橡胶草AP2/EREBP转录因子家族鉴定及表达模式分析

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作者 樊梦薇 张长萍 +1 位作者 冷亚东 闫洁 《南方农业学报》 北大核心 2025年第9期2770-2780,共11页

[目的]鉴定橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员并进行表达分析,为深入探究其对天然橡胶的转录调控机制提供理论参考。[方法]对橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员进行鉴定,并利用生物信息学方法对其进行亚家族分类、启动子顺式作用元件分析... [目的]鉴定橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员并进行表达分析,为深入探究其对天然橡胶的转录调控机制提供理论参考。[方法]对橡胶草AP2/EREBP转录因子家族成员进行鉴定,并利用生物信息学方法对其进行亚家族分类、启动子顺式作用元件分析及蛋白保守基序、保守结构域分析,并用茉莉酸甲酯(MeJA)处理橡胶草根组织,获取该家族成员在不同处理时间下的表达差异数据,对表达差异显著(P<0.05)的3个基因进行组织表达特性分析。[结果]共鉴定出228个AP2/EREBP家族成员,其中AP2亚家族成员31个、RAV亚家族成员1个、ERF亚家族成员92个、DREB亚家族成员91个、其他亚家族成员13个,基于各亚家族成员在基因组中OriID的大小分别将其命名为TkAP21~TkAP231、TkRAV1、TkERF1~TkERF92、TkDREB1~TkDREB91、TkAP2EREBP1~TkAP2EREBP13。亚细胞定位预测结果显示,228个家族成员中有129个成员只定位在细胞核,14个成员只定位在细胞质,其余成员在细胞核和细胞质中均有定位。228个家族成员均不具有跨膜结构和信号肽,其保守结构域、保守基序特点与进化关系基本吻合,具有大量的生长发育和胁迫应答相关的启动子顺式作用元件。选取3个MeJA处理后表达差异显著的家族成员进行表达分析,结果发现TkDREB62和TkERF84基因在叶中的相对表达量极显著(P<0.01、P<0.001)或显著(P<0.05)高于其他组织;TkERF91基因在根和叶中的相对表达量极显著高于花和花梗中的相对表达量(P<0.001);TkERF91基因在叶、花梗和根中的相对表达量均极显著高于TkDREB62和TkERF84基因(P<0.001)。[结论]橡胶草具有228个AP2/EREBP转录因子家族成员,其中DREB和ERF亚家族占据主导地位。基于结构域的亚家族分类结果和基于蛋白序列差异构建的系统发育树基本吻合,该家族成员在各亚家族内部表现出启动子顺式元件、蛋白质保守结构域以及保守基序上的相对一致性,但在不同亚家族之间存在差异;不同家族基因在组织表达和MeJA诱导后的表达水平上存在差异。 展开更多

关键词 橡胶草 ap2/erebp 基因家族 鉴定 表达模式

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枣AP2/EREBP转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析 被引量：18

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作者 纪晴 周凡 +7 位作者 周军 王大玮 胡孟豪 李丹 沈兵琪 邓浪 高晓宇 杜宗义 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期2983-2997,共15页

AP2/EREBP类转录因子为植物所特有的一类转录因子,参与了植物的发育和胁迫途径。本研究利用枣的全基因组数据库,通过生物信息学手段鉴定枣的AP2/EREBP家族的全部成员,并分析AP2/EREBP转录因子家族保守域特点与功能及表达情况,为枣的遗... AP2/EREBP类转录因子为植物所特有的一类转录因子,参与了植物的发育和胁迫途径。本研究利用枣的全基因组数据库,通过生物信息学手段鉴定枣的AP2/EREBP家族的全部成员,并分析AP2/EREBP转录因子家族保守域特点与功能及表达情况,为枣的遗传改良抗性育种提供理论依据。利用在线软件EBI、TAIR、Hmmer3.0、SMART、Pfam、MEME、ProtParam、SOPMA、SignalP4.1Sever和String网站,以及ClustalX2、BioEdit、MEGA6.0、MapInspect软件,对枣的AP2/EREBP转录因子家族的类型、结构域、系谱进化、序列元件、蛋白理化性质及二级结构、信号肽分析、基因定位、基因芯片表达和蛋白功能联系预测进行了分析。分析表明,枣全基因组中有127条AP2/EREBP转录因子,根据其结构域划分为4个亚家族：AP2、RAV、DREB及ERF,各家族成员数分别为：17、6、50及54。进行多序列比对和系谱进化分析,发现2个亚家族各分为6个亚族。生物信息学分析表明,AP2/EREBP家族蛋白均为亲水性蛋白、非分泌型蛋白,且该家族蛋白富含酸性氨基酸;基因定位表明,该家族基因在12条染色体上呈不均匀分布,有染色存在串联复制现象;对127个枣AP2/EREBP蛋白之间的功能联系网络进行了系统预测,分析预测了相关基因的功能和多个基因间的联系;基因芯片表达表明,AP2/EREBP转录因子在低温、高温、光照、遮阴、紫外线、UV敏感处理及外源ABA处理条件下均能被诱导表达,且在根、叶、花和果4个器官中均有显著性表达。枣AP2/EREBP基因家族结构高度保守,对外界胁迫有显著性表达,可能在枣的生长发育及其在枣的多种生理反应信号转导中发挥着重要作用,且各家族成员之间在植物生长发育过程和胁迫响应及激素信号转导途径具有交叉作用。 展开更多

