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梅花PmERF011转录因子克隆与功能验证
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作者 武金月 李雪 +2 位作者 王月鑫 张启翔 郑唐春 《浙江农林大学学报》 北大核心 2026年第1期76-85,共10页
【目的】揭示梅花Prunus mume株型性状形成的分子机制,明确AP2/ERF转录因子家族在梅花分枝调控中的作用,以期为梅花株型改良提供理论依据和候选基因。【方法】通过基因克隆技术获得PmERF011基因序列,采用生物信息学方法分析其系统进化... 【目的】揭示梅花Prunus mume株型性状形成的分子机制,明确AP2/ERF转录因子家族在梅花分枝调控中的作用,以期为梅花株型改良提供理论依据和候选基因。【方法】通过基因克隆技术获得PmERF011基因序列,采用生物信息学方法分析其系统进化关系及启动子顺式作用元件;利用实时荧光定量PCR检测该基因在梅花不同组织(根、茎、叶)中的时空表达模式;构建过表达载体并转化拟南芥Arabidopsis thaliana,通过表型观察和统计分析验证转基因功能。【结果】PmERF011属于AP2/ERF转录因子家族,与蔷薇科Rosaceae近缘物种(桃P.persica、杏P.armeniaca)高度同源,但与拟南芥、水稻Oryza sativa等差异显著;启动子顺式作用元件分析发现:PmERF011含茉莉酸甲酯与生长素响应元件;组织特异性检测结果显示:PmERF011在根与茎木质部中表达量最高,叶片中表达量较低。转基因拟南芥结果表明:过表达PmERF011显著增加了拟南芥侧枝数量(P<0.05)。【结论】PmERF011具有促进分枝增多的功能,是梅花和李属Prunus植物株型改良的候选基因。 展开更多
关键词 AP2/erf Pmerf011 梅花 株型 转录因子
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基于转录组与sRNA测序的栝楼ERF基因家族鉴定及功能研究
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作者 宋佳辉 张文玉 +3 位作者 胡秀芹 于秀月 张效振 辛杰 《中草药》 北大核心 2026年第2期627-639,共13页
目的 基于转录组测序数据鉴定栝楼Trichosanthes kirilowii ERF基因家族(TkERFs)成员,解析其在栝楼生长发育中的生物学功能,为深入研究栝楼性别分化机制提供理论依据。方法 采用生物信息学方法系统鉴定栝楼ERF基因家族成员,并筛选性别... 目的 基于转录组测序数据鉴定栝楼Trichosanthes kirilowii ERF基因家族(TkERFs)成员,解析其在栝楼生长发育中的生物学功能,为深入研究栝楼性别分化机制提供理论依据。方法 采用生物信息学方法系统鉴定栝楼ERF基因家族成员,并筛选性别分化关键候选基因TkERF2进行功能解析。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析其组织表达模式;构建TkERF2过表达载体,通过亚细胞定位及拟南芥遗传转化实验,结合表型观察、相关基因表达量检测及乙烯含量测定,探究其生物学功能;整合转录组与small RNA组学数据,筛选靶向调控TkERFs的miRNAs,完善其调控网络。结果 基于转录组数据,经开放阅读框(open reading frame,ORF)及保守结构域分析,共鉴定出54个TkERF基因(TkERF1~TkERF54)。其编码蛋白序列长度为101~389个氨基酸,相对分子质量为11 580~43 310,理论等电点(pI)为4.66~10.60。亚细胞定位预测显示74%的TkERFs定位于细胞核,26%分布于叶绿体及细胞质。蛋白质保守基序分析鉴定出10种motif。系统发育树将该家族划分为8个亚族。筛选鉴定出TkERF2、TkERF20和TkERF45受特异性miRNA靶向调控。转基因拟南芥实验表明,TkERF2显著调控乙烯合成途径,且生长素合成基因(AtYUC2、AtYUC6)、生长素响应因子(AtARF8)及生长素转运基因(AtPIN2)的表达量均显著高于野生型(P<0.05),证实TkERF2通过正向调控生长素合成与转运参与发育进程。结论 完成栝楼ERF基因家族的系统鉴定与功能初探,为解析栝楼性别决定机制及遗传改良提供了理论基础。 展开更多
关键词 栝楼 erf基因 性别分化 乙烯 生长素
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Ficus carica ERF12 improves fruit firmness at ripening
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作者 Yanlei Zhai Yuanyuan Cui +4 位作者 Zhiyi Fan Hantang Huang Zhe Wang Shangwu Chen Huiqin Ma 《Horticultural Plant Journal》 2026年第1期114-126,共13页
Fig fruit firmness decreases rapidly during ripening and after harvest,resulting in poor storability and transportation loss,which severely restricts development of the fresh fig industry.APETALA2/ethylene-responsive ... Fig fruit firmness decreases rapidly during ripening and after harvest,resulting in poor storability and transportation loss,which severely restricts development of the fresh fig industry.APETALA2/ethylene-responsive factor(AP2/ERF)transcription factors are downstream components of the ethylene-signaling