的侧柏EST-SSR引物开发与鉴定分析
10
作者 李锦秋 毕楷杰 +3 位作者 王立成 柳俊明 李清泉 顾丽姣 《林业与生态科学》 2025年第3期239-246,共8页
为了评价和利用侧柏种质资源,基于转录组测序技术,以侧柏的根、茎、叶为材料开发EST-SSR引物,并以黄叶侧柏MC1的半同胞子代黄叶苗和绿叶苗为样本,评估引物在不同侧柏资源中的适用性和多态性。结果表明根器官转录组中SSR位点数大于茎器... 为了评价和利用侧柏种质资源,基于转录组测序技术,以侧柏的根、茎、叶为材料开发EST-SSR引物,并以黄叶侧柏MC1的半同胞子代黄叶苗和绿叶苗为样本,评估引物在不同侧柏资源中的适用性和多态性。结果表明根器官转录组中SSR位点数大于茎器官、叶器官。叶器官中SSR重复类型大于茎器官、根器官。3个器官中优势基序均为A/T、AG/CT、AAG/CTT。3个器官中10、15、18 bp长度的SSR数量最多。60对EST-SSR引物有效率为100%,多态性率为16.67%,不同引物PIC值的变化范围为0.322~0.722。利用10对多态性引物扩增产物数据将样本进行聚类分析和遗传分析,并推测MC1半同胞子代有50%属于异交子代,其余疑似为自交子代,在遗传距离为200时,异交子代群体和疑似自交子代群体被划分为13大类群。 展开更多
关键词 黄叶侧柏MC1 转录组 est-SSR 子代鉴定
在线阅读 下载PDF
基于EST-SSR标记的朱顶红种质资源鉴定 被引量:4
11
作者 吕文涛 娄文睿 +1 位作者 娄晓鸣 宣继萍 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第4期1123-1132,共10页
以历年引进的朱顶红种质资源为试验材料,将其按照近似花品种和同名品种进行分组,其中近似花品种包括12个组合45个品种,同名品种包括12个组合31个品种,从已开发的EST-SSR标记中筛选多态性引物,对这些引进的朱顶红种质资源进行鉴定。结果... 以历年引进的朱顶红种质资源为试验材料,将其按照近似花品种和同名品种进行分组,其中近似花品种包括12个组合45个品种,同名品种包括12个组合31个品种,从已开发的EST-SSR标记中筛选多态性引物,对这些引进的朱顶红种质资源进行鉴定。结果表明:从朱顶红转录组开发的7对SSR标记中利用其中5对进行本次试验,通过近似花组合聚类结果分析得出,12个组合中,5个组合部分品种遗传相似系数较高,大部分组合及品种呈现错综复杂的亲缘关系;同名组合聚类结果为12个组合中有9个组合大部分品种聚在一起;‘橙色君主’、‘苹果花’和‘帆船’3个组合遗传背景复杂。部分组合亲缘关系可以看出,多组白色单瓣和红白条纹单瓣组合的遗传相似系数较高,多组重瓣和单瓣品种聚在一起。朱顶红具有丰富的遗传多样性,本研究为研究朱顶红品种间的亲缘关系,进行朱顶红种质资源鉴定提供参考。 展开更多
关键词 朱顶红 est-SSR标记 聚类分析 资源鉴定
原文传递
结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析
12
作者 黄春琼 何潇 +2 位作者 罗丽娟 董荣书 刘国道 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2386-2393,共8页
本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料,利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat,EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明:从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引... 本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料,利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat,EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明:从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引物;共检测到124个标记,平均每对引物检测到4个,多态性标记有108个,多态性位点百分率为88.60%;种质间遗传相似性系数为0.530~0.864,平均为0.711;共检测到104个观察等位基因,平均每对引物检测到3个;有效等位基因数范围为0~5,平均为3;Shannon信息指数变化范围为0~1.593,平均为0.940。Nei’s基因多样性指数范围为0~0.793,平均为0.541;在遗传相似性系数为0.800时,利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)法将43份种质划分为4个类群,聚类结果与种质地理位置有一定的关联,但联系不紧密。本研究结果表明43份种质的遗传多样性处于上等水平,EST-SSR标记能有效地评价结缕草属种质的遗传差异,为结缕草属种质资源的鉴定评价及分子标记辅助育种提供参考依据。 展开更多