关键词 枣 ap2/erebp 转录因子 生物信息学分析

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‘红阳’猕猴桃全基因组AP2/EREBP转录因子生物信息学分析 被引量：21

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作者 邓浪 沈兵琪 +4 位作者 王连春 周军 刘惠民 周凡 李德龙 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期790-805,共16页

【目的】分析‘红阳’猕猴桃全基因组AP2/EREBP转录因子家族。【方法】利用Kiwifruit Genome Database、EMBI、TAIR、SMART、Pfam、MEME、Protparam、SOPM、SWISS-MODEL、Signal P4.1 Sever网站,和Clustal X2、Bio Edit、MEGA6.0、Map I... 【目的】分析‘红阳’猕猴桃全基因组AP2/EREBP转录因子家族。【方法】利用Kiwifruit Genome Database、EMBI、TAIR、SMART、Pfam、MEME、Protparam、SOPM、SWISS-MODEL、Signal P4.1 Sever网站,和Clustal X2、Bio Edit、MEGA6.0、Map Inspect、MEV软件,分析‘红阳’猕猴桃AP2/EREBP转录因子类型、结构域、系谱进化、蛋白理化性质及高级结构、信号肽分析、基因定位、序列元件和基因表达模式。【结果】‘红阳’猕猴桃全基因组中有204条AP2/EREBP转录因子,根据其结构域划分为4个亚家族。进行多序列比对和系谱进化分析,发现2个亚家族各分为6个亚组。生物信息学分析表明,204条蛋白氨基酸序列高级结构与拟南芥AP2/EREBP转录因子相似性较高。其中存在2条分泌型蛋白。基因定位表明,该家族基因在10号染色体无定位;有染色存在串联复制现象。同源拟南芥基因表达模式分析表明,AP2/EREBP转录因子对外界胁迫有显著性表达。【结论】利用生物信息学方法获得204条猕猴桃AP2/EREBP家族转录因子,并与拟南芥AP2/EREBP转录因子进行系谱进化、结构域、基因定位和同源表达等分析,结果表明猕猴桃AP2/EREBP转录因子在进化过程中比较保守,并参与了植物发育和胁迫应答调控。 展开更多

关键词 猕猴桃 ap2/erebp 转录因子 生物信息学分析

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AP2/EREBP转录因子在植物发育和胁迫应答中的作用 被引量：27

4

作者 赵利锋 柴团耀 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2008年第1期89-101,共13页

AP2/EREBP(APETALA2/ethylene-responsive element binding proteins)是一个起源古老的转录因子超家族,它含有1个或2个由约60-70个氨基酸残基组成的非常保守的DNA结合域(DNA-bindingdomain),即AP2/ERF结构域。根据AP2/ERF结构域的数目,A... AP2/EREBP(APETALA2/ethylene-responsive element binding proteins)是一个起源古老的转录因子超家族,它含有1个或2个由约60-70个氨基酸残基组成的非常保守的DNA结合域(DNA-bindingdomain),即AP2/ERF结构域。根据AP2/ERF结构域的数目,AP2/EREBP转录因子可以分为2个亚族:EREBP亚族(具有1个AP2/ERF结构域)和AP2亚族(具有2个AP2/ERF结构域)。AP2亚族转录因子有调控花、胚珠和种子发育的功能,而EREBP亚族转录因子(包括DREB类和ERF类)的主要功能是调节植物对激素(乙烯和ABA等)、病原和胁迫(低温、干旱及高盐)等的应答反应。本文讨论了AP2/EREBP转录因子在植物发育和胁迫应答中的研究进展。 展开更多