pathway that play crucial roles in quality formation during fruit ripening.In this study,Ficus carica(Fc)ERF12 was clustered in repressor subfamily VIII of ERFs through phylogenetic analysis,and further recruited by its two EAR motifs and expression pattern during fig ripening.DNA affinity purification sequencing analysis indicated that FcERF12 binds to the promoter or gene body regions of multiple ripening-related genes,including cell wall-modification genes FcPG,FcXTH and FcPME,and ethylene-biosynthesis genes FcACS and FcACO.Yeast two-hybrid assay demonstrated that FcERF12 interacts with TOPLESS(TPL)co-repressors FcTPL1,FcTPL4 and FcTPL5,and histone deacetylases FcHDA6 and FcHDA19;interaction with FcTPL4 and FcTPL5 relied on the C-terminal EAR motif.Overexpressing FcERF12 in tomato did not change fruit size or yield,but resulted in an 18.37%increment in fruit firmness and a 49.62%reduction in ethylene-release rate at fruit ripening,accompanied by a significant decrease in seed number per fruit.Transcriptomic analysis revealed downregulation of tomato cell wallmodification genes SlPL,SlEXP and SlPG,and ethylene-synthesis genes SlACO and SlACS.Metabolomic profiling identified 82 differentially accumulated flavonoid metabolites,61 of them showing significantly decreased contents.Taken together,our results exhibit the negative regulatory role of FcERF12 in fig ethylene-signal transduction,providing new information on precise control of fruit firmness and other quality traits at ripening. 展开更多
关键词 Ficus carica L. Ethylene response factor(erf) EAR motif Fruit ripening FIRMNESS
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VqMAPK3–VqERF1B–VqPRs module confers resistance against Erysiphe necator in grapevine
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作者 Chaohui Yan Juexi Liu +4 位作者 Xiaoxuan Wang Yunfei Wang Yuejin Wang Jiaping Liang Qiliang Yang 《Journal of Integrative Agriculture》 2026年第2期682-693,共12页
Erysiphe necator is a destructive fungal pathogen that compromises grapevine yield and quality,leading to substantial economic losses.Therefore,elucidating host resistance mechanisms is essential.In this study,we iden... Erysiphe necator is a destructive fungal pathogen that compromises grapevine yield and quality,leading to substantial economic losses.Therefore,elucidating host resistance mechanisms is essential.In this study,we identified an ethylene response factor,VqERF1B,that exhibits sustained high expression during E.necator infection in Chinese wild grape Vitis quinquangularis accession ‘Danfeng-2'.Transient overexpression of VqERF1B in grape leaves enhanced resistance to E.necator by elevating transcript levels of pathogenesis-related(PR) genes,including PR1,PR2,PR5,and PR10.Conversely,silencing VqERF1B resulted in increased susceptibility.Moreover,transgenic