关键词 结缕草属 est-SSR 分子标记 遗传多样性 群体结构
在线阅读 下载PDF
利用EST-SSR标记分析绿豆农家种及育成品种的遗传多样性 被引量:3
13
作者 王月影 范保杰 +9 位作者 曹志敏 王彦 苏秋竹 张志肖 王珅 时会影 沈颖超 程须珍 刘长友 田静 《作物杂志》 北大核心 2024年第1期73-79,共7页
利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PI... 利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PIC)0.70。与育成品种相比,绿豆农家种的观测等位变异数、Ne、期望杂合度和PIC较高,表明农家种的遗传多样性高于育成品种。Structure分析可以将所有材料分为3个组群,组群内资源有按地理来源聚集的趋势,3个组群内种质间的平均遗传距离相差不大。利用UPGMA法进行聚类分析,可将所有参试绿豆材料分为A、B、C三大类群,类群A集中了大部分育成品种,类群B和C则以农家种为主。12个不同地理来源资源群体的遗传一致度介于0.4706~0.9627。 展开更多
关键词 绿豆 est-SSR标记 种质资源 遗传多样性
原文传递
蜜本南瓜EST-SSR标记开发及多态性分析 被引量:3
14
作者 杨也 李胜辉 +1 位作者 张素勤 耿广东 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第6期1934-1943,共10页
为研究和开发蜜本南瓜EST-SSR标记,本试验以蜜本南瓜为材料,经RNA提取、cDNA文库构建和转录组测序,获得36.96 Gb序列数据,组装并去冗余后得到157 943条unigene。使用MISA (v1.0)软件进行SSR检测,结果表明59 365个SSR位点分布于41 097条u... 为研究和开发蜜本南瓜EST-SSR标记,本试验以蜜本南瓜为材料,经RNA提取、cDNA文库构建和转录组测序,获得36.96 Gb序列数据,组装并去冗余后得到157 943条unigene。使用MISA (v1.0)软件进行SSR检测,结果表明59 365个SSR位点分布于41 097条unigene中,SSR分布频率为37.59%,发生频率为26.02%,平均分布距离为4 672 bp。单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复所占比例最高,三者占EST-SSR总数的90.37%,其中以二核苷酸重复最多(30.62%),其优势重复基序为AG/CT。以MB21、2202、M10B三个南瓜材料的DNA为模板进行多态性分析,结果表明30对引物中6对引物的扩增产物表现出良好的多态性。本研究开发了蜜本南瓜EST-SSR标记并分析其多态性,可为南瓜品种分子鉴定、遗传图谱构建和遗传多样性分析等提供理论基础。 展开更多
关键词 蜜本南瓜 转录组 est-SSR 多态性
原文传递
从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究 被引量:22
15
作者 李华盛 范术丽 沈法富 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2005年第4期211-216,共6页
利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。... 利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物25对,其中24对引物有扩增产物,17对产物条带比较清晰,对这些条带比较清晰的产物作了一系列的分析。 展开更多
关键词 微卫星标记 estS 棉花 est数据库 微卫星序列 est序列 生物信息学 标记筛选 重复序列 碱基序列 序列设计 扩增产物 引物 清晰 条带
在线阅读 下载PDF
脆木耳转录组EST-SSR标记特征及多态性分析 被引量:1