关键词 ap2/erebp ap2/ERF结构域 apETALA2 DREB erebp

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巴西橡胶树一个AP2/EREBP转录因子的克隆及表达分析 被引量：7

5

作者 杜磊 张德春 +2 位作者 邓治 刘向红 李德军 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1238-1244,共7页

本文采用RACE技术从巴西橡胶树中鉴定出一个AP2/EREBP转录因子。该转录因子全长cDNA为1 225 bp,最长开放阅读框699 bp,预测编码蛋白包含232个氨基酸;序列比对分析发现,该转录因子具有一段保守的AP2/EREBP结构域,与拟南芥Soloist(At4g130... 本文采用RACE技术从巴西橡胶树中鉴定出一个AP2/EREBP转录因子。该转录因子全长cDNA为1 225 bp,最长开放阅读框699 bp,预测编码蛋白包含232个氨基酸;序列比对分析发现,该转录因子具有一段保守的AP2/EREBP结构域,与拟南芥Soloist(At4g13040)类蛋白具有较高的相似性,将该基因命名为HbSoloist。半定量RT-PCR分析结果表明,HbSoloist在巴西橡胶树的胶乳、叶片、树皮和花中均有表达。与健康橡胶树相比,死皮树胶乳中HbSoloist表达量明显下降。研究发现HbSoloist表达受乙烯利、茉莉酸和低温处理调控,表明HbSoloist基因可能在巴西橡胶树乙烯、茉莉酸和低温反应中发挥作用。 展开更多

关键词 巴西橡胶树 ap2 erebp 转录因子 基因克隆 表达分析

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鉴定水稻中一个新的专一结合GCC元件的AP2/EREBP族转录因子 被引量：3

6

作者 陈峰 余军平 +1 位作者 方晓红 张贵友 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第7期627-634,共8页

TSH1,是通过搜寻GenBank的EST库而获得的一个来源于水稻的含AP2/EREBP保守结构域的蛋白质.为了详细分析TSH1蛋白与其DNA顺式元件的结合特性,首先采用传统的凝胶阻滞实验和酵母单杂交技术,证实TSH1在体内和体外均专一性地结合于GCC元件,... TSH1,是通过搜寻GenBank的EST库而获得的一个来源于水稻的含AP2/EREBP保守结构域的蛋白质.为了详细分析TSH1蛋白与其DNA顺式元件的结合特性,首先采用传统的凝胶阻滞实验和酵母单杂交技术,证实TSH1在体内和体外均专一性地结合于GCC元件,然后利用原子力显微镜技术精确测量了TSH1蛋白与GCC元件在单分子水平的相互作用力.结果表明,GST-TSH1与DRE元件没有特异性的结合,而GST-TSH1与GCC元件结合力的大小为(83.9±2.2)pN,这种特异性的结合可以被加入的游离TSH1蛋白明显降低.GST蛋白和突变GCC元件作为负对照显示出与GCC元件无特异性作用力.以上结果充分证明,TSH1是专一性地与GCC元件相作用的转录因子,而且原子力显微镜对于检测转录因子与DNA相互作用时单碱基的突变十分灵敏.通过比较几种评估转录因子与DNA顺式元件结合特异性的方法,阐述了原子力显微镜技术的特点及优越性. 展开更多

关键词 TSH1 ap2/erebp 转录因子 原子力显微镜

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AP2/EREBP转录因子及其在植物抗逆中的作用 被引量：8

7

作者 李芳 李先文 黎定军 《江西农业学报》 CAS 2008年第1期44-47,共4页

近年来,转录因子在植物防卫反应和逆境胁迫应答中的应用越来越广泛,综述了AP2/EREBP转录因子的结构特征及其在植物抗逆作用中的研究进展。

关键词 ap2/erebp 转录因子 植物抗逆性

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橡胶树皮乳管组织茉莉酸诱导相关因子AP2/EREBP基因的克隆与表达分析 被引量：5

8

作者 吴华玲 于波 +4 位作者 程芹芹 曾日中 段翠芳 聂智毅 黎瑜 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第5期287-293,共7页