Arabidopsis lines stably overexpressing VqERF1B exhibited enhanced resistance to powdery mildew,associated with elevated PR gene expression and increased accumulation of reactive oxygen species(ROS).A series of assays identified VqMAPK3,a phosphorylated mitogen-activated protein kinase,as a direct interactor of VqERF1B.Furthermore,VqERF1B was shown to bind directly to the promoters of VqPRs,thereby activating their transcription.Notably,the VqMAPK3-VqERF1B complex exhibited greater transactivation activity on VqPR promoters than VqERF1B alone,indicating that VqMAPK3 positively modulates VqERF1Bmediated transcription of PR genes.This work advances understanding of the molecular basis of grape resistance to E.necator and provides a foundation for molecular breeding strategies. 展开更多
关键词 Erysiphe necator disease resistance erf transcription factor mitogen-activated protein kinase cascade pathway(MAPK) pathogenesis-related gene
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文冠果AP2/ERF基因家族的全基因组鉴定及表达分析
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作者 赵博文 保立 +1 位作者 丁健 陈仁鹏 《林业科学研究》 北大核心 2026年第1期151-163,共13页
[目的]对文冠果中AP2/ERF (APETALA2/乙烯反应元件结合因子)基因家族的染色体定位、基因结构、启动子中顺式作用元件以及盐雾胁迫下的表达模式进行分析,为挖掘XsAP2/ERF在盐雾胁迫下的作用提供参考。[方法]基于文冠果基因组数据,利用NCB... [目的]对文冠果中AP2/ERF (APETALA2/乙烯反应元件结合因子)基因家族的染色体定位、基因结构、启动子中顺式作用元件以及盐雾胁迫下的表达模式进行分析,为挖掘XsAP2/ERF在盐雾胁迫下的作用提供参考。[方法]基于文冠果基因组数据,利用NCBI数据库、MEGA7.0等生物信息学工具对文冠果AP2/ERF基因家族进行鉴定分析。以盐雾(饱和氯化钠)胁迫0、2和4 d的文冠果幼苗叶片为材料,进行转录组测序,分析文冠果AP2/ERF基因的表达规律。[结果](1)在文冠果全基因组中鉴定出145个AP2/ERF基因,这些基因在15条染色体上不均匀分布。(2)通过系统进化和结构域分析,将文冠果AP2/ERF基因家族分为AP2(21个成员)、ERF(119个成员)和RAV(5个成员)3个亚家族,共鉴定出10个保守基序,仅有motif 1为该基因家族的共有基序;且在文冠果AP2/ERF基因家族中有90个基因不含内含子。(3)在文冠果AP2/ERF基因启动子区域共发现19种,共1 930个顺式作用元件,涵盖非生物胁迫、生长发育、植物激素响应三大类,其中,ABA应答元件数量最多(432个);并通过互作分析,筛选出4个与文冠果AP2/ERF转录因子置信度较高的互作蛋白。(4)筛选到10个文冠果AP2/ERF基因(XsAP2/ERF2、XsAP2/ERF22、XsAP2/ERF23、XsAP2/ERF27、XsAP2/ERF48、XsAP2/ERF56、XsAP2/ERF103、XsAP2/ERF111、XsAP2/ERF122、XsAP2/ERF128)在盐雾胁迫期间持续显著上调表达。[结论]XsAP2/ERF家族基因在文冠果响应盐雾胁迫过程中有着重要作用,本项研究对于今后XsAP2/ERF家族基因生物学功能的鉴定与抗盐基因资源的挖掘具有推动作用。 展开更多
关键词 文冠果 AP2基因家族 盐雾胁迫
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番茄转录因子SlERF.F4在番茄果实抵御灰霉病中的功能分析 被引量:1
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作者 陈霞 李珊 +1 位作者 张正科 孟兰环 《植物科学学报》 北大核心 2025年第2期210-220,共11页
番茄(Solanum lycopersicum L.)是世界上种植最广泛的经济作物之一,具有极大的经济价值,但其极易受到灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的影响,造成严重的经济损失。ERF转录因子在植物胁迫响应中发挥关键作用。本研究通过获得番茄SIERF.F4过... 番茄(Solanum lycopersicum L.)是世界上种植最广泛的经济作物之一,具有极大的经济价值,但其极易受到灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的影响,造成严重的经济损失。ERF转录因子在植物胁迫响应中发挥关键作用。本研究通过获得番茄SIERF.F4过表达材料,比较其与野生型果实的差异,研究其介导的番茄果实抗灰霉病的功能。结果显示,与野生型番茄品种‘AC’(‘Ailsa Craig’)果实相比,SIERF.F4过表达(SIERF.F4-OE)番茄果实对灰葡萄孢的抗性较强,表现在灰葡萄孢接种后果实病斑扩展速率较慢。生理生化分析结果表明,SIERF.F4-OE果实体内的活性氧(O_(2)^(-)·产生速率、H_(2)O_(2)含量)和MDA含量低于‘AC’果实,同时,抗氧化酶活性(POD、CAT和SOD酶)高于‘AC’果实。此外,SIERF.F4-OE番茄果实体内苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性高于‘AC’果实。研究结果说明,SIERF.F4可通过调节番茄果实活性氧稳态及防御酶活性增强果实对灰葡萄孢的抵抗能力。 展开更多