16
作者 王艺琴 张素勤 +4 位作者 郭豪 田怀志 熊兴伟 刘进平 耿广东 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第8期2611-2619,共9页
为开发脆木耳EST-SSR标记,本试验从脆木耳转录组测序数据挖掘SSR位点,并设计引物对木耳DNA进行多态性分析,为木耳的遗传育种提供理论基础。结果发现,在脆木耳转录组的52 954条unigene序列中共搜寻到4 600个SSR位点,SSR发生频率为6.85%,... 为开发脆木耳EST-SSR标记,本试验从脆木耳转录组测序数据挖掘SSR位点,并设计引物对木耳DNA进行多态性分析,为木耳的遗传育种提供理论基础。结果发现,在脆木耳转录组的52 954条unigene序列中共搜寻到4 600个SSR位点,SSR发生频率为6.85%,分布频率为8.69%。脆木耳SSR位点共包括112种重复基元;其中,二核苷酸和三核苷酸重复为主要类型,占SSR总数的92.86%。三核苷酸重复最多(66.64%),其优势重复单元为CCG/GGC (8.71%)。从设计引物中随机挑选30对进行PCR扩增,6对引物在3份木耳种质中均能扩增出清晰的目标条带。本试验所获得的EST-SSR可为木耳种质资源鉴定、遗传结构分析及遗传图谱构建等提供参考。 展开更多
关键词 脆木耳 est-SSR 特征 PCR体系优化 多态性
原文传递
菜豆EST-SSR分子标记开发及部分种质分子身份证构建 被引量:2
17
作者 付阳云 文晓鹏 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期63-73,共11页
为开发菜豆高效新型分子标记,从分子水平解析菜豆重要种质的遗传多样性及亲缘关系,基于菜豆转录组数据,设计EST-SSR引物,建立EST-SSR标记系统.利用PCR筛选出多态性引物,结合毛细管电泳,分析81份菜豆种质的亲缘关系,并构建分子身份证.通... 为开发菜豆高效新型分子标记,从分子水平解析菜豆重要种质的遗传多样性及亲缘关系,基于菜豆转录组数据,设计EST-SSR引物,建立EST-SSR标记系统.利用PCR筛选出多态性引物,结合毛细管电泳,分析81份菜豆种质的亲缘关系,并构建分子身份证.通过MISA软件,在菜豆转录组数据85276条非冗余序列中,共挖掘出11649个EST-SSR位点.菜豆转录组SSR标记主要重复单元为1~3个碱基,其中单碱基为主要类型,占总量的56.7%;其次是三碱基重复,占总量的21.1%.从128对EST-SSR引物中筛选出18对多态性高、重复性好的引物进行PCR扩增.供试种质的多态性信息量(PIC)为0.50~0.95,平均为0.88;遗传相似性系数为0.15~0.65,以0.35为阈值可将81份种质分为3大类,其中贵州种质主要分布于第Ⅰ,Ⅲ类,而省外品种仅分布在第Ⅱ类.利用核心引物TDc9和TDc66可以有效区分81份菜豆种质,并构建其分子身份证.研究开发的EST-SSR标记系统,可用于菜豆种质的鉴定及亲缘关系分析. 展开更多
关键词 菜豆 转录组 分子标记开发 est-SSR标记 分子身份证
原文传递
白茶萎凋过程中cDNA文库筛选与EST分析
18
作者 陈静 叶乃兴 +3 位作者 陈桂信 王鹏杰 黄先洲 潘玉华 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第18期6071-6080,共10页
萎凋是白茶品质形成的关键工序。以国家级审定茶树良种‘福鼎大白茶’鲜叶—萎凋叶作为供试材料,利用双链特异性核酸酶(DSN)介导,进行抑制差减杂交技术,构建鲜叶—萎凋叶正向差减文库;利用反向印迹杂交(Northern-blot)技术进行筛选与评... 萎凋是白茶品质形成的关键工序。以国家级审定茶树良种‘福鼎大白茶’鲜叶—萎凋叶作为供试材料,利用双链特异性核酸酶(DSN)介导,进行抑制差减杂交技术,构建鲜叶—萎凋叶正向差减文库;利用反向印迹杂交(Northern-blot)技术进行筛选与评价文库质量,获得具有差异基因的阳性克隆,并将阳性克隆的测序结果进行ESTs分析和归类,分离出白茶加工过程中重要功能基因。从分子生物学角度分析白茶萎凋过程中品质形成的关键代谢途径与其基因调控的具体情况,证实白茶萎凋过程中的基因对品质形成具有重要影响。 展开更多
关键词 白茶 萎凋 CDNA文库 est分析
原文传递
基于EST指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果
19
作者 洪杨 秦芝霞 《淮海医药》 CAS 2024年第1期88-92,共5页