茉莉酸(jasmonic acid,JA)可诱导橡胶树(Hevea brasiliensis Muell.Arg.)乳管分化,是乳管分化的关键信号分子。目前,对JA诱导橡胶树乳管分化的分子机理仍然不清楚。在前期研究中通过筛选JA刺激乳管分化时期的橡胶树树皮组织cDNA差减文库... 茉莉酸(jasmonic acid,JA)可诱导橡胶树(Hevea brasiliensis Muell.Arg.)乳管分化,是乳管分化的关键信号分子。目前,对JA诱导橡胶树乳管分化的分子机理仍然不清楚。在前期研究中通过筛选JA刺激乳管分化时期的橡胶树树皮组织cDNA差减文库,获得了4条与茉莉酸诱导乳管分化相关的AP2/EREBP家族转录因子基因的EST。该研究在此基础上,采用RACE法完整地克隆了这4个AP2/EREBP转录因子基因的开放阅读框,蛋白氨基酸序列分析表明其中3个属于ERF亚类,1个属于RAV亚类;表达分析发现,这4个基因在乳管分化时期的橡胶树树皮组织的表达受JA诱导,随JA处理时间的延长,其表达量先增强后减弱,推测它们可能在JA诱导橡胶树乳管分化过程中起着重要的调控作用。 展开更多

关键词 巴西橡胶树 ap2/erebp转录因子 基因克隆 基因表达 茉莉酸 乳管分化

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AP2/EREBP转录因子的结构与功能 被引量：17

9

作者 韩志萍 安利佳 侯和胜 《中国农学通报》 CSCD 2006年第3期33-38,共6页

AP2/EREBP是植物所特有的一类转录因子。AP2/EREBP家族成员在结构上有共同的特点:每个成员都含有由60个左右氨基酸组成的非常保守的DNA结合域(即AP2/EREBP结合域)。含有AP2/EREBP结合域的转录因子在植物中广泛存在,并且参与植物的生长... AP2/EREBP是植物所特有的一类转录因子。AP2/EREBP家族成员在结构上有共同的特点:每个成员都含有由60个左右氨基酸组成的非常保守的DNA结合域(即AP2/EREBP结合域)。含有AP2/EREBP结合域的转录因子在植物中广泛存在,并且参与植物的生长、发育以及多种生理生化反应的信号转导,如:花器官形成、抗病、抗逆、激素响应(乙烯)等。在此,主要介绍了植物转录因子AP2/EREBP家族的结构及其功能的研究进展。 展开更多

关键词 ap2/erebp家族 转录因子

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大豆胞囊线虫病抗性相关AP2/EREBP转录因子生物信息学分析 被引量：3

10

作者 韩英鹏 卜凡珊 +2 位作者 田利峥 姜海鹏 赵雪 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1-8,73,共9页

AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其... AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其开展在线生物信息学预测和分析。结果表明,14个转录因子多数为酸性等电点,均属于亲水性蛋白;通过与拟南芥AP2/EREBP转录因子作多序列比对和系谱进化树分析可知,AP2/EREBP转录因子根据其保守结构域特点分为AP2、ERF和DREB等3个亚族,且可分为B3、B5、A2和A5亚类。亚细胞定位预测结果显示AP2/EREBP转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、线粒体、叶绿体;蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中,同一亚族蛋白质三级结构之间无明显差异,而不同亚族之间差异显著,表明大豆胞囊线虫病相关AP2/EREBP转录因子在遗传进化过程中高度保守,其结构和功能可能具有相似性。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 ap2/erebp 转录因子 生物信息学

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3个编码AP2/EREBP转录因子的基因克隆及其在棉纤维中优势表达的初步分析 被引量：1

11

作者 杜曼丽 倪勇祥 李学宝 《华中师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2007年第4期578-582,共5页

从棉花cDNA文库中分离到3个编码AP2/EREBP转录因子的cDNAs序列,命名为GhAP2/EREBP1、GhAP2/EREBP2和GhAP2/EREBP3.利用Real-time RT-PCR对这3个基因表达进行分析,结果表明:GhAP2/EREBP1和GhAP2/EREBP2在棉花纤维中优势表达,而GhAP2/ERE... 从棉花cDNA文库中分离到3个编码AP2/EREBP转录因子的cDNAs序列,命名为GhAP2/EREBP1、GhAP2/EREBP2和GhAP2/EREBP3.利用Real-time RT-PCR对这3个基因表达进行分析,结果表明:GhAP2/EREBP1和GhAP2/EREBP2在棉花纤维中优势表达,而GhAP2/EREBP3在花药中优势表达,在纤维中表达量也较高.这表明上述3个AP2/EREBP转录因子可能在棉花纤维发育过程中起调控作用. 展开更多