关键词 番茄 灰霉病 转录因子erf ROS
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低氮胁迫下芝麻差异表达ERF基因的鉴定及SiERF08基因的表达分析
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作者 田媛 张鹏钰 +4 位作者 李丰 王东勇 付锦州 戎亚思 高桐梅 《河南农业科学》 北大核心 2025年第4期37-46,共10页
AP2/ERF是植物最大的转录因子家族之一,参与植物代谢生物合成、器官发育、逆境响应和激素信号转导等过程。为了探究ERF基因在芝麻低氮胁迫下的表达特性,从前期芝麻根系低氮胁迫转录组中筛选出24个差异表达SiERF基因,对其进行表达特性和... AP2/ERF是植物最大的转录因子家族之一,参与植物代谢生物合成、器官发育、逆境响应和激素信号转导等过程。为了探究ERF基因在芝麻低氮胁迫下的表达特性,从前期芝麻根系低氮胁迫转录组中筛选出24个差异表达SiERF基因,对其进行表达特性和共表达网络分析,并分析了不同胁迫处理下SiERF08基因的表达特性。结果显示,24个差异表达SiERF基因开放阅读框(ORF)长度为564~1254 bp,编码蛋白质的分子质量为20.92~44.97 ku,等电点4.39~10.92。24个差异表达SiERF基因不均匀地分布在13条染色体上。启动子区域包含植物激素响应元件(ABRE、AuxRE等)、逆境胁迫响应元件(ARE、DRE core、LTR等)、生长发育相关顺式作用元件(O2-site、Gap-box和CAT-box)和光响应元件(G-box、MRE、I-box等)。基因表达和韦恩图分析结果显示,低氮胁迫下,芝麻品种缅甸高产者和郑芝HL05分别检测到24个和14个差异表达SiERF基因,其中SiERF06等3个基因在2个品种低氮胁迫3、9 d均差异表达。通过共表达网络分析筛选出SiERF08等5个低氮胁迫响应的关键候选基因。对关键候选基因SiERF08开展不同胁迫下的表达特性分析,结果显示,该基因在低氮、干旱、高盐、赤霉素及水杨酸等胁迫处理下被诱导表达,且不同胁迫处理下,SiERF08基因的表达模式不同。在干旱、高盐、水杨酸、高温和低温处理6 h,SiERF08基因的表达量最高;在低氮处理12 h,SiERF08基因表达量达到峰值;在赤霉素处理下,SiERF08基因在6 h和72 h诱导表达,且差异显著。综上所述,通过生物信息学手段对低氮胁迫下24个差异表达SiERF基因进行分析,筛选出SiERF08等5个关键候选基因,其中,SiERF08基因在低氮、干旱、高盐、水杨酸等胁迫下诱导表达,为深入探究芝麻SiERF基因功能、揭示芝麻耐低氮分子机制提供了理论依据和基因资源。 展开更多
关键词 芝麻 低氮胁迫 erf转录因子 基因表达
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低温胁迫下不同椰子品种AP2/ERF基因表达差异分析
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作者 李静 孙熹微 +4 位作者 刘小妹 丁浩 闫恒芳 冯紫菁 杨耀东 《西南农业学报》 北大核心 2025年第5期987-998,共12页
【目的】模拟低温环境,探讨海南高种椰子和绿矮椰子幼苗在不同低温胁迫处理下的耐寒性,旨在为耐寒椰子新品种的筛选以及培育提供数据支撑,也为探究椰子低温应答机制提供相应的理论依据。【方法】分别以抗寒性较强的海南高种椰子以及低... 【目的】模拟低温环境,探讨海南高种椰子和绿矮椰子幼苗在不同低温胁迫处理下的耐寒性,旨在为耐寒椰子新品种的筛选以及培育提供数据支撑,也为探究椰子低温应答机制提供相应的理论依据。【方法】分别以抗寒性较强的海南高种椰子以及低温较敏感材料绿矮椰子的6月龄幼苗为试验材料,8℃胁迫条件下,在0 h、2 h、8 h、2 d和7 d 5个时间点取样,并对样品进行生理生化指标测定、转录组测序和实时荧光定量PCR分析,拟从基因表达和代谢物水平研究不同品种椰子叶片对低温胁迫的响应机制。【结果】在8℃低温胁迫下,海南高种椰子和绿矮椰子叶片形态发生轻微变化,进一步的生理生化分析发现,耐寒品种海南高种椰子比寒敏感品种绿矮椰子响应低温胁迫更迅速,耐寒性更强。随着低温胁迫处理时间的延长,海南高种椰子和绿矮椰子的叶片电导率上升,而丙二醛含量随胁迫处理时间的延长下降。从海南高种椰子和绿矮椰子低温胁迫不同时间下的转录组数据中鉴定到172个AP2/ERF转录因子,对其中具有显著差异(P<0.05)的36个AP2/ERF转录因子进行结构域以及蛋白质理化性质分析发现,36个AP2/ERF转录因子包括31个ERF、2个RAV、3个AP2亚家族成员。CnAP2/ERF转录因子蛋白序列长度为150~1275 aa,亚细胞定位预测结果显示多数成员定位于细胞核。对36个AP2/ERF基因家族成员表达分析表明,在低温胁迫下,其中17个AP2/ERF基因的表达量在低温胁迫2 d时达到最高,在7 d时下降,11个AP2/ERF基因的表达量在7 d时达到最高。选取6个在海南高种椰子和绿矮椰子中差异显著的AP2/ERF基因进行定量PCR验证,发现其表达趋势与转录组数据结果一致。CBF1/DREB1B基因的相对表达量随着低温胁迫时间的延长而降低,但CBF2基因的表达量随着低温胁迫时间的延长而升高,在低温胁迫2 d时达到最高。【结论】通过探索海南高种椰子和绿矮椰子中不同AP2/ERF基因家族在低温胁迫下的表达模式,为进一步明确海南高种椰子和绿矮椰子耐寒性差异提供参考。最终挑选出6个响应低温胁迫的CnAP2/ERF候选基因,为进一步探索椰子低温应答机制及培育耐寒能力更强的椰子品种提供数据支持和理论参考。 展开更多
关键词 椰子 低温胁迫 AP2/erf CBF 差异分析
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桂花番茄红素β-环化酶基因LCYB上游B2亚组ERF转录因子的筛选和鉴定 被引量:2