目的:探究基于生态系统理论(EST)指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果。方法:以某院推行基于EST指导的家庭管理模式的延续性护理方案时间(2022年7月)为分界线,将推行前(2022年1月—2022年6月)的105例手外伤修复... 目的:探究基于生态系统理论(EST)指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果。方法:以某院推行基于EST指导的家庭管理模式的延续性护理方案时间(2022年7月)为分界线,将推行前(2022年1月—2022年6月)的105例手外伤修复术后患者列为对照组,予以常规出院指导及延续性护理,推行后(2022年7月—2023年1月)的103例患者列为观察组,予以基于EST指导的家庭管理的延续性护理。比较2组心理状况[心理弹性量表(CD-RISC)]评分、自我护理能力[自我护理能力量表(ESCA)]评分、自我效能[一般自我效能感量表(GSES)]、日常活动能力[改良Barthel指数(MBI)]及手功能运动情况[手指总主动活动度(TAM)、Jamar握力]。结果:干预6个月后,观察组CD-RISC评分中能力[(20.56±2.79)分]、坚韧性[(17.18±1.47)分]、接受改变[(17.62±1.41)分]、控制[(9.87±1.51)分]、精神影响[(6.98±1.25)分]5个维度评分及总分[(72.21±5.41)分]均高于对照组[(19.23±2.57)分、(16.37±1.71)分、(16.44±1.38)分、(8.18±1.34)分、(5.49±1.28)分、(65.71±5.38)分](P<0.05);观察组ESCA评分中自我护理技能[(36.01±3.18)分]、自我护理责任感[(20.23±2.23)分]、自我护理概念[(25.68±1.91)分]、健康知识水平[(37.11±4.73)分]4个维度评分及总分[(119.03±11.35)分]均高于对照组[(31.58±2.74)分、(17.87±2.17)分、(22.02±2.03)分、(32.99±4.81)分、(104.46±13.38)分](P<0.05);观察组GSES、MBI评分分别为(35.43±4.18)分、(90.05±10.24)分,高于对照组的(32.13±4.44)分、(82.79±10.59)分;观察组TAM和Jamar握力分别为(77.01±12.23)°、(38.23±5.23)kg,高于对照组的(65.58±12.44)°、(30.87±5.17)kg,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:基于EST指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中应用效果显著,可有效改善患者心理状况、自我护理能力、自我效能及日常活动能力,对手功能运动的恢复具有积极意义。 展开更多
关键词 手术后医护 est 家庭管理 手外伤
暂未订购
EST-SSR标记在竹亚科植物纤维资源评价中的应用
20
作者 王炳智 田英姿 《造纸科学与技术》 2024年第5期1-6,共6页
开发一批用于竹亚科(Bambusoideae)植物的EST-SSR分子标记,利用其判定样本亲缘关系,结合已有的纤维原料竹种的开发研究数据,给出竹亚科植物纤维资源评价方法与筛选建议。从纤维原料竹种毛竹(Phyllostachys edulis)和早竹(Phyllostachys ... 开发一批用于竹亚科(Bambusoideae)植物的EST-SSR分子标记,利用其判定样本亲缘关系,结合已有的纤维原料竹种的开发研究数据,给出竹亚科植物纤维资源评价方法与筛选建议。从纤维原料竹种毛竹(Phyllostachys edulis)和早竹(Phyllostachys violascens)转录组中挖掘EST-SSR位点并设计引物,利用PCR-PAGE对50对候选引物进行筛选验证。使用生物信息学软件对条带迁移信息进行处理,得到17份竹样本的亲缘关系。比对近缘种在文献中的竹纤维数据,得出竹亚科植物纤维资源评价方法和筛选建议。结果表明,筛选出14对高通用性和多态性引物;有6对竹样本有较近的亲缘关系,且亲缘关系较近的品种,其竹纤维性能也较为相似。得出结论,在开发竹亚科植物纤维原料新品种时,可以从备选品种中,优先考虑纤维性能优良的品种的近缘种。 展开更多
关键词 竹亚科植物 纤维原料 竹纤维 est-SSR 亲缘关系
原文传递
上一页 1 2 162 下一页 到第
使用帮助 返回顶部