关键词 ap2/erebp转录因子 棉花 基因表达模式

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‘红颜’草莓体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族转录因子的表达分析及FaEREBP基因的克隆 被引量：3

12

作者 高利梅 候羽 +1 位作者 姚允聪 姬谦龙 《北京农学院学报》 2015年第4期15-19,共5页

【目的】筛选并克隆‘红颜’草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.‘Benihopp’)体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族特异性表达的基因,以期为草莓体细胞胚发生的分子调控机理研究提供理论依据。【方法】以‘红颜’草莓非胚性愈伤组织、... 【目的】筛选并克隆‘红颜’草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.‘Benihopp’)体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族特异性表达的基因,以期为草莓体细胞胚发生的分子调控机理研究提供理论依据。【方法】以‘红颜’草莓非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织以及体细胞胚为试验材料,应用RNA-seq测序技术,筛选出差异表达的AP2/EREBP转录因子,并通过qRT-PCR技术,检测上调转录因子在非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织、体细胞胚以及幼苗根、茎、叶等组织中的表达量,以同源克隆技术获得特异性表达的转录因子FaEREBP。【结果】FaEREBP编码区核苷酸序列全长822bp,编码273个氨基酸,其表达水平在胚性愈伤组织和体细胞胚中显著高于其他组织。【结论】FaEREBP是‘红颜’草莓体细胞胚发生潜在的重要转录因子。 展开更多

关键词 '红颜’草莓 体细胞胚 RNA-SEQ ap2/erebp

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利用阵列分析水稻AP2／EREBP家族基因的表达特性

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作者 胡一兵 赵利锋 王台 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2008年第1期27-33,共7页

AP2/EREBP蛋白是广泛存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP功能域的重要转录因子家族,通常可分为包含单功能域的EREBP类蛋白和包含两个功能域的AP2类蛋白,它们的功能涉及植物生长发育调控和对逆境应答等许多方面。据预测,水稻基因组编码15... AP2/EREBP蛋白是广泛存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP功能域的重要转录因子家族,通常可分为包含单功能域的EREBP类蛋白和包含两个功能域的AP2类蛋白,它们的功能涉及植物生长发育调控和对逆境应答等许多方面。据预测,水稻基因组编码150个左右的AP2/EREBP家族成员,但目前绝大多数蛋白的功能仍不清楚。为了解这些基因在水稻不同器官中的表达特性,我们以AP2/EREBP功能域的氨基酸序列为基础,从水稻基因组数据库中搜索到12个AP2类以及20个EREBP类预测基因,利用PCR扩增的编码区序列制备了这些预测基因的macro-array。以幼芽、幼根、幼叶、颖花和灌浆期成熟叶的cDNA为探针,杂交分析结果显示:不同AP2类预测基因之间的表达量差别较大,但同一个基因在不同器官中表达量基本一致;与此不同的是,大部分EREBP类预测基因在幼根和成熟叶片中表达量较高,而在幼芽和幼叶中表达量较低。这些预测基因的表达模式可能与它们的功能密切相关。 展开更多

关键词 ap2/erebp 杂交分析 水稻 预测基因

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一类植物中特有的转录因子——AP2/EREBP转录因子家族 被引量：5

14

作者 谢永丽 《青海师范大学学报（自然科学版）》 2006年第3期80-83,共4页

AP2/EREBP转录因子家族是一类在植物中特有的转录因子.该家族转录因子的共同特点是其DNA结合域为保守的AP2/EREBP结构域.根据所含保守结构域数目,该家族分为AP2和EREBP两个亚族.AP2亚族转录因子与调控植物生长发育有关,EREBP亚族转录因... AP2/EREBP转录因子家族是一类在植物中特有的转录因子.该家族转录因子的共同特点是其DNA结合域为保守的AP2/EREBP结构域.根据所含保守结构域数目,该家族分为AP2和EREBP两个亚族.AP2亚族转录因子与调控植物生长发育有关,EREBP亚族转录因子应答植物非生物逆境胁迫.本文就AP2/EREBP类转录因子的结构特征、功能、与靶元件的作用模式、对基因的调控表达以及最新研究进展做全面性的综述. 展开更多