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作者 李莉 庞天虹 +1 位作者 付建新 张超 《浙江农林大学学报》 北大核心 2025年第1期86-93,共8页
【目的】筛选并鉴定参与调控桂花Osmanthus fragrans番茄红素β-环化酶OfLCYB基因的B2亚组ERF转录因子。【方法】以桂花品种‘堰虹桂’O. fragrans ‘Yanhong Gui’为材料,从桂花转录组数据库筛选B2亚组OfERF基因,通过生物信息学分析、... 【目的】筛选并鉴定参与调控桂花Osmanthus fragrans番茄红素β-环化酶OfLCYB基因的B2亚组ERF转录因子。【方法】以桂花品种‘堰虹桂’O. fragrans ‘Yanhong Gui’为材料,从桂花转录组数据库筛选B2亚组OfERF基因,通过生物信息学分析、实时荧光定量PCR (RT-qPCR)以及酵母单杂交技术,对OfERF基因序列和表达特性及其对Of LCYB基因启动子结合情况进行分析。【结果】OfLCYB基因启动子序列含有2个ATCTA顺式作用元件;基于桂花转录组数据库筛选出4个B2亚组ERF基因,均包含1个AP2保守结构域;RT-qPCR结果表明:OfERF72a与OfERF72b基因表达量均随着开花进程逐渐下降,与OfLCYB基因表达显著负相关,P分别为0.033 8、0.029 6;酵母单杂交结果证明:OfERF72b与OfLCYB启动子之间存在物理结合。【结论】OfERF72b可能通过调控OfLCYB的转录参与桂花类胡萝卜素的代谢。 展开更多
关键词 桂花 类胡萝卜素 erf转录因子 基因功能
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牡丹AP2/ERF转录因子的全基因组分析 被引量:1
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作者 许朵朵 杜倩倩 +4 位作者 赵理想 栗燕 黄淦 李永华 逯久幸 《中国农业科学》 北大核心 2025年第23期5031-5045,共15页
【目的】挖掘牡丹AP2/ERF基因家族在花发育中的功能,为精细化调控牡丹花型育种提供理论依据。【方法】以牡丹基因组为基础,系统鉴定牡丹AP2/ERF基因家族成员,进行系统进化分析、基因结构分析、顺式元件分析和重复事件分析。自公共数据... 【目的】挖掘牡丹AP2/ERF基因家族在花发育中的功能,为精细化调控牡丹花型育种提供理论依据。【方法】以牡丹基因组为基础,系统鉴定牡丹AP2/ERF基因家族成员,进行系统进化分析、基因结构分析、顺式元件分析和重复事件分析。自公共数据库下载拟南芥、水稻、葡萄和枫香树的基因组文件,并以牡丹为参照进行种间共线性分析。利用全球公共数据库下载所有牡丹组织测序不同部位的RNA-seq数据集,进行文件拆分、序列比较,最后通过TBtools构建热图对牡丹AP2/ERF基因家族成员的功能进行预测。通过主成分分析和层次聚类分析对样本间的整体相关性进行评估。通过对12个基因进行实时荧光定量分析,验证家族成员组织特异性表达的有效性。【结果】共鉴定出126个AP2/ERF家族成员,通过系统发育分析,将其划分为AP2、ERF、DREB和RAV 4个亚家族和1个未分类(Soloists)序列。根据共线性分析,鉴定到122个基因锚定在牡丹5条染色体上,共含有73对共线性基因。牡丹与枫香树、葡萄同源基因对数远多于牡丹与拟南芥、水稻的同源基因对,表明各亚家族内部存在高度的保守性,且常伴随UTR的缺失。顺式元件分析表明,牡丹AP2/ERF家族基因主要参与植物生长发育、激素响应、非生物胁迫应答和光信号调控过程。表达分析显示,鉴定到的126个AP2/ERF家族成员中有48%的基因参与了花发育的过程。筛选出12个与花发育相关的AP2/ERF成员(3个来自AP2亚家族、6个来自DREB亚家族和3个来自ERF亚家族),以‘凤丹白’牡丹的根、茎、叶、盛花期花瓣和5个分化时期花芽为材料,进行qRT-PCR试验,结果显示,83%的基因与预测的表达情况吻合。【结论】牡丹AP2/ERF家族的扩张是串联复制以及染色体片段复制造成的。牡丹AP2/ERF家族的扩张发生在牡丹与拟南芥分化后。牡丹中除了AP2亚家族,ERF和DREB亚家族的部分基因也参与了牡丹花发育的过程,进一步说明牡丹AP2/ERF家族成员的功能与其他植物存在较大差异。 展开更多
关键词 牡丹 基因鉴定 AP2/erf 花发育 基因组 主成分分析 QRT-PCR
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ERF 转录因子在植物逆境响应中的作用 被引量:1
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作者 王欣悦 赵楠 +5 位作者 王嫱 杨森 邵庆一 曹佳昂 王雪松 刘丽杰 《高师理科学刊》 2025年第2期63-67,共5页
植物在生长发育过程中,经常会受到各种外界因素的影响,如低温、干旱、盐渍及病虫害等,植物体内具有一系列响应机制来应对各种外界不利因素的影响.AP2/ERF是植物中最大的转录因子超家族,在许多物种中都有发现,ERF亚家族在结构上含有一个... 植物在生长发育过程中,经常会受到各种外界因素的影响,如低温、干旱、盐渍及病虫害等,植物体内具有一系列响应机制来应对各种外界不利因素的影响.AP2/ERF是植物中最大的转录因子超家族,在许多物种中都有发现,ERF亚家族在结构上含有一个保守的AP2/ERF结构域,其上的顺式作用元件能够响应多种应答.许多研究表明,植物在面对逆境胁迫时,ERF转录因子家族参与了多种胁迫反应,对植物的生长发育起重要作用.对ERF转录因子家族的结构、功能以及近年来该转录因子在植物逆境胁迫下的响应机制和研究进展进行阐述,旨在为后续进一步研究其抗逆作用机理提供理论依据和实践参考. 展开更多
关键词 erf转录因子 生物胁迫 非生物胁迫
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山药花青素合成相关ERF基因鉴定和分析
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作者 马隆隆 李顺朋 +5 位作者 汪厚民 张昊 王瑞飞 李朝闯 李明军 杨清香 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第10期95-102,共8页
乙烯响应因子(ERF)是调控植物逆境响应与花青素合成的一类重要转录因子。本研究基于盐碱胁迫下绿色和紫色山药植株的转录组数据,共鉴定到28个显著差异表达的ERF家族成员,这些蛋白均具有保守的AP2结构域、典型WLG和YRG单元、保守串联基序... 乙烯响应因子(ERF)是调控植物逆境响应与花青素合成的一类重要转录因子。本研究基于盐碱胁迫下绿色和紫色山药植株的转录组数据,共鉴定到28个显著差异表达的ERF家族成员,这些蛋白均具有保守的AP2结构域、典型WLG和YRG单元、保守串联基序motif 2-motif 3-motif 1。氨基酸序列分析表明,ERFs蛋白的氨基酸数量为143~327个,分子量15.9~35.3 kDa,理论等电点4.78~9.73,以酸性、亲水性蛋白为主,且均可定位在细胞核,其中9个成员同时定位在细胞质。系统进化分析显示,28个ERFs蛋白与其他物种已知花青素合成相关ERFs存在较高同源性,暗示它们可能参与花青素合成;同时,它们的启动子序列中含有响应光、激素、环境胁迫及生长发育的顺式作用元件。研究结果为后续开展山药ERF蛋白在花青素合成方面的功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 山药 erf基因 盐碱胁迫 花青素 转录组
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灰毡毛忍冬AP2/ERF家族成员鉴定及表达分析
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作者 周思敏 瞿美玲 +6 位作者 曾娟 何佳蔚 张惊宇 王志辉 童巧珍 周日宝 刘湘丹 《中国中药杂志》 北大核心 2025年第15期4248-4262,共15页
AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,在调控植物成花、花发育、花开放、花衰老等环节具有重要作用。该文基于灰毡毛忍冬2个品种花、叶、茎样品转录组数据鉴定得到117条灰毡毛忍冬AP2/ERF家族成员,其中14个AP2亚家族成员... AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,在调控植物成花、花发育、花开放、花衰老等环节具有重要作用。该文基于灰毡毛忍冬2个品种花、叶、茎样品转录组数据鉴定得到117条灰毡毛忍冬AP2/ERF家族成员,其中14个AP2亚家族成员、61个ERF亚家族成员、40个DREB亚家族成员、2个RAV亚家族成员,利用NCBI、ExPASy、SOMPA等多个网站进行相关基因的生物信息学分析以及差异基因表达分析,利用qRT-PCR验证灰毡毛忍冬AP2/ERF转录因子的表达情况。结果表明,117条LmAP2/ERF在蛋白理化性质、AP2结构域、家族进化、蛋白功能等方面具有相似性和可变性。差异基因表达分析结果表明AP2/ERF转录因子主要在灰毡毛忍冬2个品种的花中差异表达,差异表达基因主要为ERF亚族和DREB亚族基因,进一步得到分析潜在调控灰毡毛忍冬花发育的AP2亚族基因3条、ERF亚族基因2条,调控花开放的ERF亚族基因2条,调控花衰老的ERF亚族基因2条和DREB亚族基因1条。结合家族进化分析及表达分析推测AP2/ERF转录因子能够调控灰毡毛忍冬花发育、开放及衰老,ERF亚家族基因可能为影响灰毡毛忍冬花期长短的关键基因。该研究为后续研究灰毡毛忍冬AP2/ERF转录因子家族具体功能提供了理论基础,为研究灰毡毛忍冬品种间花表型差异的分子机制提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 灰毡毛忍冬 AP2/erf 生物信息学 转录因子
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猕猴桃AP2/ERF家族成员鉴定与分析
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作者 毛可欣 李健 +3 位作者 吕巍 王海荣 安淼 李国田 《分子植物育种》 北大核心 2025年第2期402-414,共13页
本研究对‘红阳’猕猴桃基因组鉴定得到219个AP2/ERF家族基因,对其进行了多序列比对,并构建系统发育进化树。根据序列所包含的保守结构域和motif进行分类鉴定,确立猕猴桃AP2/ERF家族可以分为AP2、ERF和RAV 3类,AP2分类中包含40个基因,而... 本研究对‘红阳’猕猴桃基因组鉴定得到219个AP2/ERF家族基因,对其进行了多序列比对,并构建系统发育进化树。根据序列所包含的保守结构域和motif进行分类鉴定,确立猕猴桃AP2/ERF家族可以分为AP2、ERF和RAV 3类,AP2分类中包含40个基因,而RAV中只有4个,ERF序列较多,分为9个子类。顺式作用元件分析显示,该家族基因参与多种植物激素途径,参与植物的生长发育以及对各种外界胁迫响应。通过共线性分析证实了该家族通过基因复制事件进行扩张。通过基因表达模式分析发现,在果实成熟过程中有123个基因差异表达。本研究为AP2/ERF基因家族的研究和猕猴桃基因家族分析提供参考。 展开更多
关键词 猕猴桃 AP2/erf家族 鉴定 生物信息
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芒果果实MiERF20基因的克隆、定位及表达分析
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作者 郭盼 王鑫 +4 位作者 张莎莎 马德新 龚艳 邵远志 李雯 《热带作物学报》 北大核心 2025年第4期788-797,共10页
芒果(Mangifera indica L.)是典型的呼吸跃变型水果,其成熟衰老与乙烯密切相关。ERF转录因子(ethyleneresponsive factor)在植物生长发育、果实成熟和乙烯信号转导中发挥重要作用。本研究以贵妃芒果品种为试验材料,克隆MiERF20基因,并... 芒果(Mangifera indica L.)是典型的呼吸跃变型水果,其成熟衰老与乙烯密切相关。ERF转录因子(ethyleneresponsive factor)在植物生长发育、果实成熟和乙烯信号转导中发挥重要作用。本研究以贵妃芒果品种为试验材料,克隆MiERF20基因,并对其生物学功能进行分析。结果表明:MiERF20基因全长492 bp,编码163个氨基酸;MiERF20蛋白为不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜区,含有25个磷酸化位点及1个AP2保守结构域;其二级结构以40.49%的无规则卷曲为主,还含有33.13%的α-螺旋、16.56%的延伸链和9.82%的β-转角,三级结构符合AP2结构域特征;MiERF20与漆树科开心果的ERF20蛋白同源性达83.89%。亚细胞定位显示MiERF20位于细胞核,且具有转录激活活性。原核表达实验表明该蛋白在原核系统中能被诱导表达。实时荧光定量分析结果显示,MiERF20基因受乙烯诱导表达,表明其在乙烯调控果实成熟中发挥重要作用。本研究为进一步解析ERF转录因子在果实采后成熟过程中的功能和调控机制提供基础。 展开更多