关键词 ap2/erebp转录因子 植物生长发育调控 逆境胁迫应答

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艾纳香AP2/EREBP转录因子家族生物信息学分析 被引量：4

15

作者 查英 白琳 +6 位作者 谢小丽 王凯 元超 于福来 黄梅 官玲亮 陈松笔 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期5953-5959,共7页

AP2/EREBP是植物特有的一类具有庞大家族的转录因子。该转录因子广泛参与调节植物生理功能和水杨酸、茉莉酸、脱落酸和乙烯等信号转导途径。本研究利用艾纳香的全长转录组数据,通过生物信息学的手段对艾纳香AP2/EREBP家族进行挖掘并分析... AP2/EREBP是植物特有的一类具有庞大家族的转录因子。该转录因子广泛参与调节植物生理功能和水杨酸、茉莉酸、脱落酸和乙烯等信号转导途径。本研究利用艾纳香的全长转录组数据,通过生物信息学的手段对艾纳香AP2/EREBP家族进行挖掘并分析,为从分子水平研究艾纳香代谢调控提供参考依据。利用DNAMAN、MEGA5.05软件以及Protparam、SOPMA在线网站,对艾纳香AP2/EREBP转录因子家族的类型、结构域、系统进化、蛋白理化性质和氨基酸序列高级结构等进行分析。结果表明从艾纳香转录组中挖掘到57个AP2/EREBP基因,通过查找开放阅读框筛选出18条能翻译成完整蛋白的序列;根据结构域的划分可分为DREB、ERF和AP2三个亚族;通过与拟南芥AP2/EREBP相关基因进行系统进化分析,结果表明艾纳香DREB和ERF亚族成员分别属于B2、B4、B5、B6和A6簇;生物信息学表明艾纳香AP2/EREBP转录因子家族蛋白富含酸性氨基酸,热稳定性较高且均为亲水性蛋白,全部蛋白都以无规则卷曲为主;每个亚家族的蛋白质三级结构差异不明显,但不同亚族之间有差异,主要表现在β-转角、β-折叠及无规则卷曲长度不同。本研究结果为进一步研究艾纳香AP2/EREBP基因功能提供参考。 展开更多

关键词 艾纳香(Blumea blasamifera) ap2/erebp 转录因子 生物信息学

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水稻AP2/EREBP转录因子响应非生物胁迫的表达谱分析 被引量：3

16

作者 靳鹏 黄立钰 +3 位作者 王迪 吴慧敏 朱苓华 傅彬英 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期3765-3773,共9页

【目的】了解AP2/EREBP家族基因参与逆境反应分子机理,为水稻抗逆相关基因的克隆及揭示水稻抗逆分子调控机理奠定基础。【方法】采用基因芯片技术分析AP2/EREBP家族基因在水稻幼苗受PEG、低温、高盐、ABA、GA等处理下的表达谱变化,并通... 【目的】了解AP2/EREBP家族基因参与逆境反应分子机理,为水稻抗逆相关基因的克隆及揭示水稻抗逆分子调控机理奠定基础。【方法】采用基因芯片技术分析AP2/EREBP家族基因在水稻幼苗受PEG、低温、高盐、ABA、GA等处理下的表达谱变化,并通过实时定量PCR技术对部分具有明显表达特点基因的胁迫表达谱进行验证。【结果】点制了水稻AP2/EREBP转录因子家族的基因芯片,检测到42个胁迫差异表达的AP2/EREBP基因。实时定量PCR所得结果与基因芯片结果基本吻合,说明芯片结果可靠。两个AP2/EREBP基因对所有胁迫反应相同,其它差异表达的AP2/EREBP基因对不同胁迫反应各不相同。【结论】研究发现两个AP2/EREBP基因在水稻应对外界胁迫反应中起核心分子调控作用;不同差异表达AP2/EREBP基因在水稻响应不同胁迫反应过程中具有相同或者不同的分子应答机理。 展开更多

关键词 水稻 ap2/erebp 基因芯片 非生物胁迫

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葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析 被引量：3

17

作者 郑建立 高峰 +5 位作者 田永生 高建杰 帅建军 彭日荷 熊爱生 姚泉洪 《上海农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期9-15,共7页

采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析。结果表明:3个转... 采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析。结果表明:3个转录因子属于AP2/EREBP-B1亚族,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面具有高度的一致性。 展开更多

关键词 葡萄 ap2/erebp 电子克隆 转录因子 生物信息学

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抗逆相关AP2/EREBP转录因子研究进展 被引量：9

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作者 丰锦 陈信波 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1-6,11,共7页

干旱、低温、土地盐碱化等非生物胁迫是影响植物生长发育以及作物产量的重要因素。近年来大量研究表明,多种转录因子参与调控植物对各种生物及非生物胁迫的应答与防御反应,与此同时人们对其作用机理的探索也日渐深入。AP2/ERF转录因子... 干旱、低温、土地盐碱化等非生物胁迫是影响植物生长发育以及作物产量的重要因素。近年来大量研究表明,多种转录因子参与调控植物对各种生物及非生物胁迫的应答与防御反应,与此同时人们对其作用机理的探索也日渐深入。AP2/ERF转录因子家族是植物所特有的一类转录因子,在拟南芥中该家族至少有146个成员;而在水稻中该基因家族多达181个,是已知水稻转录因子基因中最大的家族。这些编码含有一个保守APETALA(AP2)结构域的蛋白质可能在植物多个发育过程及应答外界环境信号过程中发挥重要功能。综述了AP2/EREBP类转录因子的结构特征及其功能特性,并重点讨论了它们在植物抗逆中的调控作用及其在植物抗逆性分子遗传改良上的意义。 展开更多

关键词 ap2/erebp 转录因子 非生物胁迫

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AP2功能基因在植物花发育中的重要作用 被引量：29

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作者 闻可心 刘雪梅 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期1-7,共7页

AP2基因作为调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立、花器官的特性特化以及形成调控。所编码的AP2/EREBP转录因子的主要特征是都至少含有一个由60到70个左右的氨基酸组成高度保守的DNA结合区,称作AP2结合域。按其所含的AP2结构... AP2基因作为调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立、花器官的特性特化以及形成调控。所编码的AP2/EREBP转录因子的主要特征是都至少含有一个由60到70个左右的氨基酸组成高度保守的DNA结合区,称作AP2结合域。按其所含的AP2结构域的数目分为3个亚族,即AP2亚家族、EREBP亚家族和RAV亚家族,每个亚家族都有各自的作用。AP2基因不但自身调控着花、胚珠的发育,而且与其他因子相互协作,参与到复杂的花发育调控网络。将对AP2基因的特征和分类及其在花发育中的作用进行概述。 展开更多

关键词 ap2基因 ap2/erebp转录因子 花发育 调控作用

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四合木抗逆相关的转录因子TmAP2-1基因的克隆及功能分析

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作者 王玉静 李敏春 +2 位作者 武旺 吴韩英 许亦农 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期23-33,共11页

AP2/EREBP家族的转录因子在调控植物生长发育和应答环境胁迫方面具有重要作用。利用同源克隆结合RACE(rapid-amplification of cDNA ends)技术,从四合木(Tetraena mongolica)中克隆了AP2/EREBP家族的基因,将其命名为TmAP2-1(GenBank登录... AP2/EREBP家族的转录因子在调控植物生长发育和应答环境胁迫方面具有重要作用。利用同源克隆结合RACE(rapid-amplification of cDNA ends)技术,从四合木(Tetraena mongolica)中克隆了AP2/EREBP家族的基因,将其命名为TmAP2-1(GenBank登录号:JQ676996)。序列分析结果表明,该基因的开放阅读框长度为1452bp,编码483个氨基酸;比对结果显示TmAP2-1有2个AP2/ERF结构域,属于AP2/EREBP转录因子家族的AP2亚家族。亚细胞定位实验结果表明,TmAP2-1定位在细胞核中。该基因编码的蛋白在酵母中没有转录激活活性。利用Real-timePCR检测发现该基因在根、茎、叶等器官中均表达,且在叶中表达量最高。此外,TmAP2-1还受到NaCl、低温、PEG和ABA的强烈诱导,推测TmAP2-1可能参与四合木的逆境胁迫响应。在四合木愈伤组织中过表达该基因能够降低四合木愈伤组织中油脂的含量,同时提高可溶性糖的含量,暗示该基因可能通过影响糖代谢过程参与逆境胁迫响应。 展开更多

关键词 逆境 ap2 erebp 基因克隆 可溶性糖 四合木

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