关键词 芒果 erf转录因子 乙烯信号 基因表达 表达分析
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外源NO调控干旱胁迫下紫花苜蓿AP2/ERFs基因的表达分析
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作者 温小月 赵颖 +4 位作者 王宝强 王贤 朱晓林 王义真 魏小红 《草业学报》 北大核心 2025年第6期154-167,共14页
紫花苜蓿是世界上种植最广泛的饲用豆科作物。APETALA2/ethylene-responsive factor(AP2/ERF)转录因子在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用。一氧化氮(nitric oxide,NO)作为植物体内的一种信号分子,在植物抗旱中扮演重要角色。本研究利... 紫花苜蓿是世界上种植最广泛的饲用豆科作物。APETALA2/ethylene-responsive factor(AP2/ERF)转录因子在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用。一氧化氮(nitric oxide,NO)作为植物体内的一种信号分子,在植物抗旱中扮演重要角色。本研究利用生物信息学方法对紫花苜蓿MsAP2/ERF基因家族成员进行鉴定及其对NO和干旱的响应模式分析,并从MsAP2/ERF基因家族中筛选到强烈响应NO调控的MsERF07基因进行亚细胞定位。结果表明,该家族成员均含有AP2结构域,其蛋白质的氨基酸数目介于176~422;亚细胞定位预测大部分蛋白都定位在细胞核;MsERF01和MsERF11的亲缘关系较近,并且它们具有相似的结构域;61.54%的MsAP2/ERF基因只含有外显子,也具有高度相似的保守基序;蛋白互作显示MsERF01和MsERF11、MsERF05和MsERF07均处于蛋白互作图中的同一节点;13个MsAP2/ERF基因家族成员被不均匀分布在13条染色体上,MsAP2/ERF基因家族成员的启动子序列中有43个与光反应、组织特异性表达、胁迫以及植物激素相关的顺式调控元件。此外,紫花苜蓿的转录组测序数据分析表明大部分MsAP2/ERF基因家族成员在NO的调控下表达量增加,进一步qRT-RCR试验结果显示,外源NO促进了干旱胁迫下MsAP2/ERF基因的表达量。克隆MsERF07基因,亚细胞定位结果显示该蛋白定位在细胞核与细胞膜中,本研究为后续研究紫花苜蓿MsERF07基因响应干旱胁迫的分子机制提供了基础。 展开更多
关键词 干旱胁迫 一氧化氮 紫花苜蓿 AP2/erf
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海滨木槿AP2/ERF基因家族鉴定及盐胁迫响应模式
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作者 邓薪瑜 倪龙杰 +3 位作者 向鹏 王芝权 於朝广 顾春笋 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期618-629,共12页
【目的】鉴定海滨木槿AP2/ERF基因家族成员并分析其盐胁迫响应模式,为木槿属植物的耐盐育种提供参考。【方法】使用生物信息学技术对海滨木槿AP2/ERF基因进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析和qRT-PCR技术验证HhERF对盐胁迫的响... 【目的】鉴定海滨木槿AP2/ERF基因家族成员并分析其盐胁迫响应模式,为木槿属植物的耐盐育种提供参考。【方法】使用生物信息学技术对海滨木槿AP2/ERF基因进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析和qRT-PCR技术验证HhERF对盐胁迫的响应情况。【结果】(1)在海滨木槿基因组中共鉴定出134个AP2/ERF家族基因成员,命名为HhERF1~HhERF134。(2)理化性质分析结果表明,其蛋白等电点为4.68~10.15,分子质量为1.569~78.511 ku;亚细胞定位预测表明蛋白都位于细胞核。(3)基因结构分析显示,在系统发育树中同一分支上的HhERF基因具有较高的结构相似性。(4)顺式作用元件分析表明,HhERF基因家族成员广泛参与了光响应、植物激素信号转导及非生物逆境胁迫响应。(5)转录组数据和qRT-PCR结果显示,大多数HhERF基因在盐胁迫处理后的特定时间点相对表达量上调,尤其在处理24 h后;其中,HhERF5、HhERF9和HhERF27基因在根部表现出显著的上调。【结论】海滨木槿AP2/ERF基因家族在盐胁迫响应中表现出复杂的时空表达模式,可能通过调控多个生物学过程,如激素信号传导和逆境应答,参与植物的盐胁迫响应。 展开更多
关键词 海滨木槿 AP2/erf基因家族 盐胁迫 生物信息学方法 QRT-PCR
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木薯MeERF1基因克隆及其表达分析
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作者 杨超逸 林世扬 +3 位作者 蓝东旭 杨亚鹏 颜彦 胡伟 《福建农业学报》 北大核心 2025年第11期1117-1123,共7页
【目的】乙烯响应因子(ethylene responsive factor,ERF)在植物生长发育、非生物胁迫以及抗氧化系统中均具有重要功能。克隆木薯MeERF1基因并进行亚细胞定位和表达分析,可为深入研究其潜在功能提供参考。【方法】利用PCR扩增从木薯‘SC... 【目的】乙烯响应因子(ethylene responsive factor,ERF)在植物生长发育、非生物胁迫以及抗氧化系统中均具有重要功能。克隆木薯MeERF1基因并进行亚细胞定位和表达分析,可为深入研究其潜在功能提供参考。【方法】利用PCR扩增从木薯‘SC8’中获得特异性MeERF1基因CDS序列(全长1425 bp),综合运用生物信息学方法对序列进行功能注释与结构预测,并通过农杆菌介导的瞬时转化体系,检测MeERF1蛋白的亚细胞定位情况。同时检测木薯不同组织以及脱落酸(abscisic acid,ABA)处理块根后不同时间点MeERF1基因的相对表达量。【结果】PCR克隆获得的MeERF1基因CDS序列与Phytozome数据库收录的参考核苷酸序列(登录号:Manes.13G148300)一致性高达100%,功能预测显示该CDS编码的蛋白分子量52.7 kDa,由474个氨基酸组成,理论等电点pI 6.28,属于酸性蛋白类型。预测分析表明该蛋白含有90.30%的无规则卷曲结构、6.96%的α-螺旋构象和2.74%的延伸链片段,亚细胞定位试验证实了MeERF1蛋白定位于细胞核。通过多序列比对及系统进化分析发现,MeERF1蛋白包含一个关键的AP2/ERF家族保守结构域,该结构域特异性结合GCC/box,证明其作为转录因子发挥生物学功能。该蛋白与巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)ERF蛋白的氨基酸序列相似度最高(80.33%)。组织表达模式分析表明MeERF1基因在木薯的不同组织中均有表达,其中在须根中表达量最高,显著高于其他组织类型,茎部次之。MeERF1基因在采后不同时间的块根切片中受诱导表达,且相对表达在ABA处理12 h后显著提高,达到峰值。【结论】MeERF1基因属于AP2/ERF类转录因子,定位于细胞核,主要在须根中表达,在块根采后生理衰变过程中受诱导,ABA处理显著增强诱导作用,表明MeERF1可能通过响应ABA信号在木薯块根采后生理衰变过程中发挥功能。 展开更多
关键词 木薯 erf转录因子 基因克隆 脱落酸 采后生理衰变
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AP2/ERF转录因子家族响应木本植物非生物胁迫的研究进展 被引量:1
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作者 黄倩慧 田博雯 +4 位作者 华炫 周欣彤 江梓涵 陈艳红 张健 《南通大学学报(自然科学版)》 2025年第1期74-84,共11页
木本植物是全球生态系统的重要支柱,在维护生态平衡中起着重要作用,其在生长过程中会受到多种非生物胁迫,如冷胁迫、干旱胁迫、盐胁迫等,这些胁迫会严重影响木本植物的生长发育。AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)转录因子... 木本植物是全球生态系统的重要支柱,在维护生态平衡中起着重要作用,其在生长过程中会受到多种非生物胁迫,如冷胁迫、干旱胁迫、盐胁迫等,这些胁迫会严重影响木本植物的生长发育。AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)转录因子在木本植物中分布广泛,是植物最大的转录因子家族之一。文章总结了木本植物AP2/ERF转录因子的分类情况,探讨了AP2/ERF转录因子在木本植物响应非生物胁迫(冷、干旱、盐、淹水)中的关键作用。研究还发现,木本植物AP2/ERF转录因子家族中ERF和DREB亚家族成员数量最多,其中DREB亚家族成员CBF是木本植物冷胁迫信号转导的关键因子。该综述为更好地理解木本植物中AP2/ERF转录因子的功能及其在非生物响应中的作用提供了支撑。 展开更多
关键词 木本植物 AP2/erf转录因子 非生物胁迫 冷胁迫 干旱胁迫 盐胁迫 淹水胁迫
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7个苎麻AP2/ERF基因时空表达分析与花发育相关BnERF1基因克隆
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作者 彭文仙 马鑫 +4 位作者 何思 何也君 张晓洋 霍颖怡 邢虎成 《分子植物育种》 北大核心 2025年第2期428-436,共9页
苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaudich.]生殖生长对其纤维发育有显著的抑制作用,且苎麻开花受乙烯调控。AP2/ERF转录因子在植物中对乙烯信号响应和调控生长发育具有关键作用。本研究根据苎麻转录组数据筛选到7个不同的ERF基因,在分析其在不... 苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaudich.]生殖生长对其纤维发育有显著的抑制作用,且苎麻开花受乙烯调控。AP2/ERF转录因子在植物中对乙烯信号响应和调控生长发育具有关键作用。本研究根据苎麻转录组数据筛选到7个不同的ERF基因,在分析其在不同种质不同部位的时空表达情况基础上,克隆了一个与花芽发育密切相关的ERF基因,并进行生物信息学特征分析。结果表明:7个ERF基因在不同种质和不同组织中均表达,但表达量差异显著,存在基因型和组织器官特异性。其中Unigene9156和Unigene16687在所有种质中相对表达量较高,尤其在0.5~1.0 cm花芽(雌花芽和雄花芽)中表达量极高。Unigene9156在‘GBN08’种质0.5~1.0 cm雄花芽中的表达量是在‘GBN08’麻骨中表达量的650多倍,而在‘GBN09’种质0.5~1.0 cm雌花芽中的表达量是在‘GBN08’麻骨中表达量的338倍。因此可推测Unigene9156在调节苎麻开花和花芽发育方面可能有重要作用。以苎麻转录组数据中的Unigene9156为模板,克隆Unigene9156基因ORF,长为1302 bp,命名为BnERF1(登录号:MZ540911)。该基因编码433个氨基酸,分子质量为47.05 kD,理论等电点为9.04,含有AP2结构域的YRG和RAYD基序,是无信号肽蛋白,亚细胞定位在细胞核内。系统进化树显示苎麻与川桑、异色山黄麻、大麻的ERF蛋白同源关系较近。该研究为进一步揭示AP2/ERF调控苎麻开花提供了科学依据。 展开更多
关键词 苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaudich.] AP2 erf 克隆
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